17.02.1955
737 5013
tiina.alamae@ut.ee
Married to Jaak Alamäe, two sons: Priit and Erkki.
For many years I have educated biologists, gene technologists, environmental technologists and biology teachers in various disciplines of microbiology. I have contributed to education of Estonian people by writing numerous articles regarding microbiology to Estonian Encyclopedias (ENE and TEA) and compiling a microbiology chapter for a Gymnasium Biology Textbook.

Career

Institutions and positions
1992–...   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Associated Professor (microbiology) (1,00)
01.09.2016–31.01.2020   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor in Microbiology (1,00)
01.01.2016–31.08.2016   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor in Microbiology (1,00)
01.09.2011–31.12.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Associate Professor in Microbiology (1,00)
01.01.2008–31.08.2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Associate Professor in Microbiology (1,00)
01.09.2006–31.12.2007   
University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor (1,00)
01.09.2001–31.08.2006   
University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor (1,00)
1978–1992   
University of Tartu, Dep. of Plant Physiology and Biochemistry, junior research scientist, 1978-1984; assistant, 1984-1988; lecturer, 1988-1991; ass. prof., since 1991. Ass. prof. of the Department of Genetics, Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, since 1992. (1,00)
 
 
Education
1974–1978   
University of Tartu (biology, microbiology) cum laude
 
 
R&D related managerial and administrative work
2014−...   
Management Committee member of the COST action CM1402 'From molecules to crystals - how do organic molecules form crystals (Crystallize)’
2008−...   
Comissioner of the International Comission on Yeasts at Mycology Divison of International Union of Microbiological Societies (IUMS)
2005−...   
Chairman of a B Sc defence comission in Institute of Molecular and Cell Biology
2003−...   
Evaluation of EU project proposals (FP-6, INTAS) and Spanish and Latvian project proposals. Evaluation of project proposals submitted to Estonian Research Agency.
2003−...   
Board member of the Estonian Society for Microbiology
2003−...   
Reviewer of the manuscripts to journals Yeast, Analyst, BMC Microbiolgy, Plos One, Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic; FEMS Yeast Research, Gene, Cell Biology International, Canadian J. of Microbiology, Molecular BioSystems, Food and Function, FEMS Microbiology Letters, etc
2014−2014   
Scientific committee member of the International Conference on Polysaccharides-Glycoscience (Prague)
2014−2014   
Organization of the Second Interntional Congress of Baltic Microbiologists in Tartu
2012−2012   
Organization of the 1st Congress of Baltic Microbiologists in Riga
2009−2013   
ESF network programme The Euroglycoscience Forum, member of the steering committee from Estonia
2009−2013   
Steering committee member of the research networking programme Euroglycoforum
2007−2017   
Member of Scientific Council of the Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu
2007−2010   
Participation in COST 928 action "Control and exploitation of enzymes for added-value products" coordinated by Dr J. Buchert (VTT, Helsinki)
2004−2008   
Member of the Council of Faculty of Biology and Geography, University of Tartu
2000−2000   
Organization of International Conference in Tartu
1996−2017   
Delegate of the Federation of European Microbiological Societies (FEMS) from Estonia
1994−2002   
Chairman of the Estonian Society for Microbiology
 
 
Creative work
I read lectures in Tartu University courses "Microbiology I" and "Microbiology II", a course on bacterial diversity and systematics and have prepared teaching materials for all these classes. Earlier, I have been lecturing also other courses such as applied microbiology, water and soil microbiology and have supervised students practical works in microbiology. Also, I have been writing articles for Estonian encyclopedias and science portals. I wrote a chapter on biology of microorganisms to a biology textbook for gymnasium students..
 
 
Additional information
I have been official opponent in three PhD defences and numerous MSc defences. Under my supervision two PhD theses and 16 MSc theses have been defended. Currently I supervise two PhD students and two MSc students.;
I have been organizing local microbiology conferences in Estonia. I have read lectures at education seminars for gymnasium teachers and also popularized microbiology and microbial biotechnology in Estonian gymnasiums.;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2015, Tiina Alamäe, Big Medal of Tartu University
2005, Tiina Alamäe, Medal of Tartu University
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS CLASSIFICATION: T360 Biochemical technology ; SPECIFICATION: Heterologous expression and characterization of biotechnologically relevant proteins. Bacterial levansucrases as producers of levan and oligosaccharides from sucrose and raffinose. Bacterial endo-levanases as producers of fructooligosaccharides from levans.
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS CLASSIFICATION: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology ; SPECIFICATION: Studies of pro- and eukaryotic microorganisms from the aspect of physiology, metabolic regulation, biochemistry and biotechnology. Study of biochemical properties and evolution of yeast alpha-glucosidases.
ETIS CLASSIFICATION: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering; CERCS CLASSIFICATION: T360 Biochemical technology
 
 

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
3.1.
2020
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
6.3.
2019
6.3.
2019
5.2.
2018
5.2.
2018
1.1.
2016
5.1.
2016
5.1.
2016
5.2.
2016
5.2.
2016
5.2.
2016
6.7.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
6.3.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
3.1.
2014
3.1.
2014
3.1.
2014
5.1.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
6.1.
2014
6.1.
2014
1.1.
2013
5.1.
2013
5.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
6.1.
2013
6.1.
2013
1.1.
2012
3.1.
2012
3.1.
2012
3.1.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
6.1.
2012
1.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
3.1.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
6.3.
2009
1.1.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
5.2.
2007
5.2.
2007
3.4.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
5.2.
2005
3.4.
2004
3.5.
2004
1.1.
2003
1.1.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
5.2.
2001
1.1.
2000
6.2.
2000
6.2.
2000
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1997
5.2.
1996
1.1.
1995
1.1.
1994
1.1.
1985
14.02.2020
17.02.1955
737 5013
tiina.alamae@ut.ee
Olen abielus Jaak Alamäega, mul on kaks poega: Priit ja Erkki.
Olen aastaid õpetanud mikrobioloogiat ja sellega seotud aineid Tartu Ülikooli üliõpilastele, kirjutanud mikrobioloogia-alase peatüki gümnaasiumiõpikusse ja arvukalt mikrobioloogia-alaseid artikleid Eesti entsüklopeediatesse (ENE ja TEA).

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
1992–...   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, mikrobioloogia (1,00)
01.09.2016–31.01.2020   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, geneetika dotsent (1,00)
01.01.2016–31.08.2016   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
01.09.2011–31.12.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
01.01.2008–31.08.2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
01.09.2006–31.12.2007   
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
01.09.2001–31.08.2006   
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
1978–1992   
Tartu Ülikool, Taimefüsioloogia ja biokeemia kateeder, nooremteadur 1978-1984; assistent sealsamas 1984-1988; vanemõpetaja sealsamas 1988-1991; dotsent sealsamas 1991-1992; Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis dotsent alates 1992. a. (1,00)
 
 
Haridustee
1974–1978   
Tartu Ülikool, bioloogia (mikrobioloogia) cum laude
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2014−...   
COST võrgustiku CM1402 ‘From molecules to crystals - how do organic molecules form crystals (Crystallize)’ juhtimiskomitee Eestipoolne liige
2008−...   
IUMSi Mükoloogia komitee Rahvusvahelise Pärmikomisjoni liige
2005−...   
Bakalaureusetööde kaitsmiskomisjoni esimees TÜMRIs
2003−...   
Euroopa Liidu teadusgrantide (FP-6; INTAS) ning Hispaania ja Läti teadusprojektide evalueerimine. Eesti Teadusfondi ja Teadusagentuuri taotluste retsenseerimine
2003−...   
Eesti Mikrobioloogide Ühenduse nõukogu liige
2003−...   
Käsikirjade retsenseerimine ajakirjadele Yeast, Analyst, BMC Microbiolgy, Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, Genes, FEMS Yeast Research, Gene, Cell Biology International, Folia Microbiologica, Canadian Journal of Microbiology.
2014−2014   
Rahvusvahelise konverentsi 10th International Conference on Polysaccharides-Glycoscience (2014) teaduskomitee liige
2014−2014   
Olin Tartus toimunud II rahvusvahelise Balti Mikrobioloogide Konverentsi üks korraldajatest
2012−2012   
I Balti Mikrobioloogide Konverentsi korraldamine Riias
2009−2013   
Euroopa Teadusfondi võrgustiku Euroglükofoorum juhtimiskomitee Eestipoolne liige
2009−2013   
Euroopa Teadusfondi teadusvõrgustiku 'Euroglycoforum' juhtimiskomitee liige
2007−2017   
TÜMRI Nõukogu liige, Tartu Ülikool
2007−2010   
Osalemine COST võrgustikus "Ensüümide kasutamine produktide väärtustamiseks". Programmi koordineeris Dr J. Buchert (VTT, Helsinki)
2004−2008   
Bioloogia-geograafiateaduskonna nõukogu liige
2000−2000   
Organiseerisin Tartus rahvusvahelise konverentsi "Microbiological Safety of Food"
1996−2017   
Euroopa Mikrobioloogia Seltside Liidu Eestipoolne esindaja
1994−2002   
Eesti Mikrobioloogia Seltsi esimees
 
 
Loometöö
Loen Tartu Ülikoolis loenguid üldises mikrobioloogias, mikroobide süstemaatikas ja mitmekesisuses, ja olen koostanud kõigi loengukursuste jaoks õppevahendid. Varem olen lugenud ka tööstusmikrobioloogia ning vee ja mulla mikrobioloogia kursuseid ning juhendanud mikrobioloogia praktikume. Olen teinud ja teen kaastööd Eesti Entsüklopeediale ja TEA entsüklopeediale ja teinud kaastööd ka teadusportaalidele. Olen kirjutanud peatüki mikroorganismide bioloogiast gümnaasiumi üldbioloogia õpikusse..
 
 
Lisainfo
Olen olnud ametlik oponent kolmele doktoritööle ja paljudele magistritöödele. Olen eelretsenseerinud paljusid doktoritöid. Minu juhendamisel on kaitstud 2 doktoritööd ja 16 magistritööd. Praegu juhendan kahte doktoranti ja kahte magistranti.;
Olen organiseerinud ka kohalikke mikrobioloogia seltsi konverentse. Olen lugenud loenguid Eesti bioloogiaõpetajate koolitustel ja populaarteaduslikke loengud koolides.;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2015, Tiina Alamäe, Tartu Ülikooli suur medal
2005, Tiina Alamäe, Ülikooli teenetemedal
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS KLASSIFIKAATOR: T360 Biokeemiatehnoloogia ; TÄPSUSTUS: Biotehnoloogilise potentsiaaliga võõrvalkude heteroloogiline ekspresseerimine ja iseloomustamine. Bakteriaalsed levaansukraasid ja endo-levanaasid kui biotehnoloogiliselt perspektiivsed valgud.
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS KLASSIFIKAATOR: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia ; TÄPSUSTUS: Pro- ja eukarüootsete mikroorganismide füsioloogia, biokeemia, metabolismi ja biotehnoloogiaga seotud uuringud. Pärmide maltaaside ja isomaltaaside omaduste ja evolutsiooni uurimine.
ETIS KLASSIFIKAATOR: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika); CERCS KLASSIFIKAATOR: T360 Biokeemiatehnoloogia ; TÄPSUSTUS: Mikroorganismide genoomide ja metabolismi uurimine eesmärgiga täiendada baasteadmisi ja leida uusi biotehnoloogilisi rakendusi.

Lõppenud projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
3.1.
2020
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
6.3.
2019
6.3.
2019
5.2.
2018
5.2.
2018
1.1.
2016
5.1.
2016
5.1.
2016
5.2.
2016
5.2.
2016
5.2.
2016
6.7.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
6.3.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
3.1.
2014
3.1.
2014
3.1.
2014
5.1.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
6.1.
2014
6.1.
2014
1.1.
2013
5.1.
2013
5.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
6.1.
2013
6.1.
2013
1.1.
2012
3.1.
2012
3.1.
2012
3.1.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
6.1.
2012
1.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
6.1.
2011
3.1.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
5.2.
2009
6.3.
2009
1.1.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
5.2.
2007
5.2.
2007
3.4.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
5.2.
2005
3.4.
2004
3.5.
2004
1.1.
2003
1.1.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
5.2.
2001
1.1.
2000
6.2.
2000
6.2.
2000
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1997
5.2.
1996
1.1.
1995
1.1.
1994
1.1.
1985
14.02.2020
  • Found 7 results
ProgramTypeNumberNameProject startProject endPrincipal investigatorInstitutionFinancing
ETFETF7528Hansenula polymorpha MAL genes, promoters and proteins: basic research and biotechnological applications 01.01.200831.12.2011Tiina AlamäeUniversity of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu; University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu; University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old)85 700,57 EUR
SFSF0182562Cs03Regulation of metabolic processes and genetic rearrangements in microorganisms. This project includes also research leaded by Tiina Alamäe (Study of regulation of gene expression in methylotrophic yeasts).01.01.200331.12.2007Maia KivisaarUniversity of Tartu, Faculty of Biology and Geography245 292,91 EUR
ETFETF9072Structure-function analysis of levansucrase protein of Pseudomonas syringae: basic studies and biotechnological aspects01.01.201231.12.2015Tiina AlamäeUniversity of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu48 000,00 EUR
SFSF0180088s08Nutrients and other chemical effectors as triggereres of metabolic and regulatory response in pro- and eukaryotic microorganisms: metabolic, ecological and applied aspects 01.01.200831.12.2013Andres MäeUniversity of Tartu, Faculty of Biology and Geography; University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu; University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old)410 413,66 EUR
MUUSLOMR12215T (3.2.0701.12-0041)Design and application of novel levansucrase catalysts for the production of functional food ingredients01.10.201231.08.2015Tiina AlamäeUniversity of Tartu418 573,40 EUR
PUT; PUT_OPPUT1050Enzymatic production of novel prebiotics: characterization of enzymes and evaluation of efficacy of the products 01.01.201631.12.2019Tiina AlamäeUniversity of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology249 600,00 EUR
ETFETF5676Elaboration of new microbial systems for the expression of foreign proteins¿¿¿¿¿01.01.200431.12.2007Tiina AlamäeUniversity of Tartu, Faculty of Biology and Geography34 306,42 EUR