See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
priit.palta@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.02.2020–...   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, genoomi-informaatika vanemteadur (0,25)
2017–...   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, FinnGeni Sekveneerimise Informaatika tiimi juht (1,00)
01.01.2018–31.01.2020   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, bioinformaatika ja genoomika teadur (0,25)
01.05.2016–31.12.2017   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu, bioinformaatika ja genoomika teadur (0,25)
01.01.2016–30.04.2016   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu, spetsialist (0,20)
2013–2017   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Järeldoktor (1,00)
01.05.2011–30.09.2013   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika teadur (0,50)
2011–2013   
Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, UK, Järeldoktor (1,00)
01.05.2008–30.04.2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, teadur (0,50)
01.01.2008–30.04.2008   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, programmeerija (0,50)
03.01.2005–31.12.2007   
Eesti Biokeskus, Bioinformaatika spetsialist (0,50)
2004–2008   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool, programmeerija (0,50)
 
 
Haridustee
2007–2015   
Tartu Ülikool (Ph.D. bioinformaatikas)
2005–2007   
Tartu Ülikool (M.Sc. bioinformaatikas)
2000–2005   
Tartu Ülikool (B.Sc. bioinformaatikas)
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2018−...   
Nordic Society for Precision Medicine liige
2012−...   
International Headache Society liige
2007−...   
Eesti Inimesegeneetika Ühingu liige

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2019, Priit Palta, Development of the NIPTIFY+ genetic testing platform, proof of concept and commercial feasibility; Enterprise Estonia
2018, Priit Palta, Genotype imputation-based polygenic risk score (PRS) platform, proof of concept and commercial feasibility; Business Finland funded TUTL award
2016, Priit Palta, Development of Nordic Exome Variant Catalogue, NIASC seed project Funding; Nordic Information for Action eScience Center, NordForsk
2013, Priit Palta, Soome Kultuurifondi stipendium
2007, Priit Palta, SA Geenikeskus, Artur Linnu Stipendiumifond – Artur Linnu nimeline stipendium
2007, Priit Palta, Kristjan Jaagu personaalne teadusreiside rahastus
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS KLASSIFIKAATOR: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika
 
 
Lisainfo
Development of highly scalable statistical and computational methods for human genetics and genomics. Polygenic risk scores for complex diseases, statistical and deterministic computational haplotype phasing, genotype imputation, common and rare variant association testing. Population genetics and enriched variants in isolated populations, 2nd generation whole-exome sequencing (WES) and whole-genome sequencing (WGS) data processing and analysis.

Juhendatud järeldoktorid

  • 01.09.2016−... Kalle Pärn "Geeniandmete töötlemiseks ja analüüsimiseks vajalike suure läbilaskevõimega arvutuspilve-põhiste bioinformaatiliste töövoogude väljatöötamine" Helsingi Ülikool, Soome Molekulaarse Meditsiini Instituut

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
3.1.
2019
3.1.
2019
6.7.
2019
6.8.
2019
6.8.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
3.1.
2018
5.2.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
5.1.
2009
5.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
3.04.2020
priit.palta@ut.ee

Career

Institutions and positions
01.02.2020–...   
University of Tartu, Institute of Genomics, Senior Research Fellow of Genome Informatics (0,25)
2017–...   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Sequencing Informatics Team Lead (1,00)
01.01.2018–31.01.2020   
University of Tartu, Institute of Genomics, Research Fellow (0,25)
01.05.2016–31.12.2017   
University of Tartu, Estonian Genome Center , Research Fellow (0,25)
01.01.2016–30.04.2016   
University of Tartu, Estonian Genome Center , Specialist (0,20)
2013–2017   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, post-doctoral fellow (1,00)
01.05.2011–30.09.2013   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow in Bioinformatics (0,50)
2011–2013   
Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, UK, post-doctoral fellow (1,00)
01.05.2008–30.04.2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (0,50)
01.01.2008–30.04.2008   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Programmer (0,50)
03.01.2005–31.12.2007   
Estonian Biocentre, Specialist (0,50)
2004–2008   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Bioinformatics, Other staff (0,50)
 
 
Education
2007–2015   
University of Tartu (Ph.D. in bioinformatics)
2005–2007   
University of Tartu (M.Sc. in bioinformatics)
2000–2005   
University of Tartu (B.Sc. in bioinformatics)
 
 
R&D related managerial and administrative work
2018−...   
Member of the Nordic Society for Precision Medicine
2012−...   
Member of the International Headache Society
2007−...   
Member of Estonian Society of Human Genetics

Qualifications

 
 
Honours & awards
2019, Priit Palta, Development of the NIPTIFY+ genetic testing platform, proof of concept and commercial feasibility; Enterprise Estonia
2018, Priit Palta, Genotype imputation-based polygenic risk score (PRS) platform, proof of concept and commercial feasibility; Business Finland funded TUTL award
2016, Priit Palta, Development of Nordic Exome Variant Catalogue, NIASC seed project Funding; Nordic Information for Action eScience Center, NordForsk
2013, Priit Palta, Finnish Cultural Foundation, personal research award
2007, Priit Palta, Estonian Genome Foundation – nominal scholarship of the Artur Lind's Stipend Foundation
2007, Priit Palta, Kristjan Jaak’s personal travel award
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS CLASSIFICATION: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
 
 
Additional information
Development of highly scalable statistical and computational methods for human genetics and genomics. Polygenic risk scores for complex diseases, statistical and deterministic computational haplotype phasing, genotype imputation, common and rare variant association testing. Population genetics and enriched variants in isolated populations, 2nd generation whole-exome sequencing (WES) and whole-genome sequencing (WGS) data processing and analysis.

Supervision of postdoctoral researchers

  • 01.09.2016−...    Kalle Pärn  "Geeniandmete töötlemiseks ja analüüsimiseks vajalike suure läbilaskevõimega arvutuspilve-põhiste bioinformaatiliste töövoogude väljatöötamine" (University of Helsinki, Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM))

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
3.1.
2019
3.1.
2019
6.7.
2019
6.8.
2019
6.8.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
3.1.
2018
5.2.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
5.1.
2009
5.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
3.04.2020

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
SFSF0180026s09Bioinformaatika rakendamine genoomijärjestuste uurimiseks 01.01.200931.12.2014Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond546 107,92 EUR
ETFETF7617DNA koopiaarvu variatsioonid ja inimese (X-liiteline) vaimne alaareng01.01.200831.12.2011Ants KurgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond74 393,39 EUR
MUUVP1GI19575 FinnGen koostöö02.10.201901.08.2020Tõnu EskoTartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut240 000,00 EUR
TKSLTMR16142T (TK142)Genoomika ja Siirdemeditsiini Tippkeskus (TK142)01.01.201601.03.2023Andres MetspaluTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu4 474 349,50 EUR
SFSF0182649s04Inimese genoomi haplotüüpse struktuuri analüüs (0182649s04)01.01.200431.12.2008Maido RemmTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond224 329,88 EUR
MUUSLIC-513771 (LSHB-CT-2005-513771)SLIC-Biosensors in Molecular Diagnostics: Nanotechnology for the Analysis of species-specific Microbial Transcripts01.01.200531.12.2007Ants KurgEesti Biokeskus383 999,97 EUR
1.1.5.3.4.1.3.2.; 1.1.5.3.4.1.3.2.2.SP1GI20181T (MOBERA21)Südamerütmihäirete aluseks oleva kodade elektrijuhtivuse määrajate uurimine (ERA-CVD)01.04.202030.04.2022Tõnu EskoTartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut144 245,20 EUR
ETFETF5467Uue DNA diagnostika tehnoloogia väljatöötamine inimese kromosoomide struktuursete aberratsioonide tuvastamiseks vaimse alaarengu korral 01.01.200331.12.2006Ants KurgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond51 656,40 EUR