15.01.1984
kaspar.valgepea@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.03.2019–31.08.2023   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, gaasfermentatsiooni tehnoloogiate vanemteadur (1,00)
01.09.2018–28.02.2019   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, sünteetilise bioloogia teadur (1,00)
2015–2018   
The University of Queensland, Brisbane, Austraalia, Järeldoktor (1,00)
2013–2015   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Teadur (1,00)
2012–2013   
Genomatica, Inc., San Diego, Ameerika Ühendriigid, Külalisteadlane (1,00)
2008–2012   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Teadur (1,00)
2006–2007   
Eesti Kaitsevägi, Kohustuslik ajateenistus (1,00)
2005–2006   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Teadur (1,00)
 
 
Haridustee
2010–2014   
Dokorantuur (PhD), Tallinna Tehnikaülikool, keemia ja geenitehnoloogia
2008–2010   
Magistrantuur (MSc cum laude), Tallinna Tehnikaülikool, rakenduskeemia ja biotehnoloogia eriala
2007–2008   
Magistri taseme tudeng, University of Electro-Communications, Tokyo, Jaapan
2003–2006   
Bakalaureuse õpingud (BSc), Tallinna Tehnikaülikool, rakenduskeemia ja biotehnoloogia eriala
2000–2003   
Gustav Adolfi Gümnaasium
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2019−...   
Lektor "Applied Synthetic Biology", Tartu Ülikool
2018−...   
Lektor "Molecular Systems Biology", Tartu Ülikool
2011−...   
Mendeley Adviser
2018−2018   
Lektor "Biomolekulaarne inseneerimine", The University of Queensland
2016−2018   
Australian Institute for Bioengineering and Nanotechnology (AIBN) Ambassador
2011−2011   
Süsteemide bioloogia loengukursuse "Microbial Growth and Physiology" organiseerija, TFTAK, Eesti
2010−2010   
Lektor ja praktikumide juhendaja "Fermentatsiooni erikursus", Tallinna Tehnikaülikool
 
 
Loometöö
SUULISED ETTEKANDED
2019 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" konverentsil "Biological Solutions for the Global CO2 Challenge", Heidelberg, Saksamaa
2018 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" konverentsil "Clostridium XV", Freising, Saksamaa
2018 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" kursusel "Bioengineering Platforms", Heron Island, Austraalia
2017 - "Capturing waste carbon using gas fermentation" konverentsil "Brisbane Life Sciences Symposium", Brisbane, Austraalia
2017 - Keynote ettekanne "Systems biology of acetogen gas fermentation" konverentsil "2017 International Conference on BioNano Innovation", Brisbane, Austraalia
2016 - "Understanding energetics in a syngas fermenting bacterium" kursusel "Gas Fermentation Workshop", Heron Island, Austraalia
2012 - "Absolute quantitative triple-omics analyses reveals that Escherichia coli achieves faster growth by increasing catalytic activities of enzymes and translation rate" konverentsil "Microbial Stress: from Molecules to Systems", Belgirate, Itaalia
2010 - "Systems biology approach reveals that overflow metabolism of acetate in Escherichia coli is triggered by carbon catabolite repression of acetyl-CoA synthetase" sümpoosiumil "2010 Symposium of the DSM", Kopenhaagen, Taani
2009 - "Growth rate dependent acetate metabolism characterization in Escherichia coli continuous cultures" konverentsil "Recent Advances in Fermentation Technology VIII", San Diego, USA
2008 - "Thermus thermophilus gene expression changes in different growth rates" JUSST konverentsil, Tokyo, Jaapan

KURSUSED
2019 - "EMBO Laboratory Leadership for Group Leaders", Heidelberg, Saksamaa
2017 - "Uniquest Research Commercialisation Workshop", The University of Queensland, Austraalia
2016 - "UQ Early-Career Academic Development Program", The University of Queensland, Austraalia
2016 - "Gas Fermentation Workshop", The University of Queensland, Austraalia
2016 - "Workshops on Scientific Publishing, Grant Writing and Supervision", The University of Queensland, Austraalia
2013 - “Advanced Course on Metabolic Engineering and Systems Biology”, Chalmers University of Technology, Rootsi
2012 - “Advanced Course on Microbial Physiology and Fermentation Technology”, Delft University of Technology, Holland
2011 - “FEBS-SystemsX Advanced Lecture Course on Systems Biology”, Innsbruck, Austria
2009 - “Flow Cytometry course”, University of York, Suurbritannia.
 
 
Teenistuskäigu lisainfo
09.2015 - Praktika LanzaTech Inc'is, Skokie, Ameerika Ühendriigid;
2012-2013 - Praktika külalisteadlasena, Genomatica Inc, San Diego, Ameerika Ühendriigid;
11.2010 - Praktika Süsteemide Bioloogia Instituudis, Taani Tehnikaülikool, Taani;
2007 - 2008 Magistri taseme uurimustöö,The University of Electro-Communications, Tokyo, Jaapan;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2017, Kaspar Valgepea, Ametikõrgendus "Academic Level B" tasemele, The University of Queensland, Brisbane, Austraalia
2014, Kaspar Valgepea, Peapreemia üliõpilaste riikliku teadustööde konkurssil, doktoriõppe aste
2012, Kaspar Valgepea, "Baltic-American Freedom Foundation Professional Internship Program" stipendium
2011, Kaspar Valgepea, Artur Linnu nimeline stipendium, Sihtasutuse Geenikeskus
2010, Kaspar Valgepea, II preemia üliõpilaste riikliku teadustööde konkurssi bio- ja keskkonnateaduste valdkonnas, magistriõppe aste
2010, Kaspar Valgepea, III preemia TTÜ tudengite teadustööde konkurssi loodusteaduste valdkonnas, magistriõppe aste
2009, Kaspar Valgepea, Jaan Poska stipendium
2007, Kaspar Valgepea, Kristjan Jaagu stipendium
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika); CERCS ERIALA: T490 Biotehnoloogia ; PÕHISUUND: Mikroobse metabolismi terve-raku tasemel mõistmine ning modifitseerimine läbi süsteemide bioloogia

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2015
1.1.
2015
1.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
11.06.2019
15.01.1984
kaspar.valgepea@ut.ee

Career

Institution(s) and position(s)
01.03.2019–31.08.2023   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Senior Research Fellow in Gas Fermentation Technologies (1,00)
01.09.2018–28.02.2019   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Research Fellow in Synthetic Biology (1,00)
2015–2018   
The University of Queensland, Brisbane, Australia, Post-Doc (1,00)
2013–2015   
Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (1,00)
2012–2013   
Genomatica, Inc., San Diego, USA, Visiting Scholar (1,00)
2008–2012   
Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (1,00)
2006–2007   
Estonian Defense Forces, Mandatory military service (1,00)
2005–2006   
Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (1,00)
 
 
Education
2010–2014   
PhD studies (PhD), Tallinn University of Technology, Chemistry and Gene Technology
2008–2010   
Master studies (MSc cum laude), Tallinn University of Technology, Applied Chemistry and Biotechnology
2007–2008   
Master's level research student, University of Electro-Communications, Tokyo, Japan
2003–2006   
Bachelor studies (BSc), Tallinn University of Technology, Applied Chemistry and Biotechnology
2000–2003   
Gustav Adolf Grammar School
 
 
R&D related managerial and administrative work
2019−...   
Lecturer "Applied Synthetic Biology", University of Tartu
2018−...   
Lecturer "Molecular Systems Biology", University of Tartu
2011−...   
Mendeley Adviser
2018−2018   
Lecturer "Biomolecular engineering", The University of Queensland
2016−2018   
Australian Institute for Bioengineering and Nanotechnology (AIBN) Ambassador
2011−2011   
Organizer of Systems Biology lecture course “Microbial Growth and Physiology”, CCFFT, Estonia
2010−2010   
Lecturer and practical course advisor of “Advanced Microbial Fermentation Technologies”, Tallinn University of Technology
 
 
Creative work
ORAL PRESENTATIONS
2019 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" at the conference "Biological Solutions for the Global CO2 Challenge", Heidelberg, Germany
2018 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" at the conference "Clostridium XV", Freising, Germany
2018 - "Systems biology of acetogen gas fermentation" at the workshop "Bioengineering Platforms", Heron Island, Australia
2017 - "Capturing waste carbon using gas fermentation" at the conference "Brisbane Life Sciences Symposium", Brisbane, Australia
2017 - Keynote speaker "Systems biology of acetogen gas fermentation" at the conference "2017 International Conference on BioNano Innovation", Brisbane, Australia
2016 - "Understanding energetics in a syngas fermenting bacterium" at the "Gas Fermentation Workshop", Heron Island, Australia
2012 - "Absolute quantitative triple-omics analyses reveals that Escherichia coli achieves faster growth by increasing catalytic activities of enzymes and translation rate" at the conference "Microbial Stress: from Molecules to Systems", Belgirate, Italy
2010 - "Systems biology approach reveals that overflow metabolism of acetate in Escherichia coli is triggered by carbon catabolite repression of acetyl-CoA synthetase" at "2010 Symposium of The DSM", Copenhagen, Denmark
2009 - "Growth rate dependent acetate metabolism characterization in Escherichia coli continuous cultures" at the conference "Recent Advances in Fermentation Technology VIII", San Diego, USA
2008 - "Thermus thermophilus gene expression changes in different growth rates" at the JUSST Conference, Tokyo, Japan

COURSES
2019 - "EMBO Laboratory Leadership for Group Leaders", Heidelberg, Germany
2017 - "Uniquest Research Commercialisation Workshop", The University of Queensland, Australia
2016 - "UQ Early-Career Academic Development Program", The University of Queensland, Australia
2016 - "Gas Fermentation Workshop", The University of Queensland, Australia
2016 - "Workshops on Scientific Publishing, Grant Writing and Supervision", The University of Queensland, Australia
2013 - “Advanced Course on Metabolic Engineering and Systems Biology”, Chalmers University of Technology, Sweden
2012 - “Advanced Course on Microbial Physiology and Fermentation Technology”, Delft University of Technology, The Netherlands
2011 - “FEBS-SystemsX Advanced Lecture Course on Systems Biology”, Innsbruck, Austria
2009 - “Flow Cytometry course”, University of York, United Kingdom.
 
 
Additional career information
09.2015 - Internship at LanzaTech Inc., Skokie, USA;
2012-2013 - Professional Internship as a Visiting Scholar, Genomatica Inc, San Diego, USA;
11.2010 - Internship at the Systems Biology Institute, Technical University of Denmark, Denmark ;
2007 - 2008 Master's level research, The University of Electro-Communications, Tokyo, Japan;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2017, Kaspar Valgepea, Promotion to Academic Level B, The University of Queensland, Brisbane, Australia
2014, Kaspar Valgepea, Grand Prize in Estonian National Students Contest of Research, PhD level
2012, Kaspar Valgepea, Baltic-American Freedom Foundation Professional Internship Program Scholarship
2011, Kaspar Valgepea, Artur Lind Scholarship, Estonian Genome Centre Foundation
2010, Kaspar Valgepea, 2nd prize in Bio- and Environmental Sciences, Estonian National Students Contest of Research, MSc level
2010, Kaspar Valgepea, 3rd prize in Life Sciences, Tallinn University of Technology Students Contest of Research, MSc level
2009, Kaspar Valgepea, Jaan Poska Scholarship
2007, Kaspar Valgepea, Kristjan Jaak Scholarship
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering; CERCS SPECIALITY: T490 Biotechnology ; SPECIALITY: Whole-cell understanding and engineering of microbial metabolism through systems biology
 
 

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2015
1.1.
2015
1.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
11.06.2019
  • Leitud 14 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
MOBTPMOBTP111Atsetogeense gaasfermentatsiooni CO2-e fikseerimise süsteemide bioloogiline kvantifitseerimine 01.04.201931.03.2021Kaspar ValgepeaTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut86 117,20 EUR
ETFETF8165Escherichia coli atsetaadi metabolismi kvantitatiivne kirjeldamine bioprotsesside optimeerimiseks, kasutades aktselerostaatseid paralleelkultivatsioonisüsteeme01.01.201031.12.2013Kaarel AdambergTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond49 084,64 EUR
RITA1AlamprojektLLTKT19190 (RITA1/02-20-03)Kliimamuutuste leevendamine läbi CCS ja CCU tehnoloogiate 01.04.201931.03.2021Gunnar NurkTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, keemia instituut105 388,68 EUR
ETFETF9192Oomikameetodite arendamine bakterite kvantitatiivsete süsteemibioloogiliste uuringute jaoks01.01.201231.12.2015Raivo ViluTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond57 600,00 EUR
MUUAR11122Piimhappebakterite süsteemibioloogiline disain01.09.201131.08.2014Raivo ViluTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Biotehnoloogia õppetool389 037,69 EUR
MUUEU29994Support for Competence Center of Food and Fermentation Technologies01.01.200930.06.2015Raivo Vilu; Toomas Paalme; Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus7 028 458,00 EUR
PSGPSG289Suureskaalaline gaasi-fermenteerivate atsetogeenide genotüüp-fenotüüp seoste süsteemidebioloogiline kvantifitseerimine01.01.201931.12.2022Kaspar ValgepeaTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut81 250,00 EUR
IUTIUT19-27Süsteemibioloogia rakendused toituteaduses ja -tehnoloogias01.01.201431.12.2019Toomas PaalmeTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond; Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut852 000,00 EUR
SFSF0140090s08Toidu süsteemibioloogia ja füüsika01.01.200831.12.2013Toomas PaalmeTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond705 093,40 EUR
MUUEU27607Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus01.11.200730.06.2008Raivo Vilu; Toomas Paalme; Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus657 826,17 EUR
MUUEU28668Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus01.07.200830.06.2009Toomas Paalme; Raivo Vilu; Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus903 909,35 EUR
MUUEU48667Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus01.07.201530.06.2022Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus5 697 954,91 EUR
MUUEU22704Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus27.10.200531.10.2007Raivo Vilu; Toomas Paalme; Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus1 725 043,14 EUR
MUUEU19691Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus27.10.200426.10.2005Raivo Vilu; Toomas Paalme; Urmas SannikAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus338 077,35 EUR