See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2018–...   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli genoomika instituut, bioinformaatika ja genoomika teadur (0,25)
2017–...   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Vanemteadur (1,00)
01.05.2016–31.12.2017   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu, bioinformaatika ja genoomika teadur (0,25)
01.01.2016–30.04.2016   
Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu, spetsialist (0,20)
2013–2017   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Järeldoktor (1,00)
01.05.2011–30.09.2013   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, bioinformaatika teadur (0,50)
2011–2013   
Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, UK, Järeldoktor (1,00)
01.05.2008–30.04.2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, teadur (0,50)
01.01.2008–04.04.2011   
Eesti Biokeskus, Erakorraline teadur (0,50)
01.01.2008–30.04.2008   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, programmeerija (0,50)
01.09.2005–31.12.2007   
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, programmeerija (0,50)
03.01.2005–31.12.2007   
Eesti Biokeskus, Bioinformaatika spetsialist (0,50)
2004–2008   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Bioinformaatika õppetool, programmeerija (0,50)
 
 
Haridustee
2007–2015   
Tartu Ülikool (Ph.D. bioinformaatikas)
2005–2007   
Tartu Ülikool (M.Sc. bioinformaatikas)
2000–2005   
Tartu Ülikool (B.Sc. bioinformaatikas)
1994–2000   
Tartu Mart Reiniku Gümnaasium (põhi- ja keskkool)
1988–1994   
Tartu 12. keskkool (alg- ja põhikool)
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2007−...   
Eesti Inimesegeneetika Ühingu liige

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2007, Priit Palta, SA Geenikeskus, Artur Linnu Stipendiumifond – Artur Linnu nimeline stipendium
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika
 
 
Lisainfo
Development of highly scalable statistical and computational methods for human genetics and genomics. Polygenic risk scores for complex diseases, statistical and deterministic computational haplotype phasing, genotype imputation, common and rare variant association testing. Population genetics and enriched variants in isolated populations, 2nd generation whole-exome sequencing (WES) and whole-genome sequencing (WGS) data processing and analysis.

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
6.7.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
3.1.
2018
5.2.
2018
6.7.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
5.1.
2009
5.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
29.06.2019

Career

Institution and occupation
01.01.2018–...   
University of Tartu, Institute of Genomics, Research Fellow (0,25)
2017–...   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Sequencing Informatics Team Lead (1,00)
01.05.2016–31.12.2017   
University of Tartu, Estonian Genome Center , Research Fellow (0,25)
01.01.2016–30.04.2016   
University of Tartu, Estonian Genome Center , Specialist (0,20)
2013–2017   
Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, post-doctoral fellow (1,00)
01.05.2011–30.09.2013   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow in Bioinformatics (0,50)
2011–2013   
Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, UK, post-doctoral fellow (1,00)
01.05.2008–30.04.2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Research Fellow (0,50)
01.01.2008–04.04.2011   
Estonian Biocentre, Extraordinary Researcher (0,50)
01.01.2008–30.04.2008   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Programmer (0,50)
01.09.2005–31.12.2007   
University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Molecular and Cell Biology, Programmer (0,50)
03.01.2005–31.12.2007   
Estonian Biocentre, Specialist (0,50)
2004–2008   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Chair of Bioinformatics, Other staff (0,50)
 
 
Education
2007–2015   
University of Tartu (Ph.D. in bioinformatics)
2005–2007   
University of Tartu (M.Sc. in bioinformatics)
2000–2005   
University of Tartu (B.Sc. in bioinformatics)
1994–2000   
Tartu Mart Reinik’s Gymnasium
1988–1994   
Tartu Twelfth High School
 
 
R&D related managerial and administrative work
2007−...   
Member of Estonian Society of Human Genetics

Qualifications

 
 
Honours & awards
2007, Priit Palta, Estonian Genome Foundation – nominal scholarship of the Artur Lind's Stipend Foundation
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALTY: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
 
 
Additional information
Development of highly scalable statistical and computational methods for human genetics and genomics. Polygenic risk scores for complex diseases, statistical and deterministic computational haplotype phasing, genotype imputation, common and rare variant association testing. Population genetics and enriched variants in isolated populations, 2nd generation whole-exome sequencing (WES) and whole-genome sequencing (WGS) data processing and analysis.

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2019
6.7.
2019
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
1.1.
2018
3.1.
2018
5.2.
2018
6.7.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.1.
2011
5.2.
2011
5.2.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
5.1.
2009
5.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
29.06.2019
  • Leitud 6 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
SFSF0180026s09Bioinformaatika rakendamine genoomijärjestuste uurimiseks 01.01.200931.12.2014Maido RemmTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond546 107,92 EUR
ETFETF7617DNA koopiaarvu variatsioonid ja inimese (X-liiteline) vaimne alaareng01.01.200831.12.2011Ants KurgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond74 393,39 EUR
TKSLTMR16142T (TK142)Genoomika ja Siirdemeditsiini Tippkeskus (TK142)01.01.201601.03.2023Andres MetspaluTartu Ülikool, Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu4 474 349,50 EUR
SFSF0182649s04Inimese genoomi haplotüüpse struktuuri analüüs (0182649s04)01.01.200431.12.2008Maido RemmTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond224 329,88 EUR
MUUSLIC-513771 (LSHB-CT-2005-513771)SLIC-Biosensors in Molecular Diagnostics: Nanotechnology for the Analysis of species-specific Microbial Transcripts01.01.200531.12.2007Ants KurgEesti Biokeskus383 999,97 EUR
ETFETF5467Uue DNA diagnostika tehnoloogia väljatöötamine inimese kromosoomide struktuursete aberratsioonide tuvastamiseks vaimse alaarengu korral 01.01.200331.12.2006Ants KurgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond51 656,40 EUR