Signe Saumaa

https://www.etis.ee/CV/Signe_Saumaa/est
28.01.1978
737 6038
signe.saumaa@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
Alates 01.09.2002 doktorantuuris Tartu Ülikoolis
01.11.2006–31.12.2007   
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, geneetika teadur (1,00)
2006–2006   
Eesti Biokeskus, vanemlaborant (0,10)
2006–31.10.2006   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Geneetika õppetool, Teadur (1,00)
 
 
Haridustee
Tartu Ülikool, bioloogia-geograafiateaduskond, B. Sc kraad molekulaar - ja rakubioloogia erialal, 2000
Tartu Ülikool, bioloogia-geograafiateaduskond, M. Sc kraad geneetika erialal, 2002
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
Eesti Mikrobioloogide Ühenduse liige (EMÜ),
Geneetika praktikumi läbiviimine Tartu Ülikooli bioloogia ja geenitehnoloogia eriala üliõpilastele ning Räpina Aianduskooli biotehnoloogia eriala õpilastele

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Signe Saumaa, doktorikraad, 2007, (juh) Maia Kivisaar, The role of DNA mismatch repair and oxidative DNA damage defense systems in avoidance of stationary phase mutations in Pseudomonas putida (DNA paardumisvigade reparatsiooni ja DNA oksüdatiivsete kahjustuste kaitsesüsteemide roll statsionaarse faasi mutatsioonide ärahoidmisel bakteris Pseudomonas putida), Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Signe Saumaa, magistrikraad (teaduskraad), 2002, (juh) Maia Kivisaar, DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
0, Signe Saumaa, Eesti TA üliõpilaste teadustööde konkursi II preemia aastast 2002, 2004 aastal valiti osalejaks Howard Hughes Medical Institute poolt sponsoreeritud rahvusvahelisel kursusel "The Molecular Basis of Bacterial Stress Responses", mis toimus Argentinas
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; TÄPSUSTUS: Statsionaarse faasi mutatsiooniprotsesside uurimine bakteris Pseudomonas putida.
 
 
Lisainfo
B.Sc molekulaar- ja rakubioloogia erialal
M.Sc geneetika erialal
Tartu Ülikool, 2000

Tartu Ülikool, 2002

Lõppenud projektid

Juhendamisel väitekirjad

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2012
Jakovleva, Julia; Teppo, Annika; Velts, Anna; Saumaa, Signe; Moor, Hanna; Kivisaar, Maia; Teras, Riho (2012). Fis regulates the competitiveness of Pseudomonas putida on barley roots by inducing biofilm formation. Microbiology, 158 (3), 708−720.10.1099/mic.0.053355-0.
1.1.
2011
Sidorenko, J; Jatsenko, T; Saumaa, S; Teras, R; Tark-Dame, M; Hõrak, R; Kivisaar, M. (2011). Involvement of specialized DNA polymerases Pol II, Pol IV and DnaE2 in DNA replication in the absence of Pol I in Pseudomonas putida. Mutation Research - Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 714, 63−77.10.1016/j.mrfmmm.2011.06.013.
5.2.
2011
Sidorenko, Julia; Jatsenko, Tatjana; Saumaa, Signe; Teras, Riho; Tark-Dame, Mariliis; Hõrak, Rita; Kivisaar, Maia (2011). DNA polymerase I defiviensy in P. putida: growth defects and involvement of specialized DNA polymerases in DNA replication. Pseudomonas 2011, Sidney, Australia, 04.-07. 09. 2011.
1.1.
2009
Tarassova, K.; Tegova, R.; Tover, A.; Teras, R.; Tark, M.; Saumaa, S.; Kivisaar, M. (2009). Elevated Mutation Frequency in Surviving Populations of Carbon-Starved rpoS-Deficient Pseudomonas putida Is Caused by Reduced Expression of Superoxide Dismutase and Catalase. Journal of Bacteriology, 191, 3604−3614.10.1128/JB.01801-08.
5.2.
2009
Saumaa, S.; Siderenko, J.; Teras, R.; Kivisaar, M. (2009). ImuB and DnaE2 Complement DNA Polymerase I Function in UV Damage Tolerance Pathway in Pseudomonas putida. Molecular genetics of bacteria and phages; USA Madison; 04.08.2009-09.08.2009.
1.1.
2007
Saumaa, S.; Tover, A.; Tark, M.; Tegova, R.; Kivisaar, M. (2007). Oxidative DNA damage defense systems in avoidance of stationary-phase mutagenesis in Pseudomonas putida. Journal of Bacteriology, 189, 5504−5514.10.1128/JB.00518-07.
1.1.
2006
Saumaa, S.; Tarassova, K.; Tark, M.; Tover, A.; Tegova, R.; Kivisaar, M. (2006). Involvement of DNA mismatch repair in stationary-phase mutagenesis during prolonged starvation of Pseudomonas putida. DNA Repair, 5 (4), 505−514.10.1016/j.dnarep.2005.12.003.
1.1.
2002
Saumaa, S.; Tover, A.; Kasak, L.; Kivisaar, M. (2002). Different spectra of stationary-phase mutations in early-arising versus late-arising mutants of Pseudomonas putida: Involvement of the DNA repair enzyme MutY and the stationary-phase sigma factor RpoS. Journal of Bacteriology, 184 (24), 6957−6965.
6.7.
2002
Saumaa, Signe (2002). DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel. (Magistritöö). Tartu Ülikool: Tartu Ülikool.
3.01.2020

Signe Saumaa

https://www.etis.ee/CV/Signe_Saumaa/eng
28.01.1978
737 6038
signe.saumaa@ut.ee

Career

Institutions and positions
Ph.D student from 2002 at the University of Tartu
01.11.2006–31.12.2007   
University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology, Research Fellow (1,00)
2006–2006   
Estonian Biocentre, Other staff (0,10)
2006–31.10.2006   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Genetics, Researcher (1,00)
 
 
R&D related managerial and administrative work
Member of Estonian Society for Microbiologists (EMÜ),
Instructor of the practical course in Genetics to students of biology and gene technology in University of Tartu and to students of biotechnology from Räpina Gardening College

Qualifications

Academic degrees
Signe Saumaa, Doctor's Degree, 2007, (sup) Maia Kivisaar, The role of DNA mismatch repair and oxidative DNA damage defense systems in avoidance of stationary phase mutations in Pseudomonas putida, University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology.
Signe Saumaa, Research Master's Degree, 2002, (sup) Maia Kivisaar, DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel, University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology.
 
 
Honours & awards
0, Signe Saumaa, Second prize in student research competition of National Academy of Sciences in 2002, In 2004 was selected and participated the Howard Hughes Medical Institute sponsored international course "The Molecular Basis of Bacterial Stress Responses" that w
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; SPECIFICATION: Stationary phase mutation processes in bacterium Pseudomonas putida.
 
 
Additional information
B.Sc in Molecular and Cell Biology
M.Sc in Genetics
University of Tartu, 2000

University of Tartu, 2002

Dissertations under supervision

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2012
Jakovleva, Julia; Teppo, Annika; Velts, Anna; Saumaa, Signe; Moor, Hanna; Kivisaar, Maia; Teras, Riho (2012). Fis regulates the competitiveness of Pseudomonas putida on barley roots by inducing biofilm formation. Microbiology, 158 (3), 708−720.10.1099/mic.0.053355-0.
1.1.
2011
Sidorenko, J; Jatsenko, T; Saumaa, S; Teras, R; Tark-Dame, M; Hõrak, R; Kivisaar, M. (2011). Involvement of specialized DNA polymerases Pol II, Pol IV and DnaE2 in DNA replication in the absence of Pol I in Pseudomonas putida. Mutation Research - Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 714, 63−77.10.1016/j.mrfmmm.2011.06.013.
5.2.
2011
Sidorenko, Julia; Jatsenko, Tatjana; Saumaa, Signe; Teras, Riho; Tark-Dame, Mariliis; Hõrak, Rita; Kivisaar, Maia (2011). DNA polymerase I defiviensy in P. putida: growth defects and involvement of specialized DNA polymerases in DNA replication. Pseudomonas 2011, Sidney, Australia, 04.-07. 09. 2011.
1.1.
2009
Tarassova, K.; Tegova, R.; Tover, A.; Teras, R.; Tark, M.; Saumaa, S.; Kivisaar, M. (2009). Elevated Mutation Frequency in Surviving Populations of Carbon-Starved rpoS-Deficient Pseudomonas putida Is Caused by Reduced Expression of Superoxide Dismutase and Catalase. Journal of Bacteriology, 191, 3604−3614.10.1128/JB.01801-08.
5.2.
2009
Saumaa, S.; Siderenko, J.; Teras, R.; Kivisaar, M. (2009). ImuB and DnaE2 Complement DNA Polymerase I Function in UV Damage Tolerance Pathway in Pseudomonas putida. Molecular genetics of bacteria and phages; USA Madison; 04.08.2009-09.08.2009.
1.1.
2007
Saumaa, S.; Tover, A.; Tark, M.; Tegova, R.; Kivisaar, M. (2007). Oxidative DNA damage defense systems in avoidance of stationary-phase mutagenesis in Pseudomonas putida. Journal of Bacteriology, 189, 5504−5514.10.1128/JB.00518-07.
1.1.
2006
Saumaa, S.; Tarassova, K.; Tark, M.; Tover, A.; Tegova, R.; Kivisaar, M. (2006). Involvement of DNA mismatch repair in stationary-phase mutagenesis during prolonged starvation of Pseudomonas putida. DNA Repair, 5 (4), 505−514.10.1016/j.dnarep.2005.12.003.
1.1.
2002
Saumaa, S.; Tover, A.; Kasak, L.; Kivisaar, M. (2002). Different spectra of stationary-phase mutations in early-arising versus late-arising mutants of Pseudomonas putida: Involvement of the DNA repair enzyme MutY and the stationary-phase sigma factor RpoS. Journal of Bacteriology, 184 (24), 6957−6965.
6.7.
2002
Saumaa, Signe (2002). DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel. (Magistritöö). Tartu Ülikool: Tartu Ülikool.
3.01.2020
Detailne otsing
  • Leitud 11 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
PRGPRG707Bakterite evolutsioneerumise molekulaarsed mehhanismid stressitingimustes.01.01.202031.12.2024Maia KivisaarTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut257 125,00 EUR
MUUHHMI 55000316Bakterite füsioloogilisest seisundist mõjutatud geneetiliste ümberkorralduste regulatsiooni uuringud perekond Pseudomonas bakteritel01.01.200131.12.2005Maia KivisaarEesti Biokeskus183 745,99 EUR
IUTIUT20-19Bakterite keskkonnastressiga kohastumise molekulaarsed mehhanismid01.01.201431.12.2019Maia KivisaarTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut1 138 200,00 EUR
ETFETF6025ColR-ColS kahekomponendilise signaaliraja roll bakterite geneetilises kohastumises keskkonnaga01.01.200531.12.2008Rita HõrakEesti Biokeskus26 270,25 EUR
ETFETF7376Erinevate DNA reparatsioonisüsteemide ja DNA polümeraaside osalus stressist indutseeritud mutageneesil pseudomonaadides01.01.200831.12.2011Maia KivisaarTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond86 296,05 EUR
SFSF0182562Cs03Metaboolsete protsesside regulatsioon ja geneetilised ümberkorraldused mikroorganismides; Alateema siseselt eraldiseisev töö (Dots. T. Alamäe) Geeniekspressiooni regulatsiooni uurimine metülotroofsetel pärmidel01.01.200331.12.2007Maia KivisaarTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond245 292,91 EUR
ETFETF9114Mutageensed protsessid pseudomonaadides01.01.201231.12.2015Maia KivisaarTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut69 600,00 EUR
SFSF0180031s08Mutageneesi molekulaarsed mehhanismid bakterites01.01.200831.12.2013Maia KivisaarTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut774 319,05 EUR
MUUHHMI 55005614Pseudomonaadide geneetilise adaptatsiooni molekulaarsed mehhanismid keskkonastressi tingimustes01.01.200631.12.2010Maia KivisaarEesti Biokeskus363 449,57 EUR
ETFETF7019Pseudomonas aeruginosa statsionaarse faasi populatsioonis toimuvate mutatsiooniprotsesside iseloomustamiseks kasutatavate testsüsteemide konstrueerimine01.01.200731.12.2010Riho TerasTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond58 704,90 EUR
ETFETF5757Stressi poolt indutseeritud mutageneesi molekulaarsed alused pseudomonaadides01.01.200431.12.2007Maia KivisaarEesti Biokeskus58 881,44 EUR