Janne Pullat

https://www.etis.ee/CV/Janne_Pullat/est
16.04.1974
jpullat@gmail.com

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.03.2016–31.12.2017   
Labema Eesti OÜ, Scientific Liaison Manager (1,00)
08.11.2010–01.02.2016   
InBio OÜ, BD Biosciences Tootejuht (1,00)
01.01.2010–31.12.2010   
Florida Ülikool, Järeldoktorantuur
01.01.2008–31.01.2009   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu, erakorraline teadur (1,00)
01.01.2008–31.12.2010   
IREK Mikrobioloogia lektor
01.01.2004–31.12.2006   
Saksa Vähiuuringute Insituut, Külalisteadur
2002–2007   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (0,50)
01.01.2002–31.12.2003   
Saksa Vähiuuringute Instituut, Külalisteadur
2001–2002   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (1,00)
1998–2001   
Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond, Füüsikalise keemia instituut, Elektrokeemia õppetool, Laborant (1,00)
 
 
Haridustee
2002–2008   
Tartu Ülikool, Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, PhD
1998–2000   
Tartu Ülikool, Keemia Osakond, Füüsikalise ja Elektrokeemia Instituut, M. Sc
1997–1998   
Tartu Ülikool, Õpetajakoolitus, Gümnaasiumi ja põhikooli keemia õpetaja
1993–1998   
Tartu Ülikool, Keemia osakond, Füüsikalise ja elektrokeemia Instituut, Bakalaureus
1988–1992   
Valga Gümnaasium
1981–1988   
Kohtla-Järve 1. Keskkool
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2011−2014   
Eesti FACS kasutajate kursuse „Advances in flow cytometry“ korraldamine (18-19.Mai 2011)
2009−2010   
TalveAkadeemia 2009 teadusartiklite konkursi hindamise komisjoni liige (Loodusteadused ja tehnika)

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Janne Pullat, doktorikraad, 2008, (juh) Andres Metspalu, Design, functionalization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray (in situ sünteesitud oligonukleotiidide mikrokiibi disain, funktsionaliseerimine ja rakendamine), Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut.
Janne Pullat, magistrikraad (teaduskraad), 2000, (juh) Heldur Keis, Plii(II)ioonide ja polükarboksüülhapete vahelise komplekseerumisreaktsiooni tasakaalu uurimine, Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2003, Janne Pullat, Euroopa Teadusfondi Funktsionaalse genoomika programmi reisistipendium
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; PÕHISUUND: Oligonukleotiidel põhineva in situ sünteesitud DNA kiibi disain ja funktsionaliseerimine
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.11. Keemia ja keemiatehnika

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2012
Nürnberg, ST.; Rendon, A.; Smethurst, PA.; Paul, DS.; Voss, K.; Thon, JN.; Lloyd-Jones, H.; Sambrook, JG.; Tijssen, MR.; Gieger, C.; Radhakrishnan, A.; Cvejic, A.; Tang, W.; Porcu, E.; Pistis, G.; Serbanovic-Canic, J.; Elling, U.; Goodall, AH.; Labrune, Y.; Lopez, LM. ... Ouwehand, W. (2012). A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM3 promoter in megakaryocytes near a MEIS1 binding site. Blood, 120 (24), 4859−4868.10.1182/blood-2012-01-401893.
1.1.
2011
Gieger, C; Radhakrishnan, A; Cvejic, A; Tang, WH; Porcu, E; Pistis, G; Serbanovic-Canic, J; Elling, U; Goodall, AH; Labrune, Y; Lopez, LM; Magi, R; Meacham, S; Okada, Y; Pirastu, N; Sorice, R; Teumer, A; Voss, K; Zhang, WH; Ramirez-Solis, R ... Soranzo, N (2011). New gene functions in megakaryopoiesis and platelet formation. Nature, 480 (7376), 201−208.
1.1.
2010
Allik, J.; Realo, A.; Mõttus, R.; Esko, T.; Pullat, J.; Metspalu, A. (2010). Variance Determines Self-Observer Agreement on the Big Five Personality Traits. Journal of Research in Personality, 44 (4), 421−426.10.1016/j.jrp.2010.04.005.
3.1.
2009
Tõnisson, Neeme; Oitmaa, Eneli; Krjutskov, Kaarel; Pullat, Janne; Lind, Ilona; Leego, Merike; Kurg, Ants; Metspalu, Andres. (2009). Arrayed primer extension microarrays for molecular diagnostics. In: MOLECULAR DIAGNOSTICS 2nd edition (267−284).. Elsevier.
1.1.
2008
Pullat, J.; Kusnezow, W.; Jaakson, K.; Beier, M.; Hoheisel, J.; Metspalu, A. (2008). Arrayed Primer Extension on in situ Synthesized 5'→3' Oligonucleotides in Microchannels. New Biotechnology, 25, 133−141.10.1016/j.nbt.2008.08.001.
2.3.
2008
Pullat, Janne (2008). Design, functionlization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray. (Tartu Ülikool). Tartu: Tartu Ülikooli Kirjastus.
2.3.
2008
Pullat, J. (2008). Design, functionlization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray [Võrguteavik]. (Doktoritöö). Tartu: Tartu Ülikool.
3.1.
2008
Pullat, J.; Metspalu, A. (2008). Arrayed primer extension reaction for genotyping on oligonucleotide microarray. In: Hahn, S.; Jackson, L.G. (_EditorsAbbr). Prenatal Diagnosis 435 (161−167).. Humana Press.
5.2.
2008
Pullat, J.; Beier, M.; Hoheisel, J.; Metspalu, A. (2008). In situ Synthesised Oligonucleotide Microarray for Mutational Analysis and Genotyping of DNA. Genetics - Understanding Living Systems: XX International Congress of Genetics; Berlin, Germany; July 12-17, 2008. 295−295.
1.1.
2007
Pullat, J.; Fleisher, R.; Becker, N.; Beier, M.; Metspalu, A.; Hoheisel, J.D. (2007). Optimization of candidate-gene SNP-genotyping by flexible oligonucleotide microarrays; analyzing variations in immune regulator genes of hay-fever samples. BMC Genomics, 17 (8), 282−294.
1.2.
2007
Schliwka, Julia; Pullat, Janne, Devilliers, Ethel-Michelle; Hoheisel, Jörg D.; Beier, Markus (2007). Mit der Geniom Microarray-Technologie HPV-Genotypen auf der Spur. BIOspektrum, 52−53.
5.2.
2007
Pullat, J., Kusnezow, W., Hoheisel, J.D., Metspalu, A. (2007). in situ synthesized oligonucleotide microarray for mutational analysis and genotyping of the DNA. 30th Estonian Chemistry Days. _EditorsAbbr A. Rinken, K. Laiduner. Tartu Ülikooli Kirjastus, 121−122.
5.1.
2006
Pullat, Janne; Schanne, Michaela ; Moskalyov, Evgenij; Tonisson, Neeme; Beier, Verena and Hoheisel, Jörg D. (2006). Genotyping analyses; from typing human papilloma virus samples to large-scale epigenetic studies. CNIO Workshop on SNPs INT:CNIO SYMP MolecularMarkers INT: CNIO Meeting IIWorkshop on SNPs analysis, tools and applications. _EditorsAbbr Mercedes Robledo, Joaquín Dopazo, Javier Benítez. 14.
5.1.
2004
Pullat, Janne; Beier, Markus; Dahms, Michael; deVilliers, Ethel; Hoheisel, Jörg (2004). Simultaneous typing of HPV strains by microarray analysis. 10. 1124.
1.1.
2003
Bauer, A.; Beckmann, B.; Busold, C.; Brandt, O.; Kusnezow, W.; Pullat, J.; Aign, V.; Fellenberg, K.; Fleischer, R.; Jacob, A.; Frohme, M.; Hoheisel, J.D. (2003). Use of complex DNA- and antibody-microarrays as tools in functional analyses. Comparative and Functional Genomics, 4, 520−524.
1.2.
2000
Keis, Heldur; Kruusma, Jaanus; Pullat, Janne (2000). Polarography and stripping voltammetry of lead-polycarboxylate complexes on dropping mercury and rotating disc electrodes. Proceedings of the Estonian Academy of Sciences. Chemistry, 156−167.
6.7.
2000
Pullat, J. (2000). Plii(II)ioonide ja polükarboksüülhapete vahelise komplekseerumisreaktsiooni tasakaalu uurimine : magistritöö füüsikalisest keemiast ja elektrokeemiast. (Tartu Ülikool; Füüsikalise keemia instituut ). Tartu,: Tartu Ülikool.
5.2.
1999
Keis, H.; Kruusma, J.; Pullat, J. (1999). Polarography and stripping voltammetry of lead-polycarboxylate complexes on mercury drop and roating disc electrodes. Abstracts of 50th Annual Meeting of ISE. Pavia, 818.
5.2.
1999
Keis, H.; Kruusma, J.; Pullat, J. (1999). Polarography and stripping voltammetry of metal- polycarboxylate complexes on mercury drop and rotating disc electrodes. Abstracts of the Baltic Conference on Electrochemistry. Palanga, 77.

Tööstusomand

18.04.2019

Janne Pullat

https://www.etis.ee/CV/Janne_Pullat/eng
16.04.1974
jpullat@gmail.com
http://

Career

Institution(s) and position(s)
01.03.2016–31.12.2017   
Labema Estonia Ltd., Scientific Liaison Manager (1,00)
08.11.2010–01.02.2016   
Inbio, BD Biosciences Product Manager (1,00)
01.01.2010–31.12.2010   
University of Florida, Postdoc
01.01.2008–31.01.2009   
University of Tartu, Estonian Genome Center , Research Fellow extraordinarius (1,00)
01.01.2008–31.12.2010   
IREK Lecturer of Microbiology
01.01.2004–31.12.2006   
German Cancer Research Center, Functional Genome Analysis, Visiting Scientist
2002–2007   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (0,50)
01.01.2002–31.12.2003   
German Cancer Research Center, Functional Genome Analysis, Visiting Scientist
2001–2002   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (1,00)
1998–2001   
University of Tartu, Faculty of Physics and Chemistry, Institute of Physical Chemistry, Chair of Electrochemistry, Lab Assistant (1,00)
 
 
Education
2002–2008   
Molecular and cell Biology, University of Tartu, Estonia, PhD in Biotechnology
1998–2000   
M.Sc in Physical and Electrochemistry, Faculty of Chemistry, University of Tartu, Estonia
1997–1998   
Chemistry Teacher, Faculty of Chemistry, University of Tartu, Estonia
1993–1998   
B.Sc in Physical and Electrochemistry, Faculty of Chemistry, University of Tartu, Estonia
1988–1992   
Valga Gymnasium, Estonia
1981–1988   
Kohtla-Järve Secondary School No. 1, Estonia
 
 
R&D related managerial and administrative work
2011−2014   
Orginising an Estonian FACS users meeting „Advances in flow cytometry“ (May 18-19, 2011)
2009−2010   
WinterAcademy 2009 member of the comission of scientific publications

Qualifications

Academic degrees
Janne Pullat, Doctor's Degree, 2008, (sup) Andres Metspalu, Design, functionalization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray, University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu.
Janne Pullat, Research Master's Degree, 2000, (sup) Heldur Keis, Plii(II)ioonide ja polükarboksüülhapete vahelise komplekseerumisreaktsiooni tasakaalu uurimine (Investigation of stability of the Lead(II)-polymetacrylic acid ligand system), University of Tartu, Faculty of Physics and Chemistry.
 
 
Honours & awards
2003, Janne Pullat, European Science Foundation Functional Genome fellowship
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.11. Chemistry and Chemical Technology
 
 

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2012
Nürnberg, ST.; Rendon, A.; Smethurst, PA.; Paul, DS.; Voss, K.; Thon, JN.; Lloyd-Jones, H.; Sambrook, JG.; Tijssen, MR.; Gieger, C.; Radhakrishnan, A.; Cvejic, A.; Tang, W.; Porcu, E.; Pistis, G.; Serbanovic-Canic, J.; Elling, U.; Goodall, AH.; Labrune, Y.; Lopez, LM. ... Ouwehand, W. (2012). A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM3 promoter in megakaryocytes near a MEIS1 binding site. Blood, 120 (24), 4859−4868.10.1182/blood-2012-01-401893.
1.1.
2011
Gieger, C; Radhakrishnan, A; Cvejic, A; Tang, WH; Porcu, E; Pistis, G; Serbanovic-Canic, J; Elling, U; Goodall, AH; Labrune, Y; Lopez, LM; Magi, R; Meacham, S; Okada, Y; Pirastu, N; Sorice, R; Teumer, A; Voss, K; Zhang, WH; Ramirez-Solis, R ... Soranzo, N (2011). New gene functions in megakaryopoiesis and platelet formation. Nature, 480 (7376), 201−208.
1.1.
2010
Allik, J.; Realo, A.; Mõttus, R.; Esko, T.; Pullat, J.; Metspalu, A. (2010). Variance Determines Self-Observer Agreement on the Big Five Personality Traits. Journal of Research in Personality, 44 (4), 421−426.10.1016/j.jrp.2010.04.005.
3.1.
2009
Tõnisson, Neeme; Oitmaa, Eneli; Krjutskov, Kaarel; Pullat, Janne; Lind, Ilona; Leego, Merike; Kurg, Ants; Metspalu, Andres. (2009). Arrayed primer extension microarrays for molecular diagnostics. In: MOLECULAR DIAGNOSTICS 2nd edition (267−284).. Elsevier.
1.1.
2008
Pullat, J.; Kusnezow, W.; Jaakson, K.; Beier, M.; Hoheisel, J.; Metspalu, A. (2008). Arrayed Primer Extension on in situ Synthesized 5'→3' Oligonucleotides in Microchannels. New Biotechnology, 25, 133−141.10.1016/j.nbt.2008.08.001.
2.3.
2008
Pullat, Janne (2008). Design, functionlization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray. (Tartu Ülikool). Tartu: Tartu Ülikooli Kirjastus.
2.3.
2008
Pullat, J. (2008). Design, functionlization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray [Võrguteavik]. (Doktoritöö). Tartu: Tartu Ülikool.
3.1.
2008
Pullat, J.; Metspalu, A. (2008). Arrayed primer extension reaction for genotyping on oligonucleotide microarray. In: Hahn, S.; Jackson, L.G. (_EditorsAbbr). Prenatal Diagnosis 435 (161−167).. Humana Press.
5.2.
2008
Pullat, J.; Beier, M.; Hoheisel, J.; Metspalu, A. (2008). In situ Synthesised Oligonucleotide Microarray for Mutational Analysis and Genotyping of DNA. Genetics - Understanding Living Systems: XX International Congress of Genetics; Berlin, Germany; July 12-17, 2008. 295−295.
1.1.
2007
Pullat, J.; Fleisher, R.; Becker, N.; Beier, M.; Metspalu, A.; Hoheisel, J.D. (2007). Optimization of candidate-gene SNP-genotyping by flexible oligonucleotide microarrays; analyzing variations in immune regulator genes of hay-fever samples. BMC Genomics, 17 (8), 282−294.
1.2.
2007
Schliwka, Julia; Pullat, Janne, Devilliers, Ethel-Michelle; Hoheisel, Jörg D.; Beier, Markus (2007). Mit der Geniom Microarray-Technologie HPV-Genotypen auf der Spur. BIOspektrum, 52−53.
5.2.
2007
Pullat, J., Kusnezow, W., Hoheisel, J.D., Metspalu, A. (2007). in situ synthesized oligonucleotide microarray for mutational analysis and genotyping of the DNA. 30th Estonian Chemistry Days. _EditorsAbbr A. Rinken, K. Laiduner. Tartu Ülikooli Kirjastus, 121−122.
5.1.
2006
Pullat, Janne; Schanne, Michaela ; Moskalyov, Evgenij; Tonisson, Neeme; Beier, Verena and Hoheisel, Jörg D. (2006). Genotyping analyses; from typing human papilloma virus samples to large-scale epigenetic studies. CNIO Workshop on SNPs INT:CNIO SYMP MolecularMarkers INT: CNIO Meeting IIWorkshop on SNPs analysis, tools and applications. _EditorsAbbr Mercedes Robledo, Joaquín Dopazo, Javier Benítez. 14.
5.1.
2004
Pullat, Janne; Beier, Markus; Dahms, Michael; deVilliers, Ethel; Hoheisel, Jörg (2004). Simultaneous typing of HPV strains by microarray analysis. 10. 1124.
1.1.
2003
Bauer, A.; Beckmann, B.; Busold, C.; Brandt, O.; Kusnezow, W.; Pullat, J.; Aign, V.; Fellenberg, K.; Fleischer, R.; Jacob, A.; Frohme, M.; Hoheisel, J.D. (2003). Use of complex DNA- and antibody-microarrays as tools in functional analyses. Comparative and Functional Genomics, 4, 520−524.
1.2.
2000
Keis, Heldur; Kruusma, Jaanus; Pullat, Janne (2000). Polarography and stripping voltammetry of lead-polycarboxylate complexes on dropping mercury and rotating disc electrodes. Proceedings of the Estonian Academy of Sciences. Chemistry, 156−167.
6.7.
2000
Pullat, J. (2000). Plii(II)ioonide ja polükarboksüülhapete vahelise komplekseerumisreaktsiooni tasakaalu uurimine : magistritöö füüsikalisest keemiast ja elektrokeemiast. (Tartu Ülikool; Füüsikalise keemia instituut ). Tartu,: Tartu Ülikool.
5.2.
1999
Keis, H.; Kruusma, J.; Pullat, J. (1999). Polarography and stripping voltammetry of lead-polycarboxylate complexes on mercury drop and roating disc electrodes. Abstracts of 50th Annual Meeting of ISE. Pavia, 818.
5.2.
1999
Keis, H.; Kruusma, J.; Pullat, J. (1999). Polarography and stripping voltammetry of metal- polycarboxylate complexes on mercury drop and rotating disc electrodes. Abstracts of the Baltic Conference on Electrochemistry. Palanga, 77.

Industrial property

18.04.2019
Detailne otsing
  • Leitud 4 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
SFSF0180142Cs08Geneetiline varieeruvus, elustiil ja keskkonnategurid kui peamised tervise mõjurid - EGV01.01.200831.12.2013Andres MetspaluTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu459 958,57 EUR
SFSF0182582Bs03Inimese Genoom II01.01.200331.12.2007Andres MetspaluEesti Biokeskus354 581,83 EUR
SFSF0182582As03Inimese Genoom II01.01.200331.12.2007Andres MetspaluTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond328 505,88 EUR
ETFETF5467Uue DNA diagnostika tehnoloogia väljatöötamine inimese kromosoomide struktuursete aberratsioonide tuvastamiseks vaimse alaarengu korral 01.01.200331.12.2006Ants KurgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond51 656,40 EUR