Kristjan Välk

https://www.etis.ee/CV/Kristjan_Välk/est
30.08.1980
+372 53412722
kvalk@hot.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2012–31.12.2015   
Bergeni Ülikool, järeldoktorantuur
2010–2012   
Reproduktiivmeditsiini ja -bioloogia Tehnoloogia Arenduskeskuse AS, Teadur (1,00)
01.01.2007–31.12.2009   
Asper Biotech, Teadus-arendusjuht
2006–2008   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (0,50)
20.01.2005–19.02.2005   
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, spetsialist (0,10)
 
 
Haridustee
2012–2015   
Järeldoktorantuur (multiformse glioblastoomi alternatiivsed ravimeetodid)
2005–2011   
Tartu Ülikool, molekulaardiagnostika eriala ( Ph.D)
2003–2005   
Tartu Ülikool, geenitehnoloogia eriala ( M.Sc )
1999–2003   
Tartu Ülikool, geenitehnoloogia eriala ( B.Sc )
1988–1999   
Tartu Tamme Gümnaasium1988-1999

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Kristjan Välk, doktorikraad, 2011, (juh) Andres Metspalu, Gene expression profiling and genome-wide association studies of non-small cell lung cancer (Mitteväikerakulise kopsuvähi kogugenoomi geeniekspressiooni- ja assotsiatsiooniuuringud), Tartu Ülikool.
Kristjan Välk, magistrikraad (teaduskraad), 2005, (juh) Ants Kurg; Andres Metspalu, Mitteväikserakulise kopsuvähi diferentsiaalselt ekspresseeruvate geenide analüüs cDNA mikrokiipidel, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2005, Kristjan Välk, European Society of Human Genetics, noore teadlase autasu 2005
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; PÕHISUUND: Molekulaardiagnostika, vähi geneetika, reguloom, biomarkerid
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.1. Biomeditsiin; CERCS ERIALA: B726 Kliiniline bioloogia ; PÕHISUUND: vähkkasvala geeniekspressiooni profiilid, vähkkasvaja geneetika

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2012
Lokk, Kaie; Vooder, Tõnu; Kolde, Raivo; Välk, Kristjan; Võsa, Urmo; Roosipuu, Retlav; Milani, Lili; Fischer, Krista; Koltšina, Marina; Urgard, Egon; Annilo, Tarmo; Metspalu, Andres; Tõnisson, Neeme (2012). Methylation Markers of Early-Stage Non-Small Cell Lung Cancer. PLoS ONE, 7 (6), e39813− .10.1371/journal.pone.0039813.
1.1.
2012
Kazma, Remi; Babron, Marie-Claude; Gaborieau, Valerie; Genin, Emmanuelle; Brennan, Paul; Hung, Rayjean, J.; McLaughlin, John, R.; Krokan, Hans, E.; Elvestad, Maiken, B.; Skorpen, Frank; Anderssen, Endre; Vooder, Tõnu; Välk, Kristjan; Metspalu, Andres; Field, John, K.; Lathrop, Mark; Sarasin, Alain; and Benhamou, Simone;  for the, ILCCO consortium. (2012). Lung cancer and DNA repair genes: multilevel association analysis from the International Lung Cancer Consortium. Carcinogenesis, 33 (5), 1059−1064.10.1093/carcin/bgs116.
1.1.
2011
Võsa, Urmo; Vooder, Tõnu; Kolde, Raivo; Fischer, Krista; Välk, Kristjan; Tõnisson, Neeme; Roosipuu, Retlav; Vilo, Jaak; Metspalu, Andres; Annilo, Tarmo (2011). Identification of miR-374a as a prognostic marker for survival in patients with early-stage nonsmall cell lung cancer. Genes, Chromosomes and Cancer, 50 (10), 812−822.10.1002/gcc.20902.
1.2.
2011
Urgard, E.; Vooder, T.; Võsa, U.; Välk, K.; Liu, M.g; Luo, C.; Hoti, F.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Laine, J.; Frenz, C.M.; Zhang, L.; Metspalu, A. (2011). Metagenes associated with survival in non-small cell lung cancer. Cancer Informatics, 10, 175−183.dx.doi.org/10.4137/CIN.S7135.
5.2.
2011
Kirotar, K.; Vooder, T., Kolde R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2011). Genome-wide methylation profiling of non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 2: European Human Genetics Conference; Amsterdam, Holland; 28.–31. mai, 2011. Nature Publishing Group, 378−378. (19).
5.2.
2011
Välk, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Roosipuu, R.; Vilo, J.; Metspalu, A. (2011). Whole genome gene expression profiling of two control and three subsequent lung cancer samples of the same patient. World Conference on Lung Cancer, Amsterdam, 2011.
1.1.
2010
Välk, Kristjan; Vooder, Tõnu; Kolde, Raivo; Reintam, Mari-Ann; Petzold, Cathleen; Vilo, Jaak; Metspalu, Andres (2010). Gene Expression Profiles of Non-Small Cell Lung Cancer: Survival Prediction and New Biomarkers. Oncology, 79, 283−292.DOI:10.1159/000322116.
1.2.
2010
Vooder, Tõnu; Välk, Kristjan; Kolde, Raivo; Roosipuu, Retlav; Vilo, Jaak; Metspalu, Andres (2010). Gene Expression-Based Approaches in Differentiation of metastases and Second Primary Tumour. Case Reports in Oncology, 3 (2), 255−261.10.1159/000318010.
5.2.
2010
Kirotar, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2010). Methylation markers of early-stage non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 1: European Human Genetics Conference, Göteborg, Rootsi; 12.-15. juuni, 2010. Nature Publishing Group, 276−276. (15).
5.2.
2010
Annilo, Tarmo; Võsa, Urmo; Kolde, Raivo; Välk, Kristjan; Roosipuu, Retlav; Vooder, Tõnu; Metspalu, Andres (2010). Aberrantly expressed microRNAs indicate the pathways potentially associated with non-small cell lung cancer development. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference, Gothenburg, Sweden; June 12-15, 2010. Nature Publishing Group, 182−183. (18; Suppl 1).
1.1.
2009
Landi, MT.; Chatterjee, N.; Yu, K.; Goldin, LR.; Goldstein, AM.; Rotunno, M.; Mirabello, L.; Jacobs, K.; Wheeler, W.; Yeager, M.; Bergen, AW.; Li, Q.; Consonni, D.; Pesatori, AC.; Wacholder, S.; Thun, M.; Diver, R.; Oken, M.; Virtamo, J.; Albanes, D. ... Caporaso, NE (2009). A Genome-wide Association Study of Lung Cancer Identifies a Region of Chromosome 5p15 Associated with Risk for Adenocarcinoma. American Journal of Human Genetics, 85 (5), 679−691.10.1016/j.ajhg.2009.09.012.
5.1.
2009
Vooder, T., Välk, K., Palta ,P., Kolde, R., Metspalu, A. (2009). Parallel comparison of NSCLC CNV, survival and gene expression profiles in Estonian population. Journal of Thoracic Oncology: 13 th World Conference on Lung Cancer; San Francisco, USA; 31.07-04.08.2009. Lippincott Williams & Wilkins, 932−932. (Supplement: Suppl. 1).
5.2.
2009
Kirotar, K.; Kolde, R.; Bure, I.; Solvjova, M.; Vooder, T.; Välk, K.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2009). Methylation changes in p53 pathway in non-small cell lung cancer and their potential association with TP53 mutations. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference, Wienna, Austria; 23.-26. mai, 2009. Nature Publishing Group, 301−301, P11.090. (17; Suppl. 2).
3.4.
2008
Tõnisson, N.; Fellenberg, K.;Kuner, R.; Meister, M.; Vooder, T.; Välk, K.; Kirotar, K.; Metspalu, A.; Hoheisel, J.D. (2008). Combined analysis of altered promotor methylation and gene expression changes in non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, 16: European Human Genetics Conference 2008, Barcelona, Spain. Nature Publishing Group, 406−406. (Supplement; 2).
5.2.
2008
Välk, Kristjan (2008). Discriminatory gene set for adenocarcinoma. Journal of Thoracic Oncology, Vol 3: 1-st International Lung Cancer Conference, Liverpool, 9-11 July 2008. _EditorsAbbr Lippincott Williams and Wilkins. 16522 Hunters Green Parkway, Hagerstown, MD 21740-2116: Lippincott Williams & Wilkins, 235−236. (Nr. 7; Supplement 3).
5.2.
2008
Tõnisson, N.; Fellenberg, K.; Kuner, R.; Meister, M.; Riazalhosseini, Y.; Vooder, T.; Välk, K.; Kirotar, K.; Beier, V.; Metspalu, A.; Hoheisel, J.D. (2008). Identification of altered promoter methylation in non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl. 1: European Human Genetics Conference, Barcelona, 31.05.-3.06.2008. Nature Publishing Group, 316. (15).
3.4.
2006
Välk, Kristjan; Vooder, Tõnu; Petzold, Cathleen; Metspalu, Andres (2006). Data of NSCLC gene expression pilot study. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference 2005, Amsterdam, Netherland, May 6-9, 2006. Nature Publishing Group, 220.
2.3.
2005
Välk, Kristjan (2005). Mitteväikserakulise kopsuvähi diferentsiaalselt ekspresseeruvate geenide analüüs cDNA mikrokiipidel. (Tartu Ülikool). Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut: Tartu Ülikool.
3.4.
2005
Välk, Kristjan; Vooder, Tõnu; Kurg, Ants; Metspalu, Andres (2005). Study of NSCLC gene expression and single nucleotide polymorphism. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference 2005, Prague, Czech Republic, May 7-10, 2005. Nature Publishing Group, 189.
5.2.
2005
Välk, Kristjan; Vooder, Tõnu; Metspalu, Andres (2005). Preliminary data of Non-Small Cell Lung Cancer gene expression pilot study. UNDERSTANDING THE GENOME- Microarray applications from the biology to the clinic, Sheraton Hotel Conference Centre,_Genoa, Italy, 11-13 November 2005.
18.04.2019
Detailne otsing
  • Leitud 5 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF5995Gata3 ja temaga seotud faktorite roll südame arengus01.01.200431.12.2007Raivo RaidTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond30 581,80 EUR
ETFETF7473Geenide ekspressioonimustri, ja staatuse (epigeneetilised muutused, geenivariatsioon, koopiaarvu muutused) uurimine mitteväikserakulise kopsuvähi korral kasvajate molekulaarse klassifitseerimise ning varajase diagnostika ja ravi optimeerimise eesmärg01.01.200831.12.2011Neeme TõnissonTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond71 324,72 EUR
SFSF0180142As08Geneetiline varieeruvus, elustiil ja keskkonnategurid kui peamised tervise mõjurid01.01.200831.12.2013Neeme TõnissonTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut536 490,12 EUR
SFSF0182582As03Inimese Genoom II01.01.200331.12.2007Andres MetspaluTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond328 505,88 EUR
ETFETF6465Mitteväikserakulise kopsuvähi diferentsiaalselt ekspresseeruvate geenide avastamine, kasvajate molekulaarne fenotüpiseerimine varajase diagnostika ja ravistrateegiate optimiseerimiseks01.01.200531.12.2008Andres MetspaluTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond54 948,99 EUR