Mari Sepp

https://www.etis.ee/CV/Mari_Sepp_001/est
6.07.1982
620 4444
mari.sepp@ttu.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
04.01.2015–31.12.2016   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool, TL peatatud (0,50)
24.03.2013–19.10.2014   
Tallinna Tehnikaülikool, Lapsepuhkus (1,00)
01.01.2010–31.12.2016   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool, Teadur (1,00)
2005–31.12.2009   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, insener (1,00)
2004–2005   
Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut, insener (0,25)
01.01.2004–31.12.2004   
Helsingi Ülikool, Biotehnoloogia Instituut
01.01.2003–31.12.2003   
Helsingi Ülikool, Biotehnoloogia Instituut
 
 
Haridustee
2006–2012   
Tallinna Tehnikaülikool, doktorikraad geenitehnoloogias
2004–2006   
Tallinna Tehnikaülikool, loodusteaduste magistri kraad
2000–2004   
Tartu Ülikool; diplom cum laude, B.Sc transgeense tehnoloogia erialal
1997–2000   
Miina Härma Gümnaasium
1988–1997   
Puhja Gümnaasium

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Mari Sepp, doktorikraad, 2012, (juh) Tõnis Timmusk, Functions of the basic-helix-loop-helix transcription factor TCF4 in health and disease (Aluselise heeliks-ling-heeliks transkriptsioonifaktori TCF4 funktsioonid ja seosed haigustega), Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool.
Mari Sepp, magistrikraad (teaduskraad), 2006, (juh) Tõnis Timmusk, Novel Targets Of Huntingtin Revealed By Analysis Of Transcription Factor Subcellular Localization (Transkriptsioonifaktorite rakusisese lokalisatsiooni muutused Huntingtoni tõves), Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2013, Mari Sepp, Aasta teadusartikkel 2012, Tallinna Tehnikaülikool
2012, Mari Sepp, Poster-ettekande auhind Psühhiaatrilise Geneetika kongressil
2012, Mari Sepp, Noorteadlase auhind, väljastaja Geenitehnoloogia instituut, Tallinna Tehnikaülikool
2012, Mari Sepp, Tänukiri Eesti Õpilaste Teadustööde Riiklikul konkursil Jaan Tootsi (I preemia) juhendamise eest
2009, Mari Sepp, Tiina Mõisa doktoriõppe stipendium Tallinna Tehnikaülikooli Arengufondis
2008, Mari Sepp, Tänukiri Eesti Üliõpilaste Teadustööde Riiklikul konkursil Ave Eesmaa (I preemia) juhendamise eest
2005, Mari Sepp, Artur Linnu stipendium; väljastaja Eesti Geenikeskus
2004, Mari Sepp, Noore teadlase auhind, väljastaja Histokeemia Ühing
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; PÕHISUUND: Molekulaarne neurobioloogia
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; CERCS ERIALA: B220 Geneetika, tsütogeneetika
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.1. Biomeditsiin; CERCS ERIALA: B470 Füsioloogia
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B210 Histoloogia, tsütokeemia, histokeemia, koekultuurid
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B220 Geneetika, tsütogeneetika

Jooksvad projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2014
Kannike, K.; Sepp, M.; Zuccato, C.; Cattaneo, E.; Timmusk, T. (2014). Forkhead transcription factor FOXO3a levels are increased in Huntington disease because of overactivated positive autofeedback loop. Journal of Biological Chemistry, 289, 32845−32857.
1.1.
2014
Jaanson, K.; Sepp, M.; Aid-Pavlidis, T.; Timmusk, T. (2014). BAC-based cellular model for screening regulators of BDNF gene transcription. BMC Neuroscience, 15, 75.
6.7.
2013
Sepp, M.; Vihma, H.; Kannike, K.; Pruunsild, P.; Timmusk, T. (2013). Basic helix-loop-helix transcription factor TCF4 is a calcium-dependent transcriptional activator in neurons. Journal of Neuroscience, manuscript.
1.1.
2012
Sepp, M.; Pruunsild, P.; Timmusk, T. (2012). Pitt–Hopkins syndrome-associated mutations in TCF4 lead to variable impairment of the transcription factor function ranging from hypomorphic to dominant-negative effects. Human Molecular Genetics, 2873−2888.
1.1.
2011
Sepp, M.; Kannike, K.; Eesmaa, A.; Urb, M.; Timmusk, T. (2011). Functional diversity of human basic helix-loop-helix transcription factor TCF4 isoforms generated by alternative 5' exon usage and splicing. PLOS ONE, 6, e22138.
1.1.
2011
Pruunsild, P.; Sepp, M.; Orav, E.; Koppel, I.; Timmusk, T. (2011). Identification of cis-elements and transcription factors regulating neuronal activity-dependent transcription of human BDNF gene. Journal of Neuroscience, 31, 3295−3308.
1.1.
2010
Koppel, I.; Aid-Pavlidis, T.; Jaanson, K.; Sepp, M.; Palm, K.; Timmusk, T. (2010). BAC transgenic mice reveal distal cis-regulatory elements governing BDNF gene expression. Genesis, 48, 214−219.
1.1.
2009
Rullinkov, G.; Tamme, R.; Sarapuu, A.; Lauren, J.; Sepp, M.; Palm, K.; Timmusk, T. (2009). Neuralized-2: expression in human and rodents and interaction with Delta-like ligands. Biochemical and Biophysical Research Communications, 389, 420−425.
1.1.
2009
Kairisalo, M.; Korhonen, L.; Sepp, M.; Pruunsild, P.; Kukkonen, J.; Timmusk, T.; Blomgren, K.; Lindholm, D. (2009). NF-κB-dependent regulation of brain-derived neurotrophic factor in hippocampal neurons by X-linked inhibitor of apoptosis protein. European Journal of Neuroscience, 30, 958−966.
1.1.
2009
Koppel, I.; Aid-Pavlidis, T.; Jaanson, K.; Sepp, M.; Pruunsild, P.; Palm, K.; Timmusk, T. (2009). Tissue-specific and neural activity-regulated expression of human BDNF gene in BAC transgenic mice. BMC Neuroscience, 10, 68.
1.1.
2009
Kazantseva, A.; Sepp, M.; Kazantseva, J.; Sadam, H.; Pruunsild, P.; Timmusk, T.; Neuman, T.; Palm, K. (2009). N-terminally truncated BAF57 isoforms contribute to the diversity of SWI/SNF complexes in neurons. Journal of Neurochemistry, 109 (3), 807−818.10.1111/j.1471-4159.2009.06005.x.
1.1.
2009
Kurg, R.; Uusen, P.; Sepp, T.; Sepp, M.; Abroi, A.; Ustav, M. (2009). Bovine papillomavirus type 1 E2 protein heterodimer is functional in papillomavirus DNA replication in vivo. Virology, 386 (2), 353−359.10.1016/j.virol.2009.01.025.
1.3.
2007
Timmusk, T.; Koppel, I.; Pruunsild, P.; Sepp, M.; Tamme, R. (2007). Neurotroofsed tegurid. Eesti Arst, 86, 614−621.
1.1.
2005
Kurg, R.; Sild, K.; Ilves, A.; Sepp, M.; Ustav, M. (2005). Association of bovine papillomavirus E2 protein with nuclear structures in vivo. Journal of Virology, 79 (16), 10528−10539.

Tööstusomand

25.04.2019

Mari Sepp

https://www.etis.ee/CV/Mari_Sepp_001/eng
6.07.1982
620 4444

Career

Institution(s) and position(s)
01.01.2010–31.12.2016   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Molecular Biology, Researcher (1,00)
2005–31.12.2009   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Other staff (1,00)
2004–2005   
National Institute of Chemical Physics and Biophysics, Other staff (0,25)
01.01.2004–31.12.2004   
University of Helsinki, Institute of Biotechnology
01.01.2003–31.12.2003   
University of Helsinki, Institute of Biotechnology
 
 
Education
2006–2012   
Tallinn University of Technology, Ph.D in gene technology
2004–2006   
Tallinn University of Technology, M.Sc in natural sciences
2000–2004   
University of Tartu; diploma cum laude, B.Sc in transgenic technology
1997–2000   
Miina Harma Grammar School
1988–1997   
Puhja Secondary School

Qualifications

Academic degrees
Mari Sepp, Doctor's Degree, 2012, (sup) Tõnis Timmusk, Functions of the basic-helix-loop-helix transcription factor TCF4 in health and disease, Tallinn University of Technology Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Molecular Biology.
Mari Sepp, Research Master's Degree, 2006, (sup) Tõnis Timmusk, Novel Targets Of Huntingtin Revealed By Analysis Of Transcription Factor Subcellular Localization, Tallinn University of Technology Faculty of Science, Department of Gene Technology.
 
 
Honours & awards
2013, Mari Sepp, Science publication of the year 2012, Tallinn University of Technology
2012, Mari Sepp, The World Congress of Psychiatric Genetics Poster Presentation Award
2012, Mari Sepp, The Young Scientist Award, issued by the Department of Gene Technology, Tallinn University of Technology
2012, Mari Sepp, Diploma for supervising Jaan Toots, 1st prize in Estonian Contest for Young Scientists
2009, Mari Sepp, The Stipend of Tiina Mõis; issued by the Development Foundation of Tallinn University of Technology
2008, Mari Sepp, Diploma for supervising Ave Eesmaa, 1st prize in Estonian Science Contest for University Level Students
2005, Mari Sepp, The Stipend of Artur Lind; issued by Estonian Genome Foundation
2004, Mari Sepp, The Young Scientist Award, issued by the Society for Histochemistry
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; CERCS SPECIALITY: B220 Genetics, cytogenetics
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.1. Biomedicine; CERCS SPECIALITY: B470 Physiology
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALITY: B210 Histology, cytochemistry, histochemistry, tissue culture
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALITY: B220 Genetics, cytogenetics
 
 

Projects in progress

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
Kannike, K.; Sepp, M.; Zuccato, C.; Cattaneo, E.; Timmusk, T. (2014). Forkhead transcription factor FOXO3a levels are increased in Huntington disease because of overactivated positive autofeedback loop. Journal of Biological Chemistry, 289, 32845−32857.
1.1.
2014
Jaanson, K.; Sepp, M.; Aid-Pavlidis, T.; Timmusk, T. (2014). BAC-based cellular model for screening regulators of BDNF gene transcription. BMC Neuroscience, 15, 75.
6.7.
2013
Sepp, M.; Vihma, H.; Kannike, K.; Pruunsild, P.; Timmusk, T. (2013). Basic helix-loop-helix transcription factor TCF4 is a calcium-dependent transcriptional activator in neurons. Journal of Neuroscience, manuscript.
1.1.
2012
Sepp, M.; Pruunsild, P.; Timmusk, T. (2012). Pitt–Hopkins syndrome-associated mutations in TCF4 lead to variable impairment of the transcription factor function ranging from hypomorphic to dominant-negative effects. Human Molecular Genetics, 2873−2888.
1.1.
2011
Sepp, M.; Kannike, K.; Eesmaa, A.; Urb, M.; Timmusk, T. (2011). Functional diversity of human basic helix-loop-helix transcription factor TCF4 isoforms generated by alternative 5' exon usage and splicing. PLOS ONE, 6, e22138.
1.1.
2011
Pruunsild, P.; Sepp, M.; Orav, E.; Koppel, I.; Timmusk, T. (2011). Identification of cis-elements and transcription factors regulating neuronal activity-dependent transcription of human BDNF gene. Journal of Neuroscience, 31, 3295−3308.
1.1.
2010
Koppel, I.; Aid-Pavlidis, T.; Jaanson, K.; Sepp, M.; Palm, K.; Timmusk, T. (2010). BAC transgenic mice reveal distal cis-regulatory elements governing BDNF gene expression. Genesis, 48, 214−219.
1.1.
2009
Rullinkov, G.; Tamme, R.; Sarapuu, A.; Lauren, J.; Sepp, M.; Palm, K.; Timmusk, T. (2009). Neuralized-2: expression in human and rodents and interaction with Delta-like ligands. Biochemical and Biophysical Research Communications, 389, 420−425.
1.1.
2009
Kairisalo, M.; Korhonen, L.; Sepp, M.; Pruunsild, P.; Kukkonen, J.; Timmusk, T.; Blomgren, K.; Lindholm, D. (2009). NF-κB-dependent regulation of brain-derived neurotrophic factor in hippocampal neurons by X-linked inhibitor of apoptosis protein. European Journal of Neuroscience, 30, 958−966.
1.1.
2009
Koppel, I.; Aid-Pavlidis, T.; Jaanson, K.; Sepp, M.; Pruunsild, P.; Palm, K.; Timmusk, T. (2009). Tissue-specific and neural activity-regulated expression of human BDNF gene in BAC transgenic mice. BMC Neuroscience, 10, 68.
1.1.
2009
Kazantseva, A.; Sepp, M.; Kazantseva, J.; Sadam, H.; Pruunsild, P.; Timmusk, T.; Neuman, T.; Palm, K. (2009). N-terminally truncated BAF57 isoforms contribute to the diversity of SWI/SNF complexes in neurons. Journal of Neurochemistry, 109 (3), 807−818.10.1111/j.1471-4159.2009.06005.x.
1.1.
2009
Kurg, R.; Uusen, P.; Sepp, T.; Sepp, M.; Abroi, A.; Ustav, M. (2009). Bovine papillomavirus type 1 E2 protein heterodimer is functional in papillomavirus DNA replication in vivo. Virology, 386 (2), 353−359.10.1016/j.virol.2009.01.025.
1.3.
2007
Timmusk, T.; Koppel, I.; Pruunsild, P.; Sepp, M.; Tamme, R. (2007). Neurotroofsed tegurid [Neurotrophic factors]. Eesti Arst, 86, 614−621.
1.1.
2005
Kurg, R.; Sild, K.; Ilves, A.; Sepp, M.; Ustav, M. (2005). Association of bovine papillomavirus E2 protein with nuclear structures in vivo. Journal of Virology, 79 (16), 10528−10539.

Industrial property

25.04.2019
Detailne otsing
  • Leitud 18 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
EMPEMP128 Sünaptilise plastilisuse võtmegeenide BDNF ja Arc aktiivsusest sõltuv regulatsioon01.01.201431.12.2016Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond270 000,00 EUR
MUUF8002BDNFi regulatsiooniga seotud uued ravimistrateegiad närvisüsteemi haiguste raviks01.01.200831.08.2010Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool97 001,59 EUR
MUUF7004BDNFi regulatsiooniga seotud uued ravimistrateegiad närvisüsteemi haiguste raviks.15.12.200615.03.2007Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool12 487,63 EUR
MUURU, 20007 (9.6-4/2234)Diskrimineerimine Eestis: elanikkonnaküsitlus02.04.200707.12.2007Mikko Kari LagerspetzTallinna Ülikool; Tallinna Ülikool, Rahvusvaheliste ja Sotsiaaluuringute Instituut, Kodanikeühiskonna Uurimis- ja Arenduskeskus11 231,64 EUR
ETFETF5555Drosophila neuralized geeni homoloogid imetajates01.01.200331.12.2006Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond39 829,73 EUR
IUTIUT19-18Geeniekspressiooni ja signaaliülekande regulatsioon närvisüsteemis ja selle patoloogiates01.01.201431.12.2019Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut; Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut1 152 000,00 EUR
SFSF0222602s03Geeniekspressiooni regulatsioon närvisüsteemis.01.01.200331.12.2007Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond182 979,05 EUR
SFSF0140143s08Geeniregulatsioon ja signaaliülekanne närvisüsteemis01.01.200831.12.2013Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond837 015,63 EUR
MUUTAR16018Genoomika ja Siirdemeditsiini Tippkeskus01.01.201601.03.2023Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool344 181,21 EUR
MUUTA37409Kodanikualgatuse organiseerimine Eestis: ressursid ja perspektiivid osalemaks otsustusprotsessides Eesti ja Euroopa tasanditel30.03.200931.12.2009Mikko Kari LagerspetzTallinna Ülikool; Tallinna Ülikool, Rahvusvaheliste ja Sotsiaaluuringute Instituut, Kodanikeühiskonna Uurimis- ja Arenduskeskus5 144,89 EUR
MUUTA, 18307 (CITA-CT-2006-028504)Mitmekesisus Euroopa Avalikkuses EUROSPHERE01.02.200731.01.2012Mikko Kari LagerspetzTallinna Ülikool; Tallinna Ülikool, Eesti Humanitaarinstituut108 309,41 EUR
MUUV284Neurotrofiinide geenide ekspressiooni regulatsioon närvisüsteemis.01.05.200531.01.2008Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool459 298,19 EUR
ETFETF8844Neurotroofse teguri BDNF geeni regulatsioon ja selle häired närvisüsteemi haigustes 01.01.201131.12.2014Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond84 849,60 EUR
MUUTT/5310projekti "Järvamaa kodanikuühiskonna arengukava" elluviimine21.05.201030.09.2010Mari SeppTallinna Ülikool; Tallinna Ülikool, Rahvusvaheliste ja Sotsiaaluuringute Instituut2 725,96 EUR
MUURU,07805 (05-2005, RK 05155)Rollid ja hoiakud Eesti avalikus teenistuses06.06.200527.01.2006Mikko Kari LagerspetzTallinna Ülikool; Tallinna Ülikool, Eesti Humanitaarinstituut16 604,44 EUR
MUUVA16017TCF4 transkriptsioonilise aktiivsuse regulatsioon neuronites01.01.201631.12.2017Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool91 156,69 EUR
MUUVA648TCF4 valgu transkriptsioonilist aktiivsust ja fosforüleerimist närvirakkudes reguleerivad signaalirajad ja ühendid01.02.201428.02.2015Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool41 964,00 EUR
ETFETF7257Transkriptsiooni häired Huntingtoni tõves01.01.200731.12.2010Tõnis TimmuskTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond66 140,90 EUR