Signe Värv

https://www.etis.ee/CV/Signe_Värv/est
signe.varv@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
07.01.2017–...   
Oslo Ülikool, Bioteaduste teaduskond, Biokeemia ja molekulaarbioloogia sektsioon, Rein Aasland'i grupp, Järeldoktor (1,00)
01.01.2015–31.12.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, rakubioloogia teadur (1,00)
07.01.2013–06.01.2017   
Univiersity of Bergen, Department of Molecular Biology, Aasland group, Järeldoktor (1,00)
01.02.2012–31.12.2014   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, rakubioloogia teadur (1,00)
01.09.2011–31.01.2012   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, teadur (1,00)
2006–2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Rakubioloogia õppetool, erakorraline teadur (1,00)
 
 
Haridustee
Tartu Ülikool, geenitehnoloogia

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Signe Värv, doktorikraad, 2011, (juh) Arnold Kristjuhan, Study on the mechanisms of RNA polymerase II-dependent transcription elongation (RNA polümeraas II-sõltuva transkriptsiooni elongatsiooni mehhanismide uurimine), Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut.
Signe Värv, magistrikraad (teaduskraad), 2004, (juh) Dina Lepik; Toivo Maimets, P19ARFi mõju p53-e märklaudgeenide transkriptsiooni aktivatsioonile, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Rakubioloogia õppetool.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2011, Signe Värv, III preemia doktoriõppe üliõpilaste teadustööde riiklikul konkursil
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS ERIALA: T490 Biotehnoloogia ; PÕHISUUND: geenitehnoloogia

Jooksvad projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
Jefimov, Kirill; Alcaraz, Nicolas; Kloet, Susan; Varv, Signe; Aastedatter Sakya, Siri; Dalager Vaagenso, Christian; Vermeulen, Michiel; Aasland, Rein; Andersson, Robin (2019). The GBAF chromatin remodeling complex binds H3K27ac and mediates enhancer transcription. 10.1101/445148 [ilmumas].
1.1.
2018
Sein, Henel; Reinmets, Kristina; Peil, Kadri; Kristjuhan, Kersti; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2018). Rpb9-deficient cells are defective in DNA damage response and require histone H3 acetylation for survival. Scientific Reports, 8 (1), 2949−2949.10.1038/s41598-018-21110-9.
1.1.
2015
Sein, Henel; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2015). Distribution and Maintenance of Histone H3 Lysine 36 Trimethylation in Transcribed Locus. PLOS ONE, 10 (3), e0120200.10.1371/journal.pone.0120200.
1.1.
2014
Rack JG, Lutter T, Kjæreng Bjerga GE, Guder C, Ehrhardt C, Värv S, Ziegler M, Aasland R (2014). The PHD finger of p300 influences its ability to acetylate histone and non-histone targets. Journal of Molecular Biology, 426 (24), 3960−3972.10.1016/j.jmb.2014.08.011.
1.1.
2013
Rull, Kristiina; Tomberg, Kärt; Kõks, Sulev; Männik, Jaana; Möls, Märt; Sirotkina, Meeli; Värv, Signe; Laan, Maris (2013). Increased placental expression and maternal serum levels of apoptosis-inducing TRAIL in recurrent miscarriage. Placenta, 34 (2), 141−148.10.1016/j.placenta.2012.11.032.
1.1.
2013
Lõoke, Marko; Kristjuhan, Kersti; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2013). Chromatin-dependent and -independent regulation of DNA replication origin activation in budding yeast. EMBO Reports, 14 (2), 191−198.10.1038/embor.2012.196.
1.1.
2011
Peil, K.; Värv, S.; Lõoke, M.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2011). Uniform distribution of elongating RNA polymerase II complexes in transcribed gene locus. Journal of Biological Chemistry, 286 (27), 23817−23822.
1.1.
2010
Lõoke, M.; Reimand, J.; Sedman, T.; Sedman, J.; Järvinen, L.; Värv, S.; Peil, K.; Kristjuhan, K.; Vilo, J.; Kristjuhan, A. (2010). Relicensing of transcriptionally inactivated replication origins in budding yeast. Journal of Biological Chemistry, 285 (51), 40004−40011.10.1074/jbc.M110.148924.
1.1.
2010
Värv, S.; Kristjuhan, K.; Peil, K.; Lõoke, M.; Mahlakõiv, T.; Paapsi, K.; Kristjuhan, A. (2010). Acetylation of H3 K56 is required for RNA polymerase II transcript elongation through heterochromatin in yeast. Molecular and Cellular Biology, 30 (6), 1467−1477.10.1128/MCB.01151-09.
5.1.
2010
Värv, S.; Sein, H.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2010). Dynamics of histone modifications in actively transcribed locus. FEBS JOURNAL, 277: 35th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies Gothenburg, SWEDEN, JUN 26-JUL 01, 2010. 159.
1.1.
2007
Värv, S.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2007). RNA polymerase II determines the area of nucleosome loss in transcribed gene loci. Biochemical and Biophysical Research Communications, 358, 666−671.
1.1.
2003
Lepik, D.; Jaks, V.; Kadaja, L.; Maimets, T. (2003). Electroporation and carrier DNA cause p53 activation, cell cycle arrest, and apoptosis. Analytical Biochemistry, 318 (1), 52−59.
19.04.2019

Signe Värv

https://www.etis.ee/CV/Signe_Värv/eng
signe.varv@ut.ee

Career

Institution(s) and position(s)
07.01.2017–...   
University of Oslo, Department of Biosciences, Section for Biochemistry and Molecular Biology, Rein Aasland group, post doctoral researcher (1,00)
01.01.2015–31.12.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow of Cell Biology (1,00)
07.01.2013–06.01.2017   
Univiersity of Bergen, Department of Molecular Biology, Aasland group, Post-Doc (1,00)
01.02.2012–31.12.2014   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow of Cell Biology (1,00)
01.09.2011–31.01.2012   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (1,00)
2006–2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Cell Biology, erakorraline teadur (1,00)
 
 
Education
University of Tartu, gene technology

Qualifications

Academic degrees
Signe Värv, Doctor's Degree, 2011, (sup) Arnold Kristjuhan, Study on the mechanisms of RNA polymerase II-dependent transcription elongation, University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu.
Signe Värv, Research Master's Degree, 2004, (sup) Dina Lepik; Toivo Maimets, P19ARFi mõju p53-e märklaudgeenide transkriptsiooni aktivatsioonile, University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Cell Biology.
 
 
Honours & awards
2011, Signe Värv, Third award on the contest of research works for PhD students (organised by the Estonian Ministry of Education and Research)
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS SPECIALITY: T490 Biotechnology ; SPECIALITY: gene technology
 
 

Projects in progress

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
Jefimov, Kirill; Alcaraz, Nicolas; Kloet, Susan; Varv, Signe; Aastedatter Sakya, Siri; Dalager Vaagenso, Christian; Vermeulen, Michiel; Aasland, Rein; Andersson, Robin (2019). The GBAF chromatin remodeling complex binds H3K27ac and mediates enhancer transcription. 10.1101/445148 [forthcoming].
1.1.
2018
Sein, Henel; Reinmets, Kristina; Peil, Kadri; Kristjuhan, Kersti; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2018). Rpb9-deficient cells are defective in DNA damage response and require histone H3 acetylation for survival. Scientific Reports, 8 (1), 2949−2949.10.1038/s41598-018-21110-9.
1.1.
2015
Sein, Henel; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2015). Distribution and Maintenance of Histone H3 Lysine 36 Trimethylation in Transcribed Locus. PLOS ONE, 10 (3), e0120200.10.1371/journal.pone.0120200.
1.1.
2014
Rack JG, Lutter T, Kjæreng Bjerga GE, Guder C, Ehrhardt C, Värv S, Ziegler M, Aasland R (2014). The PHD finger of p300 influences its ability to acetylate histone and non-histone targets. Journal of Molecular Biology, 426 (24), 3960−3972.10.1016/j.jmb.2014.08.011.
1.1.
2013
Rull, Kristiina; Tomberg, Kärt; Kõks, Sulev; Männik, Jaana; Möls, Märt; Sirotkina, Meeli; Värv, Signe; Laan, Maris (2013). Increased placental expression and maternal serum levels of apoptosis-inducing TRAIL in recurrent miscarriage. Placenta, 34 (2), 141−148.10.1016/j.placenta.2012.11.032.
1.1.
2013
Lõoke, Marko; Kristjuhan, Kersti; Värv, Signe; Kristjuhan, Arnold (2013). Chromatin-dependent and -independent regulation of DNA replication origin activation in budding yeast. EMBO Reports, 14 (2), 191−198.10.1038/embor.2012.196.
1.1.
2011
Peil, K.; Värv, S.; Lõoke, M.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2011). Uniform distribution of elongating RNA polymerase II complexes in transcribed gene locus. Journal of Biological Chemistry, 286 (27), 23817−23822.
1.1.
2010
Lõoke, M.; Reimand, J.; Sedman, T.; Sedman, J.; Järvinen, L.; Värv, S.; Peil, K.; Kristjuhan, K.; Vilo, J.; Kristjuhan, A. (2010). Relicensing of transcriptionally inactivated replication origins in budding yeast. Journal of Biological Chemistry, 285 (51), 40004−40011.10.1074/jbc.M110.148924.
1.1.
2010
Värv, S.; Kristjuhan, K.; Peil, K.; Lõoke, M.; Mahlakõiv, T.; Paapsi, K.; Kristjuhan, A. (2010). Acetylation of H3 K56 is required for RNA polymerase II transcript elongation through heterochromatin in yeast. Molecular and Cellular Biology, 30 (6), 1467−1477.10.1128/MCB.01151-09.
5.1.
2010
Värv, S.; Sein, H.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2010). Dynamics of histone modifications in actively transcribed locus. FEBS JOURNAL, 277: 35th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies Gothenburg, SWEDEN, JUN 26-JUL 01, 2010. 159.
1.1.
2007
Värv, S.; Kristjuhan, K.; Kristjuhan, A. (2007). RNA polymerase II determines the area of nucleosome loss in transcribed gene loci. Biochemical and Biophysical Research Communications, 358, 666−671.
1.1.
2003
Lepik, D.; Jaks, V.; Kadaja, L.; Maimets, T. (2003). Electroporation and carrier DNA cause p53 activation, cell cycle arrest, and apoptosis. Analytical Biochemistry, 318 (1), 52−59.
19.04.2019
Detailne otsing
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF7839AHR-seoselise endokriinse regulatsiooni molekulaarsed mehhanismid reproduktiivkudedes01.01.200931.12.2012Tarmo TiidoTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond47 121,20 EUR
ETFETF5801ARFi osa rakulises vastuses DNA kahjustustele ja genoomi destabiliseerimisele01.01.200431.12.2007Dina LepikTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond32 344,41 EUR
ETFETF9188DNA REPLIKATSIOONI JA TRANSKRIPTSIOONI REGULEERIMINE KROMATIINI MODIFIKATSIOONIDE KAUDU01.01.201231.12.2015Arnold KristjuhanTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut69 600,00 EUR
SFSF0182532s03Kasvajaseoselised muutused rakusisestes signaaliülekande radades.01.01.200331.12.2007Toivo MaimetsTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond445 336,37 EUR
SFSF0180028s12Kromatiini dünaamika ja modifitseerimine eukarüootide DNA replikatsioonis ja RNA polümeraas II sõltuvas transkrisptsioonis01.01.201231.12.2013Arnold KristjuhanTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut120 120,00 EUR
IUTIUT20-23Kromatiini roll DNA replikatsiooni ja transkriptsiooni reguleerimisel01.01.201431.12.2019Arnold KristjuhanTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut699 600,00 EUR
ETFETF6604RNA polümeraas II sõltuva transkriptsiooni elongatsiooni uurimine01.01.200631.12.2009Arnold KristjuhanTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond46 396,14 EUR
SFSF0180100s08Signaaliülekande rajad inimese tüvirakkudes, nende diferentseerunud järglastes ja kasvajarakkudes.01.01.200831.12.2013Toivo MaimetsTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond457 071,51 EUR