Marina Koltšina

https://www.etis.ee/CV/Marina_Koltšina/est
12.09.1986
marina.koltsina@gmail.com

Teenistuskäik

Haridustee
2010–...   
Doktoriõpe, Tartu Ülikool, Geenitehnoloogia õppekava
2008–2010   
Magistriõpe, Tartu Ülikool, Geenitehnoloogia õppekava
2005–2008   
Bakalaureuseõpe, Tartu Ülikool, Geenitehnoloogia õppekava
1993–2005   
Narva Soldino Gümnaasium

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Marina Koltšina, magistrikraad, 2010, (juh) Neeme Tõnisson; Kaie Lokk, Genoomse koopiaarvu muutused mitteväikerakulise kopsuvähi korral, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool.
Marina Koltšina, doktorant [Õpingud katkestatud], (juh) Neeme Tõnisson; Andres Salumets, Koopiaarvu muutuste ja nende funktsionaalse mõju selgitamine kasvajates ja kasvajalaadsetes protsessides, .
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS KLASSIFIKAATOR: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2014
Krjutškov, Kaarel; Koltšina, Marina; Grand, Kelli; Võsa, Urmo; Sauk, Martin; Tõnisson, Neeme; Salumets, Andres (2014). Tissue-specific mitochondrial heteroplasmy at position 16,093 within the same individual. Current Genetics, 60 (1), 11−16.10.1007/s00294-013-0398-6.
1.1.
2014
Lokk, Kaie; Modhukur, Vijayachitra; Rajashekar, Balaji; Märtens, Kaspar; Mägi, Reedik; Kolde, Raivo; Koltšina, Marina; Nilsson, Torbjörn K.; Vilo, Jaak; Salumets, Andres; Tõnisson, Neeme (2014). DNA methylome profiling of human tissues identifies global and tissue-specific methylation patterns. Genome Biology, 15 (4), R54.10.1186/gb-2014-15-4-r54.
5.2.
2013
Koltšina, M.; Metspalu, A; Tõnisson, N.; Salumets, A. (2013). Somatic mosaicism for DNA Copy Number Variations: a rare phenomenon in human genome. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Pariis, Prantsusmaa; 8.–11. juuni, 2013. Nature Publishing Group, 452−452. (21; Suppl 2).
5.2.
2013
Tõnisson, N.; Lokk, K; Modhukur, V.; Rajashekar, B; Martens, K; Koltšina, M; Mägi, R.; Kolde, R.; Salumets, A. (2013). DNA metylome comparison of various human tissues. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Pariis, Prantsusmaa; 8.–11. juuni, 2013. Nature Publishing Group, 373−373. (21; Suppl 2).
1.1.
2012
Lokk, Kaie; Vooder, Tõnu; Kolde, Raivo; Välk, Kristjan; Võsa, Urmo; Roosipuu, Retlav; Milani, Lili; Fischer, Krista; Koltšina, Marina; Urgard, Egon; Annilo, Tarmo; Metspalu, Andres; Tõnisson, Neeme (2012). Methylation Markers of Early-Stage Non-Small Cell Lung Cancer. PLoS ONE, 7 (6), e39813− .10.1371/journal.pone.0039813.
5.2.
2012
Tõnisson, N.; Lokk, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Välk, K.; Roosipuu, R.; Võsa, U.; Milani, L.; Fischer, K.; Koltšina, M.; Urgard, E.; Annilo, T.; Metspalu, A. (2012). Altered DNA methylation in early-stage non-small-cell lung cancer. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Nürnberg, Saksamaa; 23.–26. juuni, 2012. Nature Publishing Group, 174−174. (20; Suppl 1).
5.2.
2011
Solovjova, M.; Kirotar, K.; Vooder, T.; Roosipuu, R.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2011). Genome-wide detection of copy number alterations in non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 2: European Human Genetics Conference; Amsterdam, Holland; 28.–31. mai, 2011. Nature Publishing Group, 200−200. (19).
5.2.
2011
Kirotar, K.; Vooder, T., Kolde R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2011). Genome-wide methylation profiling of non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 2: European Human Genetics Conference; Amsterdam, Holland; 28.–31. mai, 2011. Nature Publishing Group, 378−378. (19).
5.2.
2010
Kirotar, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2010). Methylation markers of early-stage non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 1: European Human Genetics Conference, Göteborg, Rootsi; 12.-15. juuni, 2010. Nature Publishing Group, 276−276. (15).
5.2.
2009
Kirotar, K.; Kolde, R.; Bure, I.; Solvjova, M.; Vooder, T.; Välk, K.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2009). Methylation changes in p53 pathway in non-small cell lung cancer and their potential association with TP53 mutations. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference, Wienna, Austria; 23.-26. mai, 2009. Nature Publishing Group, 301−301, P11.090. (17; Suppl. 2).
5.04.2018

Marina Koltšina

https://www.etis.ee/CV/Marina_Koltšina/eng
12.09.1986
marina.koltsina@gmail.com

Career

Education
2010–...   
PhD study, University of Tartu, Gene technology
2008–2010   
Master's degree, University of Tartu, Gene technology
2005–2008   
Bachelor's degree, University of Tartu, Gene Technology
1993–2005   
Narva Soldino Gymnasium, Narva, Estonia

Qualifications

Academic degrees
Marina Koltšina, Master's Degree, 2010, (sup) Neeme Tõnisson; Kaie Lokk, Genoomse koopiaarvu muutused mitteväikerakulise kopsuvähi korral (Genomic Copy Number Alterations In Non-Small Cell Lung Cancer), University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Biotechnology.
Marina Koltšina, Phd student [Interrupted], (sup) Neeme Tõnisson; Andres Salumets, Koopiaarvu muutuste ja nende funktsionaalse mõju selgitamine kasvajates ja kasvajalaadsetes protsessides, .
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS CLASSIFICATION: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
Krjutškov, Kaarel; Koltšina, Marina; Grand, Kelli; Võsa, Urmo; Sauk, Martin; Tõnisson, Neeme; Salumets, Andres (2014). Tissue-specific mitochondrial heteroplasmy at position 16,093 within the same individual. Current Genetics, 60 (1), 11−16.10.1007/s00294-013-0398-6.
1.1.
2014
Lokk, Kaie; Modhukur, Vijayachitra; Rajashekar, Balaji; Märtens, Kaspar; Mägi, Reedik; Kolde, Raivo; Koltšina, Marina; Nilsson, Torbjörn K.; Vilo, Jaak; Salumets, Andres; Tõnisson, Neeme (2014). DNA methylome profiling of human tissues identifies global and tissue-specific methylation patterns. Genome Biology, 15 (4), R54.10.1186/gb-2014-15-4-r54.
5.2.
2013
Koltšina, M.; Metspalu, A; Tõnisson, N.; Salumets, A. (2013). Somatic mosaicism for DNA Copy Number Variations: a rare phenomenon in human genome. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Pariis, Prantsusmaa; 8.–11. juuni, 2013. Nature Publishing Group, 452−452. (21; Suppl 2).
5.2.
2013
Tõnisson, N.; Lokk, K; Modhukur, V.; Rajashekar, B; Martens, K; Koltšina, M; Mägi, R.; Kolde, R.; Salumets, A. (2013). DNA metylome comparison of various human tissues. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Pariis, Prantsusmaa; 8.–11. juuni, 2013. Nature Publishing Group, 373−373. (21; Suppl 2).
1.1.
2012
Lokk, Kaie; Vooder, Tõnu; Kolde, Raivo; Välk, Kristjan; Võsa, Urmo; Roosipuu, Retlav; Milani, Lili; Fischer, Krista; Koltšina, Marina; Urgard, Egon; Annilo, Tarmo; Metspalu, Andres; Tõnisson, Neeme (2012). Methylation Markers of Early-Stage Non-Small Cell Lung Cancer. PLoS ONE, 7 (6), e39813− .10.1371/journal.pone.0039813.
5.2.
2012
Tõnisson, N.; Lokk, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Välk, K.; Roosipuu, R.; Võsa, U.; Milani, L.; Fischer, K.; Koltšina, M.; Urgard, E.; Annilo, T.; Metspalu, A. (2012). Altered DNA methylation in early-stage non-small-cell lung cancer. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference; Nürnberg, Saksamaa; 23.–26. juuni, 2012. Nature Publishing Group, 174−174. (20; Suppl 1).
5.2.
2011
Solovjova, M.; Kirotar, K.; Vooder, T.; Roosipuu, R.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2011). Genome-wide detection of copy number alterations in non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 2: European Human Genetics Conference; Amsterdam, Holland; 28.–31. mai, 2011. Nature Publishing Group, 200−200. (19).
5.2.
2011
Kirotar, K.; Vooder, T., Kolde R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2011). Genome-wide methylation profiling of non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 2: European Human Genetics Conference; Amsterdam, Holland; 28.–31. mai, 2011. Nature Publishing Group, 378−378. (19).
5.2.
2010
Kirotar, K.; Vooder, T.; Kolde, R.; Välk, K.; Solovjova, M.; Roosipuu, R.; Annilo, T.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2010). Methylation markers of early-stage non-small cell lung cancer. European Journal of Human Genetics, Suppl 1: European Human Genetics Conference, Göteborg, Rootsi; 12.-15. juuni, 2010. Nature Publishing Group, 276−276. (15).
5.2.
2009
Kirotar, K.; Kolde, R.; Bure, I.; Solvjova, M.; Vooder, T.; Välk, K.; Metspalu, A.; Tõnisson, N. (2009). Methylation changes in p53 pathway in non-small cell lung cancer and their potential association with TP53 mutations. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference, Wienna, Austria; 23.-26. mai, 2009. Nature Publishing Group, 301−301, P11.090. (17; Suppl. 2).
5.04.2018
Detailne otsing
  • Leitud 2 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF7473Geenide ekspressioonimustri, ja staatuse (epigeneetilised muutused, geenivariatsioon, koopiaarvu muutused) uurimine mitteväikserakulise kopsuvähi korral kasvajate molekulaarse klassifitseerimise ning varajase diagnostika ja ravi optimeerimise eesmärg01.01.200831.12.2011Neeme TõnissonTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond71 324,72 EUR
SFSF0180142As08Geneetiline varieeruvus, elustiil ja keskkonnategurid kui peamised tervise mõjurid01.01.200831.12.2013Neeme TõnissonTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut536 490,12 EUR