26.06.1958
+372 56807898
madismetsis@gmail.com

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2015–...   
Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut, Bioloogia professor (1,00)
01.01.2001–...   
The Scripps Reasearch Institute, La Jolla, California, adjungeeritud professor neurofarmakoloogias
11.01.2013–30.08.2015   
Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Professor (1,00)
2009–01.01.2014   
Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS (endine Reproduktiivmeditsiini TAK AS) , AP juht (0,30)
01.04.2008–10.01.2013   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus, Professor (1,00)
01.12.2007–10.01.2013   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskuse juhataja kt (1,00)
01.01.2007–31.12.2011   
BiotaP OÜ, teadusnõunik
2005–31.03.2008   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool, Professor (1,00)
01.01.2004–31.12.2006   
TAI vanemteadur
01.01.2001–31.12.2001   
The Scripps Reasearch Institute, La Jolla, California, Associate professor in neuropharmacology
01.01.1996–31.12.2001   
TTÜ molekulaarbioloogia professor
01.01.1990–31.12.2005   
Karolinska Instituut, uurija, grupijuht
01.01.1986–31.12.1990   
KBFI vanemteadur
01.01.1981–31.12.1985   
Tartu Riikliku Ülikooli Üld- ja molekulaarpatoloogia Instituudi nooremteadur
 
 
Haridustee
1976–1981   
Moskva Ülikool, Bioloogia teaduskond, Molekulaarbiolooogia õppetool
1966–1981   
Tallinna 44. Keskkool
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2013−2016   
Nõukogu liige, TLU, LTTI
2013−2015   
biolooga õppesuuna juht
2007−2012   
TTÜ Matemaatika- ja Loodusteaduskonna Integreeritud Süsteemide Bioloogia Keskuse juhataja
2007−2012   
TTÜ Matemaatika-Loodusteaduskonna nõukogu liiga
1996−2005   
grupijuhtide nõukokogu liige KIs
1988−2000   
Nõukogu liige KBFIs, TTÜ GTIs
 
 
Loometöö
Rida artikleid Postimehes, Eesti Päevalehes ja Linnalehes teaduse ja ühiskonna teemadel.
 
 
Teenistuskäigu lisainfo
Lisainfo puudub;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
1999, Madis Metsis, Kapten Artur Eriksson'i stipendium (Rootsi)
1995, Madis Metsis, HHMI stipendiaat
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS ERIALA: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; PÕHISUUND: Keskonnas vabalt elavate mikroorganismide populatsioonide dünaamika , Transkriptsioonilised võrgustikud kasvavas koes, Tuumahormoonide retseptorite molekulaarsed interaktsioonide kaardistamine genoomi tasele
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.3. Geneetika; CERCS ERIALA: B220 Geneetika, tsütogeneetika ; PÕHISUUND: geeniregulatsioon, transkriptsioonilised võrgud, tuumahormoonide retseptorite molekulaarsed interaktsioonide kaardistamine genoomi tasele, geeniregulatsioon, transkriptsioonilised võrgud, geeniregulatsioon, transkriptsioonilised võrgud
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.2. Maateadused; CERCS ERIALA: B410 Mullateadus, põllumajanduslik hüdroloogia ; PÕHISUUND: Mulla mikrobioomi analüüs ja modeleerimine
 
 
Lisainfo
1985, bioloogiateaaduste kandidaat,Tartu Ülikool
1995, molekulaarse neurobioloogia dotsent, Karolinska Instituut, Rootsi

Lõppenud projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
5.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.5.
2013
3.5.
2013
5.1.
2013
5.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.3.
2012
3.2.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
3.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.1.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
5.2.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.3.
2007
1.1.
2006
5.2.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2000
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1997
1.1.
1997
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1992
1.1.
1992
1.1.
1992
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1988
1.1.
1988
1.1.
1986
1.1.
1985
1.1.
1985
1.1.
1984
1.1.
1983
1.1.
1982
5.2.
0
5.2.
0
5.2.
0
18.04.2019
26.06.1958
+372 56807898
madismetsis@gmail.com

Career

Institution(s) and position(s)
01.09.2015–...   
Tallinn University, School of Natural Sciences and Health, Professor of Biology (1,00)
01.01.2001–...   
The Scripps Reasearch Institute, La Jolla, California, adjunct professor in neuropharmacology
11.01.2013–30.08.2015   
Tallinn University, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Professor (1,00)
2009–01.01.2014   
Competence Centre on Health Technologies, WP leader (0,30)
01.04.2008–10.01.2013   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Centre for Biology of Integrated Systems, Professor (1,00)
01.12.2007–10.01.2013   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Center fo Biology of Intergrated Systems, Chairman (1,00)
01.01.2007–31.12.2011   
BiotaP OÜ, Scientifc Adviser
2005–31.03.2008   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Gene Technology, Professor (1,00)
01.01.2004–31.12.2006   
NIHD senior researcher
01.01.2001–31.12.2001   
The Scripps Reasearch Institute, La Jolla, California, Associate professor in neuropharmacology
01.01.1996–31.12.2001   
TTU professor of molecular biology
01.01.1990–31.12.2005   
Karolinska Institutet, researcher, group leader
01.01.1986–31.12.1990   
senior researcher, NICPBP
01.01.1981–31.12.1985   
Junior researcher, TU IGMP
 
 
Education
1976–1981   
Moscow University, Department of Biology, Chair of Molecular Biology
1966–1981   
Tallinn 44. Secondary School
 
 
R&D related managerial and administrative work
2013−2016   
Board member. TU, School of Natural Sciences and Health
2013−2015   
Head of biology curriculum
2007−2012   
Chairman of the Center for Biology of Integrated Sµstems, Faculty of Science, TUT
2007−2012   
Member of the board of the Deparment of Science, TUT
1996−2005   
member of groupleader board at Karolinska Institutet
1988−2000   
member of institue board at NICPBP, IBT at TTU
 
 
Creative work
Publications in newspapers on issues concerning science and society.
 
 
Additional career information
No additional information;

Qualifications

 
 
Honours & awards
1999, Madis Metsis, Kapten Artur Eriksson stipend (Sweden)
1995, Madis Metsis, HHMI fellow
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS SPECIALITY: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; SPECIALITY: Populations dynamics of free living microrganisms, Transcriptional networks in developing tissue, Genomwide mapping of Nuclear hormone receptor interactions
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.3. Genetics; CERCS SPECIALITY: B220 Genetics, cytogenetics ; SPECIALITY: regulation of gene ekspression, transcriptional networks, , regulation of gene ekspression, transcriptional networks
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.2. Geosciences; CERCS SPECIALITY: B410 Soil science, agricultural hydrology ; SPECIALITY: Analysis and modeling of the soil microbiome
 
 
Additional information
1985, PhD., Tartu University, Estonia
1995, docent in molecular neurobiology, Karolinska Institutet, Sweden

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
5.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.5.
2013
3.5.
2013
5.1.
2013
5.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.3.
2012
3.2.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
3.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
5.1.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
5.2.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.3.
2007
1.1.
2006
5.2.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2000
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1998
1.1.
1997
1.1.
1997
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1995
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1994
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1993
1.1.
1992
1.1.
1992
1.1.
1992
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1990
1.1.
1988
1.1.
1988
1.1.
1986
1.1.
1985
1.1.
1985
1.1.
1984
1.1.
1983
1.1.
1982
5.2.
0
5.2.
0
5.2.
0
18.04.2019
  • Leitud 20 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
MUULep10002Biomeditsiiniliste andmete integreerimine ja otsing01.09.200930.06.2011Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus31 636,27 EUR
MUUAR11087EESTI TEADUSARVUTUSTE INFRASTRUKTUUR01.06.201130.04.2014Madis Metsis; Jaak Simm; Thomas LepikTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus783 497,00 EUR
1.1.7.4.1.TF1816 (TLÜ uuringufondi nõukogu otsus 15.04.2016 )Genoomika labori loomine Loodus- ja terviseteaduste instituudis, rõhuga geenitehnoloogia rakendamisele keskkonna- ja terviseteadustes01.04.201631.12.2018Kairi KoortTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut37 400,00 EUR
SFSF0192109s02Helicobacter pylori infektsioon ja gastroduodenaalne patoloogia: peremehest ja mikroobist sõltuvate tegurite roll infektsiooni kliinilises väljundis (krooniline gastriit, peptiline haavand, maovähk).01.01.200231.12.2006Oleg KurtenkovTervise Arengu Instituut277 057,00 EUR
MUUEU 27376Keskonnaseire metagenoomse platvormi arendus16.07.200715.08.2007Madis MetsisBiotaTec OÜ12 725,00 EUR
MUUEU 27552Keskonnaseire metagenoomse platvormi arendus15.09.200731.08.2010Madis MetsisBiotaTec OÜ444 202,00 EUR
1.1.7.2.TRU19002A Laagna kogukonnaaia mulla analüüsimine 03.09.201830.06.2019Tiiu KoffTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut500,00 EUR
MUUEU 29922Mikrobioomide analüüs10.01.200909.04.2009Liina EekBiotaTec OÜ18 406,00 EUR
MUUF/1713 (TLÜ senati teaduskomisjoni istungi protokoll nr.14 29.04.2013 )MLI bioinformaatika arvutusbaasi loomine01.05.201331.12.2014Madis MetsisTallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut8 000,00 EUR
MUUTF1713 MLI bioinformaatika arvutusbaasi loomine 01.05.201331.05.2020Kairi KoortTallinna Ülikool2 000,00 EUR
MUUT217 (0140217Bs98)Molekulaarsed interaktsioonid ontogeneesis01.01.199831.12.2002Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool12 782,33 EUR
SFSF0140108s08Nukleotiidide metabolismis osalevad ensüümid - võrdlev biokeemia, molekulaarbioloogia ja evolutsioonilised aspektid 01.01.200831.12.2013Merike KelveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond302 690,08 EUR
MUUF/2213 (TLÜ senati teadukomisjoni istungi protokoll 18.11.2013)Pilootprojekt kombineeritud teaduskompetentsi väljakujunemiseks neurodegeneratiivsete haiguste uurimiseks TLÜ's 01.11.201331.05.2020Kairi KoortTallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut8 000,00 EUR
ETFETF7823Raku energiaühikute moodustumise dünaamika tüvirakkude differentseerumise protsessis lihasrakkudeks ja nende degradatsioon vananemise käigus01.01.200931.12.2012Valdur SaksKeemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut88 352,54 EUR
MUUB611Rakuline ja molekulaarne süsteemibioloogia01.01.200831.12.2010Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus486 904,50 EUR
MUUBF57Regulatoorsete võrkude tuvastamine normaalses ja patoloogilises koes ja selle baasil diagnostika, prognostika ja ravimidisaini meetodite loomine01.01.200731.12.2007Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool5 752,05 EUR
SFSF0222604s03Taimede ja taimeviiruste geenide ekspressiooni ja funktsiooni uurimine01.01.200331.12.2007Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond218 130,45 EUR
1.1.7.4.1.TF5916 (TLÜ uuringufondi nõukogu 25. novembri 2016. aasta koosoleku otsus nr 9/16)Tallinna Ülikooli loodus- ja terviseteaduste instituudi molekulaarteaduste labori proovimaterjali eeltöötluse metoodika kaasajastamine ja arendamine21.11.201630.01.2017Margit KaldmäeTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut8 000,00 EUR
MUUTF1515 (TLÜ senati teaduskomisjoni istungi protokoll 20.04.2015 nr 9)TLÜ käitumis- ja neuroteaduste tippkeskus 01.05.201531.12.2020Ruth ShimmoTallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut138 000,00 EUR
MUUVEU445Uue metagenoomse keskkonnamonitooringu meetodi arendus01.01.201030.06.2012Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus1 597 791,21 EUR