Maido Remm

11.07.1965
737 5001
maido.remm@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2016–...    Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, bioinformaatika professor (1,00)
01.02.2013–31.12.2015    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika professor (1,00)
01.02.2008–31.01.2013    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika professor (1,00)
01.01.2008–31.01.2008    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, õppetooli juhataja
01.01.2008–31.01.2008    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika professor (1,00)
01.02.2003–31.12.2007    Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, bioinformaatika professor (1,00)
2001–2004    Eesti Biokeskus, Vanemteadur (0,20)
01.01.1999–31.12.2000    järeldoktorantuur, Karolinska Institute, Center for Genomics and Bioinformatics Research
01.01.1997–31.12.1998    järeldoktorantuur, Uppsala University, Department of Molecular Biology
1990–1992    Eesti Biokeskus, Teadur (1,00)
 
 
Haridustee
1992–1997    doktorant, Tartu Ülikool
1983–1990    Tartu Ülikool, bioloogia-geograafia teaduskond, biokeemia eriala.
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2015−...    ETAG ekspertkomisjoni liige
2008−...    Rahvusvahelise Arvutusliku Bioloogia Ühingu liige
2007−...    TÜ LOTE Geenitehnoloogia ja Bioloogia õppekavade programmikomitee liige
2003−...    Molekulaar- ja Rakubioloogia instituudi nõukogu liige
2008−2015    Genoomika tippkeskuse juht
2008−2009    TKN liige
2005−2005    Seitsmenda iga-aastase Põhjamaade Bioinformaatika konverentsi Bioinformatics2005 peakorraldaja (23 esinejat ja ca 200 osalejat, peamiselt välisriikidest).
2004−2007    Bioloogia-Geograafia Teaduskonna nõukogu liige
2004−2005    24 töökohaga Linux-põhise arvutiklassi loomine ja ühendamine Eesti GRIDiga
2004−2011    Eesti HTM juures asuva Teaduskompetentsi nõukogu ekspertliige.
2004−2012    Eesti esindaja Põhjamaade Bioinformaatika ühingu juhatuses.
2004−2007    TÜ Bioloogia- Geograafia teaduskonna nõukogu liige
 
 
Loometöö
Õpik kõrgkoolidele "Bioinformaatika alused" (2015). http://www.tyk.ee/loodusteadused/00000011691;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2008, Maido Remm, Riigi teaduspreemia uurimuste tsükli “Inimgenoomi bioinformaatiline analüüs” eest
2001, Maido Remm, EC DG Research projekti Genemill repatrieerumise grant
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS ERIALA: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.1.
2015
3.1.
2015
3.1.
2015
5.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
3.1.
2007
3.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2006
3.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2005
5.2.
2005
3.1.
2004
5.2.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
5.1.
2002
5.1.
2002
5.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
5.1.
2001
1.1.
2000
1.1.
1999
1.1.
1995
1.1.
1992
1.1.
1992

Maido Remm

11.07.1965
737 5001
maido.remm@ut.ee

Career

Institution and position
01.01.2016–...    University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Professor of Bioinformatics (1,00)
01.02.2003–...    Tartu Ülikool, Professor (1,00)
01.10.2008–31.12.2015    Estonian Biocentre, Extraordinary Senior Researcher (0,20)
01.09.2007–30.09.2008    Estonian Biocentre, Extraordinary Senior Researcher (0,50)
03.01.2005–31.08.2007    Estonian Biocentre, Extraordinary Senior Researcher (0,20)
2001–2004    Estonian Biocentre, Senior Researcher (0,20)
01.01.1999–31.12.2000    Postdoc training, Karolinska Institute, Center for Genomics and Bioinformatics Research, SWEDEN
01.01.1997–31.12.1998    Postdoc training, Uppsala University, Department of Molecular Biology, Bioinformatics group, SWEDEN
1990–1992    Estonian Biocentre, Researcher (1,00)
 
 
Education
1992–1997    Ph.D. Student, University of Tartu, ESTONIA
1983–1990    University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, graduated as biochemist.
 
 
R&D related managerial and administrative work
2015−...    member of the expert commission of the Estonian Research Council
2008−...    Member of International Society of Computational Biology (ISCB)
2007−...    Member of University of Tartu programme committee for developing "Gene Technology" and "Biology" curricula for Master and Bachelor level.
2003−...    Member of council, Institute of Molecular and Cellular Biology
2008−2015    Head of the Centre of Excellence in Genomics at Estonian Biocentre
2008−2009    Member of Scientific Competence Council at Estonian Ministry of Education and Research
2005−2005    Main organizer for the 7th annual Nordic Bioinformatics conference Bioinformatics2005 in Tartu (23 speakers, ca 200 participants, mostly from outside Estonia).
2004−2007    Member of council, Faculty of Biology and Geography
2004−2005    Installation of Linux based computer class and joining it with the Estonian GRID project
2004−2011    Member of expert comission of Scientific Competence at Estonian Ministry of Education and Research.
2004−2012    Representative of Estonia in board of Nordic Society of Bioinformatics.
2004−2007    Member of council, Faculty of Biology and Geography, University of Tartu
 
 
Creative work
Textbook for graduate students "Principles of Bioinformatics" (2015).
http://www.tyk.ee/loodusteadused/00000011691;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2008, Maido Remm, National Science Award
2001, Maido Remm, EC project Genemill repatriation grant
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS SPECIALTY: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALTY: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
 
 
Additional information
PhD
University of Tartu, 1997

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.1.
2015
3.1.
2015
3.1.
2015
5.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
3.1.
2007
3.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2006
3.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2005
5.2.
2005
3.1.
2004
5.2.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
5.1.
2002
5.1.
2002
5.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
5.1.
2001
1.1.
2000
1.1.
1999
1.1.
1995
1.1.
1992
1.1.
1992
  • Leitud 20 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
MUULLTMR16091Ampitsiliini ja klindamütsiini resistentsust määravate geenide olemasolu tuvastamine tüves Lactobacillus brevis TAK 124-1 AerobEst® NCIMB4214901.04.201630.09.2016Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut1 675,00 EUR
MUUSARMB11183T (3.2.0701.11-0013)Antibiootikumresistentsuse molekulaarne multipleks diagnostika01.11.201131.12.2014Siiri KõljalgTartu Ülikool, Arstiteaduskond, Mikrobioloogia instituut575 233,00 EUR
MUULSHB-CT-2007-037592Applied venomics of the cone snail species Conus consors for the accelerated, cheaper, safer and more ethical production of innovative biomedical drugs01.02.200731.01.2012Maido RemmEesti Biokeskus500 140,99 EUR
MUUMBGMR05146RArray based sequencing-by-synthesis01.09.200531.08.2007Maido RemmTartu Ülikool134 636,02 EUR
SFSF0180026s09Bioinformaatika rakendamine genoomijärjestuste uurimiseks 01.01.200931.12.2014Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond546 107,92 EUR
MUUSLOTI12206T (3.2.0701.12-0038)Biotehnoloogiliste meetodite arendus toiduallergeenide seireks01.12.201231.08.2015Mart UstavTartu Ülikool530 136,63 EUR
MUUIBGMR05044DNA-DNA interaktsioonide modelleerimine01.03.200531.05.2007Maido RemmTartu Ülikool332 858,26 EUR
TKTK142Genoomika ja Siirdemeditsiini Tippkeskus01.01.201601.03.2023Andres MetspaluTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu3 862 819,20 EUR
TKTK10, 3.2.0101.08-0011Genoomika tippkeskus01.02.200831.08.2015Maido RemmEesti Biokeskus4 844 886,43 EUR
MUUSBGMR04008IKT rakendamine kõrghariduses. Bioinfo klaster01.12.200301.04.2004Maido RemmTartu Ülikool8 947,63 EUR
SFSF0182649s04Inimese genoomi haplotüüpse struktuuri analüüs (0182649s04)01.01.200431.12.2008Maido RemmTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond224 329,88 EUR
IUTIUT34-11Kiiremad ja usaldusväärsemad meetodid genoomijärjestuste analüüsimiseks01.01.201531.12.2020Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut288 000,00 EUR
MUULLOMR10049Kompleksdiagnostikaks sobivate praimerite ja hübridisatsiooniproovide disainimine15.04.201031.12.2012Maido RemmTartu Ülikool25 564,66 EUR
ETFETF6041Konserveerunud järjestuselementide detekteerimine eukarüootsetes genoomides võrdleva genoomika abil01.01.200531.12.2006Maido RemmEesti Biokeskus12 910,15 EUR
MUULLOMR14084Laktobatsillide genoomide võrdlus10.06.201431.08.2015Maido RemmTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut12 000,00 EUR
MUUMBGMR07249Modular Education for Interdisciplinary Systems Biology01.11.200731.12.2009Maido RemmTartu Ülikool33 464,27 EUR
MUULLOMR10018PCR-i praimerite ja Luminex hübridisatsiooniproovide disainimine"01.01.201030.06.2010Maido RemmTartu Ülikool19 173,49 EUR
MUUSLIC-513771 (LSHB-CT-2005-513771)SLIC-Biosensors in Molecular Diagnostics: Nanotechnology for the Analysis of species-specific Microbial Transcripts01.01.200531.12.2007Ants KurgEesti Biokeskus383 999,97 EUR
APSF0180026s09APVäikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema SF0180026s09 raames01.01.201031.12.2011Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond63 911,65 EUR
APSF0180026s09AP13Väikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema SF0180026s09 raames01.01.201331.12.2014Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut64 000,00 EUR
  • Leitud 83 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Toubiana, Julie; Okada, Satoshi; Hiller, Julia; Oleastro, Matias; Lagos Gomez, Macarena; Aldave Becerra, Juan Carlos; Ouachée-Chardin, Marie; Fouyssac, Fanny; Girisha, Katta Mohan; Etzioni, Amos; Van Montfrans, Joris; Camcioglu, Yildiz; Kerns, Leigh Ann; Belohradsky, Bernd; Blanche, Stéphane; Bousfiha, Aziz; Rodriguez-Gallego, Carlos; Meyts, Isabelle; Kisand, Kai; Reichenbach, Janine ... , (2016). Heterozygous STAT1 gain-of-function mutations underlie an unexpectedly broad clinical phenotype. Blood, 127 (25), 3154−3164, 10.1182/blood-2015-11-679902.1.1.
Jakobson, Liina1☯; Vaahtera, Lauri☯; Tõldsepp, Kadri☯; Nuhkat, Maris; Wang, Cun; Wang, Yuh-Shuh; Hõrak, Hanna; Valk, Ervin; Pechter, Priit; Sindarovska, Yana; Tang, Jing; Xiao, Chuanlei; Xu, Yang; Gerst Talas, Ulvi; Garcia-Sosa, Alfonso T.; Kangasjärvi, Saijaliisa; Maran, Uko; Remm, Maido; Roelfsema, M. Rob G.; Hu, Honghong ... Brosche, Mikael (2016). Natural Variation in Arabidopsis Cvi-0 Accession Reveals an Important Role of MPK12 in Guard Cell CO2 Signaling. Plos Biology, 1/25−25/25.10.1371/journal.pbio.2000322.1.1.
Brauer, Age; Telling, Kaidi; Laht, Mailis; Kalmus, Piret; Lutsar, Irja; Remm, Maido; Kisand, Veljo; Tenson, Tanel (2016). Plasmid with colistin resistance gene mcr-1 in ESBL-producing Escherichia coli strains isolated from pig slurry in Estonia. Antimicrobial agents and chemotherapy, 60 (11), 6933−36, 10.1128/AAC.00443-16.1.1.
Karmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; Wilson Sayres, Melissa A; Järve, Mari; Talas, Ulvi Gerst; Rootsi, Siiri; Ilumäe, Anne-Mai; Mägi, Reedik; Mitt, Mario; Pagani, Luca; Puurand, Tarmo; Faltyskova, Zuzana; Clemente, Florian; Cardona, Alexia; Metspalu, Ene; Sahakyan, Hovhannes; Yunusbayev, Bayazit; Hudjashov, Georgi; DeGiorgio, Michael ... Kivisild, Toomas (2015). A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture. Genome Research, 25 (4), 459−466.10.1101/gr.186684.114.1.1.
Kaplinski, Lauris; Lepamets, Maarja; Remm, Maido (2015). GenomeTester4: a toolkit for performing basic set operations - union, intersection and complement on k-mer lists. GigaScience, 4 (58), 1−8, 10.1186/s13742-015-0097-y.1.1.
Palta, Priit; Kaplinski, Lauris; Nagirnaja, Liina; Veidenberg, Andres; Möls, Märt; Nelis, Mari; Esko, Tõnu; Metspalu, Andres; Laan, Maris; Remm, Maido (2015). Haplotype phasing and inheritance of copy number variants in nuclear families. PLoS ONE, 10 (4), UNSP e0122713.10.1371/journal.pone.0122713.1.1.
Kõiv, V.; Roosaare, M.; Vedler, E; Kivistik., P A; Toppi, K.; Schryer, DW.; Remm, M.; Tenson, T; Mäe, A. (2015). Microbial population dynamics in response to Pectobacterium atrosepticum infection in potato tubers. Scientific Reports, 5 (11606), 1−18, 10.1038/srep11606.1.1.
Andreson, Reidar; Kaplinski, Lauris; Remm Maido (2015). Fast masking of repeated primer binding sites in eukaryotic genomes. In: Basu, Chhandak (Ed.). PCR Primer Design (1−16). New York: Springer. (Methods in Molecular Biology).3.1.
Kaplinski, Lauris; Remm, Maido (2015). MultiPLX: automatic grouping and evaluation of PCR primers. In: Basu, Chhadank (_EditorsAbbr). PCR Primer Design (127−142). New York: Springer. (Methods in Molecular Biology).3.1.
Naaber, Paul; Balode, Arta; Egorova, Svetlana; Huik, Kristi; Ivanova, Marina; Kaftyreva, Lidia; Kõljalg, Siiri; Kõressaar, Triinu; Lillo, Jana; Löhr, Iren; Miciuleviciene, Jolanta; Pai, Kristiine; Pavelkovich, Anastassia; Remm, Maido; Sepp, Epp (2015). The epidemiology of CTX-M group genes among clinical Escherichia coli strains in Estonia, Latvia, Lithuania, Norway and Russia. 5.2.
van den Brand, M.; Peters, R.P.; Catsburg, A.; Rubenjan, A.; Broeke, F.J.; van den Dungen, F.A.; van Weissenbruch, M.M.; van Furth, A.M.; Kõressaar, T.; Remm, M.; Savelkoul, P.H.; Bos, M.P. (2014). Development of a multiplex real-time PCR assay for the rapid diagnosis of neonatal late onset sepsis. Journal of Microbiological Methods, 106, 8−15, 10.1016/j.mimet.2014.07.034.1.1.
Sothiselvam, S; Liu, B; Han, W; Ramu, H; Klepacki, D; Atkinson, GC; Brauer, A; Remm, M; Tenson, T; Schulten, K; Vázquez-Laslop, N; Mankin, AS. (2014). Macrolide antibiotics allosterically predispose the ribosome for translation arrest. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 111 (27), 9804−9809, 10.1073/pnas.1403586111.1.1.
Nagirnaja, Liina; Palta, Priit; Kasak, Laura; Rull, Kristiina; Christiansen, Ole B.; Nielsen, Henriette S.; Steffensen, Rudi; Esko, Tõnu; Remm, Maido; Laan, Maris (2014). Structural genomic variation as risk factor for idiopathic recurrent miscarriage. Human Mutation, 35 (8), 972−982.10.1002/humu.22589.1.1.
Vedler, Eve; Heinaru, Eeva; Jutkina, Jekaterina; Viggor, Signe; Kõressaar, Triinu; Remm, Maido; Heinaru, Ain (2013). Limnobacter spp. as newly detected phenol-degraders among Baltic Sea surface water bacteria characterized by comparative analysis of catabolic genes. Systematic and Applied Microbiology, 36 (8), 525−532, 10.1016/j.syapm.2013.07.004.1.1.
Nikopensius, T; Annilo, T; Jagomägi, T; Gilissen, C; Kals, M; Krjutškov, K; Mägi, R; Eelmets, M; Gerst-Talas, U; Remm, M; Saag, M; Hoischen, A; Metspalu, A (2013). Non-syndromic Tooth Agenesis Associated with a Nonsense Mutation in Ectodysplasin-A (EDA). Journal of Dental Research, 92 (6), 507−511, 10.1177/0022034513487210.1.1.
Koua, D; Laht, S; Kaplinski, L; Stöcklin, R; Remm, M; Favreau, P; Lisacek, F (2013). Position-specific scoring matrix and hidden Markov model complement each other for the prediction of conopeptide superfamilies. Biochimica et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics, 1834 (4), 717−724, 10.1016/j.bbapap.2012.12.015.1.1.
Remm, Maido; Krjutškov, Kaarel; Metspalu, Andres (2013). Primer Design for Large-Scale Multiplex PCR and Arrayed Primer Extension (APEX). In: Tania Nolan; Stephen A. Bustin (_EditorsAbbr). PCR Technology: Current Innovation - 3rd Edition (199−207). CRC PRESS.3.1.
Koressaar, Triinu; Remm, Maido (2012). Characterization of Species-Specific Repeats in 613 Prokaryotic Species. DNA Research, 19 (3), 219−230, 10.1093/dnares/dss006.1.1.
Koua, D.; Brauer, A.; Laht, S.; Kaplinksi, L.; Favreau, P.; Remm, M.; Lisacek, F.; Stöcklin, R. (2012). ConoDictor: a tool for prediction of conopeptide superfamilies. Nucleic Acids Research, 40, W238−W241, 10.1093/nar/gks337.1.1.
Terrat Y, Biass D, Dutertre S, Favreau P, Remm M, Stöcklin R, Piquemal D, Ducancel F. (2012). High-resolution picture of a venom gland transcriptome: Case study with the marine snail Conus consors. Toxicon, 59, 34−46.1.1.
Võsa, L; Sudakov, A; Remm, M; Ustav, M; Kurg, R. (2012). Identification and analysis of papillomavirus E2 protein binding sites in the human genome. Journal of Virology, 86 (1), 348−357, 10.1128/JVI.05606-11.1.1.
Laht S, Koua D, Kaplinski L, Lisacek F, Stöcklin R, Remm M (2012). Identification and classification of conopeptides using profile Hidden Markov Models. Biochimica et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics, 1824, 488−492.1.1.
Saare, Merli; Sõritsa, Deniss; Vaidla, Kadri; Palta, Priit; Remm, Maido; Laan, Martti; Karro, Helle; Sõritsa, Andrei; Salumets, Andres; D'Hooghe, Thomas; Peters, Maire (2012). No evidence of somatic DNA copy number alterations in eutopic and ectopic endometrial tissue in endometriosis. Human Reproduction, 27 (6), 1857−1864.10.1093/humrep/des125.1.1.
Untergasser, Andreas; Cutcutache, Ioana; Koressaar, Triinu; Ye, Jian; Faircloth, Brant C; Remm, Maido; Rozen, Steve. (2012). Primer3 - new capabilities and interfaces. Nucleic Acids Research, 40 (15), e115, 10.1093/nar/gks596.1.1.
Brauer, A.; Kurz, A.; Stockwell, T.; Baden-Tillson, H.; Heidler, J.; Wittig, I.; Kauferstein, S.; Mebs, D.; Stöcklin, R.; Remm, M. (2012). The Mitochondrial Genome of the Venomous Cone Snail Conus consors. PLoS ONE, 7 (12), e51528 .1.1.
  • Leitud 21 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Identification of eukaryotic taxons from raw sequencing data using taxon-specific k-mersRaime, KairidoktorikraadMaido RemmJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Classification and identification of conopeptides using profile hidden Markov models and position-specific scoring matrices - doktorikraadMaido RemmKaitstud2015Tartu Ülikool
Computational methods for DNA copy number detection - doktorikraadMaido RemmKaitstud2015Tartu Ülikool
Development of a methodology for predicting the quality of resequencing probes - magistrikraadMaido RemmKaitstud2008Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Distribution and phylogeny of the bacterial translational GTPases and the Mqsr/YgiT regulatory system - doktorikraadTanel Tenson; Maido RemmKaitstud2013Tartu Ülikool
Erinevate in silico meetodite võrdlus PCR praimerite kvaliteedi parandamiseks - magistrikraad (teaduskraad)Andres Metspalu; Maido RemmKaitstud2002Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
From virus to host gene transfer in eukaryotesKirsip, HeleridoktorikraadAare Abroi; Maido RemmJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Improvement of PCR primer design for detection of prokaryotic species - doktorikraadMaido RemmKaitstud2012Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
Methods and software for predicting PCR failure rate in large genomes - doktorikraadMaido RemmKaitstud2008Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
Methods for fast detection of taxonomic units using second generation sequencing data - doktorikraadMaido RemmJuhendamiselTartu Ülikool
Nukleotiidide, koodonite ja aminohapete sagedused kõrge ekspressioonitasemega geenides - magistrikraadMaido Remm; Tanel TensonKaitstud2006Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Papilloomiviirustes E8 valku kodeeriva ala tuvastamine in silicoMikk PuustusmaamagistrikraadAare Abroi; Maido RemmKaitstud2014Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Polümeraasi ahelreaktsiooni modelleerimine DNA amplifitseerimiseks bakteriaalsetest genoomidest - magistrikraad (teaduskraad)Maido RemmKaitstud2006Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond
Role of viruses in evolution and evolution of virusesPuustusmaa, MikkdoktorikraadAare Abroi; Maido RemmJuhendamiselTartu Ülikool
Sequence motifs influencing the efficiency of translationBrauer, AgedoktorikraadMaido Remm; Tanel TensonKaitstud2009Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
Statistical methods for DNA copy-number detectionPriit Paltamagistrikraad (teaduskraad)Maido RemmKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Taksoni-spetsiifiliste praimerite disaini metoodika arendus ning selle rakendamine allergeensete taimeliikide tuvastamisel - magistrikraadMaido Remm; Triinu KõressaarKaitstud2015Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
The application of oligonucleotide hybridization model for PCR and microarray optimization - doktorikraadMaido RemmKaitstud2013Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
The Linkage Disequilibrium And The Selection of Genetic markers For Association Studies in European Populations - doktorikraadMaido RemmKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Valgudomeenide analüüs koonusteos Conus consors - magistrikraadMaido RemmKaitstud2014Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool
Virus identification using taxon-specific marker sequences from unassembled sequencing dataVaher, MihkeldoktorikraadMaido RemmJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
  • Leitud 1 kirjet
TüüpPrioriteedi numberPrioriteedi kuupäevPrioriteedi klassifikaatorPealkiriAutoridFailAsutused
Patentne leiutisP20080002218.04.2008Rahvusvaheline (IPC)Meetod, komplekt, oligonukleotiidid ja DNA järjestused organismide identifitseerimiseks ja/või kvantifitseerimiseks taksonspetsiifiliste nukleiinhappe järjestuste abilMaido Remm; Kai Jõers; Triinu KõressaarTartu Ülikool