Silja Laht

https://www.etis.ee/CV/Silja_Laht/est
5.02.1978
737 4046
siljal@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.03.2015–31.08.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika teadur (0,20)
01.12.2013–28.02.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika teadur (0,20)
01.03.2012–30.11.2013   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika teadur (0,40)
01.09.2009–29.02.2012   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (0,40)
02.01.2009–30.06.2011   
Cellin Technologies OÜ, Teadur (0,60)
01.03.2005–30.09.2008   
InBio OÜ, Teadur (1,00)
01.02.2002–28.02.2005   
FIT Biotech Oyj Plc Eesti filiaal, Teadur (1,00)
 
 
Haridustee
2000–2001   
Tartu Ülikool, magistriõpe molekulaarbioloogia ja geneetika eriala
1996–2000   
Tartu Ülikool, bakalauruseõpe molekulaarbioloogia ja geneetika eriala

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Silja Laht, doktorikraad, 2015, (juh) Maido Remm, Classification and identification of conopeptides using profile hidden Markov models and position-specific scoring matrices (Konopeptiidide klassifitseerimine ja kindlakstegemine varjatud Markovi mudelite ja positsioonispetsiifiliste skoorimaatriksite abil), Tartu Ülikool.
Silja Laht, magistrikraad (teaduskraad), 2001, (juh) Tiina Alamäe, Pärmi Hansenula polymorpha glükokinaas: geeni kloneerimine ja valgu iseloomustamine, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
 
 

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2013
Koua, D; Laht, S; Kaplinski, L; Stöcklin, R; Remm, M; Favreau, P; Lisacek, F (2013). Position-specific scoring matrix and hidden Markov model complement each other for the prediction of conopeptide superfamilies. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1834 (4), 717−724.10.1016/j.bbapap.2012.12.015.
1.1.
2012
Laht S, Koua D, Kaplinski L, Lisacek F, Stöcklin R, Remm M (2012). Identification and classification of conopeptides using profile Hidden Markov Models. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1824, 488−492.
1.1.
2012
Koua, D.; Brauer, A.; Laht, S.; Kaplinksi, L.; Favreau, P.; Remm, M.; Lisacek, F.; Stöcklin, R. (2012). ConoDictor: a tool for prediction of conopeptide superfamilies. Nucleic Acids Research, 40, W238−W241.10.1093/nar/gks337.
1.1.
2008
Laht, Silja; Meerits, Kati; Altroff, Harri; Faust, Helena; Tsaney, Robert; Kogerman, Priit; Järvekülg, Lilian; Paalme, Viiu; Valkna, Andres; Timmusk, Sirje. (2008). Generation and characterization of a single-chain Fv antibody against G, a hedgehog signaling pathway transcription factor. Hybridoma, 27 (3), 167−174.10.1089/hyb.2008.0004.
1.1.
2002
Laht, Silja; Karp, Helen; Kotka, Pille; Järviste, Aiki; Alamäe, Tiina. (2002). Cloning and characterization of glucokinase from a methylotrophic yeast Hansenula polymorpha: different effects on glucose repression in H. polymorpha and Saccharomyces cerevisiae. Gene, 296, 195−203.10.1016/S0378-1119(02)00859-4.

Tööstusomand

5.04.2018

Silja Laht

https://www.etis.ee/CV/Silja_Laht/eng
5.02.1978
737 4046
siljal@ut.ee

Career

Institution(s) and position(s)
01.03.2015–31.08.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellowbioinformaatika (0,20)
01.12.2013–28.02.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (0,20)
01.03.2012–30.11.2013   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (0,40)
01.09.2009–29.02.2012   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (0,40)
02.01.2009–30.06.2011   
Cellin Technologies Ltd, Researcher (0,60)
01.03.2005–30.09.2008   
Inbio, Researcher (1,00)
01.02.2002–28.02.2005   
FIT Biotech Oyj Plc, Researcher (1,00)
 
 
Education
2000–2001   
1996–2000   

Qualifications

Academic degrees
Silja Laht, Doctor's Degree, 2015, (sup) Maido Remm, Classification and identification of conopeptides using profile hidden Markov models and position-specific scoring matrices, University of Tartu.
Silja Laht, Master's Degree, 2001, (sup) Tiina Alamäe, Pärmi Hansenula polymorpha glükokinaas: geeni kloneerimine ja valgu iseloomustamine (Hansenula polymorpha glucokinase: cloning of the gene and characterization of the protein), University of Tartu, Faculty of Biology and Geography.
 
 

Projects in progress

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2013
Koua, D; Laht, S; Kaplinski, L; Stöcklin, R; Remm, M; Favreau, P; Lisacek, F (2013). Position-specific scoring matrix and hidden Markov model complement each other for the prediction of conopeptide superfamilies. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1834 (4), 717−724.10.1016/j.bbapap.2012.12.015.
1.1.
2012
Laht S, Koua D, Kaplinski L, Lisacek F, Stöcklin R, Remm M (2012). Identification and classification of conopeptides using profile Hidden Markov Models. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1824, 488−492.
1.1.
2012
Koua, D.; Brauer, A.; Laht, S.; Kaplinksi, L.; Favreau, P.; Remm, M.; Lisacek, F.; Stöcklin, R. (2012). ConoDictor: a tool for prediction of conopeptide superfamilies. Nucleic Acids Research, 40, W238−W241.10.1093/nar/gks337.
1.1.
2008
Laht, Silja; Meerits, Kati; Altroff, Harri; Faust, Helena; Tsaney, Robert; Kogerman, Priit; Järvekülg, Lilian; Paalme, Viiu; Valkna, Andres; Timmusk, Sirje. (2008). Generation and characterization of a single-chain Fv antibody against G, a hedgehog signaling pathway transcription factor. Hybridoma, 27 (3), 167−174.10.1089/hyb.2008.0004.
1.1.
2002
Laht, Silja; Karp, Helen; Kotka, Pille; Järviste, Aiki; Alamäe, Tiina. (2002). Cloning and characterization of glucokinase from a methylotrophic yeast Hansenula polymorpha: different effects on glucose repression in H. polymorpha and Saccharomyces cerevisiae. Gene, 296, 195−203.10.1016/S0378-1119(02)00859-4.

Industrial property

5.04.2018
Detailne otsing
  • Leitud 4 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF6152Alfa-fetoproteiini retseptori kloonimine ja iseloomustamine01.01.200531.12.2007Harri AltroffCelecure AS41 144,07 EUR
MUULSHB-CT-2007-037592Applied venomics of the cone snail species Conus consors for the accelerated, cheaper, safer and more ethical production of innovative biomedical drugs01.02.200731.01.2012Maido RemmEesti Biokeskus500 140,99 EUR
SFSF0180026s09Bioinformaatika rakendamine genoomijärjestuste uurimiseks 01.01.200931.12.2014Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond546 107,92 EUR
IUTIUT34-11Kiiremad ja usaldusväärsemad meetodid genoomijärjestuste analüüsimiseks01.01.201531.12.2020Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut480 000,00 EUR