Sten Ilmjärv

https://www.etis.ee/CV/Sten_Ilmjärv/est
2.06.1985
sten.ilmjarv@gmail.com

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2014–...   
Bio- ja siirdemeditsiini instituut
01.01.2009–...   
OÜ Quretec
 
 
Haridustee
2009–...   
Ph.D. (neuroteadused) - Tartu Ülikool
2007–2009   
MA (geenitehnoloogia/bioinformaatika) - Tartu Ülikool
2003–2007   
BA (geenitehnoloogia) - Tartu Ülikool
1992–2003   
Keskharidus -Tallinna Õismäe Humanitaargümnaasium

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Sten Ilmjärv, doktorikraad, 2015, (juh) Jaak Vilo; Eero Vasar; Hendrik Luuk, Estimating differential expression from multiple indicators (Diferentsiaalse geeniekspressiooni erinevuste hindamine mitmete indikaatorite alusel), Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Bio- ja siirdemeditsiini instituut.
Sten Ilmjärv, magistrikraad, 2009, (juh) Hedi Peterson; Jaak Vilo, Promootorjärjestuste uurimine BxD hiireliini geeniekspressiooni dünaamika alusel, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool.
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; PÕHISUUND: Bioinformaatika
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; PÕHISUUND: Neuroteadused

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2014
Ilmjärv, Sten; Hundahl, Christian Ansgar; Reimets, Riin; Niitsoo, Margus; Kolde, Raivo; Vilo, Jaak; Vasar, Eero; Luuk, Hendrik (2014). Estimating differential expression from multiple indicators. Nucleic Acids Research, 42 (8), e72.10.1093/nar/gku158.
1.1.
2011
Hundahl, Christian Ansgar; Luuk, Hendrik; Ilmjärv, Sten; Falktoft, Birgitte; Raida, Zindy; Vikesaa, Jonas; Friis-Hansen, Lennart; Hay-Schmidt, Anders (2011). Neuroglobin-Deficiency Exacerbates Hif1A and c-FOS Response, but Does Not Affect Neuronal Survival during Severe Hypoxia In Vivo. PLOS ONE, 6 (12), 1−14.10.1371/journal.pone.0028160.
1.1.
2010
Kuegler, Philipp B.; Zimmer, Bastian; Waldmann, Tanja; Baudis, Birte; Ilmjärv, Sten; Hescheler, Jürgen; Gaughwin, Phil; Brundin, Patrik; Mundy, William; Bal-Price, Anna K.; Schrattenholz, André; Krause, Karl-Heinz; van Thriel, Christoph; Rao, Mahendra S.; Kadereit, Suzanne; Leist, Marcel (2010). Markers of murine embryonic and neural stem cells, neurons and astrocytes: reference points for developmental neurotoxicity testing. ALTEX, 27 (1), 17−42.
18.04.2019

Sten Ilmjärv

https://www.etis.ee/CV/Sten_Ilmjärv/eng
2.06.1985
sten.ilmjarv@gmail.com

Career

Institution(s) and position(s)
01.01.2014–...   
bioinformaatika spetsialist
01.01.2009–...   
Quretex Ldt.
 
 
Education
2009–...   
Ph.D. (neurosciences) - Tartu University
2007–2009   
MA (genetechnology/bioinformatics) - Tartu University
2003–2007   
BA (genetechnology) - University of Tartu
1992–2003   
Secondary education -Tallinna Õismäe Humanitaargümnaasium

Qualifications

Academic degrees
Sten Ilmjärv, Doctor's Degree, 2015, (sup) Jaak Vilo; Eero Vasar; Hendrik Luuk, Estimating differential expression from multiple indicators, University of Tartu, Faculty of Medicine, Institute of Biomedicine and Translational Medicine.
Sten Ilmjärv, Master's Degree, 2009, (sup) Hedi Peterson; Jaak Vilo, Promootorjärjestuste uurimine BxD hiireliini geeniekspressiooni dünaamika alusel (Researching promoter sequences on the basis of gene expression Dynamics in mouse BxD lines), University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Bioinformatics.
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; SPECIALITY: Bioinformatics
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; SPECIALITY: Neurosciences
 
 

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
Ilmjärv, Sten; Hundahl, Christian Ansgar; Reimets, Riin; Niitsoo, Margus; Kolde, Raivo; Vilo, Jaak; Vasar, Eero; Luuk, Hendrik (2014). Estimating differential expression from multiple indicators. Nucleic Acids Research, 42 (8), e72.10.1093/nar/gku158.
1.1.
2011
Hundahl, Christian Ansgar; Luuk, Hendrik; Ilmjärv, Sten; Falktoft, Birgitte; Raida, Zindy; Vikesaa, Jonas; Friis-Hansen, Lennart; Hay-Schmidt, Anders (2011). Neuroglobin-Deficiency Exacerbates Hif1A and c-FOS Response, but Does Not Affect Neuronal Survival during Severe Hypoxia In Vivo. PLOS ONE, 6 (12), 1−14.10.1371/journal.pone.0028160.
1.1.
2010
Kuegler, Philipp B.; Zimmer, Bastian; Waldmann, Tanja; Baudis, Birte; Ilmjärv, Sten; Hescheler, Jürgen; Gaughwin, Phil; Brundin, Patrik; Mundy, William; Bal-Price, Anna K.; Schrattenholz, André; Krause, Karl-Heinz; van Thriel, Christoph; Rao, Mahendra S.; Kadereit, Suzanne; Leist, Marcel (2010). Markers of murine embryonic and neural stem cells, neurons and astrocytes: reference points for developmental neurotoxicity testing. ALTEX, 27 (1), 17−42.
18.04.2019
Detailne otsing
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
IUTIUT34-4Andmeteaduse meetodid ja rakendused (DSMA)01.01.201531.12.2020Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut583 000,00 EUR
MUUESNATSEmbrüonaalsete tüvirakkude põhised alternatiivsed testimisstrateegiad01.04.200831.03.2013Jaak ViloOÜ Quretec447 381,54 EUR
PUTPUT120Hüpotermia toimel indutseeritud faktorite tuvastamine01.01.201331.12.2016Christian Ansgar HundahlTartu Ülikool, Meditsiiniteaduste valdkond, bio- ja siirdemeditsiini instituut208 320,00 EUR
SFSF0180008s12Kaasaegsed teadusarvutuste meetodid, platvormid ja rakendused. 01.01.201231.12.2014Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond306 870,00 EUR
ETFETF7437Paljude geeniekspressiooniandmete ühisanalüüs (MEM)01.01.200831.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond64 222,50 EUR
SFSF0182712s06Suuremahuliste ja keeruliste arvutusülesannete lahendamise meetodid, arvutuskeskkonnad ja rakendused.01.01.200631.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond584 274,70 EUR
SFSF0180148s08Uued sihtmärgid emotsionaalse käitumise regulatsioonis ja nende tähendus psühhiaatrilistes häiretes01.01.200831.12.2013Eero VasarTartu Ülikool, Arstiteaduskond1 372 106,39 EUR
ETFETF9099Ärevusega seotud transkriptsiooniliste mehhanismide ja uudsete sihtmärkmolekulide tuvastamine01.01.201231.12.2015Hendrik LuukTartu Ülikool, Arstiteaduskond69 600,00 EUR