Kalle Olli

12.02.1967
5056239
kalle.olli@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.05.2002–31.01.2007    Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Botaanika ja ökoloogia instituut, botaanika vanemteadur (1,00)
2000–2002    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika õppetool, Teadur (1,00)
1998–2000    Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, Postdoctoral Scholar, Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, 1998-2000 (1,00)
1998–1998    orwegian College of Fishery Science, University of Tromsø, Norway, Postdoctoral Researcher, Norwegian College of Fishery Science, University of Tromsø, Norway, 1998 (1,00)
 
 
Haridustee
Diplom cum laude., Bioloogia, Tartu Ülikool, 1993
M.S., Botaanika, Tartu Ülikool, 1994
Ph.D., Botaanika ja mükoloogia, Tartu Ülikool, 1997
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2008−...    Tartu Ülikooli Loodus- ja tehonloogiateaduskonna teadus ja arendus prodekaan
2007−...    Teaduste Akadeemia merekomisjoni liige
Eesti Loodusuurijate Selts (ELUS)
Nordic Arctic Network (NARP)
NorFa kootöövõrk: “Integrated approaches to coastal eutrophication”
2003−2006    ETF, bio-geo teaduste ekspertkomisjon, ekspert

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2006, Kalle Olli, Riigi teaduspreemia
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogia; PÕHISUUND: bioloogiline okenaograafia, planktoloogia, fütoplanktoni ökoloogia
 
 
Lisainfo
ISI Researcher ID
http://www.researcherid.com/rid/G-5389-2010
Jooksvad EL grantid:
Life cycle transformations among HAB species (SEED); EU 6th framework; 2005 – 2008
Thresholds of environmental sustainability (THRESHOLDS); EU 6th framework; 2005 – 2008
Lõppenud EL grantid:
Silicate and Baltic Sea Ecosystem Response (SIBER) EU 5th framework; 2002-2005
Detection and Analyis of Nutrient Limitation: Impacts of Loading on Coastal Plankton Communities Across a Hierarchy of Temporal and Physiological-systemic Scales" (DANLIM); EU 5th framework; 2002-2004
Transfer and Fate of HAB toxins in European marine waters" (FATE); EU 5th framework; 2002-2004
Personaalsed uurimisstipendiumid:
Nordic Academy for Advanced Study (ForFa); 1993 – 1997 (vaheaegadega)
NSF/NATO Postdoctoral Fellowship 1998 – 1999
Fulbright Postdoctoral Scholarship 1999 – 2000
Woods Hole Postdoctoral Fellowship 1998 – 2000

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2016
5.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
3.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
3.4.
2011
3.4.
2011
1.1.
2010
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2004
3.1.
2003
3.1.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
1.1.
2002
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1998
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996

Kalle Olli

12.02.1967
5056239
kalle.olli@ut.ee

Career

Institution and occupation
01.05.2002–31.01.2007    University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Botany and Ecology, Senior Research Fellow (1,00)
2002–2002    Tartu University, Institute of Botany and Ecology, Senior Research Fellow, Tartu University, Institute of Botany and Ecology, 2002 (1,00)
2002–2002    Tartu University, Institute of Botany and Ecology, Extraordinary senior research fellow, Tartu University, Institute of Botany and Ecology, 2002 (1,00)
2000–2002    University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Ecology and Earth Sciences, Tartu University, Chair of Botany, Researcher (1,00)
2000–2000    Tartu University, Institute of Botany and Ecology, Research fellow, Tartu University, Institute of Botany and Ecology, 2000 (1,00)
1998–2000    Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, Postdoctoral Scholar, Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, 1998-2000 (1,00)
1998–1998    orwegian College of Fishery Science, University of Tromsø, Norway, Postdoctoral Researcher, Norwegian College of Fishery Science, University of Tromsø, Norway, 1998 (1,00)
1997–1997    Tartu University, Institute of Botany and Ecology, Research fellow, Tartu University, Institute of Botany and Ecology 1997 (1,00)
 
 
Education
Diploma cum laude., Biology, Tartu University, 1993
M.S., Botany, Tartu University, 1994
Ph.D., Botany and mycology, Tartu University, 1997
 
 
R&D related managerial and administrative work
2008−...    Vice-dean, University of Tartu, Faculty of Science and Technology
2007−...    Estonian Academy of Sciences, member of maritime commission
Estonian Naturalist Society (ELUS)
Nordic Arctic Network (NARP)
NorFa Network: “Integrated approaches to coastal eutrophication”
2003−2006    Estonian Science Foundation, expert in bio-geo sciences

Qualifications

 
 
Honours & awards
2006, Kalle Olli, National Science Prize
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.4. Ecology, Biosystematics and -physiology; SPECIALITY: biological oceanography, planktology, phytoplankton ecology
 
 
Additional information
ISI Researcher ID
http://www.researcherid.com/rid/G-5389-2010
Contract holder in current EU grants:
Life cycle transformations among HAB species (SEED); EU 6th framework; 2005 – 2008
Thresholds of environmental sustainability (THRESHOLDS); EU 6th framework; 2005 – 2008
Contract holder in previous EU grants:
Silicate and Baltic Sea Ecosystem Response (SIBER) EU 5th framework; 2002-2005
Detection and Analyis of Nutrient Limitation: Impacts of Loading on Coastal Plankton Communities Across a Hierarchy of Temporal and Physiological-systemic Scales" (DANLIM); EU 5th framework; 2002-2004
Transfer and Fate of HAB toxins in European marine waters" (FATE); EU 5th framework; 2002-2004
Personal research awards:
Nordic Academy for Advanced Study (ForFa); 1993 – 1997 (with brakes)
NSF/NATO Postdoctoral Fellowship 1998 – 1999
Fulbright Postdoctoral Scholarship 1999 – 2000
Woods Hole Postdoctoral Fellowship 1998 – 2000


Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2016
5.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
3.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
3.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
3.4.
2011
3.4.
2011
1.1.
2010
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.1.
2005
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2004
3.1.
2003
3.1.
2003
1.1.
2002
1.1.
2002
1.1.
2002
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
2001
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1999
1.1.
1998
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
1.1.
1996
  • Leitud 13 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
ETFETF6470Allelopaatia haptofüütidel - funktsionaalsed seaduspärasused01.01.200531.12.2008Kalle OlliTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond44 816,67 EUR
MUUVBGBO02005DANLIM: Detection and Analysis of Nutrient Limitation in Coastal Plankton Communities across a Hierarchy of Temporal and Physical-Systematic Scales.01.02.200231.12.2005Kalle OlliTartu Ülikool133 773,98 EUR
ETFETF7787Eutrofeerumise ja kliimamuutuste mõju fütoplanktoni protsessidele01.01.200931.12.2012Kalle OlliTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond47 121,20 EUR
MUUVBGBO02006FATE: Transfer and Fate of Harmful Algal Bloom (HAB) Toxins in European Marine Waters.01.02.200231.12.2005Kalle OlliTartu Ülikool23 399,97 EUR
PUTPUT39Fütoplanktoni muutuv elurikkus ökosüsteemsete funktsioonide mõjutajana Läänemeres01.01.201331.12.2016Kalle OlliTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut281 280,00 EUR
MUULLOOM08023Mikrovetikate kasvatamine ja analüüsimine.20.02.200830.09.2008Kalle OlliTartu Ülikool3 016,63 EUR
MUUMBGBO05058RSEED: Life Cycle Transformations among HAB Species and the Environmental and Physiological Factors that regulate them.28.03.200528.03.2008Kalle OlliTartu Ülikool92 539,98 EUR
MUUVBGBO02096SIBER: Silicate and Baltic Sea Ecosystem Response.01.11.200231.10.2005Kalle OlliTartu Ülikool97 547,97 EUR
PUT; PUT_OPPUT1574Sidustades funktsionaalse ja fülogeneetilise elurikkuse – sillapea ökosüsteemide funktsionaalsuste kaardistamiseks juba täna01.01.201731.12.2020Kalle OlliTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut70 000,00 EUR
SFSF0180095s08Taimede bioloogilise mitmekesisuse komponendid: seosed suure- ja väikeseskaalaliste protsessidega01.01.200831.12.2013Meelis PärtelTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut923 465,28 EUR
SFSF0182551s03Taimede evolutsioon, mitmekesisus ja levik ning funktsioon ökosüsteemides01.01.200331.12.2007Meelis PärtelTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond376 439,61 EUR
HLKHLK04-7Tartu Ülikooli vetikate ja sammalde kogude inventariseerimine ja avalikustamine.01.01.200431.12.2008Kalle OlliTartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed, Tartu Ülikooli Muuseumid99 859,70 EUR
MUUMBGBO05057RTHRESHOLDS: Threshold of Environmental Sustainability.01.01.200531.12.2008Kalle OlliTartu Ülikool61 320,00 EUR
  • Leitud 54 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Joonas, Elise; Aruoja, Villem; Olli, Kalle; Syvertsen-Wiig, Guttom; Vija, Heiki; Kahru, Anne (2017). Potency of (doped) rare earth oxide particles and their constituent metals to inhibit algal growth and induce direct toxic effects. Science of the Total Environment, 593-504, 478−486.10.1016/j.scitotenv.2017.03.184.1.1.
Klais, Riina; Norros, Veera; Lehtinen, Sirpa; Tamminen Timo; Olli, Kalle (2016).

Community assembly and drivers of phytoplankton functional structure

. Functional Ecology, 31, 760−767.10.1111/1365-2435.12784.
1.1.
Joonas, E.; Aruoja, V.; Olli, K.; Kahru, A. (2016).

Toxic effects of (doped) rare earth oxides and their constituent metals on algae Raphidocelis subcapitata

. Toxicology Letters, 258S. Elsevier, 210.
5.1.
Joonas, Elise; Aruoja, Villem; Olli, Kalle; Kahru, Anne (2016). Doped Rare Earth Oxides and Their Constituent Metals Inhibit Algal Growth by Metal Ion Leaching, Nutrient Removal and Agglomeration Around Algae. Book of abstracts: EcoBalt 2016: EcoBalt, Tartu, oktoober 2016. EcoBalt2016, 48.5.2.
Joonas, Elise; Aruoja, Villem; Olli, Kalle; Kahru, Anne (2016).

Doped rare earth oxides and their constituent metals inhibit Raphidocelis subcapuitata growth via ion leaching, nutrient removal and agglomeration

. Biodiagnostics and assessment of environmental quality: approaches, methods, criteria and reference standards in ecotoxicology: International Symposium BIODIAGNOSTICS-2016, Moscow, 25-28 October 2016. GEOS, 68.
5.2.
Olli, Kalle; Paerl, Hans W.; Klais, Riina (2015). Diversity of coastal phytoplankton assemblages – Cross ecosystem comparison. Estuarine, coastal and shelf science, 162, 110−118.10.1016/j.ecss.2015.03.015.1.1.
Olli, Kalle; Klais Riina, Tamminen Timo (2015). Rehabilitating the cyanobacteria–niche partitioning, resource use efficiency and phytoplankton community structure during diazotrophic cyanobacterial blooms. Journal of Ecology, 103 (5), 1153−1164.10.1111/1365-2745.12437.1.1.
Olli, Kalle (2015). Unraveling the uncertainty and error propagation in the vertical flux Martin curve. Progress in Oceanography, 135, 146−155.10.1016/j.pocean.2015.05.016.1.1.
Viitasalo, Markku; Blenckner, Thorsten; Gårdmark, Anna; Kaartokallio, Hermanni; Kautsky, Lena; Kuosa, Harri; Lindegren, Martin; Norkko, Alf; Olli, Kalle; Wikner, Johan (2015). Environmental Impacts—Marine Ecosystems. In: The BACC II Author Team (Ed.). Second Assessment of Climate Change for the Baltic Sea Basin (363−380).. Springer. (Regional Climate Studies).10.1007/978-3-319-16006-1_7.3.1.
Olli, Kalle; Ptacnik, Robert; Andersen, Tom; Trikk, Olga; Klais, Riina; Lehtinen, Sirpa; Tamminen, Timo (2014). Against the tide: Recent diversity increase enhances resource use in a coastal ecosystem. Limnology and Oceanography, 59 (1), 267−274.10.4319/lo.2014.59.1.0267.1.1.
Vahtera, E.; Crespo, B.G.; McGillicuddy, Jr. D.J.; Olli, K.; Anderson, D.M. (2014).

Alexandrium fundyense cyst viability and germling survival in light vs. dark at a constant low temperature

. Deep-Sea Research Part II. Topical Studies in Oceanography, 103, 112−119.10.1016/j.dsr2.2013.05.010.
1.1.
Spilling K, Kremp A, Klais R, Olli K, Tamminen T (2014). Spring bloom community change modifies carbon pathways and C: N: P: Chl a stoichiometry of coastal material fluxes. Biogeosciences, 11 (24), 7275−7289.10.5194/bg-11-7275-2014.1.1.
Timm, T.; Ott, I.; Paaver, T.; Pall, P.; Virro, T.; Olli, K. (2014). Sisevete hüdrobioloogia õpetamise ajaloost Eesti ülikoolides. Eesti sisevete hüdrobioloogia ajaloost (9−44).. Tartu: Eesti Looduseuurijate Selts. (Teaduse ajaloo lehekülgi Eestist; 14).3.2.
Olli, Kalle; Trikk, Olga; Klais, Riina; Ptacnik, Robert; Andersen, Tom; Lehtinen, Sirpa; Tamminen, Timo (2013). Harmonizing large data sets reveals novel patterns in the Baltic Sea phytoplankton community structure. Marine Ecology-Progress Series, 473, 53−66.10.3354/meps10065.1.1.
Tamelander, Tobias; Reigstad, Marit; Olli, Kalle; Slagstad, Dag; Wassmann, Paul (2013). New Production Regulates Export Stoichiometry in the Ocean. PLoS ONE, 8 (1), e54027.10.1371/journal.pone.0054027.1.1.
Klais, Riina; Tamminen, Timo; Kremp, Anke; Spilling, Kristian; Woong, Byoung; Hajdu, Susanna; Olli, Kalle (2013). Spring phytoplankton communities shaped by interannual weather variability and dispersal limitation: Mechanisms of climate change effects on key coastal primary producers. Limnology and Oceanography, 58 (2), 753−762.10.4319/lo.2012.58.2.0753.1.1.
Tammert, Helen; Lignell, Risto; Kisand, Veljo; Olli, Kalle (2012). Labile carbon supplement induces growth of filamentous bacteria in the Baltic Sea. Aquatic Biology, 15 (2), 121−134.10.3354/ab00424.1.1.
Klais, Riina; Tamminen, Timo; Kremp, Anke; Spilling, Kristian; Olli, Kalle (2011). Decadal-Scale Changes of Dinoflagellates and Diatoms in the Anomalous Baltic Sea Spring Bloom. PLoS ONE, 6 (6), e21567.10.1371/journal.pone.0021567.1.1.
Ptacnik, R.; Olli, K.; Lehtinen, S.; Tamminen, T.; Andersen, T. (2011). Does plankton diversity peak at intermediate salinities? Comment on Telesh et al. (2011). Marine Ecology-Progress Series, 432, 291−292.10.3354/meps09216.1.1.
Olli, Kalle; Klais, Riina; Tamminen, Timo; Ptacnik, Robert; Andersen, Tom (2011). Long term changes in the Baltic Sea phytoplankton community. Boreal Environment Research, 16, 3−14.1.1.
Klais, Riina; Tamminen, Timo; Lehtinen, Sirpa; Olli, Kalle (2011). Functional ecology of the phytoplankton: Temporal shifts in the Baltic Sea phytoplankton as reflected by functional diversity analysis. World Conference on Marine Biodiversity 2011, Aberdeen, Scotland (UK). 3.4.
Olli, Kalle; Tamminen, Timo; Ptacnik, Robert; Andersen, Tom; Klais, Riina (2011). Structural changes in the Baltic Sea phytoplankton community. World Conference on Marine Biodiversity 2011, Aberdeen, Scotland (UK). 3.4.
Olli, K.; Trunov, K. (2010). Abundance and distribution of vernal bloom dinoflagellate cysts in the Gulf of Finland and Gulf of Riga (the Baltic Sea). Deep-Sea Research Part II, 57, 235−242.10.1016/j.dsr2.2009.09.009.1.1.
Tammert, H.; Olli, K.; Sturluson, M.; Hodal, H. (2008). Bacterial biomass and activity in the marginal ice zone of the northern Barents Sea. Deep-Sea Research II, 55, 2199−2209.10.1016/j.dsr2.2008.05.011.1.1.
Olli, K.; Clarke, A.; Danielsson, Å.; Aigars, J.; Conley, D.; Tamminen, T. (2008). Diatom stratigraphy and long-term dissolved silica concentrations in the Baltic Sea. Journal of Marine Systems, 73, 284−299.10.1016/j.jmarsys.2007.04.009.1.1.
  • Leitud 15 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Baltic Sea phytoplankton in temporal shiftTrikk, OlgamagistrikraadKalle OlliKaitstud2008Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
Distribution and ecology of Charophytes in the Baltic SeaTorn, KairedoktorikraadKalle Olli; Georg MartinKaitstud2008Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Ecological Role of Physiological and Phylogenetic Diversity in Aquatic Bacterial CommunitiesTammert, HelendoktorikraadKalle Olli; Veljo KisandKaitstud2011Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Funktsionaalse mitmekesisuse mõju tehislike fütoplanktonikoosluste saagikuseleJoonas, ElisemagistrikraadKalle OlliKaitstud2015Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
Funktsionaalse mitmekesisuse roll fütoplanktoni koosluse vastupanul oksüdatiivsele stressileMihkel RistimäemagistrikraadKalle OlliKaitstud2015Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut
Fülogeneetiliselt tuletatud ja morfoloogiliste funktsionaalsete tunnuste võrdlus makroökoloogilistes mustritesKaspar ArmemagistrikraadKalle OlliKaitstud2015Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut
Nanoparticle induced stress on phytoplankton assemblages – bridging the gap between biodiversity and nanotoxicology Joonas, ElisedoktorikraadKalle Olli; Villem Aruoja; Anne KahruJuhendamiselTartu Ülikool
Phytoplankton in Estonian coastal waters – variability, trends and response to environmental pressuresJaanus, AndresdoktorikraadKalle OlliKaitstud2011Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Phytoplankton trends in the Baltic SeaKlais, RiinadoktorikraadKalle OlliKaitstud2012Tartu Ülikool
Prymnesium parvum toksiinide mõju mikrovetikate fotosünteesiaparaadileTamm, MarjumagistrikraadKalle OlliKaitstud2012Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika õppetool
Prymnesium parvum: patterns of adaptation to self-toxicityTeeveer, KarolinmagistrikraadKalle OlliKaitstud2009Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
Rohevetika kasvufüsioloogia ja fotosünteesivõime masskultiveerimisel ”õhukese kihi” kaskaadilOjamäe, KarinmagistrikraadKalle OlliKaitstud2011Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
Sinivetikate mõju Soome lahe suvisele fütoplanktoni koosluseleVahtra, JohannamagistrikraadKalle Olli; Riina KlaisKaitstud2012Tartu Ülikool
Spatio-temporal Variability of the Baltic Sea Phytoplankton Community DiversityTrikk, OlgadoktorikraadKalle OlliJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
The Response of Phytoplankton Community to the Changes in Nutrient LoadingKangro, KerstidoktorikraadKalle OlliKaitstud2010Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut