See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
15.07.1975
+372 517 6922
schryer@ut.ee
Systems biology researcher who writes software to analyze proteomics data, next-generation sequencing data, and to perform steady-state and dynamic metabolic flux analysis.

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
2013–...   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, Computational biologist (1,00)
2008–2013   
Tallinna Tehnikaülikool, TTÜ Küberneetika Instituut, insener (1,00)
01.09.2007–2008   
Tallinna Tehnikaülikool, TTÜ Küberneetika Instituut, Assistent (1,00)
2006–2008   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Researcher (1,00)
2005–2006   
Tallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond, Keemiatehnika instituut, insener (0,50)
01.01.2005–31.12.2006   
Estonian Business School, Teacher of chemistry, physics, and computer science
01.01.2000–31.12.2003   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, Graduate Teaching Assistant
01.01.1999–31.12.2004   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, Laboratory of Professor C.A.Mims, Research Assistant
01.01.1998–31.12.1999   
McAsphalt Engineering Services, Toronto, Ontario, Canada, Research Assistant
 
 
Haridustee
2007–2012   
Tallinn University of Technology, PhD, Technical Physics -- Awaiting defense on April 12, 2012
2002–2005   
University of Toronto, M.A.Sc., Chemical Engineering
1997–2000   
University of Toronto, B.A.Sc., Chemical Engineering
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2001−2002   
University of Toronto, Graduate Students’ Union Executive
2001−2002   
University of Toronto, Hart House, Member of the Board of Stewards
1999−2003   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, CEGSA Executive

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2003, David William Schryer, University of Toronto Fellowship - $1200
2002, David William Schryer, University of Toronto Fellowship - $1200
2001, David William Schryer, OGSST Scholarship $15000
2000, David William Schryer, Best Plant Design Project 2000
1998, David William Schryer, Undergraduate Achievment Scholarship - $1500
1997, David William Schryer, Undergraduate Achievment Scholarship - $1500
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.1. Biokeemia; CERCS ERIALA: P310 Proteiinid, ensümoloogia; PÕHISUUND: Analysis of proteomic data.
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS ERIALA: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika ; PÕHISUUND: Analysis of next-generation sequencing data.
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS ERIALA: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia ; PÕHISUUND: Analysis of metabolic systems.
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B130 Füsioloogiline biofüüsika
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika); PÕHISUUND: Computational Systems Biology and development of technology for 13C labeling experiments.

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2012
2.3.
2012
5.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2010
5.1.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
5.2.
2001
5.04.2018
15.07.1975
+372 517 6922
schryer@ut.ee
Systems biology researcher who writes software to analyze proteomics data, next-generation sequencing data, and to perform steady-state and dynamic metabolic flux analysis.

Career

Institution and occupation
2013–...   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Computational biologist (1,00)
2008–2013   
Tallinn University of Technology , Institute of Cybernetics at TUT, Engineer (1,00)
01.09.2007–2008   
Tallinn University of Technology , Institute of Cybernetics at TUT, Assistant (1,00)
2006–2008   
Competence Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (1,00)
2005–2006   
Tallinn University of Technology , Faculty of Chemical and Materials Technology, Department of Chemical Engineering, Other staff (0,50)
01.01.2005–31.12.2006   
Estonian Business School, Teacher of chemistry, physics, and computer science
01.01.2000–31.12.2003   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, Graduate Teaching Assistant
01.01.1999–31.12.2004   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, Laboratory of Professor C.A.Mims, Research Assistant
01.01.1998–31.12.1999   
McAsphalt Engineering Services, Toronto, Ontario, Canada, Research Assistant
 
 
Education
2007–2012   
Tallinn University of Technology, PhD, Technical Physics -- Awaiting defense on April 12, 2012
2002–2005   
University of Toronto, M.A.Sc., Chemical Engineering
1997–2000   
University of Toronto, B.A.Sc., Chemical Engineering
 
 
R&D related managerial and administrative work
2001−2002   
University of Toronto, Graduate Students’ Union Executive
2001−2002   
University of Toronto, Hart House, Member of the Board of Stewards
1999−2003   
University of Toronto, Department of Chemical Engineering, CEGSA Executive

Qualifications

 
 
Honours & awards
2003, David William Schryer, University of Toronto Fellowship - $1200
2002, David William Schryer, University of Toronto Fellowship - $1200
2001, David William Schryer, OGSST Scholarship $15000
2000, David William Schryer, Best Plant Design Project 2000
1998, David William Schryer, Undergraduate Achievment Scholarship - $1500
1997, David William Schryer, Undergraduate Achievment Scholarship - $1500
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.1. Biochemistry; CERCS SPECIALTY: P310 Proteins, enzymology ; SPECIALITY: Analysis of proteomic data.
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS SPECIALTY: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics ; SPECIALITY: Analysis of next-generation sequencing data.
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS SPECIALTY: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology ; SPECIALITY: Analysis of metabolic systems.
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALTY: B130 Physiological biophysics
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering; SPECIALITY: Computational Systems Biology and development of technology for 13C labeling experiments.
 
 

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
1.1.
2012
2.3.
2012
5.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2010
5.1.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
5.2.
2001
5.04.2018
  • Leitud 5 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF8165Escherichia coli atsetaadi metabolismi kvantitatiivne kirjeldamine bioprotsesside optimeerimiseks, kasutades aktselerostaatseid paralleelkultivatsioonisüsteeme01.01.201031.12.2013Kaarel AdambergTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond49 084,64 EUR
ETFETF7323Keskkonnatingimuste mõju glutatiooni akumulatsioonile ja ainevahetusele Saccharomyces cerevisiae rakkudes01.01.200831.12.2011Ildar NisamedtinovTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond71 043,20 EUR
SFSF0140077s08Mittelineaarne dünaamika ja komplekssüsteemid01.01.200831.12.2013Jüri EngelbrechtTallinna Tehnikaülikool, TTÜ Küberneetika Instituut1 825 683,65 EUR
TKTK124Mittelineaarsete protsesside analüüsi keskus01.01.201131.12.2015Jüri EngelbrechtTallinna Tehnikaülikool, TTÜ Küberneetika Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Füüsika Instituut2 729 927,47 EUR
ETFETF8041Na+ /Ca2+ -vahetaja roll vikerforelli kardiomüotsüütide elektromehaaniline sidestus ja energeetika01.01.200931.12.2012Rikke Birkedal NielsenTallinna Tehnikaülikool, TTÜ Küberneetika Instituut47 121,20 EUR