Kristi Huik

30.08.1983
kristi.huik@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2015–31.12.2015    Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Mikrobioloogia instituut, meditsiinilise viroloogia ja mikrobioloogia teadur (1,00)
01.06.2014–31.08.2015    Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Mikrobioloogia instituut, meditsiinilise viroloogia teadur (1,00)
01.03.2014–31.05.2014    Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Mikrobioloogia instituut, meditsiinilise mikrobioloogia nooremteadur (1,00)
01.05.2006–31.08.2013    Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Mikrobioloogia instituut, laborant (0,50)
 
 
Haridustee
2002–2007    Tartu Ülikool, Arstiteaduskond, Proviisoriõpe

Kvalifikatsioon

 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; PÕHISUUND: HI-viiruse tropismi, peremeesorganismi geneetiliste fakotite ja ko-infektsioonide mõju haiguse kulule

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
1.1.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
1.1.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
3.5.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.1.
2007
5.1.
2007

Kristi Huik

30.08.1983
kristi.huik@ut.ee

Career

Institution and position
01.09.2015–31.12.2015    University of Tartu, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Research Fellow of Medical Virology and Microbiology (1,00)
01.06.2014–31.08.2015    University of Tartu, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Research Fellow of Medical Virology (1,00)
01.03.2014–31.05.2014    University of Tartu, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Junior Research Fellow of Medical Microbiology (1,00)
01.05.2006–31.08.2013    University of Tartu, Faculty of Medicine, Department of Microbiology, Laboratory Assistant (0,50)
 
 
Education
2002–2007    Tartu University, Faculty of Medicine, Pharmacy

Qualifications

 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; SPECIALITY: Influence of IH-virus tropism, human genetic factors and co-infections on the course of the disease
 
 

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
5.2.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
5.2.
2013
1.1.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
5.2.
2012
1.1.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
5.2.
2010
1.1.
2009
5.2.
2009
3.5.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.1.
2007
5.1.
2007
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
ETFETF8415CCR5 ja CCL3L1 geneetiliste polümorfismide ning nende ekspressiooni mõjutavate viiruste mõju immuunaktivatsioonile antiretroviirusliku ravi foonil HIV-positiivsetel isikutel01.01.201031.12.2013Tõnis KarkiTartu Ülikool, Arstiteaduskond61 354,00 EUR
ETFETF8856CCR5 ja tema signaalirajaga seotud geenide regulatoorsete regioonide metülatsiooni mustri mõju HIV seropositiivsusele europiidsesse rassi kuuluvate süstivate narkomaanide populatsioonis01.01.201131.12.2013Silver TürkTartu Ülikool, Arstiteaduskond25 200,00 EUR
ETFETF7933Clostridium difficile tüvede resistentsus antibiootikumide ja desinfektantide suhtes olenevalt nende feno- ja genotüüpilistest omadustest01.01.200931.12.2011Siiri KõljalgTartu Ülikool, Arstiteaduskond44 175,68 EUR
SFSF0182726s06HIV infektsioon Eestis: viiruse ja peremeesorganismi interaktsioonid molekulaarsel ja kliinilisel tasandil01.01.200631.12.2011Irja LutsarTartu Ülikool, Arstiteaduskond372 766,67 EUR
SFSF0180004s12Infektsioon immuunsüsteemi häirega isikutel - haiguse mehhanimidest kliinilise praktikani01.01.201231.12.2014Irja LutsarTartu Ülikool, Arstiteaduskond349 080,00 EUR
IUTIUT34-24Infektsioonid langenud immuunsusega isikutel – eksperimendist kliinilisse praktikasse01.01.201531.12.2020Irja LutsarTartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, bio- ja siirdemeditsiini instituut349 200,00 EUR
ETFETF9259Läkaköha epidemioloogia ja molekulaargeneetika01.01.201231.12.2015Marje OonaTartu Ülikool, Arstiteaduskond86 217,60 EUR
ETFETF8004Peremeesorganismi geneetiliste polümorfismide mõju HI-viiruse monofüleetilise populatisooni evolutsioonile01.01.200931.12.2012Tõnu KrispinTartu Ülikool, Arstiteaduskond80 989,62 EUR
  • Leitud 55 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Huik, Kristi; Avi, Radko; Pauskar, Merit; Kallas, Eveli; Jõgeda, Ene-Ly; Karki, Tõnis; Rüütel, Kristi; Talu, Ave; Abel-Ollo, Katri; Uusküla, Anneli; Carrillo, Andrew; Ahuja, Sunil K; He, Weijing; Lutsar, Irja (2016). A CCL5 Haplotype Is Associated with Low Seropositivity Rate of HCV Infection in People Who Inject Drugs. PloS one, 11 (6), e0156850−e0156850.10.1371/journal.pone.0156850.1.1.
Kallas, Eveli; Huik, Kristi; Türk, Silver; Pauskar, Merit; Jõgeda, Ene-Ly; Šunina, Marina; Karki, Tõnis; Des Jarlais, Don; Uusküla, Anneli; Avi, Radko; Lutsar, Irja (2016). Differences in T cell distribution and CCR5 expression in HIV-positive and HIV-exposed seronegative persons who inject drugs. Medical microbiology and immunology, 205 (3), 231−239.10.1007/s00430-015-0444-8.1.1.
Jõgeda, Ene-Ly; Avi, Radko; Pauskar, Merit; Kallas, Eveli; Karki, Tõnis; Des Jarlais, Don; Uusküla, Anneli; Lutsar, Irja; Huik, Kristi (2016). Human T-lymphotropic virus types 1 and 2 are rare among intravenous drug users in Eastern Europe. Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases, 43, 83−85.10.1016/j.meegid.2016.05.022.1.1.
Jõgeda, E.-L.; Huik, K.; Pauskar, M.; Kallas, E.; Karki, T.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Lutsar, I.; Avi, R.; (2016). Prevalence and genotypes of GBV-C and its associations with HIV infection among persons who inject drugs in Eastern Europe. Journal of Medical Virology, x−x.10.1002/jmv.24683.1.1.
Avi, Radko; Pauskar, Merit; Karki, Tõnis; Kallas, Eveli; Jõgeda, Ene-Ly; Margus, Tõnu; Huik, Kristi; Lutsar, Irja (2016). Prevalence of drug resistance mutations in HAART patients infected with HIV-1 CRF06_cpx in Estonia. Journal of Medical Virology, 88 (3), 448−454.10.1002/jmv.24361.1.1.
Kallas, Eveli; Huik, Kristi; Türk, Silver; Pauskar, Merit; Jõgeda, Ene-Ly; Šunina, Marina; Karki, Tõnis; Des Jarlais, Don; Uusküla, Anneli; Avi, Radko; Lutsar, Irja (2016). T Cell Distribution in Relation to HIV/HBV/HCV Coinfections and Intravenous Drug Use. Viral immunology, 0−0.vim.2016.0057.1.1.
Soodla, P.; Rajasaar, H.; Avi, R.; Zilmer, K.; Kink, K.; Novikova, L.; Huik, K.; Maimets, M.; Lutsar, I. (2015). Design and structure of the Estonian HIV Cohort Study (E-HIV). Infectious Diseases, 47 (11), 768−675, 10.3109/23744235.2015.1061203.1.1.
Kallas, E.; Huik, K.; Pauskar, M.; Jõgeda, E.-L.; Karki, T.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Avi, R.; Lutsar, I. (2015). Influence of interleukin 10 polymorphisms -592 and -1082 to the HIV, HBV and HCV serostatus among intravenous drug users. Infection, genetics and evolution, 30, 175−180.10.1016/j.meegid.2014.12.023.1.1.
Jõgeda, Ene-Ly; Avi, Radko; Pauskar, Merit; Kallas, Eveli; Karki, Tõnis; Jarlais, Don Des; Uusküla, Anneli; Lutsar, Irja; Huik, Kristi; (2015). HTLV-1/2 is rare among Eastern-European intravenous drug users (IDUs). Retrovirology, 12, P79−P79.10.1186/1742-4690-12-S1-P79.5.2.
Soeorg H, Huik K, Parm Ü, Ilmoja ML, Metsvaht T, Lutsar I. (2015). Molecular epidemiology of Staphylococcus epidermidis colonizing gastrointestinal tract of neonates hospitalized to intensive care unit. <i>The 25th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, April 25-28, 2015, Copenhagen, Denmark..</i> 5.2.
Kallas, E.; Avi, R.; Huik, K.; Türk, S.; Pauskar, M.; Jõgeda, E.-.L.; Šunina, M.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Lutsar, I. (2015). The distribution of TEMRA cells is influenced by HIV, HBV, HCV infections and intravenous drug use. <i>25th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases; Copenhagen, Denmark, 25.-28. April 2015.</i> 5.2.
Naaber, Paul; Balode, Arta; Egorova, Svetlana; Huik, Kristi; Ivanova, Marina; Kaftyreva, Lidia; Kõljalg, Siiri; Kõressaar, Triinu; Lillo, Jana; Löhr, Iren; Miciuleviciene, Jolanta; Pai, Kristiine; Pavelkovich, Anastassia; Remm, Maido; Sepp, Epp (2015). The epidemiology of CTX-M group genes among clinical Escherichia coli strains in Estonia, Latvia, Lithuania, Norway and Russia. 5.2.
Huik, K.; Avi, R.; Uibopuu, H.; Pauskar, M.; Margus, T.; Karki, T.; Krispin, T.; Kool, P.; Rüütel, K.; Talu, A.; Abel-Ollo, K.; Uusküla, A.; Carrillo, AQ.; He, W.; Ahuja, SK.; Lutsar, I. (2014). Association between HIV-1 tropism and CCR5 human haplotype E in a Caucasian population. Jaids-Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes, 66 (3), 239−244.10.1097/QAI.0000000000000127.1.1.
Lillo, Jana; Pai, Kristiine; Bolde, Arta; Makarova, Mariia; Huik, Kristi; Kõljalg, Siiri; Ivanova, Marina; Kaftyreva, Lidia; Miciuleviciene, Jolanata; Naaber, Paul; Parv, Kristel; Pavelkovich, Anastasia; Rööp, Tiiu; Toompere, Karolin; Suzhaeva, Ludmila; Sepp, Epp (2014). Differences in extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli virulence factor genes in the Baltic Sea region. BioMed Research International, 427254, 1−7.10.1155/2014/427254.1.1.
Kõljalg, S.; Telling, K.; Huik, K.; Murruste, M.; Saarevet, V.; Pauskar, M.; Lutsar, I. (2014). First report of Wohlfahrtiimonas chitiniclastica from soft tissue and bone infection at an unusually high northern latitude. Folia Microbiologica, 60 (2), 155−158, 10.1007/s12223-014-0355-x.1.1.
Avi, R; Huik, K; Pauskar, M; Ustina, V; Karki, T; Kallas, E; Jõgeda, EL; Krispin, T; Lutsar, I (2014). Transmitted drug resistance is still low in newly diagnosed human immunodeficiency virus type 1 CRF06_cpx-infected patients in Estonia in 2010. Aids Research and Human Retroviruses, 30 (3), 278−283.10.1089/aid.2012.0357.1.1.
Pauskar, M.; Huik, K.; Avi, R.; Kallas, E.; Jõgeda, E.-L.; Karki, T.; Semjonova, S.; Smidt, J.; Novikova, L.; Ainsalu, K.; Lutsar, I. (2014). Antiretroviral drug resistance and viral tropism in HIV-1 CRF06_cpx infected patients failing antiretroviral (ARV) therapy. <i>7th National Congress HIV/AIDS and the 2nd Central European HIV Forum, Sibiu, Romania, 29-31 May 2014.</i> 5.2.
Jõgeda, E.-L.; Huik, K.; Avi, R; Pauskar, M., Kallas, E.; Karki, T.; Marsh, K.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Lutsar, I. (2014). Associations between MX2 polymorphism and the acquisition of HIV and co-infections in Caucasian intravenous drug users (IDUs). <i>European Human Genetics Conference 2014, Milan, Italy, 31 May-3 June 2014.</i> 5.2.
Pai, K.; Huik, K.; Ivanova, M.; Kõljalg, S.; Pavelkovich, K.; Parv, K.; Rööp, T.; Sepp, E.; Naaber, P. (2014). Detection and molecular characterisation of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli sequence type ST131 from the Baltic region. <i>European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcelona, Spain, 10-13 May 2014.</i> 5.2.
Avi, R.; Huik, K.; Pauskar, M.; Kallas, E.; Jõgeda, E.-L.; Zilmer, K.; Ustina, V.; Novikova, L.; Karki, T.; Kisand, V.; Lutsar, I. (2014). Full-Length Genome Sequences of Estonian HIV-1 CRF06 and Eastern-European Subtype A1 Recombinant Forms. <i>7th National Congress HIV/AIDS and the 2nd Central European HIV Forum, Sibiu, Romania, 29-31 May 2014.</i> 5.2.
Soeorg H, Huik K, Parm Ü, Ilmoja ML, Metsvaht T, Lutsar I. (2014). Genetic variation of virulence and resistance genes in Staphylococcus epidermidis circulating in neonatal intensive care units. <i>The 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, May 10-13, 2014, Barcelona, Spain..</i> 5.2.
Kallas, E.; Avi, R.; Huik, K.; Türk, S.; Pauskar, M.; Jõgeda, E.-.L.; Šunina, M.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Lutsar, I. (2014). Injection drug use influences T-cell distribution and CCR5 expression in HIV+ and ESN population. <i>24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases; Barcelona; 10-13 May 2014.</i> 5.2.
Kallas, E.; Huik, K.; Avi, R; Pauskar, M.; Jõgeda, E.-L.; Karki, T.; Marsh, K.; Des Jarlais, D.; Uusküla, A.; Lutsar, I. (2014). NLRP3 genotype CG increases the risk of HIV-1 in Caucasian intravenous drug users (IDUs). <i>European Human Genetics Conference 2014, Milan, Italy, 31 May-3 June 2014.</i> 5.2.
Soeorg H, Huik K, Parm Ü, Ilmoja ML, Metsvaht T, Lutsar I. (2014). Vancomycin-heteroresistance in Staphylococcus epidermidis colonizing neonates in neonatal intensive care units. <i>The 32nd Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases, May 6-10, 2014, Dublin, Ireland..</i> 5.2.
Soeorg, H.; Huik, K.; Parm, Ü.; Ilmoja, ML.; Metsvaht, T.; Lutsar, I. (2014). Virulentsus- ja resistentsusgeenide varieeruvus lasteintensiivravi osakondades levivate Staphylococcus epidermidis’te hulgas. <i></i> Eesti Arst, 24−24. (93; Lisa 1).5.2.
  • Leitud 1 kirjet
NimetusAsutusVastutav isik
Eesti HIV-positiivsete patsientide andmekogu biopankTartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, bio- ja siirdemeditsiini instituutKristi Huik