31.10.1983
+372 737 5013
triinu.visnapuu@ut.ee
poeg (sünd 2016)

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.02.2020–...   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikrobioloogia dotsent (1,00)
01.07.2018–31.01.2020   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikroobse glükobiotehnoloogia teadur (1,00)
01.06.2018–30.06.2018   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikroobse glükobiotehnoloogia teadur (0,50)
20.10.2016–08.01.2018   
Taani Tehnikaülikool, Lapsepuhkus (1,00)
01.01.2016–31.05.2018   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, mikroobse glükobiotehnoloogia teadur (tööleping peatatud) (1,00)
01.10.2015–31.12.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, mikroobse glükobiotehnoloogia teadur (tööleping peatatud) (1,00)
01.06.2015–08.01.2018   
Taani Tehnikaülikool, järeldoktorant (1,00)
01.10.2012–30.09.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, geneetika teadur (1,00)
2007–2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Doktorant (1,00)
 
 
Haridustee
2007–2012   
Tartu Ülikool, doktorikraad (geneetika); kraad omistatud 27.09.2012
2005–2007   
Tartu Ülikool, loodusteaduste magistri kraad, geenitehnoloogia (geneetika)
2002–2005   
Tartu Ülikool, loodusteaduste bakalaureuse kraad, geenitehnoloogia
1990–2002   
Vinni-Pajusti Gümnaasium, keskharidus (kuldmedal)
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2019−...   
COST teadlastevõrgustiku CA18132 korralduskomitee liige - Functional Glyconanomaterials for the Development of Diagnostics and Targeted Therapeutic Probes (GLYCONanoPROBES)
2019−...   
Science and Technology õppekava bakalaureusetööde kaitsmiskomisjoni liige
2018−...   
Ameerika Mikrobioloogide Seltsi esindaja Eestis (ASM Young Ambassador of Estonia)
2018−...   
FEMSi grantikomitee liige
2016−...   
Retsenseerinud käsikirju ajakirjadele Applied Microbiology and Biotechnology, Current Biotechnology, Process Biochemistry, Polymer Testing, PLOS ONE
2016−...   
Federation of European Microbiological Societies (FEMS) Eesti delegaat ja nõukogu liige
2016−...   
Taani Biotehnoloogia Seltsi liige
2014−...   
Ameerika Mikrobioloogide Ühingu (ASM) liige
2012−...   
Eesti õpilaste teadusajakirja "Akadeemiake" toimetaja ja kolleegiumi liige
2011−...   
Osalemine juhendajana rahvusvahelise bioloogiaolümpiaadi ettevalmistuskursusel
2010−...   
Vabariikliku bioloogiaolümpiaadi žürii liige: mikrobioloogia-alaste teoreetiliste ja praktiliste ülesannete väljatöötamine
2009−...   
Oponeerinud 10 bakalaureusetööd
2008−...   
Rahvusvaheline teadusalane koostöö Prof. A.D. Zamfir’i (National Institute for Research and Development in Electrochemistry and Condensed Matter, Timisoara, Rumeenia), Dr. A. Vigants'i (U. of Latvia, Riia, Läti), Prof. G. Opdenakker’i (U. of Leuven, Leuven, Holland), Dr. J. M. Mancheno (CISC, IQFR, Madriid, Hispaania), Prof. P. Stougaard'i (U. of Copenhagen, Copenhagen, Denmark), Prof. B. Svensson’iga (Taani Tehnikaülikool, Kgs. Lyngby, Taani).
2007−...   
Kaasjuhendaja bakalaureuse- ja magistritudengitele (Tartu Ülikool)
2005−...   
Eesti Mikrobioloogide Ühenduse liige
2018−2018   
Ülemaailmse Mikroobide Päeva Eesti koordinaator
2016−2016   
Juhendaja doktorandile (vahetusprogramm) ja teadusassistendile (Taani Tehnikaülikool)
2015−2015   
Tartu ülikooli Loodusmuuseumi uue püsiekspositsiooni konsultant (geneetika, mikro- ja rakubioloogia)
2014−2018   
COST teadllastevõrgustiku CM1402 "Molekulidest kristallideks - kuidas orgaanilised molekulid kristalle moodustavad?" (Crystallize) korralduskomitee asendusliige
2014−2014   
2. Balti Mikrobioloogide kongressi korraldamine 16.-19.10.2014 Tartus
2010−2014   
Teadlastevõrgustiku EUROGLYCOFORUMi liige
2007−2010   
COST 928 teadlasvõrgustiku "Ensüümide kasutamine toodete vääridamiseks" liige
 
 
Lisainfo
Täitja ja koostöö koordinaator Euroopa Regionaalarengu Fondi rahastatavas ja SA Archimedese koordineeritavas projektis 3.2.0701.12–0041 (SLOMR12215T) Uudsete levaansukraaskatalüsaatorite disain ja kasutamine funktsionaalsete toidulisandite tootmiseks (FFI; 1.10.2012-31.08.2015); põhitäitja Tiina Alamäe;
Tehtud õppetöö:
2010-2014 Mikrobioloogia ja viroloogia praktikum (LOMR.03.021; 6 EAP) Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis; 2013 aine vastutav juhendaja;
2014 Toiduainete mikrobioloogia (LOMR 03.006, 3 EAP)
2018 Practical Course in Microbiology and Virology - inglise keeles (LTMR.03.00, 6 EAP);

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2019, Triinu Visnapuu, Morrison Rogosa stipendium konverentsile ASM Microbe 2019
2019, Triinu Visnapuu, Tartu Ülikooli Arengufondi eksperimentaalarenduse toetus projektile "Scale-up production of a novel polyfructan levan by bacterial levansucrase, extremely stable and active biocatalyst" (22 000 EUR)
2018, Triinu Visnapuu, Ameerika mikrobioloogide ühenduse stipendium ASM Microbe 2018 konverentsil osalemiseks
2016, Triinu Visnapuu, Stendiettekande auhind 11. Danish Conference on Biotechnology and Molecular Biology (Vejle, Taani)
2014, Triinu Visnapuu, Kristjan Jaagu stipendium noorteadlasele lühiajaliseks välislähetuseks
2011, Triinu Visnapuu, Parima stendiettekane auhind konverentsil Glycosciences in the International Year of Chemistry: Applications to Human Health and Disease (Lissabon, Portugal)
2010, Triinu Visnapuu, ESF'i programmi DoRa tegevus 6 stipendium
2008, Triinu Visnapuu, COST928 lühiajaline uurimisstipendium
2006, Triinu Visnapuu, FEMS'i uurimisstipendium noorele teadlasele
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.1. Biokeemia; CERCS KLASSIFIKAATOR: P310 Proteiinid, ensümoloogia
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS KLASSIFIKAATOR: T360 Biokeemiatehnoloogia
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS KLASSIFIKAATOR: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia
ETIS KLASSIFIKAATOR: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika); CERCS KLASSIFIKAATOR: T490 Biotehnoloogia
 
 
Lisainfo
Minu teadustöö on seotud glükobioloogia, valkude heteroloogilise ekspressiooniga nii bakterites kui pärmides, ensüümide ja biotehnoloogiaga. Senises uurimistöös olen keskendunud biotehnoloogilise potensiaaliga ensüümide, levaansukraaside, endo-levanaaside, a-glükosidaaside uurimisele. Levaansukraaside sünteesiproduktide hulgas on erineva koostide ja pikkusega suhkruid. Olen mitmekülgselt ja erinevate meetoditega iseloomustanud Pseudomonas'e perekonda kuuluvate bakterite levaansukraase ja nende produkte. Oleme fruktaane tootnud, puhastanud ning uurinud nende kasutusvõimalusi funktsionaalsete toidulisanditena ning biotehnoloogilistes protsessides. Järeldoktorantuuri projekti raames keskendusin uute N-atsetüülheksoosaminidaaside avastamise, iseloomustamise ja puhastamisele eesmärgiga sünteesida rinnapiima oligosahhariidide prekursoreid.
Erialane enesetäiendus (kursused, workshopid):

Workshop „Protein.DTU. Future trends in protein science“ Taani Tehnikaülikool, Kgs. Lyngby, Taani; 1.12.2015
Sümpoosium „The Novozymes prize symposium. Carbohydrate-active enzye discovery, characterization and engineering“ Novo Nordisk Foundation, Hellerup, Taani; 19.11.2015

Konverents „Kuidas teadus TerVEt rahvast teenib?“ ETAG, Tartu; 27.03.2015

EL Raamprogrammi Horisont 2020 avakonverents, ETAG, Tallinn; 31.01.2014

Kursus „ Kaasaegsed Morfoloogia meetodid“ VL.1180, 2 EAP, Eesti Maaülikool; 18.-22.03.2013

Workshop „Increasing the Impact of Glycoscience through New Tools and Technologies“ CIC biomaGUNE, San Sebastian, Hispaania; 19.-21.07.2012

Seminar “Structural glycoscience: methods and instrumentation” IBS ja ESRF/ILL, Grenoble, Prantsusmaa; 29.06-1.07.2010

10. Glükoteaduste suvekool (Summer Course Glycosciences), Wageningeni Ülikool, Wageningen, Holland; 09-12.06.2008

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6.12.2019
31.10.1983
+372 737 5013
triinu.visnapuu@ut.ee
son (born 2016)

Career

Institutions and positions
01.02.2020–...   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Associate Professor in Microbiology (1,00)
01.07.2018–31.01.2020   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Research Fellow (1,00)
01.06.2018–30.06.2018   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Research Fellow (0,50)
20.10.2016–08.01.2018   
Technical University of Denmark, Maternity leave (1,00)
01.01.2016–31.05.2018   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology, Research Fellow (contract on hold) (1,00)
01.10.2015–31.12.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (contract on hold) (1,00)
01.06.2015–08.01.2018   
Technical University of Denmark (DTU), postdoc (1,00)
01.10.2012–30.09.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow in Genetics (1,00)
2007–2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, PhD student (1,00)
 
 
Education
2007–2012   
University of Tartu, PhD (genetics); degree granted 27.09.2012
2005–2007   
University of Tartu, MSc of life sciences, gene technology (genetics)
2002–2005   
University of Tartu, BSc of life sciences, gene technology
1990–2002   
Vinni-Pajusti Gümnaasium, highschool (with the highest distinction)
 
 
R&D related managerial and administrative work
2019−...   
Management Committee member of COST Action CA18132 - Functional Glyconanomaterials for the Development of Diagnostics and Targeted Therapeutic Probes (GLYCONanoPROBES)
2019−...   
Member of the Evaluation Commitee of BSc thesis in Science and Technology curriculum (in English)
2018−...   
American Society for Microbiology (ASM) Young Ambassador of Estonia
2018−...   
Member of FEMS Grants Board
2016−...   
Referee for jounals Applied Microbiology and Biotechnology, Current Biotechnology, Polymer Testing, Process Biochemistry, PLOS ONE
2016−...   
Council member of Federation of European Microbiological Societies (FEMS) and Delegate from Estonia
2016−...   
Member of Danish Biotechnological Society
2014−...   
Member of American Society for Microbiology (ASM)
2012−...   
Editor and board member of Estonian students scientific journal “Akadeemiake”
2011−...   
Participation as a supervisor in preparatory course for IBO (International Biology Olympiad)
2010−...   
Member of Estonian National Biology Olympiad committee: elaboration of theoretical and practical works in microbiology
2009−...   
Referee for 10 BSc thesis
2008−...   
International scientific collaboration with Prof. A.D. Zamfir (National Institute for Research and Development in Electrochemistry and Condensed Matter, Timisoara, Romania), Dr. A. Vigants (U. of Latvia, Riga, Latvia), Prof. G. Opdenakker (U. of Leuven, Leuven, The Netherlands), Dr. J. M. Mancheno (CISC, IQFR, Madrid, Spain), Prof. P. Stougaard (U. of Copenhagen, Copenhagen, Denmark), Prof. B. Svensson (Technical University of Denmark, Kgs. Lyngby, Denmark).
2007−...   
Cosupervisor for BSc and MSc students (University of Tartu)
2005−...   
Member of Estonian Society for Microbiology
2018−2018   
Coordinator of International Microorganism Day event at Estonia
2016−2016   
Supervisor for visiting PhD student and research assistant (Technical University of Denmark)
2015−2015   
Consultant for new permanent exhibition of University of Tartu Natural History Museum (genetics, micro- and cell biology)
2014−2018   
Management Committee substitute member of CMST COST Action CM1402 “From molecules to crystals - how do organic molecules form crystals? (Crystallize)”
2014−2014   
Organizer of 2nd Congress of Baltic Microbiologists held in Tartu 16.-19.2014
2010−2014   
Member of The Euroglycosciences Forum (EUROGLYCOFORUM)
2007−2010   
Member of COST 928 Action science network "Control and exploitation of enzymes for added-value products"
 
 
Additional information
Researcher and cooperation manager in the European Regional Development Fund project 3.2.0701.12–0041 (SLOMR12215T) Design and application of novel levansucrase catalysts for the production of functional food ingredients (Functional Food Ingredients; 1.10.2012-31.08.2015), principal investigator Tiina Alamäe ;
Teaching:
2010-2014 Practical Course of Microbiology and Virology (LOMR.03.021; 6 ECTS) in University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology; 2013, principal supervisor of the course;
2014 Food Microbiology (LOMR 03.006; 3 ECTS) in University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Molecular and Cell Biology
2018 Practical Course in Microbiology and Virology - in English (LTMR.03.00, 6 ECTS) ;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2019, Triinu Visnapuu, Morrison Rogosa Travel Award to American Society for Microbiology conference ASM Microbe 2019
2019, Triinu Visnapuu, University of Tartu Feasibility Fund grant to the project "Scale-up production of a novel polyfructan levan by bacterial levansucrase, extremely stable and active biocatalyst" (22 000 EUR)
2018, Triinu Visnapuu, ASM Student and Postdoctoral Travel Award to ASM Microbe 2018
2016, Triinu Visnapuu, Poster prize at 11. Danish Conference on Biotechnology and Molecular Biology (Vejle, Denmark)
2014, Triinu Visnapuu, Mobility grant for young researchers for foreign visit (Kristjan Jaak Scolarship) from Estonian Ministry of Education
2011, Triinu Visnapuu, The best poster prize at conference Glycosciences in the International Year of Chemistry: Applications to Human Health and Disease (Lisbon, Portugal)
2010, Triinu Visnapuu, Activity 6 stipend of the ESF DoRa Programme
2008, Triinu Visnapuu, COST928 Short Term Scientific Mission grant
2006, Triinu Visnapuu, FEMS research grant for young researcher
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.1. Biochemistry; CERCS CLASSIFICATION: P310 Proteins, enzymology
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS CLASSIFICATION: T360 Biochemical technology
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS CLASSIFICATION: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology
ETIS CLASSIFICATION: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering; CERCS CLASSIFICATION: T490 Biotechnology
 
 
Additional information
My research has been connected to glycobiology, heterologous protein expression in bacterial and yeast systems, enzymology and biotechnology. In my scientific research I have been focusing on bacterial levansucrases, endo-levanases and a-glycosidases – enzymes with biotechnological potential. Levansucrases produce a variety of fructans with different composition and chain lengths. I have been studying levansucrases from Pseudomonas bacteria: expressed the respective genes in Escherichia coli, purifying the enzymes and investigating their properties. We also produced, purified, characterized and studied the potential applications of fructans as functional food ingredients. During my postdoctoral project I was focusing on the discovery, characterization and purification of N-acetylhexosaminidases to synthesize human milk oligosaccharides precursors.
Workshops and special courses:
Workshop „Protein.DTU. Future trends in protein science“ Technical University of Denmark, Kgs. Lyngby, Denmark; 1.12.2015

Symposium „The Novozymes prize symposium. Carbohydrate-active enzye discovery, characterization and engineering“ Novo Nordisk Foundation, Hellerup, Denmark; 19.11.2015

Conference „Kuidas teadus TerVEt rahvast teenib?“ ETAG, Tartu; 27.03.2015

EL frameprogram Horisont 2020 opening conference, ETAG, Tallinn; 31.01.2014

Course „Up-to-date methods in Morphology“ („Kaasaegsed Morfoloogia meetodid“ VL.1180, 2 EAP), Eesti Maaülikool; Tartu; 18.-22.03.2013

Workshop „Increasing the Impact of Glycoscience through New Tools and Technologies“ CIC biomaGUNE, San Sebastian, Spain; 19.-21.07.2012

Seminar “Structural glycoscience: methods and instrumentation” IBS ja ESRF/ILL, Grenoble, France; 29.06-1.07.2010

10. Summer Course Glycosciences, U. of Wageningen, Wageningen, The Netherlands; 09-12.06.2008

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6.12.2019
  • Leitud 7 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF7528Hansenula polymorpha MAL geenid, promootorid ja valgud: alusuuringud ja biotehnoloogilised rakendused01.01.200831.12.2011Tiina AlamäeTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond85 700,57 EUR
SFSF0182562Cs03Metaboolsete protsesside regulatsioon ja geneetilised ümberkorraldused mikroorganismides; Alateema siseselt eraldiseisev töö (Dots. T. Alamäe) Geeniekspressiooni regulatsiooni uurimine metülotroofsetel pärmidel01.01.200331.12.2007Maia KivisaarTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond245 292,91 EUR
ETFETF9072Pseudomonas syringae levaansukraasi struktuur ja funktsioon: alusuuringud ja biotehnoloogilised aspektid 01.01.201231.12.2015Tiina AlamäeTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut48 000,00 EUR
SFSF0180088s08Toitained jt. keemilised efektorid signaali- ja metabolismiradade käivitajatena pro- ja eukarüootsetes mikroorganismides: metaboolsed, ökoloogilised ja rakenduslikud aspektid01.01.200831.12.2013Andres MäeTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond410 413,66 EUR
MUUSLOMR12215T (3.2.0701.12-0041)Uudsete levaansukraaskatalüsaatorite disain ja kasutamine funktsionaalsete toidulisandite tootmiseks01.10.201231.08.2015Tiina AlamäeTartu Ülikool418 573,40 EUR
PUT; PUT_OPPUT1050Uudsete prebiootikumide ensümaatiline süntees: ensüümide iseloomustamine ja produktide prebiootilise efektiivsuse hindamine 01.01.201631.12.2019Tiina AlamäeTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut249 600,00 EUR
ETFETF5676Uute mikroobsete süsteemide väljatöötamine ja testimine võõrvalkude ekspressiooniks01.01.200431.12.2007Tiina AlamäeTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond34 306,42 EUR