Allan Nurk

16.02.1961
737 4836
allan.nurk@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2003–31.08.2007    Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, keskkonnatehnoloogia vanemteadur (1,00)
01.01.2001–31.12.2003    TÜ Tehnoloogiainstituudi vanemteadur
01.01.1997–31.12.2001    TÜ Tehnoloogiakeskuse vanemteadur
01.01.1992–31.12.1997    TÜ MRI vanemteadur
01.01.1989–31.12.1991    TÜ Plasmiidibioloogia, teadur
01.01.1986–31.12.1989    TÜ Plasmiidibioloogia, nooremteadur
01.01.1984–31.12.1986    TÜ Geneetika, stashöör-uurija
 
 
Haridustee
kõrg
1979–1984    Tartu Riiklik Ülikool
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2007−...    Tehnoloogiainstituudi teadusnõukogu liige
2002−2006    Eesti Teadusfondi tehnikateaduste ekspertkomisjoni liige

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
1992, Allan Nurk, Riigi teaduspreemia kollektiivi liikmena
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)
 
 
Lisainfo
Ph.D. Tartu Ülikool 1992.a.

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2014
1.1.
2010
1.2.
2010
1.3.
2010
5.2.
2009
1.2.
2008
1.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2007
5.2.
2007
1.1.
2006
1.2.
2006
5.2.
2006
5.2.
2006
5.2.
2005
5.2.
2005
5.2.
2005
1.1.
2004
2.3.
2004
1.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
1.1.
2001
5.2.
2000
6.3.
2000
6.3.
2000
1.1.
1999
1.1.
1998
1.2.
1998
1.1.
1997
1.1.
1996
1.1.
1994
5.1.
1994
1.1.
1993
1.1.
1993
2.3.
1992
1.1.
1991
1.1.
1991
1.1.
1991

Tööstusomand

Tööstusomand

Allan Nurk

16.02.1961
737 4836
allan.nurk@ut.ee

Career

Institution and position
01.01.2003–31.08.2007    University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Researcher (1,00)
01.01.2001–31.12.2003    Institute of Technology, Tartu University, Tartu, Senior Researcher
01.01.1997–31.12.2001    Centre of Strategic Competence at Tartu University, Senior Researcher
01.01.1992–31.12.1997    Tartu University; Institute of Molecular and Cell Biology; Senior Researcher
01.01.1989–31.12.1991    Tartu State University; Laboratory of Plasmid Biology; Research Associate
01.01.1986–31.12.1989    Tartu State University; Laboratory of Plasmid Biology; Junior Researcher
01.01.1984–31.12.1986    Tartu State University; Department of Genetics and Cytology; pre-PhD fellowship
 
 
Education
higher education
1979–1984    University of Tartu
 
 
R&D related managerial and administrative work
2007−...    University of Tartu, Institute of technology, member of the scientific council
2002−2006    Estonian Science Fondation, Expert Commission for Engineering, expert

Qualifications

 
 
Honours & awards
1992, Allan Nurk, National Science Prize
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering
 
 
Additional information
Ph.D. 1992, defended at Tartu University

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
1.1.
2010
1.2.
2010
1.3.
2010
5.2.
2009
1.2.
2008
1.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2007
5.2.
2007
1.1.
2006
1.2.
2006
5.2.
2006
5.2.
2006
5.2.
2005
5.2.
2005
5.2.
2005
1.1.
2004
2.3.
2004
1.1.
2002
5.2.
2002
1.1.
2001
1.1.
2001
5.2.
2000
6.3.
2000
6.3.
2000
1.1.
1999
1.1.
1998
1.2.
1998
1.1.
1997
1.1.
1996
1.1.
1994
5.1.
1994
1.1.
1993
1.1.
1993
2.3.
1992
1.1.
1991
1.1.
1991
1.1.
1991

Industrial property

Industrial property
  • Leitud 40 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Suitso, I.; Jõgi, E.; Orro, T.; Kavak, A.; Kalmus, K.; Viltrop, A.; Nurk, A. (2014). Bacillus Smithii TBMI12 endospores as a potential komponent of probiotic feed addative for pigs. Veterinarija ir Zootechnica, 66, 64−68.1.1.
Pähkla, E-R.; Jõgi, E.; Nurk, A.; Pisarev, H.; Koppel, T.; Naaber, P.; Saag, M.; Lõivukene, K. (2010). Periodontal disease in mothers indicates risk in their children. International Journal of Paediatric Dentistry, 20, 24−30.1.1.
Suitso, I.; Jõgi, E.; Talpsep, E.; Naaber, P.; Lõivukene, K.; Ots, M.-L.; Michelson, T.; Nurk, A. (2010). Protective effect by Bacillus smithii TBMI12 spores of Salmonella Enteritidis in mice. Beneficial Microbes, 37−42.1.2.
Lõivukene, Krista; Adamson, Vivika; Mitt, Piret; Kõljalg, Siiri; Sepp, Epp; Ivanova, Marina; Jürna-Ellam, Marika; Kirs, Kaisa; Nurk, Allan; Rõõm, Aino; Truusalu, Kai; Naaber, Paul (2010). Metitsilliiniresistentse Staphylococcus aureus’e osakaal, esmasavaldumus ja antibiootikumiresistentsus Eestis. Eesti Arst, 89 (10), 630−636.1.3.
Lõivukene, K; Adamson, V; Ivanova, M; Jürna-Ellam, M; Kirs, K; Kõljalg, S; Mitt, P; Nurk, A; Rõõm, A; Sepp, E;i Truusalu, K; Naaber, P. (2009). Incidence and antimicrobial susceptibility pattern of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in Estonia. 5.2.
Jõgi, E.; Nurk, A.; Suitso, I.; Talpsep, E.; Naaber, P.; Lõivukene, K. (2008). Bacillus Smithii Strain TBMI12 MSCL P737 and Use of Endospores thereof as a Probiotic or a Food Supplement. World Intellectual Property Organization International Bureau bulletin, 1.1.2.
Jõgi, E.; Nurk, A.; Kask, K.; Michelson, T.; Ots, M.-L. (2008). Method for obtaining endospores of sporogenous fermentable thermophilic strains of microorganism and use of the obtained endospores to inoculate fermentation. World Intellectual Property Organization International Bureau bulletin, 1.1.2.
Michelson, T.; Suitso, I.; Talpsep, E.; Jõgi, E.; Naaber, P.; Nurk, A. (2008). A potential probiotic strain Bacillus smithii TBMI12 administrated as endospores and used as competitive exclusion agent against Salmonella enteritidis. International conference on the health impact and future pontential of benefical microbes: TNO Beneficial Microbes Conference; Amsterdam; the Netherlands; 29-30 May 2008. 5.2.
Suitso, I.; Jõgi, E.; Talpsep, E.; Naaber, P.; Lõivukene, K.; Ots, M.-L.; Nurk, A. (2008). Competitive exclusion by Bacillus smithii TBMI12 spores of Salmonella Enteritidis in mice. NordForsk Advanced Lecture Course for PhD students, post docs and young scientists "Microorganisms and Health: Intestinal Bacteria, Probiotics and Pathogens"; Norway; 10-16 June 2008. 5.2.
Suitso, I.; Jõgi, E.; Talpsep, E.: Naaber, P.; Nurk, A. (2007). Bacillus smithii TBMI12 spores as a potential competitive exclusion agent against Salmonella Enteritidis. 25th International Congress of Chemotherapy and 17th Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases; Munich, Germany; 31 March - 3 April 2007. 5.2.
Jõgi, E.; Suitso, I.; Talpsep, E.; Naaber, P.; Lõivukene, K.; Nurk, A. (2007). Probiotic influence of Bacillus smithii TBMI 12 against Clostridium difficile infection in mice and hamster model. 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases and 25th International Congress of Chemotherapy; Munich, Germany; 31 March - 3 April 2007. 5.2.
Michelson, T.; Kask, K.; Jõgi, E.; Talpsep, E.; Suitso, I.; Nurk, A. (2006). l(+)-Lactic acid producer Bacillus coagulans SIM-7 DSM 14043 and its comparison with Lactobacillus delbrueckii ssp. lactis DSM 20073. Enzyme and Microbial Technology, 39 (4), 861−867, j.enzmictec.2006.01.015.1.1.
Simisker, J.; Nurk, A.; Heinaru, A. (2006). Thermophilic microorganism Bacillus coagulans strain SIM-T DSM 14043 for the production of L(+)-lactate from fermentable sugars and their mixtures. In: (1−2). USA.1.2.
Jõgi, E.; Suitso, I.; Talpsep, E.; Naaber, P.; Nurk, A. (2006). Characterization and possible probiotic influence of Bacillus smithii strain LTN074 in a murine model. Reproduction Nutrition Development, 46: Gut Microbiology- Research to improve health, immune response and nutrition, Aberdeen, Scotland; 21-23 June 2006. Ed. Petra Louis, Harry J. Fllint. France: EDP Sciences S.A, S1−S138. (Suppl. 1).5.2.
Suitso, Indrek; Jõgi, Eerik; Michelson, Tiina; Nurk, Allan (2006). Industrially suitable producer of lactic acid Bacillus coagulans SIM-7 compared with two lactobacilli: Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii and Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis. Book of abstracts, 10th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms: Prague, Czech Republic, June 24-28, 2006. Czech Republic, Videnska 1083, 14221 Prague 4: Institute of Microbiology ASCR, 151.5.2.
Suitso, I.; Jõgi, E.; Michelson, T.; Nurk, A. (2005). Bacillus coagulans SIM-7 as an industrially suitable producer of lactic acid. Book of abstracts, 8th Symposium on Lactic acid Bacteria, Federation of European Microbiological Societies. J001.5.2.
Jõgi, E.; Nurk, A. (2005). Bacillus coagulans SIM-7 DSM 14043 sporulation and possible use as a probiotic strain. Book of Abstracts, International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld-2005), Badajoz (Spain): International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld-2005), Badajoz (Spain). 917−917.5.2.
Michelson, T.; Nurk, A. (2005).  . International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology: BioMicroWorld-2005, Badajoz, Spain, 15-18 March. 289−289.5.2.
Peters, M.; Tomikas, A.; Nurk, A. (2004). Organization of the horizontally transferred pheBA operon and its adjacent genes in the genomes of eight indigenous Pseudomonas strains. Plasmid, 52 (3), 230−236.1.1.
Peters, M. (2004). Natural horizontal transfer of the pheBA operon. (Tartu Ülikool; Bioloogia-geograafiateaduskond; Rakubioloogia õppetool). Tartu: Tartu University Press.2.3.
Ignatova, Z.; Hornle, C.; Nurk, A.; Kasche, V. (2002). Unusual signal peptide directs penicillin amidase from Escherichia coli to the tat translocation machinery. Biochemical and Biophysical Research Communications, 291 (1), 146−149.1.1.
Nurk, A.; Simisker, J.; Kangur, L.; Medijainen, L.; Heinaru, E.; Heinaru, A. (2002). A novel thermophilic isolate for the production of L(+)-lactate. The 9th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms Abstract book. Gyeongju, Korea 1.– 5.06 2002: The 9th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms; Gyeongju, Korea; 1– 5 June, 2002. 5.2.
Peters, M.; Jogi, E.; Suitso, I.; Punnisk, T.; Nurk, A. (2001). Features of the Replicon of plasmid pAM10.6 of Pseudomonas fluorescens. Plasmid, 46 (1), 25−36.1.1.
Peters, M.; Heinaru, A.; Nurk, A. (2001). Plasmid-encoded catalase KatA, the main catalase of Pseudomonas fluorescens strain Cb36. FEMS Microbiology Letters, 200 (2), 235−240.1.1.
Heinaru, A.; Mäe, A.; Truu, J.; Peters, M.; Nurk, A.; Talpsep, E. (2000). Survival and detection of nonindigeneous Pseudomonas putida in aquatic microcoms. Conference of the Estonian Society for Microbiology; Tartu, Estonia; 12.05.2000. Tartu: Tartu Ülikooli Kirjastus, 13.5.2.
  • Leitud 10 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Bacillus coagulans SIM-7 DSM 14043 maltoosi fermentatsioon perioodilises kultuurisTõns, Madismagistrikraad (teaduskraad)Allan Nurk; Ain Heinaru; Andres MäeKaitstud2006Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Bacillus coagulans SIM-7 võrdlus kahe laktobatsilli tüvega piimhappe tootmiselSuitso, Indrekmagistrikraad (teaduskraad)Allan NurkKaitstud2004Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Bacillus smithii TBMI12 as a potential probiotic feed additiveSuitso, IndrekdoktorikraadAllan Nurk; Arvo ViltropKaitstud2014Eesti Maaülikool, veterinaarmeditsiini ja loomakasvatuse instituut, veterinaaria alusteaduste ja populatsioonimeditsiini osakond
Laktaadi tootmine Bacillus coagulans SIM-7 DSM 14043 vegetatiivsete rakkude ning spooridegaKask, Karinmagistrikraad (teaduskraad)Eerik Jõgi; Allan Nurk; Andres MäeKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Loodusesse lastud phe-operoni omaksvõtt fenoolse reostusega jõe mikroobide pooltPeters, Mairemagistrikraad (teaduskraad)Allan NurkKaitstud1996Tartu Ülikool
Natural horizontal transfer of the pheBA operonPeters, MairedoktorikraadAllan NurkKaitstud2004Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond
Polühüdroksüalkanaadi süntees bakteris Pseudomonas mandelii Pc17Ots, Mari-Liismagistrikraad (teaduskraad)Allan Nurk; Andres Mäe; Oliver MeikarKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Produktiivsusele optimeeritud fermentatsioon Bacillus coagulans tüvegaMichelson, Tiinamagistrikraad (teaduskraad)Allan NurkKaitstud2003Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond
Pseudomonas mandelii Pc17 ja tema polühüdroksüalkaani metabolismMeikar, Olivermagistrikraad (teaduskraad)Allan NurkKaitstud2004Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Tuhamägede leoveega kontamineeritud Kohtla jõest isoleeritud fenoolil kasvavate bakteritüvede katehhooli 2,3-dioksügenaaside jaotusestJõgi, Eerikmagistrikraad (teaduskraad)Allan Nurk; Ain HeinaruKaitstud1998Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
  • Leitud 4 kirjet
TüüpPrioriteedi numberPrioriteedi kuupäevPrioriteedi klassifikaatorPealkiriAutoridFailAsutused
Patentne leiutisP20010016416.03.2001Rahvusvaheline (IPC) Termofiilne mikroorganismi tüvi Bacillus coagulans SIM-7 DSM 14043 ja meetod L(+)-laktaadi tootmiseks fermenteeritavatest suhkrutest ja nende segudest nimetatud mikroorganismi tüve abilJaan Simisker; Allan Nurk; Ain HeinaruTartu Ülikool
Patentne leiutisP20060003411.10.2006Rahvusvaheline (IPC)Meetod sporogeensete fermenteeritavate termofiilsete mikroorganismi tüvede endospooride saamiseks ja saadud endospooride kasutamine fermentatsiooni inokuleerimiseksEerik Jõgi; Allan Nurk; Karin Kask; Mari-Liis Ots; Tiina MichelsonTartu Ülikool
Patentne leiutisP2006000388.12.2006Rahvusvaheline (IPC)Sporogeense Bacillus Smithii tüvi TBMI12 MSCL P737 ja selle endospooride kasutamine probiootikumina, toidulisandina ning probiootiline kompositsioonEerik Jõgi; Allan Nurk; Indrek Suitso; Ene Talpsep; Paul Naaber; Krista LõivukeneTartu Ülikool
Patentne leiutisP20010018123.03.2001Rahvusvaheline (IPC)THE METHOD OF PRODUCTION OF BIODEGRADABLE LACTIC ACID POLYMERS AND THE USE OF LACTIC ACID POLYMERS PRODUCED USING SUCH A METHODAllan Nurk; Vambola Kolbakov ; Jaan SimiskerAllan Nurk, Jaan Simisker, Vambola Kolbakov