See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Dmytro Fishman

https://www.etis.ee/CV/Dmytro_Fishman/est
6.02.1991
737 6437
dmytro.fishman@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2021–26.04.2023   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut, andmeteaduse nooremlektor (1,00)
01.09.2019–31.12.2020   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut, andmeteaduse assistent (1,00)
01.09.2018–31.08.2019   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut, andmeteaduse assistent (0,80)
02.03.2016–14.08.2017   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut, bioinformaatika nooremteadur (1,00)
01.01.2016–01.03.2016   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut, bioinformaatika nooremteadur (1,00)
01.09.2015–31.12.2015   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, bioinformaatika nooremteadur (1,00)
01.08.2014–31.08.2015   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, teadusprojekti spetsialist (1,00)
01.08.2013–31.07.2014   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, informaatika assistent (0,50)
01.04.2013–30.06.2013   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, programmeerija (0,40)
2013–2014   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, informaatika assistent (1,00)
 
 
Haridustee
2013–2017   
PhD studies in the University of Tartu
29.08.2011–20.06.2013   
Master's in Software Engineering in the University of Tartu

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Dmytro Fishman, magistrikraad, 2013, (juh) Konstantin Tretjakov, Fast Approximate Max-correlation Queries (Kiired ligikaudsed päringud maksimaalse korrelatsiooni leidmiseks), Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut.
Dmytro Fishman, doktorant, (juh) Jaak Vilo; Hedi Peterson; Pärt Peterson, Bioinformatics data integration, Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut
 
 
Lisainfo
Certified Data and Software Carpentry instructor. I have been able to demonstrate an understanding of core pedagogical concepts and evidence-based teaching practices, and am qualified to teach Software and Data Carpentry's core curriculums.
Participated in the following Kaggle.com open data science competitions: BCI Challenge (top 11%), Second Annual Data Science Bowl (top 43%) and Diabetic Retinopathy Detection (top 25%).

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2020
Fishman, Dmytro; Kuzmin, Ivan; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Peterson, Hedi (2020). PAWER: protein array web exploreR. BMC Bioinformatics, 21 (1). DOI: 10.1186/s12859-020-03722-z.
1.1.
2019
Knific, Tamara; Fishman, Dmytro; Vogler, Andrej; Gstöttner, Manuela; Wenzl, René; Peterson, Hedi; Lanišnik Rižner, Tea ; (2019). Multiplex analysis of 40 cytokines do not allow separation between endometriosis patients and controls. Scientific Reports, 9, 16738. DOI: 10.1038/s41598-019-52899-8.
1.1.
2017
Ottas, Aigar; Fishman, Dmytro; Okas, Tiia-Linda; Kingo, Külli; Soomets, Ursel; (2017).

The metabolic analysis of psoriasis identifies the associated metabolites while providing computational models for the monitoring of the disease

. Archives of Dermatological Research, 309 (7), 519−528.10.1007/s00403-017-1760-1.
1.1.
2017
Fishman, Dmytro; Kisand, Kai; Hertel, Christina; Rothe, Mike; Remm, Anu; Pihlap, Maire; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Peet, Aleksandr; Meloni, Antonella; Podkrajsek, Katarina Trebusak; Battelino, Tadej; Bruserud, Øyvind; Wolff, Anette S B; Husebye, Eystein S; Kluger, Nicolas; Krohn, Kai; Ranki, Annamari; Peterson, Hedi; Hayday, Adrian ... Peterson, Pärt (2017). Autoantibody Repertoire in APECED Patients Targets Two Distinct Subgroups of Proteins. Frontiers in Immunology, 8, 976−976.10.3389/fimmu.2017.00976.
1.1.
2017
Ottas, Aigar; Fishman, Dmytro; Okas, Tiia-Linda; Pussa, Tonu; Toomik, Peeter; Martson, Aare; Kingo, Kulli; Soomets, Ursel (2017).

Blood serum metabolome of atopic dermatitis: Altered energy cycle and the markers of systemic inflammation

. PLoS ONE, 12 (11), ARTN e0188580.10.1371/journal.pone.0188580.
1.2.
2017
Jones, William; Alasoo, Kaur; Fishman, Dmytro; Parts, Leopold (2017). Computational biology: deep learning. Emerging Topics in Life Sciences, 1 (3), 257−274. DOI: 10.1042/ETLS20160025.
1.1.
2016
Meyer, Steffen; Woodward, Martin; Hertel, Christina; Vlaicu, Philip; Haque, Yasmin; Kärner, Jaanika; Macagno, Annalisa; Onuoha, Shimobi C; Fishman, Dmytro; Peterson, Hedi; Metsküla, Kaja; Uibo, Raivo; Jäntti, Kirsi; Hokynar, Kati; Wolff, Anette S B; ,; Krohn, Kai; Ranki, Annamari; Peterson, Pärt; Kisand, Kai ... Hayday, Adrian (2016). AIRE-Deficient Patients Harbor Unique High-Affinity Disease-Ameliorating Autoantibodies. Cell, 166 (3), 582−595.10.1016/j.cell.2016.06.024.
4.01.2021

Dmytro Fishman

https://www.etis.ee/CV/Dmytro_Fishman/eng
6.02.1991
737 6437
dmytro.fishman@ut.ee

Career

Institutions and positions
01.01.2021–26.04.2023   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Junior Lecturer of Data Science (1,00)
01.09.2019–31.12.2020   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Assistant of Data Science (1,00)
01.09.2018–31.08.2019   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Assistant of Data Science (0,80)
02.03.2016–14.08.2017   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Junior Research Fellow in Bioinformatics (1,00)
01.01.2016–01.03.2016   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Junior Research Fellow in Bioinformatics (1,00)
01.09.2015–31.12.2015   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Junior Research Fellow in Bioinformatics (1,00)
01.08.2014–31.08.2015   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Research Project Specialist (1,00)
01.08.2013–31.07.2014   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Assistant in Informatics (0,50)
01.04.2013–30.06.2013   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Programmer (0,40)
2013–2014   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, informaatika assistent (1,00)
 
 
Education
2013–2017   
PhD studies in the University of Tartu
29.08.2011–20.06.2013   
Master's in Software Engineering in the University of Tartu

Qualifications

Academic degrees
Dmytro Fishman, Master's Degree, 2013, (sup) Konstantin Tretjakov, Fast Approximate Max-correlation Queries, University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science.
Dmytro Fishman, Phd student, (sup) Jaak Vilo; Hedi Peterson; Pärt Peterson, Bioinformatics data integration, University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science
 
 
Additional information
Certified Data and Software Carpentry instructor. I have been able to demonstrate an understanding of core pedagogical concepts and evidence-based teaching practices, and am qualified to teach Software and Data Carpentry's core curriculums.
Participated in the following Kaggle.com open data science competitions: BCI Challenge (top 11%), Second Annual Data Science Bowl (top 43%) and Diabetic Retinopathy Detection (top 25%).

Projects in progress

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2020
Fishman, Dmytro; Kuzmin, Ivan; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Peterson, Hedi (2020). PAWER: protein array web exploreR. BMC Bioinformatics, 21 (1). DOI: 10.1186/s12859-020-03722-z.
1.1.
2019
Knific, Tamara; Fishman, Dmytro; Vogler, Andrej; Gstöttner, Manuela; Wenzl, René; Peterson, Hedi; Lanišnik Rižner, Tea ; (2019). Multiplex analysis of 40 cytokines do not allow separation between endometriosis patients and controls. Scientific Reports, 9, 16738. DOI: 10.1038/s41598-019-52899-8.
1.1.
2017
Ottas, Aigar; Fishman, Dmytro; Okas, Tiia-Linda; Kingo, Külli; Soomets, Ursel; (2017).

The metabolic analysis of psoriasis identifies the associated metabolites while providing computational models for the monitoring of the disease

. Archives of Dermatological Research, 309 (7), 519−528.10.1007/s00403-017-1760-1.
1.1.
2017
Fishman, Dmytro; Kisand, Kai; Hertel, Christina; Rothe, Mike; Remm, Anu; Pihlap, Maire; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Peet, Aleksandr; Meloni, Antonella; Podkrajsek, Katarina Trebusak; Battelino, Tadej; Bruserud, Øyvind; Wolff, Anette S B; Husebye, Eystein S; Kluger, Nicolas; Krohn, Kai; Ranki, Annamari; Peterson, Hedi; Hayday, Adrian ... Peterson, Pärt (2017). Autoantibody Repertoire in APECED Patients Targets Two Distinct Subgroups of Proteins. Frontiers in Immunology, 8, 976−976.10.3389/fimmu.2017.00976.
1.1.
2017
Ottas, Aigar; Fishman, Dmytro; Okas, Tiia-Linda; Pussa, Tonu; Toomik, Peeter; Martson, Aare; Kingo, Kulli; Soomets, Ursel (2017).

Blood serum metabolome of atopic dermatitis: Altered energy cycle and the markers of systemic inflammation

. PLoS ONE, 12 (11), ARTN e0188580.10.1371/journal.pone.0188580.
1.2.
2017
Jones, William; Alasoo, Kaur; Fishman, Dmytro; Parts, Leopold (2017). Computational biology: deep learning. Emerging Topics in Life Sciences, 1 (3), 257−274. DOI: 10.1042/ETLS20160025.
1.1.
2016
Meyer, Steffen; Woodward, Martin; Hertel, Christina; Vlaicu, Philip; Haque, Yasmin; Kärner, Jaanika; Macagno, Annalisa; Onuoha, Shimobi C; Fishman, Dmytro; Peterson, Hedi; Metsküla, Kaja; Uibo, Raivo; Jäntti, Kirsi; Hokynar, Kati; Wolff, Anette S B; ,; Krohn, Kai; Ranki, Annamari; Peterson, Pärt; Kisand, Kai ... Hayday, Adrian (2016). AIRE-Deficient Patients Harbor Unique High-Affinity Disease-Ameliorating Autoantibodies. Cell, 166 (3), 582−595.10.1016/j.cell.2016.06.024.
4.01.2021

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
Lihtotsing Tühjenda
  • Leitud 10 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
PRGPRG1095Algoritmid ja tehisintellekt digitaalsete terviseandmete analüüsis01.01.202131.12.2021Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut257 125,00 EUR
IUTIUT34-4Andmeteaduse meetodid ja rakendused (DSMA)01.01.201531.12.2020Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut699 600,00 EUR
PSGPSG59Arvutuslik analüüs ja teadmised bioloogilistest andmetest (OmicNet)01.01.201831.03.2021Hedi PetersonTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut246 375,00 EUR
1.1.5.3.4.1.3.2.; 1.1.5.3.4.1.3.2.7.SLTAT18292T (MOBERA10)Diagnostilised ja prognostilised markerid emakakeha vähile (BioEndoCar)01.05.201830.04.2021Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut144 200,00 EUR
1.1.5.3.4.1.2.SLTAT16431TEesti eluteaduste andmete teadustaristu01.03.201631.08.2022Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut987 282,88 EUR
2.1.1.LLTAT19380 Isejuhtivate sõidukite labori arendamine 4. taseme autonoomsuse tehnoloogia rakendusuuringuteks27.05.201930.06.2021Anne JäägerTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut1 201 000,00 EUR
TKAlamprojektTAR16013 (EXCITE) (TK148)IT Tippkeskus EXCITE01.09.201601.03.2023Maarja KruusmaaTallinna Tehnikaülikool, Infotehnoloogia teaduskond, Biorobootika keskus; Cybernetica AS2 121 014,65 EUR
TKSLTAT16148T (TK148)IT Tippkeskus EXCITE (TK148)01.01.201601.03.2023Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut1 446 840,73 EUR
SFSF0180008s12Kaasaegsed teadusarvutuste meetodid, platvormid ja rakendused. 01.01.201231.12.2014Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond306 870,00 EUR
2.2.1.VLTAT20457PerkinElmer 2020-2021 Süvaneurovõrkude kasutamine rakupiltide analüüsis01.08.202031.07.2021Leopold PartsTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut100 000,00 EUR