Tõnis Org
https://www.etis.ee/CV/Tõnis_Org/engCareer
Institutions and positions
01.09.2021–31.08.2023
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Genomics, Associate Professor of Bioinformatics and Medical Genomics (0,30)
01.01.2021–...
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor of Biotechnology (0,70)
01.01.2021–31.08.2021
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Genomics, Associate Professor of Bioinformatics and Medical Genomics (0,30)
01.01.2020–31.12.2020
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor of Biotechnology (0,70)
01.01.2020–31.12.2020
University of Tartu, Institute of Genomics, Senior Research Fellow of Bioinformatics and Medical Genomics (0,30)
01.09.2017–31.12.2019
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor of Biotechnology (1,00)
01.09.2016–31.12.2019
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor of Molecular Biotechnology (1,00)
01.01.2016–31.08.2016
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Senior Research Fellow of Molecular Biotechnology (1,00)
01.09.2015–31.12.2015
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Senior Research Fellow of Molecular Biotechnology (1,00)
01.09.2015–31.08.2017
University of Tartu, Senior researcher (1,00)
21.05.2013–31.10.2014
University of Tartu, Faculty of Medicine, Institute of Biomedicine, Research Fellow (1,00)
01.11.2011–20.05.2013
University of Tartu, Faculty of Medicine, Departement of General and Molecular Pathology, Research Fellow (1,00)
2010–30.06.2015
University of California, Los Angeles, Post-Doc (1,00)
01.09.2009–14.11.2010
University of Tartu, Faculty of Medicine, Departement of General and Molecular Pathology, Research Fellow (1,00)
01.09.2004–31.08.2009
University of Tartu, Faculty of Medicine, Departement of General and Molecular Pathology, Specialist (1,00)
01.01.2003–31.12.2003
research fellow in GSF institute Munich, Germany
01.01.2002–31.12.2003
Biotechnology company Asper Biotech
Education
2004–2010
Ph.D student of medicine, Tartu University
2002–2004
M.Sc student of gene technology, Tartu University
1998–2002
undergraduate student of gene technology, Tartu University
R&D related managerial and administrative work
2019−...
Vice president of Estonian Society of Human Genetics
2018−...
Board member of Estonian Society of Human Genetics
2011−...
Member of International Society of Stem Cell research
2010−...
Member of Estonian Society of Allergologists and Immunologists
2000−...
Member of Estonian Society of Human Genetics
2011−2015
Member of American Heart Association
Additional information
- 2018, Internal opponent of Andres Ainelo's PhD thesis „Physiological effects of the Pseudomonas putida toxin GraT”, University of Tartu, Estonia
- 2018, Internal opponent of Laura Kasa's PhD thesis "Genome structural variation modulating the placenta and pregnancy maintenance" University of Tartu, Estonia
- 2018, Opponent of Karmen Vaiküll's MSc thesis „Actionable gene variants in Estonian Genome Center sample – identification of diseaseassociated variants and their possible use in genetic feedback” University of Tartu, Estonia
- 2016, Opponent of Kertu Liis Krigul MSc thesis „The role of DNA methylation in the pathogenesis of endometriosis” University of Tartu, Estonia
- 2016, Opponent of Kreete Lüll´s MSc thesis "Rare variant analysis to find genetic variants associated with polycystic ovary syndrome"
- 2010, Opponent of Urmo Võsa´s MSc thesis "The expression profiles of microRNAs in non-small cell lung cancer", University of Tartu, Estonia
- 2009, Opponent of Tormi Reinson´s MSc thesis „Nonspecific DNA melting activity of HPV-18 E1 activates CHK2 kinase” , University of Tartu, Estonia
- 2008, Opponent of Kaie Kirotar´s MSc thesis „Description of methylation changes in promoter regions of p53 target genes in non-small cell lung cancer and potential associations with mutations in TP53”, University of Tartu, Estonia
- 2018, Internal opponent of Laura Kasa's PhD thesis "Genome structural variation modulating the placenta and pregnancy maintenance" University of Tartu, Estonia
- 2018, Opponent of Karmen Vaiküll's MSc thesis „Actionable gene variants in Estonian Genome Center sample – identification of diseaseassociated variants and their possible use in genetic feedback” University of Tartu, Estonia
- 2016, Opponent of Kertu Liis Krigul MSc thesis „The role of DNA methylation in the pathogenesis of endometriosis” University of Tartu, Estonia
- 2016, Opponent of Kreete Lüll´s MSc thesis "Rare variant analysis to find genetic variants associated with polycystic ovary syndrome"
- 2010, Opponent of Urmo Võsa´s MSc thesis "The expression profiles of microRNAs in non-small cell lung cancer", University of Tartu, Estonia
- 2009, Opponent of Tormi Reinson´s MSc thesis „Nonspecific DNA melting activity of HPV-18 E1 activates CHK2 kinase” , University of Tartu, Estonia
- 2008, Opponent of Kaie Kirotar´s MSc thesis „Description of methylation changes in promoter regions of p53 target genes in non-small cell lung cancer and potential associations with mutations in TP53”, University of Tartu, Estonia
Qualifications
Academic degrees
Honours & awards
2012, Tõnis Org, American Heart Association fellowship
2012, Tõnis Org, Leukemia and Lymphoma Society post-doctoral fellowship
2011, Tõnis Org, Mobilitas fellowship
2010, Tõnis Org, DoRa stipend
2010, Tõnis Org, National contest for scientific research - II prize for PhD thesis in health related studies
2009, Tõnis Org, DoRa stipend
2007, Tõnis Org, Kristjan Jaak travel stipend
2007, Tõnis Org, Best poster award at the annual meeting of Estonian society of human genetics, Pärnu
2007, Tõnis Org, Best presentation award at the Training Day for early stage researchers by the Euro-Thymaide Assembly, Toulouse
2007, Tõnis Org, Liisa Kolumbus stipend
2005, Tõnis Org, Young researcher fellowship from EMBO / FEBS
2003, Tõnis Org, Young Scientist fellowship The International School of Pediatric Sciences of the Scientific Institute, Genoa
2002, Tõnis Org, Young researcher fellowship from European Science Foundation
1998, Tõnis Org, stipend from Estonian Student Fund in USA
Category
Year
Publication
1.1.
2021
1.1.
2020
1.1.
2020
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.3.
2007
1.1.
2005
22.03.2022
Tõnis Org
https://www.etis.ee/CV/Tõnis_Org/estTeenistuskäik
Töökohad ja ametid
01.09.2021–31.08.2023
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, genoomika instituut, bioinformaatika ja meditsiinilise genoomika kaasprofessor (0,30)
01.01.2021–...
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, biotehnoloogia kaasprofessor (0,70)
01.01.2021–31.08.2021
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, genoomika instituut, bioinformaatika ja meditsiinilise genoomika kaasprofessor (0,30)
01.01.2020–31.12.2020
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, biotehnoloogia dotsent (0,70)
01.09.2017–31.12.2019
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, biotehnoloogia dotsent (1,00)
01.09.2016–31.12.2019
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, molekulaarse biotehnoloogia dotsent (1,00)
01.01.2016–31.08.2016
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, molekulaarse biotehnoloogia vanemteadur (1,00)
01.09.2015–31.12.2015
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, molekulaarse biotehnoloogia vanemteadur (1,00)
01.09.2015–31.08.2017
Tartu Ülikool, Vanemteadur (1,00)
21.05.2013–31.10.2014
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Biomeditsiini instituut, teadur (1,00)
01.11.2011–20.05.2013
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Üld- ja molekulaarpatoloogia instituut, teadur (1,00)
2010–30.06.2015
Kalifornia Ülikool Los Angeles'es, Järeldoktor (1,00)
01.09.2009–14.11.2010
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Üld- ja molekulaarpatoloogia instituut, teadur (1,00)
01.09.2004–31.08.2009
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Üld- ja molekulaarpatoloogia instituut, laborispetsialist (1,00)
01.01.2003–31.12.2003
teadustöö GSF instituudis Münhenis Saksamaal
01.01.2002–31.12.2003
Biotechnology company Asper Biotech
Haridustee
2004–2010
arstiteaduse doktorantuur, Tartu Ülikool
2002–2004
magistratuur geenitehnoloogia erialal, Tartu Ülikool
1998–2002
õpingud geenitehnoloogia erialal, Tartu Ülikool
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2019−...
Eesti Inimesegeneetika Ühingu asepresident
2018−...
Eesti Inimesegeneetika Ühingu juhatuse liige
2011−...
Rahvusvahelise Tüviraku Seltsi liige
2010−...
Eesti Immunoloogide ja Allergoloogide Seltsi liige
2000−...
Eesti Inimesegeneetika ühingu liige
2011−2015
Ameerika Südeme Assotsatsiooni liige
Lisainfo
- 2018, Andres Ainelo doktoritöö „Pseudomonas putida toksiini GraT mõju bakteri füsioloogiale” siseoponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2018, Laura Kasaku doktoritöö "Genome structural variation modulating the placenta and pregnancy maintenance" siseoponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2018, Karmen Vaikülli magistritöö „Sekkumist võimaldavad geenivariandid TÜ Eesti Geenivaramu valimis – haigusseoselisuse tuvastamine ja võimalik kasutamine geneetilises tagasisides” oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2016, Kertu Liis Kriguli magistritöö „DNA metülatsioonimustri roll endometriooni kujunemises” oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2016, Kreete Lüll magistritöö "Harvade variantide analüüs polütsüstiliste munasarjade sündroomiga seotud geneetilisete variantide tuvastamiseks" oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2010, Urmo Võsa magistritöö "MikroRNAde ekspressioonimustrid mitteväikerakulises kopsuvähis " oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2009, Tormi Reinsoni magistritöö „HPV-18 E1 aktiveerib Chk2 kinaasi läbi mitte-spetsiifilise DNA kaksikheeliksi lahtisulatamise” opponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2008, Kaie Kirotari magistritöö "p53 märklaudgeenide promootoralade metülatsiooni muutuste kirjeldamine mitteväikerakulise kopsuvähi rakuliinidel ning muutuste potentsiaalsed seosed TP53 mutatsioonidega" oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2018, Laura Kasaku doktoritöö "Genome structural variation modulating the placenta and pregnancy maintenance" siseoponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2018, Karmen Vaikülli magistritöö „Sekkumist võimaldavad geenivariandid TÜ Eesti Geenivaramu valimis – haigusseoselisuse tuvastamine ja võimalik kasutamine geneetilises tagasisides” oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2016, Kertu Liis Kriguli magistritöö „DNA metülatsioonimustri roll endometriooni kujunemises” oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2016, Kreete Lüll magistritöö "Harvade variantide analüüs polütsüstiliste munasarjade sündroomiga seotud geneetilisete variantide tuvastamiseks" oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2010, Urmo Võsa magistritöö "MikroRNAde ekspressioonimustrid mitteväikerakulises kopsuvähis " oponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2009, Tormi Reinsoni magistritöö „HPV-18 E1 aktiveerib Chk2 kinaasi läbi mitte-spetsiifilise DNA kaksikheeliksi lahtisulatamise” opponent, Tartu Ülikool, Eesti
- 2008, Kaie Kirotari magistritöö "p53 märklaudgeenide promootoralade metülatsiooni muutuste kirjeldamine mitteväikerakulise kopsuvähi rakuliinidel ning muutuste potentsiaalsed seosed TP53 mutatsioonidega" oponent, Tartu Ülikool, Eesti
Kvalifikatsioon
Teaduskraadid
Teaduspreemiad ja tunnustused
2012, Tõnis Org, AHA stipendium
2012, Tõnis Org, Leukeemia ja Lümfoomi Seltsi stipendium
2011, Tõnis Org, Mobilitase stipendium
2010, Tõnis Org, DoRa stipendium
2010, Tõnis Org, Riiklik teadustööde konkurss - II preemia terviseuuringute valdkonna doktoritööde katekoorias
2009, Tõnis Org, DoRa stipendium
2007, Tõnis Org, Kristjan Jaak reisistipendium
2007, Tõnis Org, Parima postri auhind Eesti inimesegeneetika aastakonverentsil Pärnus
2007, Tõnis Org, Parima ettekande auhind noorteadlaste treeningpäeval the Euro-Thymaide Assembly, Toulouse
2007, Tõnis Org, Liisa Kolumbuse stipendium
2005, Tõnis Org, noore teadlase stipendium EMBO / FEBS
2003, Tõnis Org, noore teadlase stipendium, The International School of Pediatric Sciences of the Scientific Institute, Genoa
2002, Tõnis Org, noore teadlase stipendium Euroopa Teadusfondilt
1998, Tõnis Org, stipendium Eesti Üliõpilaste toetusfondilt USAs
Klass
Aasta
Publikatsioon
1.1.
2021
1.1.
2020
1.1.
2020
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.3.
2007
1.1.
2005
22.03.2022
Search project
Institution is projects' financier
Institution is projects' executor
All
Projects
Master projects
Subprojects
New Frascati (2015)
Old and new Frascati
All
Ongoing
Finished
Beginning
Fuzzy
Precise
- Found 11 results
Program | Type | Number | Name | Project start | Project end | Principal investigator | Institution | Financing | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ETF | ETF6663 | AIRE gene expression in dendritic cells and influence on chemokine production | 01.01.2006 | 31.12.2009 | Pärt Peterson | University of Tartu; University of Tartu, Faculty of Medicine | 53 213,99 EUR | ||
ETF | ETF6490 | AIRE as transcriptional regulator | 01.01.2005 | 31.12.2008 | Ana Rebane | University of Tartu, Faculty of Medicine | 26 270,25 EUR | ||
1.1.5.3.4.1.5. | SP1GI20429T (MOBEC008) | cGEM - Centre for Genomics, Evolution and Medicine | 01.09.2020 | 31.10.2022 | Jon Anders Eriksson | University of Tartu, Institute of Genomics | 200 000,00 EUR | ||
MUU | PLTGI22904 | The Legacy of Past Genetic Adaptations for Present-day Health in the Estonian Population | 01.02.2022 | 31.01.2023 | Jon Anders Eriksson | University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Genomics | 50 000,00 EUR | ||
ETF | ETF8169 | Epigenetic regulations in immune tolerance | 01.01.2010 | 31.12.2012 | Pärt Peterson | University of Tartu, Faculty of Medicine | 57 542,29 EUR | ||
1.2.3.4. | MP1GI18418R (810645) | Center for Genomics, Evolution and Medicine | 01.09.2018 | 31.08.2023 | Mait Metspalu | University of Tartu, Institute of Genomics | 1 835 000,00 EUR | ||
1.2.3.4. | MMVCM18418R (810645) | Center for Genomics, Evolution and Medicine | 01.09.2018 | 31.08.2023 | Mait Metspalu | University of Tartu | 665 000,00 EUR | ||
PUT; PUT_SP | PUT1177 | Enhancer RNAs in regulation of hematopoietic development | 01.01.2016 | 30.04.2020 | Tõnis Org | University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology | 187 200,00 EUR | ||
SF | SF0182582As03 | Human Genome II | 01.01.2003 | 31.12.2007 | Andres Metspalu | University of Tartu, Faculty of Biology and Geography | 328 505,88 EUR | ||
MJD | MJD284 | Mechanisms of Scl/Tal1 dependent gene activation and repression during mesoderm diversification | 01.11.2011 | 31.10.2014 | Tõnis Org | University of Tartu, Faculty of Medicine | 94 080,00 EUR | ||
SF | SF0180021s07 | Thymic tolerance mechanisms | 01.01.2007 | 31.12.2012 | Pärt Peterson | University of Tartu, Faculty of Medicine | 527 814,01 EUR |