Pavel Kudrin

https://www.etis.ee/CV/Pavel_Kudrin/est
15.11.1987
737 4845
pavel.kudrin@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
26.03.2018–30.09.2018   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, molekulaarse mikrobioloogia teadur (1,00)
01.01.2016–25.03.2018   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia laborant (1,00)
01.09.2015–31.12.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia laborant (1,00)
01.01.2015–31.08.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia laborant (0,25)
01.01.2014–31.12.2014   
Umeå Ülikool, Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), Kristjan Jaak külalisüliõpilane
01.01.2012–31.12.2012   
Albert Einstein College of Medicine Bronxis; DoRa T6 külalisüliõpilane
2011–2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, PhD student (1,00)
01.06.2010–31.12.2010   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, laborant (0,75)
01.08.2009–31.08.2009   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, laborant (1,00)
01.06.2009–30.06.2009   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, spetsialist (1,00)
 
 
Haridustee
30.08.2011–30.08.2017   
TÜ Tehnoloogia Instituut
2006–2011   
Tartu Ülikool
1994–2006   
Kiviõli Vene Gümnaasium

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Pavel Kudrin, doktorikraad, 2017, (juh) Tanel Tenson; Vasili Hauryliuk, In search for the inhibitors of Escherichia coli stringent response factor RelA (Otsides Escherichia coli poomisvastuse valgu RelA inhibiitoreid), Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut.
Pavel Kudrin, magistrikraad, 2011, (juh) Kalle Kipper; Jaanus Remme, Tänu oma rollile subühikute assotsiatsioonil subühikutevaheline sild B3 on oluline ribosoomi funktsionaalsuse jaoks, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2017, Pavel Kudrin, The Moore Foundation Travel grant
2016, Pavel Kudrin, DoRaPluss T1.1 grant
2014, Pavel Kudrin, Kristjan Jaak semester välismaal
2013, Pavel Kudrin, Olev ja Talvi Maimetsa Stipendium
2012, Pavel Kudrin, DoRa T6 grant
2011, Pavel Kudrin, Olev ja Talvi Maimetsa Stipendium
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS ERIALA: T360 Biokeemiatehnoloogia

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2018
Kudrin Pavel, Dzhygyr Ievgen, Ishiguro Kensuke, Beljantseva Jelena, Maksimova Elena, Oliveira Sofia Raquel Alves, Varik Vallo, Payoe Roshani, Konevega Andrey L, Tenson Tanel, Suzuki Tsutomu, Hauryliuk Vasili (2018). The ribosomal A-site finger is crucial for binding and activation of the stringent factor RelA. Nucleic Acid Research.10.1093/nar/gky023.
1.1.
2017
Kudrin, P; Varik, V; Oliveira, SR; Beljantseva, J; Del Peso Santos, T; Dzhygyr, I; Rejman, D; Cava, F; Tenson, T; Hauryliuk, V. (2017). Sub-inhibitory concentrations of bacteriostatic antibiotics induce relA-dependent and relA-independent tolerance to β-lactams. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 61 (4), UNSP e02173-16.10.1128/AAC.02173-16.
1.1.
2017
Beljantseva, Jelena; Kudrin, Pavel; immy, Steffi; Ehn, Marcel; Pohl, Radek; Varik, Vallo; Tozawa, Yuzuru; Shingler, Victoria; Tenson, Tanel; Rejman, Dominik; Hauryliuk, Vasili. (2017). Molecular mutagenesis of ppGpp: turning a RelA activator into an inhibitor. Scientific Reports, 7, 41839.10.1038/srep41839.
1.1.
2017
Beljantseva, Jelena; Kudrin, Pavel; Andresen, Liis; Shingler, Victoria; Atkinson, Gemma C.; Tenson, Tanel; Hauryliuk, Vasili. (2017). Negative allosteric regulation of Enterococcus faecalis small alarmone synthetase RelQ by single-stranded RNA. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114 (14), 3726−3731.10.1073/pnas.1617868114.
2.3.
2017
Pavel Kudrin (2017). In search for the inhibitors of Escherichia coli stringent response factor RelA. (Doktoritöö, Tartu Ülikool). University of Tartu Press.
1.1.
2015
Gaca, A.; Kudrin, P. Colomer-Winter, C.; Beljantseva, J.; Liu, K.; Anderson, B.; Wang, J.; Rejman, D.; Potrykus, K.; Cashel, M.; Hauryliuk, V.; Lemos, J. (2015). From (p)ppGpp to (pp)pGpp: Characterization of Regulatory Effects of pGpp Synthesized by the Small Alarmone Synthetase of Enterococcus faecalis. Journal of Bacteriology, 197 (18), 2908−2919.10.1128/JB.00324-15.
1.1.
2012
Shyp, Viktoryia; Tankov, Stoyan; Ermakov, Andrey; Kudrin, Pavel; English, Brian P.; Ehrenberg, Måns ; Tenson, Tanel; Elf, Johan; Hauryliuk, Vasili (2012). Positive allosteric feedback regulation of the stringent response enzyme RelA by its product. EMBO Reports, 13 (9), 835−839.10.1038/embor.2012.106.
6.7.
2011
Kudrin, Pavel (2011). Intersubunit bridge B3 is important for ribosomal functionality due to its role in subunit association. (Magistritöö, Tartu Ülikool). Tartu Ülikool.
20.11.2018

Pavel Kudrin

https://www.etis.ee/CV/Pavel_Kudrin/eng
15.11.1987
737 4845
pavel.kudrin@ut.ee
http://

Career

Institution(s) and position(s)
26.03.2018–30.09.2018   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Research Fellow in Molecular Microbiology (1,00)
01.01.2016–25.03.2018   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Laboratory Assistant in Molecular Biology (1,00)
01.09.2015–31.12.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Laboratory Assistant in Molecular Biology (1,00)
01.01.2015–31.08.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Laboratory Assistant in Molecular Biology (0,25)
01.01.2014–31.12.2014   
Umeå University and The Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), Kristjan Jaak visiting student
01.01.2012–31.12.2012   
Albert Einstein College of Medicine in The Bronx; DoRa T6 visiting student
2011–2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, PhD student (1,00)
01.06.2010–31.12.2010   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Laboratory Assistant (0,75)
01.08.2009–31.08.2009   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Laboratory Assistant (1,00)
01.06.2009–30.06.2009   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Specialist (1,00)
 
 
Education
30.08.2011–30.08.2017   
University of Tartu Institute of Technology
2006–2011   
University of Tartu
1994–2006   
Kiviõli Russian Gymnasium

Qualifications

Academic degrees
Pavel Kudrin, Doctor's Degree, 2017, (sup) Tanel Tenson; Vasili Hauryliuk, In search for the inhibitors of Escherichia coli stringent response factor RelA, University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu.
Pavel Kudrin, Master's Diploma, 2011, (sup) Kalle Kipper; Jaanus Remme, Tänu oma rollile subühikute assotsiatsioonil subühikutevaheline sild B3 on oluline ribosoomi funktsionaalsuse jaoks (Intersubunit bridge B3 is important for ribosomal functionality due to its role in subunit association), University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu.
 
 
Honours & awards
2017, Pavel Kudrin, The Moore Foundation Travel grant
2016, Pavel Kudrin, DoRaPluss T.1.1 grant
2014, Pavel Kudrin, Kristjan Jaak grant
2013, Pavel Kudrin, Olev and Talvi Maimets Stipendium
2012, Pavel Kudrin, DoRa T6 grant
2011, Pavel Kudrin, Olev and Talvi Maimets Stipendium
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS SPECIALITY: T360 Biochemical technology
 
 

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2018
Kudrin Pavel, Dzhygyr Ievgen, Ishiguro Kensuke, Beljantseva Jelena, Maksimova Elena, Oliveira Sofia Raquel Alves, Varik Vallo, Payoe Roshani, Konevega Andrey L, Tenson Tanel, Suzuki Tsutomu, Hauryliuk Vasili (2018). The ribosomal A-site finger is crucial for binding and activation of the stringent factor RelA. Nucleic Acid Research.10.1093/nar/gky023.
1.1.
2017
Kudrin, P; Varik, V; Oliveira, SR; Beljantseva, J; Del Peso Santos, T; Dzhygyr, I; Rejman, D; Cava, F; Tenson, T; Hauryliuk, V. (2017). Sub-inhibitory concentrations of bacteriostatic antibiotics induce relA-dependent and relA-independent tolerance to β-lactams. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 61 (4), UNSP e02173-16.10.1128/AAC.02173-16.
1.1.
2017
Beljantseva, Jelena; Kudrin, Pavel; immy, Steffi; Ehn, Marcel; Pohl, Radek; Varik, Vallo; Tozawa, Yuzuru; Shingler, Victoria; Tenson, Tanel; Rejman, Dominik; Hauryliuk, Vasili. (2017). Molecular mutagenesis of ppGpp: turning a RelA activator into an inhibitor. Scientific Reports, 7, 41839.10.1038/srep41839.
1.1.
2017
Beljantseva, Jelena; Kudrin, Pavel; Andresen, Liis; Shingler, Victoria; Atkinson, Gemma C.; Tenson, Tanel; Hauryliuk, Vasili. (2017). Negative allosteric regulation of Enterococcus faecalis small alarmone synthetase RelQ by single-stranded RNA. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114 (14), 3726−3731.10.1073/pnas.1617868114.
2.3.
2017
Pavel Kudrin (2017). In search for the inhibitors of Escherichia coli stringent response factor RelA. (Doktoritöö, Tartu Ülikool). University of Tartu Press.
1.1.
2015
Gaca, A.; Kudrin, P. Colomer-Winter, C.; Beljantseva, J.; Liu, K.; Anderson, B.; Wang, J.; Rejman, D.; Potrykus, K.; Cashel, M.; Hauryliuk, V.; Lemos, J. (2015). From (p)ppGpp to (pp)pGpp: Characterization of Regulatory Effects of pGpp Synthesized by the Small Alarmone Synthetase of Enterococcus faecalis. Journal of Bacteriology, 197 (18), 2908−2919.10.1128/JB.00324-15.
1.1.
2012
Shyp, Viktoryia; Tankov, Stoyan; Ermakov, Andrey; Kudrin, Pavel; English, Brian P.; Ehrenberg, Måns ; Tenson, Tanel; Elf, Johan; Hauryliuk, Vasili (2012). Positive allosteric feedback regulation of the stringent response enzyme RelA by its product. EMBO Reports, 13 (9), 835−839.10.1038/embor.2012.106.
6.7.
2011
Kudrin, Pavel (2011). Intersubunit bridge B3 is important for ribosomal functionality due to its role in subunit association. (Magistritöö, Tartu Ülikool). Tartu Ülikool.
20.11.2018
Detailne otsing
  • Leitud 4 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF9012Bakterite poomisvastuse uuringud kasutades biokeemia, fülogeneetilise analüüsi ja ühe molekuli mikroskoopia meetodeid01.01.201231.12.2015Vasili HauryliukTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut57 600,00 EUR
ETFETF7616Fülogeneetiline ja biokeemiline lähenemine selgitamaks elongatsioonifaktor G variantide funktsionaalseid rolle01.01.200831.12.2011Vasili HauryliukTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond56 835,44 EUR
PUTPUT37ppGpp-vahendatud RSH valkude aktiveerimine: allosteerilise regulatsiooni mehhanismist poomisvastuse üldise loogikani01.01.201331.12.2016Vasili HauryliukTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut259 424,00 EUR
ETFETF7884Ribosoomi subühikutevaheliste sildade funktsionaalne analüüs valgusünteesi translokatsioonitsüklis.01.01.200931.12.2012Aivar LiivTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond53 965,68 EUR