Struktuur

Asutuse üldandmed

Genoomika ja proteoomika õppetool
Chair of Genomics and Proteomics
avalik-õiguslik juriidiline isik
Peep Palumaa

Kontakt

Eesti Vabariik
Akadeemia tee 15
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
MUU502FAlzheimeri tõve ravimite in vitro skriiningtesti väljatöötamine01.01.200531.12.2007Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool714 924,71 EUR
MUUBF11Apolipoproteiinide A5, C2 ja E struktuur ja funktsioonid01.07.200531.12.2005Aivar LõokeneTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool9 586,75 EUR
MUUBF108Kromatograafia seadme Äkta FPLC komplekteerimine ja töökorda seadmine01.11.200831.12.2008Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool14 060,56 EUR
MUUBF129Kromatograafia seadmete täiustamine fluorestsents detektoriga01.12.200931.03.2010Tiina KirsipuuTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool10 296,17 EUR
MUUG4925 (ETF4925)Lipoproteiinlipaasi funktsioone reguleerivad molekulaarsed mehhanismid01.01.200131.12.2004Aivar LõokeneTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool21 442,36 EUR
MUUBF127MALDI-TOF Mass-spektromeetri Voyager STR garantii, hooldusleping 201001.11.200930.04.2010Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool19 812,61 EUR
MUUG4287 (ETF4287)Metallotioneiini struktuur ja funktsioon01.01.200031.12.2002Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool16 617,03 EUR
MUUVE16052Wisoni tõve ravimite toimemehhanism01.09.201631.12.2016Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool30 000,00 EUR
  • Leitud 57 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Kirsipuu, T.; Laks, K.; Velthut-Meikas, A.; Levkov, L.; Salumets, A.; Palumaa, P. (2015). Comprehensive elucidation of amino acid profile in human follicular fluid and plasma of in vitro fertilization patients. Gynecological Endocrinology, 31 (SUP1), 9−17.10.3109/09513590.2015.1085186.1.1.
Tiiman, Ann; Krishtal, Jekaterina; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2015). In vitro fibrillization of Alzheimer’s amyloid-β peptide (1-42). AIP Advances, 5, 092401.10.1063/1.4921071.1.1.
Noormägi, A.; Valmsen, K.; Tõugu, V.; Palumaa, P. (2015). Insulin Fibrillization at Acidic and Physiological pH Values is Controlled by Different Molecular Mechanisms. The Protein Journal, 34 (6), 398−403.10.1007/s10930-015-9634-x.1.1.
Friedemann, Merlin; Helk, Eneken; Tiiman, Ann; Zovo, Kairit; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2015). Met-35 oxidation in Aβ peptide and its effect on aggregation. Biochemistry and Biophysics Reports, 3, 94−99.10.1016/j.bbrep.2015.07.017.1.1.
Bragina, O.; Gurjanova, K.; Krishtal, J.; Kulp, M.; Karro, N.; Tõugu, V.; Palumaa, P. (2015). Metallothionein 2A affects the cell respiration by suppressing the expression of mitochondrial protein cytochrome c oxidase subunit II. Journal of Bioenergetics and Biomembranes, 47 (3), 209−216.10.1007/s10863-015-9609-9.1.1.
Krishtal, Jekaterina; Friedemann, Merlin; Tõugu, Vello; Palumaa, Peep (2015). FIBRILLIZATION OF THE MIXTURES OF AMYLOID BETA 1 -40 AND 1 -42. Neurodegenerative Diseases: 12th International Conference on Alzheimer's and Parkinson's Diseases Nice, France March 18-22, 2015. 5.1.
Friedemann, Merlin; Helk, Eneken; Tiiman, Ann; Zovo, Kairit; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2015). Oxidation of Methionine-35 in Alzheimer’s amyloid-beta peptide and the aggregation of the oxidized peptide. SpringerPlus, 4: European Society of Neurochemistry Coference: Molecular Mechanisms of Regualtion in the Nervous System, Tartu, Estonia, June 14-17, 2015. Springer, P13. (S1).5.1.
Krishtal, Jekaterina; Bragina, Olga; Metsla, Kristel; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2015). Toxicity of amyloid beta 1-40 and 1-42 on Sh-SY5Y cell line. SpringerPlus, 4: European Society of Neurochemistry Coference: Molecular Mechanisms of Regualtion in the Nervous System, Tartu, Estonia, June 14-17, 2015. Springer, P19. (S1).5.1.
Gavrilova, Julia; Tõugu, Vello: Palumaa, Peep (2014). Affinity of zinc and copper ions to insulin monomers. Metallomics, 6, 1296−1300.DOI:10.1039/C4MT00059E.1.1.
Brancaccio, D.; Gallo, A.; Mikolajczyk, M.; Zovo, K.; Palumaa, P.; Novellino, E.; Piccioli, M.; Ciofi-Baffoni, S.; Banci, L. (2014). Formation of [4Fe-4S] clusters in the mitochondrial iron-sulfur cluster assembly machinery. Journal of the American Chemical Society, 136, 16240−16250.1.1.
Tõugu, Vello; Friedemann, Merlin; Tiiman, Ann; Palumaa, Peep (2014). Copper(II) ions and the Alzheimer's amyloid-β peptide: Affinity and stoichiometry of binding. AIP Conference Proceedings: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering (ICCMSE) 2014, Athens, Greece, 4-7 April 2014. Ed. T. E. Simos , Z. Kalogiratou, T. Monovasilis. American Institute of Physics, 109−111. (1618).10.1063/1.4897689.3.1.
Palumaa, P.; Banci, L.; Bertini, I.; Ciofi-Baffoni, S.; Zovo, K. (2014). Structural and functional insight into trafficking of copper in the cell. Journal of Biological Inorganic Chemistry, 19: 12th European Biological Inorganic Chemistry Conference (EuroBIC), Zürich, SWITZERLAND, AUG 24-28, 2014. Springer Verlag, S851−S851. (Supplement 2).5.1.
Wärmlander, Sebastian; Tiiman, Ann; Abelein, Axel; Luo, Jinghui; Jarvet, Jüri; Söderberg, Kajsa L; Danielsson, Jens; Gräslund, Astrid. (2013). Biophysical Studies of the Amyloid beta-Peptide: Interactions with Metal Ions and Small Molecules. Chembiochem : a European journal of chemical biology, 14 (14), 1692−1704.1.1.
Palumaa, P. (2013). Copper chaperones. The concept of conformational control in the metabolism of copper. FEBS Letters, 587 (13), 1902−1910.1.1.
Tiiman, Ann; Noormägi, Andra; Friedemann, Merlin; Krishtal, Jekaterina; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2013). Effect of agitation on the peptide fibrillization: Alzheimer’s amyloid- b peptide 1-42 but not amylin and insulin fibrils can grow under quiescent conditions. Journal of Peptide Science, 19, 386−391.1.1.
Tiiman, Ann; Palumaa, Peep; Tõugu, Vello (2013). The Missing Link in the Amyloid Cascade of Alzheimer's Disease - Metal Ions. Neurochemistry International, 62 (4), 367−378.1.1.
Taler-Verčič, A.; Kirsipuu, T.; Friedemann, M.; Noormägi, A.; Polajnar, M.; Smirnova, J.; Znidarič, MT.; Zganec, M.; Skarabot, M.; Vilfan, A.; Staniforth, RA.; Palumaa, P.; Zerovnik, E. (2013). The role of initial oligomers in amyloid fibril formation by human stefin B. International Journal of Molecular Sciences, 14 (9), 18362−18384.1.1.
Kirsipuu, Tiina; Laks, Katrina; Velthut-Meikas, Agne; Palumaa, Peep. (2013). Amino acid profiling in human follicular fluid and plasma of IVF patients. FEBS Journal, 280: 38th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), Saint Petersburg, RUSSIA, JUL 06-11, 2013. Wiley-Blackwell, 282−282. (SI).5.1.
Friedemann, Merlin; Tougu, Vello; Kirsipuu, Tiina; Palumaa, Peep. (2013). Amyloid beta 1-42 oligomerization in vitro and characterization with SDS-PAGE, MALDI and ESI MS. FEBS Journal SI, 280: 38th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), Saint Petersburg, RUSSIA, JUL 06-11, 2013. Wiley-Blackwell, 140−141.5.1.
Laks, Katrina; Kirsipuu, Tiina; Dmitrijeva, Tuuli; Salumets, Andres; Palumaa, Peep (2013). Assessment of blood contamination in biological fluids using MALDI-TOF MS. FEBS Journal, 280: 38th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), Saint Petersburg, RUSSIA, JUL 06-11, 2013. Wiley-Blackwell, 489−489. (SI).5.1.
Palumaa, P. (2013). Structure and functioning of copper chaperones. FEBS Journal, 280: 38th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), Saint Petersburg, RUSSIA, JUL 06-11, 2013. Wiley-Blackwell, 151−151. (Special Issue: SI; Supplement: 1).5.1.
Tõugu, V.; Palumaa, P. (2012). Coordination of zinc ions to the key proteins of neurodegenerative diseases: amyloid-β peptide, APP, α-synuclein and prion protein. Coordination Chemistry Reviews, 256, 2219−2224.1.1.
Banci, L.; Bertini, I.; Cantini, F.; Kozyreva, T.; Massagni, C.; Palumaa, P.; Rubino, JT.; Zovo, K. (2012). Human superoxide dismutase 1 (hSOD1) maturation through interaction with human copper chaperone for SOD1 (hCCS). PNAS, 109 (34), 13555−13560.1.1.
Noormägi, A.; Primar, K.; Tõugu, V.; Palumaa, P. (2012). Interference of low-molecular substances with the thioflavin-T fluorescence assay of amyloid fibrils. Journal of Peptide Science, 18 (1), 59−64.10.1002/psc.1416.1.1.
Smirnova, J.; Muhhina, J.; Tõugu, V.; Palumaa, P. (2012). Redox and metal ion binding properties of human IGF-1 determined by ESI-MS. Biochemistry, 51, 5851−5859.1.1.
  • Leitud 1 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Fluorescent labeling of peptides monitored by MALDI MS.Friedemann, MerlinmagistrikraadPeep PalumaaKaitstud2010Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool