See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Struktuur

Asutuse üldandmed

Bioinformaatika õppetool
Chair of Bioinformatics
31.12.2015
avalik-õiguslik juriidiline isik

Kontakt

Eesti Vabariik
Tartu
Riia 23 - 303-306
(+372) 737 5001
(+372) 742 0286
  • Leitud 78 kirjet
PublikatsioonAutoridAastaVäljaande pealkiriKlassifikaatorFailAsutused
Protein Structure-Guided Hidden Markov Models (HMMs) as A Powerful Method in the Detection of Ancestral Endogenous Viral ElementsKirsip, Heleri; Abroi, Aare2019Viruses1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in cultureKarmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; Wilson Sayres, Melissa A; Järve, Mari; Talas, Ulvi Gerst; Rootsi, Siiri; Ilumäe, Anne-Mai; Mägi, Reedik; Mitt, Mario; Pagani, Luca; Puurand, Tarmo; Faltyskova, Zuzana; Clemente, Florian; Cardona, Alexia; Metspalu, Ene; Sahakyan, Hovhannes; Yunusbayev, Bayazit; Hudjashov, Georgi; DeGiorgio, Michael ... Kivisild, Toomas2015Genome Research1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Evolutsioonilise bioloogia õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool;
Tartu Ülikool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Haplotype phasing and inheritance of copy number variants in nuclear families Palta, Priit; Kaplinski, Lauris; Nagirnaja, Liina; Veidenberg, Andres; Möls, Märt; Nelis, Mari; Esko, Tõnu; Metspalu, Andres; Laan, Maris; Remm, Maido2015PLOS ONE1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Inimese molekulaargeenetika uurimisgrupp;
Helsingi Ülikool, Biotehnoloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Matemaatilise statistika instituut, Matemaatilise statistika õppetool;
Sihtasutus Geenikeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool;
Bostoni Lastehaigla, Endokrinoloogia osakond;
Harvardi Meditsiinikool, Geneetika teaduskond;
Broadi Instituut;
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu
Microbial population dynamics in response to Pectobacterium atrosepticum infection in potato tubersKõiv, V.; Roosaare, M.; Vedler, E; Kivistik., P A; Toppi, K.; Schryer, DW.; Remm, M.; Tenson, T; Mäe, A.2015Scientific Reports1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Eesti Taimekasvatuse Instituut
Development of a multiplex real-time PCR assay for the rapid diagnosis of neonatal late onset sepsisvan den Brand, M.; Peters, R.P.; Catsburg, A.; Rubenjan, A.; Broeke, F.J.; van den Dungen, F.A.; van Weissenbruch, M.M.; van Furth, A.M.; Kõressaar, T.; Remm, M.; Savelkoul, P.H.; Bos, M.P.2014Journal of Microbiological Methods1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
Development of a multiplex real-time PCR assay for the rapid diagnosis of neonatal late onset sepsis.van den Brand M; Peters RP; Catsburg A; Rubenjan A; Broeke FJ; van den Dungen FA; van Weissenbruch MM; van Furth AM; Kõressaar T; Remm M; Savelkoul PH; Bos MP.2014Journal of Microbiological Methods1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Macrolide antibiotics allosterically predispose the ribosome for translation arrest.Sothiselvam, S; Liu, B; Han, W; Ramu, H; Klepacki, D; Atkinson, GC; Brauer, A; Remm, M; Tenson, T; Schulten, K; Vázquez-Laslop, N; Mankin, AS.2014Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America1.1.Tartu Ülikool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut
Profile of whole blood gene expression following immune stimulation in a wild passerineMeitern, Richard; Andreson, Reidar; Hõrak, Peeter2014BMC Genomics1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Zooloogia osakond;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Structural genomic variation as risk factor for idiopathic recurrent miscarriageNagirnaja, Liina; Palta, Priit; Kasak, Laura; Rull, Kristiina; Christiansen, Ole B.; Nielsen, Henriette S.; Steffensen, Rudi; Esko, Tõnu; Remm, Maido; Laan, Maris2014Human Mutation1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Naistekliinik;
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut;
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
Position-specific scoring matrix and hidden Markov model complement each other for the prediction of conopeptide superfamiliesKoua, D; Laht, S; Kaplinski, L; Stöcklin, R; Remm, M; Favreau, P; Lisacek, F2013Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
Primer Design for Large-Scale Multiplex PCR and Arrayed Primer Extension (APEX)Remm, Maido; Krjutškov, Kaarel; Metspalu, Andres2013PCR Technology: Current Innovation - 3rd Edition3.1.Tartu Ülikool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool
Characterization of Species-Specific Repeats in 613 Prokaryotic SpeciesKoressaar, Triinu; Remm, Maido2012DNA Research1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
ConoDictor: a tool for prediction of conopeptide superfamiliesKoua, D.; Brauer, A.; Laht, S.; Kaplinksi, L.; Favreau, P.; Remm, M.; Lisacek, F.; Stöcklin, R.2012Nucleic Acids Research1.1.Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Genome and low-iron response of an oceanic diatom adapted to chronic iron limitationLommer, Markus; Specht, Michael; Roy, Alexandra-Sophie; Kraemer, Lars; Andreson, Reidar; Gutowska, Magdalena A.; Wolf, Juliane; Bergner, Sonja V.; Schilhabel, Markus B.; Klostermeier, Ulrich C.; Beiko, Robert G .; Rosenstiel, Philip; Hippler, Michae; LaRoche, Julie.2012Genome Biology1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
High-resolution picture of a venom gland transcriptome: Case study with the marine snail Conus consorsTerrat Y, Biass D, Dutertre S, Favreau P, Remm M, Stöcklin R, Piquemal D, Ducancel F.2012Toxicon1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
Identification and analysis of papillomavirus E2 protein binding sites in the human genome.Võsa, L; Sudakov, A; Remm, M; Ustav, M; Kurg, R.2012Journal of Virology1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Icosagen AS
Identification and classification of conopeptides using profile Hidden Markov ModelsLaht S, Koua D, Kaplinski L, Lisacek F, Stöcklin R, Remm M2012Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool
Littoral macroinvertebrates in lowland lakes: the effects of habitat, season, eutrophication and land use on some metrics of biological qualityTimm, H.; Möls, T.2012Fundamental and Applied Limnology (Archiv für Hydrobiologie)1.1.Eesti Maaülikool, Põllumajandus- ja keskkonnainstituut, limnoloogiakeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
No evidence of somatic DNA copy number alterations in eutopic and ectopic endometrial tissue in endometriosisSaare, Merli; Sõritsa, Deniss; Vaidla, Kadri; Palta, Priit; Remm, Maido; Laan, Martti; Karro, Helle; Sõritsa, Andrei; Salumets, Andres; D'Hooghe, Thomas; Peters, Maire2012Human Reproduction1.1.Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Naistekliinik, Sünnitusabi ja günekoloogia õppetool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Naistekliinik;
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Üld- ja molekulaarpatoloogia instituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Üld- ja molekulaarpatoloogia instituut, Molekulaarpatoloogia uurimisgrupp;
Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS (endine Reproduktiivmeditsiini TAK AS) ;
Reproduktiivmeditsiini ja -bioloogia Tehnoloogia Arenduskeskuse AS;
SA Tartu Ülikooli Kliinikum, Tartu Ülikooli kliinikumi naistekliinik
Primer3 - new capabilities and interfacesUntergasser, Andreas; Cutcutache, Ioana; Koressaar, Triinu; Ye, Jian; Faircloth, Brant C; Remm, Maido; Rozen, Steve.2012Nucleic Acids Research1.1.Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
The Mitochondrial Genome of the Venomous Cone Snail Conus consorsBrauer, A.; Kurz, A.; Stockwell, T.; Baden-Tillson, H.; Heidler, J.; Wittig, I.; Kauferstein, S.; Mebs, D.; Stöcklin, R.; Remm, M.2012PLOS ONE1.1.Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
A Computational Study of Elongation Factor G (EFG) Duplicated Genes: Diverged Nature Underlying the Innovation on the Same Structural TemplateMargus, T.; Remm, M.; Tenson, T.2011PLOS ONE1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut
A parallel SNP array study of genomic aberrations associated with mental retardation in patients and general population in Estonia. Männik, K; Parkel, S; Palta, P; Zilina, O; Puusepp, H; Esko, T; Mägi, R; Nõukas, M; Veidenberg, A; Nelis, M; Metspalu, A; Remm, M; Ounap, K; Kurg, A.2011European Journal of Medical Genetics1.1.Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Lastekliinik, Pediaatria õppetool;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool;
Tartu Ülikool
Antibiotic-induced ribosomal assembly defects result from changes in the synthesis of ribosomal proteinsSiibak, T.; Peil, L.; Dönhofer, A.; Tats, A.; Remm, M.; Wilson, D.; Tenson, T.; Remme, J.2011Molecular Microbiology1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Eesti Biokeskus
Detection of NASBA amplified bacterial tmRNA molecules on SLICSel designed microarray probesScheler, O.; Kaplinski, L.; Glynn, B.; Palta, P.; Parkel, S.; Toome, K.; Maher, M.; Barry, T.; Remm, M.; Kurg, A.2011BMC Biotechnology1.1.Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Biotehnoloogia õppetool;
Eesti Biokeskus;
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool;
Tartu Ülikool;
Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Biomeditsiini instituut