See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Timo Tõnis Sikka

https://www.etis.ee/CV/Timo Tõnis_Sikka/est
timo.tonis.sikka@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
12.11.2018–...   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, spetsialist (0,10)
 
 
Haridustee
2016–...   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Geenitehnoloogia, doktoriõpe
2015–2016   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Geenitehnoloogia, magistriõpe

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Timo Tõnis Sikka, magistrikraad, 2016, (juh) Tõnu Esko, Immuunoglobuliin G glükosüleerimist mõjutavad DNA variatsioonid Eesti populatsioonis, Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu.
Timo Tõnis Sikka, doktorant, (juh) Tõnu Esko; Andres Metspalu, Applications for long range haplotyping and phasing in endogamous populations (Uudsed meetodid ja rakendused pikkade haplotüüpide faasimiseks endogaamsetes populatsioonides), Tartu Ülikool.
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS KLASSIFIKAATOR: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2020
Klarić, Lucija; Tsepilov, Yakov A; Stanton, Chloe M; Mangino, Massimo; Sikka, Timo Tõnis; Esko, Tõnu; Pakhomov, Eugene; Salo, Perttu; Deelen, Joris; McGurnaghan, Stuart J; Keser, Toma; Vučković, Frano; Ugrina, Ivo; Krištić, Jasminka; Gudelj, Ivan; Štambuk, Jerko; Plomp, Rosina; Pučić-Baković, Maja; Pavić, Tamara; Vilaj, Marija ... Hayward, Caroline (2020). Glycosylation of immunoglobulin G is regulated by a large network of genes pleiotropic with inflammatory diseases. Science Advances, 6 (8), eaax0301−eaax0301.10.1126/sciadv.aax0301.
6.7.
2019
Kals, Mart; Nikopensius, Tiit; Läll, Kristi; Pärn, Kalle; Tõnis Sikka, Timo; Suvisaari, Jaana; Salomaa, Veikko; Ripatti, Samuli; Palotie, Aarno; Metspalu, Andres; Esko, Tõnu; Palta, Priit; Mägi, Reedik; (2019). Advantages of genotype imputation with ethnically matched reference panel for rare variant association analyses. bioRxiv, 579201.10.1101/579201.
3.04.2020

Timo Tõnis Sikka

https://www.etis.ee/CV/Timo Tõnis_Sikka/eng
timo.tonis.sikka@ut.ee

Career

Institutions and positions
12.11.2018–...   
University of Tartu, Institute of Genomics, Specialist (0,10)
 
 
Education
2016–...   
University of Tartu, PhD student, gene technology
2015–2016   
University of Tartu, MSc in gene technology

Qualifications

Academic degrees
Timo Tõnis Sikka, Master's Degree, 2016, (sup) Tõnu Esko, Immuunoglobuliin G glükosüleerimist mõjutavad DNA variatsioonid Eesti populatsioonis (The role of genetic variants on immunoglobulin G glycosylation in Estonian population), University of Tartu, Estonian Genome Center.
Timo Tõnis Sikka, Phd student, (sup) Tõnu Esko; Andres Metspalu, Applications for long range haplotyping and phasing in endogamous populations, University of Tartu.
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS CLASSIFICATION: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
 
 

Projects in progress

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2020
Klarić, Lucija; Tsepilov, Yakov A; Stanton, Chloe M; Mangino, Massimo; Sikka, Timo Tõnis; Esko, Tõnu; Pakhomov, Eugene; Salo, Perttu; Deelen, Joris; McGurnaghan, Stuart J; Keser, Toma; Vučković, Frano; Ugrina, Ivo; Krištić, Jasminka; Gudelj, Ivan; Štambuk, Jerko; Plomp, Rosina; Pučić-Baković, Maja; Pavić, Tamara; Vilaj, Marija ... Hayward, Caroline (2020). Glycosylation of immunoglobulin G is regulated by a large network of genes pleiotropic with inflammatory diseases. Science Advances, 6 (8), eaax0301−eaax0301.10.1126/sciadv.aax0301.
6.7.
2019
Kals, Mart; Nikopensius, Tiit; Läll, Kristi; Pärn, Kalle; Tõnis Sikka, Timo; Suvisaari, Jaana; Salomaa, Veikko; Ripatti, Samuli; Palotie, Aarno; Metspalu, Andres; Esko, Tõnu; Palta, Priit; Mägi, Reedik; (2019). Advantages of genotype imputation with ethnically matched reference panel for rare variant association analyses. bioRxiv, 579201.10.1101/579201.
3.04.2020

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
Lihtotsing Tühjenda
  • Leitud 5 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
1.1.5.3.4.1.3.2.; 1.1.5.3.4.1.3.2.6.SP1GI18045T (MOBERA5; 462-16-100)Geenide-keskkonna vastastikune mõju tervishoiu ja hariduse ebavõrdsuse tekkimisel (GEIGHEI)01.03.201828.02.2021Tõnu EskoTartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut143 809,00 EUR
TKSLTMR16142T (TK142)Genoomika ja Siirdemeditsiini Tippkeskus (TK142)01.01.201601.03.2023Andres MetspaluTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu4 474 349,50 EUR
PUT; PUT_SPPUT1660Harvaesinevate genetiliste variantide mõju hindamine tervisekäitumisele populatsiooni isolaatides01.01.201731.12.2020Tõnu EskoTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut214 680,00 EUR
IUTIUT20-60Oomiksi põhised meetodid terviseuuringutes: integreeritud lähenemine haiguste tekkeprotsesside mõistmiseks ja prognoosimiseks01.01.201431.12.2019Andres MetspaluTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut1 327 800,00 EUR
1.1.5.3.4.1.3.2.; 1.1.5.3.4.1.3.2.2.SP1GI20181T (MOBERA21)Südamerütmihäirete aluseks oleva kodade elektrijuhtivuse määrajate uurimine (ERA-CVD)01.04.202030.04.2022Tõnu EskoTartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut144 245,20 EUR