See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
23.01.1979
+372 737 5050
monika.karmin@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2019–...   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, Teadur (0,30)
25.08.2019–...   
Massey Ülikool, Palmerston North, Uus-Meremaa, Järeldoktor inimese arvutuslikus geneetikas (1,00)
01.03.2018–17.04.2018   
Massey University, Palmerston North, Uus-Meremaa, Külalisteadur (1,00)
01.01.2018–01.09.2019   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, Teadur (1,00)
01.01.2018–31.08.2019   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, populatsioonigeneetika teadur (1,00)
22.06.2016–14.12.2016   
University of Auckland, Külalisteadur (1,00)
01.01.2016–31.12.2017   
Eesti Biokeskus, Teadur (1,00)
01.06.2010–31.12.2015   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (1,00)
01.10.2009–31.05.2010   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (0,50)
01.01.2007–31.12.2007   
Quattromed HTI Laborid OÜ, laborant
2005–27.02.2014   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Evolutsioonilise bioloogia õppetool, doktorant (1,00)
 
 
Haridustee
2005–03.03.2014   
Tartu Ülikool, doktoriõpingud
2002–2005   
Tartu Ülikool, magistratuur
1998–2003   
Tartu Ülikool, bakalaureuseõpe
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2018−2019   
Tartu Ülikooli Genoomika Instituudi teadusnõukogu liige
 
 
Loometöö
2018–2019 GEENIAALNE näitus Tallinna Teletornis. Inimese eelajalugu, geneetikat ja personaalmeditsiini tutvustav näitus. (Tallinn, Tallinna Teletorn).
2015
Kaastöö "Evolutsioon, molekulaar- ja rakubioloogia" sektsiooni uuednamisele TÜ Loodusmuuseumis. (Tartu, Tartu Ülikooli Loodusmuuseum) http://www.natmuseum.ut.ee/et/püsiekspositsioon-maa-elu-lugu.
 
 
Lisainfo
2012 - 2013
Bioloogia õpikodade läbiviimine projektis "Füüsika, keemia ja bioloogia õpikojad". Projekti eesmärgiks on pakkuda loodusteadustest huvituvatele noortele põhikooli vanemas astmes ja gümnaasiumis võimalust avastada loodusteadusi ja täiendada oma erialaseid teadmisi, viies läbi teemakohaseid katseid. Täpsem info projekti kohta: www.fyysika.ee/opikojad.;
2010 - 2019
Loengud ja praktikumide juhendamised Tartu Ülikooli bakalaureuse ja magistritaseme kursustel: immunoloogia ja immunogeneetika, evolutsiooniline bioloogia, populatsioonigeneetika;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2017, Monika Karmin, Monika Karmin, Riigi teaduspreemia
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud
 
 
Lisainfo
Kursused:
2015:
Arvutuslik molekulaarne evolutsioon; Wellcome Trust Advance Courses in Sanger Center, UK.
2015:
Illumina NextSeq 500 tutvustav kursus; Tartu.
2012:
Statistika R-iga epidemiloogias; Pärnu, Estonia.
2011:
Immunoregulatsoon: tsütokiinid ja interferoonid, TTÜ.
2011:
Eksoomisekveneerimine, genotüpiseerimine ja kiibiCGH: genoomianalüüsi tehnoloogiad; Wellcome Trust Advance Courses in Sanger Center, UK.
2010:
Kaasaegsed sekveneerimistehnoloogiad ja nende rakendused; Cold Spring Harbor Laboratory, USA.

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2004
25.03.2020
23.01.1979
+372 737 5050
monika.karmin@ut.ee

Career

Institutions and positions
01.09.2019–...   
University of Tartu, Institute of Genomics, Researcher (0,30)
25.08.2019–...   
Massey University, Palmerston North, New Zealand, Post doctoral fellow in human computational genetics (1,00)
01.03.2018–17.04.2018   
Massey University, Palmerston North, New Zealand, Visiting Researcher (1,00)
01.01.2018–01.09.2019   
University of Tartu, Institute of Genomics, Researcher (1,00)
22.06.2016–14.12.2016   
University of Auckland, Visiting researcher (1,00)
01.01.2016–31.12.2017   
Estonian Biocentre, Researcher (1,00)
01.06.2010–31.12.2015   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (1,00)
01.10.2009–31.05.2010   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (0,50)
01.01.2007–31.12.2007   
Quattromed HTI Laborid OÜ, lab assistant
2005–27.02.2014   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Evolutionary Biology, doctoral student (1,00)
 
 
Education
2005–03.03.2014   
University of Tartu, Doctoral studies
2002–2005   
University of Tartu, Master studies
1998–2003   
University of Tartu, Batchelor studies
 
 
R&D related managerial and administrative work
2018−2019   
Member of the scientific council of Institute of Genomics, University of Tartu
 
 
Creative work
2018-2019 GENE-IUS exhibition in the TV Tower of Tallinn. Introducing human prehistory, genetics and personal medicine. (Tallinn, Tallinna Teletorn).
2015
Participation in renewing of the section on Evolution, molecular and cellular biology in the main exhibit of the Natural History Museum of University of Tartu. (Tartu, Tartu Ülikooli Loodusmuuseum) http://www.natmuseum.ut.ee/et/püsiekspositsioon-maa-elu-lugu.
 
 
Additional information
2012 - 2013
Supervising biology workshops in a project "Workshops of physics, chemistry and biology" with the aim of providing an opportunity for youths interested in natural sciences to broaden their knowledge by doing various experiments. The project is addressed to youths studying in the upper part of the basic school (year 8 and year 9) and in the secondary school (years 10, 11 and 12).;
2010 - 2019
Lecturer and instructor of practicals on the bachelor and masters level in the University of Tartu. Topics: Immunology and Immunogenetics, Evolutionary Biology, Population Genetics. ;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2017, Monika Karmin, Monika Karmin, State science prize, Estonia
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences
 
 
Additional information
Attended courses:
2015:
Computational Molecular Evolution; Wellcome Trust Advance Courses in Sanger Center, UK.
2015:
Illumina NextSeq 500 introduction course; Tartu in-house.
2012:
Statistical Practice in Epidemiology using R; Pärnu, Estonia.
2011:
Immunoregulation: Cytokines and interferons; Tallinn Technical University.
2011:
Exome Sequencing, Genotyping and ArrayCGH: Technologies for Genome Analysis; Wellcome Trust Advance Courses in Sanger Center, UK.
2010:
Course of Advance Sequencing Technologies and Applications; Cold Spring Harbor Laboratory, USA.

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2004
25.03.2020

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
  • Leitud 9 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF6040Eestlaste ema- ja isaliinid fülogeograafilises kontekstis01.01.200531.12.2010Kristiina TambetsEesti Biokeskus53 191,16 EUR
ETFETF5807Euraasia elanike geneetilise diversifitseerumise lätted: uurimus Lähis-Ida ja Põhja- ning Kirde-Aafrika geeniliinide hargnemise ajast ja kohast01.01.200431.12.2006Ene MetspaluTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond11 125,14 EUR
ETFETF8973Euraasia populatsioonide geneetiline struktuur ja kohastumine lokaalses keskkonnas arktika populatsioonide näitel.01.01.201131.12.2014Mait MetspaluEesti Biokeskus48 000,00 EUR
SFSF0182474As03Genoomi polümorfism ja inimkonna bioloogiline ajalugu01.01.200331.12.2007Richard VillemsEesti Biokeskus471 731,87 EUR
PUTPUT766Inimese geneetiline varieeruvus Lõuna Aasias, genees ja järelmid01.01.201531.12.2016Gyaneshwer ChaubeyEesti Biokeskus112 800,00 EUR
SFSF0270177Bs08Inimpopulatsioonide globaalne struktureerumine: ränded, triiv ja valik01.01.200831.12.2013Ene MetspaluTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut274 940,96 EUR
ETFETF7858Lähis-Ida neoliitiline revolutsioon ja selle mõju inimpopulatsioonide geneetilisele struktuurile siirdealadel: emaliinide fülogeograafilise analüüsi põhjal01.01.200931.12.2011Ene MetspaluTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond40 474,08 EUR
IUTIUT24-1Täisgenoomse ajastu koidik arheogeneetikas 01.01.201431.12.2019Richard VillemsEesti Biokeskus; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut1 386 400,00 EUR
ETFETF5574Volga-Uurali ja Siberi rahvaste Y kromosoomi fülogenees01.01.200331.12.2006Toomas KivisildEesti Biokeskus31 647,55 EUR