Priit Adler

6.09.1982
737 6137
adler@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2010–31.08.2013    Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, programmeerija (0,60)
01.01.2006–31.12.2007    OÜ FibroTx, programmeerija/bioinformaatik
2005–2005    Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, Tarkvarasüsteemide õppetool, programmeerija (1,00)
 
 
Haridustee
2007–2015    Tartu Ülikool
2005–2007    Tartu Ülikool
2001–2005    Tartu Ülikool

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2012
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
3.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
3.1.
2008

Priit Adler

6.09.1982
737 6137
adler@ut.ee

Career

Institution and occupation
19.09.2016–...    University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Research Fellow of Bioinformatics (1,00)
02.03.2016–18.09.2016    University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Computer Science, Programmer (1,00)
01.09.2013–31.12.2015    University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Programmer (1,00)
01.09.2010–31.08.2013    University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Programmer (0,60)
01.01.2006–31.12.2007    OÜ FibroTx, programmer/bioinformatic
2005–2005    University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Chair of Software Systems, programmeerija (1,00)
 
 
Education
2007–2015    University of Tartu
2005–2007    University of Tartu
2001–2005    University of Tartu

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2014
1.1.
2012
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
3.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
3.1.
2008
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
1.2.3.3.AgedBrainSYSBIO (305299)Aju vananemisega seotud bioloogiliste radade süsteemibioloogia01.01.201330.06.2017Jaak ViloOÜ Quretec463 520,00 EUR
IUTIUT34-4Andmeteaduse meetodid ja rakendused (DSMA)01.01.201531.12.2020Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Arvutiteaduse instituut349 800,00 EUR
1.1.5.3.4.1.2.SLTAT16431TEesti eluteaduste andmete teadustaristu01.03.201631.08.2022Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Arvutiteaduse instituut987 282,88 EUR
MUUENFIN (LSHG-CT-2005-518254)ENFIN - Süsteemibioloogia15.11.200514.11.2010Jaak ViloOÜ Quretec287 602,42 EUR
ETFETF5724Geeniregulatsiooni bioinformaatika (BiGeR)01.01.200431.12.2007Jaak ViloEesti Biokeskus33 858,74 EUR
SFSF0180008s12Kaasaegsed teadusarvutuste meetodid, platvormid ja rakendused. 01.01.201231.12.2014Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond306 870,00 EUR
ETFETF7437Paljude geeniekspressiooniandmete ühisanalüüs (MEM)01.01.200831.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond64 222,50 EUR
SFSF0182712s06Suuremahuliste ja keeruliste arvutusülesannete lahendamise meetodid, arvutuskeskkonnad ja rakendused.01.01.200631.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond584 274,70 EUR
  • Leitud 14 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Fishman, Dmytro; Kisand, Kai; Hertel, Christina; Rothe, Mike; Remm, Anu; Pihlap, Maire; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Peet, Aleksandr; Meloni, Antonella; Podkrajsek, Katarina Trebusak; Battelino, Tadej; Bruserud, Øyvind; Wolff, Anette S B; Husebye, Eystein S; Kluger, Nicolas; Krohn, Kai; Ranki, Annamari; Peterson, Hedi; Hayday, Adrian ... Peterson, Pärt (2017).

Autoantibody Repertoire in APECED Patients Targets Two Distinct Subgroups of Proteins.

. Frontiers in immunology, 8, 976−976.10.3389/fimmu.2017.00976.
1.1.
Altmäe, Signe; Koel, Mariann; Võsa, Urmo; Adler, Priit; Suhorutšenko, Marina; Laisk-Podar, Triin; Kukushkina, Viktorija; Saare, Merli; Velthut-Meikas, Agne; Krjutškov, Kaarel; Aghajanova, Lusine; Lalitkumar, Parameswaran G; Gemzell-Danielsson, Kristina; Giudice, Linda; Simón, Carlos; Salumets, Andres (2017). Meta-signature of human endometrial receptivity: a meta-analysis and validation study of transcriptomic biomarkers. Scientific reports, 7 (1), 10077−10077.10.1038/s41598-017-10098-3.1.1.
Reimand Jüri; Arak Tambet; Adler Priit; Kolberg Liis; Reisberg Sulev; Peterson Hedi; Vilo Jaak (2016). g:Profiler-a web server for functional interpretation of gene lists (2016 update). Nucleic Acids Research, gkw199.10.1093/nar/gkw199.1.1.
Lees, JG.; Hériché, JK.; Morilla, I.; Fernández, JM.; Adler, P.; Krallinger, M.; Vilo, J.; Valencia, A.; Ellenberg, J.; Ranea, JA.; Orengo, C. (2015). FUN-L: Gene prioritization for RNAi screens. Bioinformatics, 31 (12), 2052−2053.10.1093/bioinformatics/btv073.1.1.
Örd, Tiit; Örd, Daima; Adler, Priit; Vilo, Jaak; Örd, Tõnis (2015). TRIB3 enhances cell viability during glucose deprivation in HEK293-derived cells by upregulating IGFBP2, a novel nutrient deficiency survival factor. Biochimica et Biophysica Acta-Molecular Cell Research, 1853 (10), 2492−2505.10.1016/j.bbamcr.2015.06.006.1.1.
Hériché, JK. ; Lees, JG. ; Morilla, I.; Walter, T. ; Petrova, B.; Julia Roberti, M.; Hossain, MJ.; Adler, P.; Fernández, JM.; Krallinger, M.; Haering, CH.; Vilo, J.; Valencia, A.; Ranea, JA. ; Orengo, C.; Ellenberg, J (2014). Integration of biological data by kernels on graph nodes allows prediction of new genes involved in mitotic chromosome condensation. Molecular Biology of the Cell, 25 (16), 2522−2536.10.1091/mbc.E13-04-0221.1.1.
Kolde, Raivo; Laur, Sven ; Adler, Priit ; Vilo, Jaak (2012). Robust Rank Aggregation for gene list integration and meta-analysis. Bioinformatics, 28 (4), 573−580.10.1093/bioinformatics/btr709.1.1.
Billon, Nathalie; Kolde, Raivo; Reimand, Juri; Monteiro, Miguel C; Kull, Meelis; Peterson, Hedi; Tretyakov, Konstantin; Adler, Priit; Wdziekonski, Brigitte; Vilo, Jaak; Dani, Christian (2010). Comprehensive transcriptome analysis of mouse embryonic stem cell adipogenesis unravels new processes of adipocyte development. Genome Biology, 11 (8), R80.10.1186/gb-2010-11-8-r80.1.1.
Adler, P.; Kolde, R.; Kull, M.; Tkachenko, A.; Peterson, H.; Reimand, J.; Vilo, J. (2009). Mining for coexpression across hundreds of datasets using novel rank aggregation and visualisation methods. Genome Biology, 10 (12), R139.10.1186/gb-2009-10-12-r139.1.1.
Schulz, H; Kolde, R; Adler, P; Aksoy, I; Anastassiadis, K; Bader, M; Billon, N; Boeuf, H; Bourillot, PY; Buchholz, F; Dani, C; Doss, MX; Forrester, L; Gitton, M; Henrique, D; Hescheler, J; Himmelbauer, H; Hübner, N; Karantzali, E; Kretsovali, A ... Functional Genomics in Embryonic Stem Cells Consortium, x (2009). The FunGenES database: a genomics resource for mouse embryonic stem cell differentiation. PLoS ONE, 4 (9), e6804−e6804.10.1371/journal.pone.0006804.1.1.
Adler, P.; Peterson, H.; Agius, P.; Reimand, J.; Vilo, J. (2009). Ranking genes by their co-expression to subsets of pathway members. In: Annals of the New York Academy of Sciences (1−13).. Oxford: Blackwell Publishing. (Challenges of Systems Biology: Community Effort to Harness Biological Complexity).10.1111/j.1749-6632.2008.03747.x.3.1.
Reimand, J. ; Tooming, L. ; Peterson, H.; Adler, P.; Vilo, J. (2008). GraphWeb: mining heterogeneous biological networks for gene modules with functional significance. Nucleic Acids Research, 36, W452−W459.10.1093/nar/gkn230.1.1.
Adler, P.; Reimand, J.; Jänes, J.; Kolde, R.; Peterson, H.; Vilo, J. (2008). KEGGanim: pathway animations for high-throughput data. Bioinformatics, 24 (4), 588−590.10.1093/bioinformatics/btm581.1.1.
Tkatchenko, A.; Tretjakov, K.; Adler, P.; Vilo, J. (2008). Text mining for automatic annotation of microarray experiment clusters. Databases and Information Systems: 8th International Baltic Conference on Databases and Information Systems; Tallinn; 02-05 June 2008. Ed. Haav, H.-M.; Kalja, A. Tallinn University of Technology Press, 423−426.3.1.
  • Leitud 1 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Re-using public RNA-Seq dataTasa, TõnismagistrikraadPriit AdlerKaitstud2015Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut
  • Leitud 1 kirjet
AutoridPealkiriAsutus
Jaak Vilo; Raivo Kolde; Priit Adler; Meelis Kull; Jüri Reimand; Hedi PetersonMEM - Multi-Experiment-Matrix Gene expression search database and toolsTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut