See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Kairi Koort

https://www.etis.ee/CV/Kairi_Koort/est
16.08.1977
+3725205507
kairita@tlu.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2015–...   
Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut, Lektor (1,00)
2014–31.08.2015   
Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS (endine Reproduktiivmeditsiini TAK AS) , Teadur (1,00)
01.01.2014–2015   
Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Lektor (1,00)
2013–2013   
Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Lektor (0,50)
2009–2014   
Reproduktiivmeditsiini ja -bioloogia Tehnoloogia Arenduskeskuse AS, Teadur (0,50)
2008–2013   
Tallinna Tehnikaülikool, Lektor (0,25)
2008–2013   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskuse erakorraline teadur (0,25)
01.01.2008–31.12.2013   
Wellcome Trust Tüviraku-uuringute Keskus, Cambridge Ülikool, UK, Teadur (1,00)
01.01.2008–31.12.2010   
EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituut, Cambridge, UK, Teadur (1,00)
2003–2006   
Tervise Arengu Instituut, Vanemteadur (1,00)
 
 
Haridustee
2006–2008   
Marie Curie Biostar stipendiaat, EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituut, Cambridge, UK
01.02.2005–01.12.2005   
Doktoriõppe projekt, Bergeni Arvutiteaduste Keskus, Bergeni Ülikool
2003–2008   
Doktoriõpe funktsionaalses genoomikas ja bioinformaatikas, CMB, Karolinska Instituut, Stockholm, Rootsi Kuningriik
2002–2003   
Rootsi Instituudi Visby programmi stipendiaat, CGB, Karolinska Instituut, Stockholm, Rootsi Kuningriik
2001–2003   
Magistrikraad geenitehnoloogias. Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut, Tallinna Tehnikaülikool
1995–2001   
Bakalaureusekraad molekulaarbioloogias ja geneetikas. Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Tartu Ülikool
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2019−...   
Eesti Mikrobioloogide Ühenduse liige
2019−...   
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi jätkusuutlikuse õppekavadesse integreerimise komisjoni liige
2018−...   
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi valimiskomisjoni liige
2018−...   
TLÜ doktoriõppekavade õppeaine "Research Ethics" arendusrühma vastutav liige
2018−...   
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi atesteerimiskomisjoni liige
2018−...   
Molekulaarse biokeemia ja ökoloogia magistriõppekava kaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2018−...   
Eesti LINK koalitsiooni asutajaliige
2017−...   
TLÜ karjäärimudeli töörühma liige
2017−...   
Integreeritud loodusteadust B.Sc kaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2017−...   
Molekulaarse biokeemia ja ökoloogia magistriõppekava eelkaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2016−...   
TLÜ Looduse Akadeemia liige
2016−...   
Molekulaarne biokeemia ja ökoloogia magistriõppekava vastuvõtukomisjoni liige, Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut
2015−...   
Molekulaarse biokeemia ja ökoloogia M.Sc molekulaarse ökoloogia õppekava juht, Loodus- ja terviseteaduste instituut, Tallinna Ülikool
2015−...   
Intergreeritud loodusteaduste B.Sc bioloogia õppekava juht, Loodus- ja tervisteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2015−...   
Bioloogia B.Sc õppekava juht, Loodus- ja Terviseteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2015−...   
Bioloogia õppesuuna bakalaureusetööde kaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2015−...   
Bioloogia bakalaureuseõppekava vastuvõtukomisjoni liige, Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut
2015−...   
Integreeritud loodusteadused bakalaureuseõppekava vastuvõtukomisjoni liige, Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut
2015−...   
Molekulaarse biokeemia ja ökoloogia magistriõppekava nõukogu liige, Loodus- ja terviseteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2010−...   
European Molecular Biology Laboratories Alumni Association liige
2003−...   
The Swedish Institute Visby Programme Alumni Association liige
2016−2016   
Geoökoloogia magistriõppekava kaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2015−2016   
Haridusinnovatsiooni keskuse töörühma liige, Tallinna Ülikool
2015−2016   
Merebioloogia M.Sc õppekava juht, Loodus- ja Terviseteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2015−2016   
Merebioloogia magistriõppekava kaitsmiskomisjoni liige, Loodus- ja Terviseteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2014−2015   
Bioloogia õppesuuna bakalaureusetööde kaitsmiskomisjoni liige, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2014−2015   
Molekulaarse biokeemia ja ökoloogia magistriõppekava nõukogu liige, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Tallinna Ülikool

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Kairi Koort, magistrikraad (teaduskraad), 2003, (juh) Madis Metsis, Genome-wide identification of TGFβ target genes in human neuroblastoma cells. (TGFβ sihtmärkgeenide identifitseerimine inimese neuroblastoomi rakkudes: ülegenoomne analüüs.), Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut.
Kairi Koort, magistrikraad, 2001, (juh) Sulev Ingerpuu; Mart Ustav, Inimese neutrofiilide tuumaantigeeni IGR-2 2F1 iseloomustamine., Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
Kairi Koort, doktorant, (juh) Boris Lenhard; Björn Anderrson; Madis Metsis, Large scale identification of transcription factor binding sites in human genome., Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2018, Kairi Koort, Margaret Hooki uurimistöö "Naftaga reostunud pinnase mikrobioloogiline analüüs Eesti rannikualade näitel" juhendamine. Eesti Teadusagentuuri ja Tartu Keskkonnahariduse Keskuse keskkonna-alaste uurimistööde konkurss, II koht.
2017, Kairi Koort, Triin Palmiste konkursitöö „Probiootilise potentsiaaliga vaginaalsete Lactobacillus crispatus tüvede proteoomi analüüs” juhendamine. Eesti Teadusagentuuri teadustööde riikliku konkursi tänukiri terviseuuringute valdkonnas.
2015, Kairi Koort, Negavatt konkurssi Eesti Kunstiakadeemia tudengite finaalitöö "RING" juhendamine.
2009, Kairi Koort, Cancer Research UK grant Wellcome Trust Tüviraku-uuringute Keskuses, Cambridge Ülikoolis, UK
2006, Kairi Koort, Marie Curie Biostar grant EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituudis, Cambridges, UK
2002, Kairi Koort, Rootsi Instituudi Visby programmi stipendium magistritöö läbiviimiseks Karolinska Instituudis, Rootsi Kuningriigis.
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Juhendamisel väitekirjad

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
5.2.
2019
Danilo Mladenović, Paolo Guazzi, Elina Aleksejeva, Antonio Chiesi, Kairi Koort, Davide Zocco, Triin Oja, Nataša Zarovni (2019). Effects of lipoprotein destabilization on isolation and analysis of plasma-derived extracellular vesicles. ISEV2019 Abstract Book: Annual Meeting ISEV 2019, Kyoto, Japan. Taylor and Francis Group, 227−228.10.1080/20013078.2019.1593587.
5.2.
2018
Reiska, Priit; Jõesaar, Andres; Kangur, Mihkel; Koort, Kairi; Sillaots, Martin; Uusküla, Mari. (2018). Educational Innovation in University Pedagogy on the Example of LIFE Projects at Tallinn University. Teaching for learning – the university perspective Conference in Tartu Abstract Book: Teaching for learning – the university perspective Conference in Tartu (Estonia), 23-25 January, 2018. Tartu: Publicon, 27.
6.7.
2018
Koort, Kairi (2018). Kuidas meie uskumused selle kohta mis on bioloogiline indiviid võivad mõjutada tervist ja heaolu? Tallinna Ülikooli Päev 2018 programm: Tallinna Ülikooli Päev 2018; Tallinn University Day 2018. Tallinna Ülikool: TLU,.
1.1.
2017
van Rijswijk, Merlijn; Beirnaert, Charlie; Caron, Christophe; Cascante, Marta; Dominguez, Victoria; Dunn, Warwick B.; Ebbels, Timothy M. D.; Giacomoni, Franck; Gonzalez-Beltran, Alejandra; Hankemeier, Thomas; Haug, Kenneth; Izquierdo-Garcia, Jose L.; Jimenez, Rafael C.; Jourdan, Fabien; Kale, Namrata; Klapa, Maria I.; Kohlbacher, Oliver; Koort, Kairi; Kultima, Kim; Le Corguillé, Gildas ... Steinbeck Christoph. (2017). The future of metabolomics in ELIXIR. F1000Research.f1000research.12342.1.
2.4.
2017
Koort, K. (2017). Systems Biology. e-Study Platform for Tallinn University Master Students.
2.4.
2017
Koort, K.; Aalberg, UB. (2017). Bio- ja geenitehnoloogia. e-õpivahend Tallinna Ülikooli bakalaureuse üliõpilastele.
2.4.
2017
Koort, K.; Stanford, D; Pulver, A. (2017). Teaduseetika. e-õpivahend Tallinna Ülikooli magistrantidele.
5.2.
2017
Hook, Margaret; Rajasaar, Maarja Mirjam; Koort, Kairi (2017). The Sequencing of Prokaryotic Microbiomes of Estonian Coastal Soils Affected by Crude Oil Contamination – a Diagnostic Tool for Coastal Ecosystem Health Assessment. eBook of Abstracts: Nature Based Solutions. From Innovation to Common-use: Nature Based Solutions. From Innovation to Common-use; 24-26 October, 2017; Tallinn, Estonia. _EditorsAbbr Galina Kapanen, Ivo Krustok, Tiiu Koff. Tallinna Ülikool, 131.
6.7.
2017
Koort, Kairi (2017). Varase algusega Parkinsoni tõve geneetilised alused. Tallinn University Brain Awareness Week. TLU,.
5.2.
2016
Koort, Kairi (2016). Study of the molecular component of Parkinson's Disease etiopathogenesis and development of life quality assessment of the patient and their family. The Centre of Excellence in Behavioural and Neural Sciences Conference Report: The Centre of Excellence in Behavioural and Neural Sciences, Tallinn, Estonia, 30.11.2016. TLU School of Natural Sciences : TLU,.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Mikrobioloogia süvakursus. e–õpivahendid Tallinna Ülikooli magistrantidele.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Gene Expression Regulation. e-Study Plaform for Tallinn University Master Students.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Süsteemibioloogia. e-õpivahend Tallinna Ülikooli bakalaureusetudengitele.
2.4.
2014
Tammoja, K. (2014). Mikrobioloogia e–õpivahendid Tallinna Ülikooli bakalaureusetudengitele.
1.1.
2010
Salmon-Divon, Mali; Dvinge, Heidi; Tammoja, Kairi; Bertone, Paul. (2010). PeakAnalyzer: genome-wide annotation of chromatin binding and modification loci. BMC Bioinformatics, 11, 415.10.1186/1471-2105-11-415.
3.2.
2009
Tammoja, K; Salmon-Divon, M; Dvinge, H; Bertone, P. (2009). Genome-wide analysis of transcription factor-mediated gene regulation. In: Vienna Leigh, Louisa Wright (_EditorsAbbr). European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2009 (106−107). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
3.2.
2009
Tommei, D, Tammoja, K; Pollard, S; Smith, A; Dircks, P; Bertone, P. (2009). Transcriptional regulation of neural stem cell differentiation. In: Vienna Leigh, Louisa Wright (_EditorsAbbr). European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2009 (107−108). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
5.2.
2009
Tammoja, K; Dvinge, H; Salmon-Divon, M; Metsis, M; Bertone, P. (2009). The Analysis on Smad2 and Smad3 ChIP-Seq Data. Conference Proceedings of Functionbal Genomics & Systems Biology Workshop: Functional Genomics & Systems Biology 2009, Wellcome Trust Conference Centre. Hinxton, UK: Wellcome Trust Conference Centre,.
3.2.
2008
Tammoja, K; Salmon-Divon, M; Dvinge, H; Lenhard, B; Bertone P. (2008). Genome-wide analysis of transcription factor-mediated gene regulation. In: European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2008 (123−124). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
5.2.
2008
Tammoja, K; Dvinge, H; Salmon-Divon, M; Bertone, P. (2008). Whole Genome Investigation of Androgen Receptor Binding. Conference Proceedings of Signalling to Chromatin 2008: Signalling to Chromatin 2008, Wellcome Trust Conference Centre. Hinxton, UK: Wellcome Trust Conference Centre,.
5.2.
2008
Tammoja, Kairi; Lenhard, Boris. (2008). Transcriptional regulation of hormone-dependant systems. Conference Proceedings of Post-translational Modifications & Chromatin Conference: Post-translational Modifications & Chromatin Conference, The Babbage Lecture Theatre University New Museums Site. _EditorsAbbr Minh Tran-Dang. Cambridge, UK: St. John's Innovation Centre, Cambridge, UK,.
5.2.
2007
Tammoja, K; Lenhard, B; Bertone PN. (2007). Genome wide identification of Estrogen Receptor Binging Regions in MCF7 Breast Cancer Cell-line. Conference Proceedings of Functional Genomics & Systems Biology: Joint Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust Conference: Functional Genomics & Systems Biology. Cold Spring Harbor, USA: Cold Spring Harbor Lab Press, Publications Dept,.
5.2.
2006
Tammoja, K; Metsis, M; Lenhard, B, Bertone, PN. (2006). Whole Genome Analysis of Transcription Factor Binding Regions in LNCaP Prostate Cancer Cell-line. Conference Proceedings of the 3rd EMBL Biennial Symposium: From Functional Genomics to Systems Biology: The 3rd EMBL Biennial Symposium: From Functional Genomics to Systems Biology, EMBL Heidelberg, October 14-17, 2006. Heidelberg, Germany: European Molecular Biology Organization,.
5.2.
2006
Tammoja, Kairi (2006). Transcriptional landscape of Androgen Receptor Binding. 3rd Conference of the Consortium for Post-Genome Science Proceedings, 3: 3rd Conference of the Consortium for Post-Genome Science ‘Genomes to Systems’. Manchester International Convention Centre,.
1.1.
2005
Carninci P, Kasukawa T, […] Tammoja K, […] Hayashizaki Y. (2005). The transcriptional landscape of the mammalian genome. Science, 309 (5740), 1559−1563.
6.7.
2003
Tammoja, Kairi (2003). Genome-wide identification of TGFβ target genes in human neuroblastoma cells. In: . Tallinna Tehnikaülikool.
6.7.
2001
Tammoja, Kairi (2001). Inimese neutrofiilide tuumaantigeeni IGR-2 2F1 iseloomustamine. Tartu Ülikool.

Tööstusomand

13.05.2019

Kairi Koort

https://www.etis.ee/CV/Kairi_Koort/eng
16.08.1977
+3725205507
kairita@tlu.ee
http://

Career

Institution and occupation
01.09.2015–...   
Tallinn University, School of Natural Sciences and Health, Lecturer (1,00)
2014–31.08.2015   
Competence Centre on Health Technologies, Researcher (1,00)
01.01.2014–2015   
Tallinn University, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Lecturer (1,00)
2013–2013   
Tallinn University, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Lecturer (0,50)
2009–2014   
CCRMB, Researcher (0,50)
2008–2013   
Tallinn University of Technology , Lecturer (0,25)
2008–2013   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Extraordinary Researcher (0,25)
01.01.2008–31.12.2013   
The Wellcome Trust Centre for Stem Cell Research, University of Cambridge, UK, Researcher (1,00)
01.01.2008–31.12.2010   
EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK, Researcher (1,00)
2003–2006   
National Institute for Health Development, Senior Researcher (1,00)
 
 
Education
2006–2008   
Marie Curie Biostar Fellow. EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK
01.02.2005–01.12.2005   
Doctoral Project, Bergen Center for Computational Science, Bergen University
2003–2008   
Doctoral Studies in Functional Genomics and Bioinformatics, Department of Cell and Molecular Biology, CGB, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden
2002–2003   
The Swedish Institute Visby Programme Scholar, Center for Genomics and Bioinformatics, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden
2001–2003   
MSc in Gene Technology. National Institute of Chemical Physics and Biophysics, Tallinn Technical University, Estonia
1995–2001   
BSc in Molecular Biology and Genetics, Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Estonia
 
 
R&D related managerial and administrative work
2019−...   
Member of the Estonian Society of Microbiology
2019−...   
Member of the Sustainability in Higher Education Curricula Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...   
Member of the Electoral Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...   
Member of the Doctoral Programme Research Ethics Course Development Committee, Tallinn University
2018−...   
Member of the Evaluation Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...   
Member of the Molecular Biochemistry and Ecology Master Program Thesis Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...   
Founding Member of the Estonian LINK Coalition
2017−...   
Member of the Career Model Workgroup, Tallinn University
2017−...   
Member of the Integrated Natural Sciences BSc Thesis Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2017−...   
Member of the Molecular Biochemistry and Ecology Master Program Thesis Pre-Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2016−...   
Member of Tallinn University Nature Academy
2016−...   
Molecular Biochemistry and Ecology MSc Admission Committee Member, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...   
Head of Molecular Ecology module in Molecular Biochemistry and Ecology M.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn Univesity
2015−...   
Head of Biology in Integrated Natural Sciences B.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...   
Head of Biology B.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn Univesity
2015−...   
Member of the Biology BSc Thesis Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...   
Biology BSc Admission Committee Member, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...   
Integrated Natural Sciences BSc Admission Committee Member, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...   
Member of the Molecular Biochemistry and Ecology MSc Programme Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2010−...   
Member of European Molecular Biology Laboratories Alumni Association
2003−...   
The Swedish Institute Visby Programme Alumni Association Member
2016−2016   
Member of the Geoecology Master Program Thesis Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−2016   
Member of the Centre for Innovation in Education Team, Tallinn University
2015−2016   
Head of Marine Biology M.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn Univesity
2015−2016   
Member of the Marine Biology Master Programme Defence Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2014−2015   
Member of the Biology BSc Thesis Defence Committee, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Tallinn University
2014−2015   
Member of the Molecular Biochemistry and Ecology MSc Programme Committee, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Tallinn University

Qualifications

Academic degrees
Kairi Koort, Master's Degree, 2003, (sup) Madis Metsis, Genome-wide identification of TGFβ target genes in human neuroblastoma cells., Tallinn University of Technology Faculty of Science, Department of Gene Technology.
Kairi Koort, Master's Diploma, 2001, (sup) Sulev Ingerpuu; Mart Ustav, Inimese neutrofiilide tuumaantigeeni IGR-2 2F1 iseloomustamine. (Characterization of human neutrophil nuclear antigen IGR-2 2F1.), University of Tartu, Faculty of Biology and Geography.
Kairi Koort, Phd student, (sup) Boris Lenhard; Björn Anderrson; Madis Metsis, Large scale identification of transcription factor binding sites in human genome., Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
 
 
Honours & awards
2018, Kairi Koort, For the supervision of Margaret Hook's research paper "Microbiological analysis of oil-contaminated coastal soils in Estonia". Estonian Research Council and Tartu Environmental Education Centre competition of research papers in Environmental Sciences, II place.
2017, Kairi Koort, Supervision of Triin Palmiste's Master Thesis "Proteome Analysis of Lactobacillus crispatus Strains with Probiotic Potential". Honourable mention in the Estonian Research Fund National Competition Health Research Category.
2015, Kairi Koort, Negavatt competition finals. Supervision of Estonian Art Academy project "RING".
2009, Kairi Koort, Cancer Research UK Collaborator Grant at the Wellcome Trust Center for Stem Cell Research, University of Cambridge, UK
2006, Kairi Koort, Marie Curie Biostar Fellowship at the EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK
2002, Kairi Koort, The Swedish Institute Visby Programme Scholarship. Scholarsip for overseas research at the Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies
 
 

Projects in progress

Completed projects

Dissertations under supervision

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
5.2.
2019
Danilo Mladenović, Paolo Guazzi, Elina Aleksejeva, Antonio Chiesi, Kairi Koort, Davide Zocco, Triin Oja, Nataša Zarovni (2019). Effects of lipoprotein destabilization on isolation and analysis of plasma-derived extracellular vesicles. ISEV2019 Abstract Book: Annual Meeting ISEV 2019, Kyoto, Japan. Taylor and Francis Group, 227−228.10.1080/20013078.2019.1593587.
5.2.
2018
Reiska, Priit; Jõesaar, Andres; Kangur, Mihkel; Koort, Kairi; Sillaots, Martin; Uusküla, Mari. (2018). Educational Innovation in University Pedagogy on the Example of LIFE Projects at Tallinn University. Teaching for learning – the university perspective Conference in Tartu Abstract Book: Teaching for learning – the university perspective Conference in Tartu (Estonia), 23-25 January, 2018. Tartu: Publicon, 27.
6.7.
2018
Koort, Kairi (2018). Kuidas meie uskumused selle kohta mis on bioloogiline indiviid võivad mõjutada tervist ja heaolu? Tallinna Ülikooli Päev 2018 programm: Tallinna Ülikooli Päev 2018; Tallinn University Day 2018. Tallinna Ülikool: TLU,.
1.1.
2017
van Rijswijk, Merlijn; Beirnaert, Charlie; Caron, Christophe; Cascante, Marta; Dominguez, Victoria; Dunn, Warwick B.; Ebbels, Timothy M. D.; Giacomoni, Franck; Gonzalez-Beltran, Alejandra; Hankemeier, Thomas; Haug, Kenneth; Izquierdo-Garcia, Jose L.; Jimenez, Rafael C.; Jourdan, Fabien; Kale, Namrata; Klapa, Maria I.; Kohlbacher, Oliver; Koort, Kairi; Kultima, Kim; Le Corguillé, Gildas ... Steinbeck Christoph. (2017). The future of metabolomics in ELIXIR. F1000Research.f1000research.12342.1.
2.4.
2017
Koort, K. (2017). Systems Biology. e-Study Platform for Tallinn University Master Students.
2.4.
2017
Koort, K.; Aalberg, UB. (2017). Bio- ja geenitehnoloogia. e-õpivahend Tallinna Ülikooli bakalaureuse üliõpilastele.
2.4.
2017
Koort, K.; Stanford, D; Pulver, A. (2017). Teaduseetika. e-õpivahend Tallinna Ülikooli magistrantidele.
5.2.
2017
Hook, Margaret; Rajasaar, Maarja Mirjam; Koort, Kairi (2017). The Sequencing of Prokaryotic Microbiomes of Estonian Coastal Soils Affected by Crude Oil Contamination – a Diagnostic Tool for Coastal Ecosystem Health Assessment. eBook of Abstracts: Nature Based Solutions. From Innovation to Common-use: Nature Based Solutions. From Innovation to Common-use; 24-26 October, 2017; Tallinn, Estonia. _EditorsAbbr Galina Kapanen, Ivo Krustok, Tiiu Koff. Tallinna Ülikool, 131.
6.7.
2017
Koort, Kairi (2017). Varase algusega Parkinsoni tõve geneetilised alused. Tallinn University Brain Awareness Week. TLU,.
5.2.
2016
Koort, Kairi (2016). Study of the molecular component of Parkinson's Disease etiopathogenesis and development of life quality assessment of the patient and their family. The Centre of Excellence in Behavioural and Neural Sciences Conference Report: The Centre of Excellence in Behavioural and Neural Sciences, Tallinn, Estonia, 30.11.2016. TLU School of Natural Sciences : TLU,.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Mikrobioloogia süvakursus. e–õpivahendid Tallinna Ülikooli magistrantidele.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Gene Expression Regulation. e-Study Plaform for Tallinn University Master Students.
2.4.
2015
Tammoja, K. (2015). Süsteemibioloogia. e-õpivahend Tallinna Ülikooli bakalaureusetudengitele.
2.4.
2014
Tammoja, K. (2014). Mikrobioloogia e–õpivahendid Tallinna Ülikooli bakalaureusetudengitele.
1.1.
2010
Salmon-Divon, Mali; Dvinge, Heidi; Tammoja, Kairi; Bertone, Paul. (2010). PeakAnalyzer: genome-wide annotation of chromatin binding and modification loci. BMC Bioinformatics, 11, 415.10.1186/1471-2105-11-415.
3.2.
2009
Tammoja, K; Salmon-Divon, M; Dvinge, H; Bertone, P. (2009). Genome-wide analysis of transcription factor-mediated gene regulation. In: Vienna Leigh, Louisa Wright (_EditorsAbbr). European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2009 (106−107). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
3.2.
2009
Tommei, D, Tammoja, K; Pollard, S; Smith, A; Dircks, P; Bertone, P. (2009). Transcriptional regulation of neural stem cell differentiation. In: Vienna Leigh, Louisa Wright (_EditorsAbbr). European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2009 (107−108). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
5.2.
2009
Tammoja, K; Dvinge, H; Salmon-Divon, M; Metsis, M; Bertone, P. (2009). The Analysis on Smad2 and Smad3 ChIP-Seq Data. Conference Proceedings of Functionbal Genomics & Systems Biology Workshop: Functional Genomics & Systems Biology 2009, Wellcome Trust Conference Centre. Hinxton, UK: Wellcome Trust Conference Centre,.
3.2.
2008
Tammoja, K; Salmon-Divon, M; Dvinge, H; Lenhard, B; Bertone P. (2008). Genome-wide analysis of transcription factor-mediated gene regulation. In: European Bioinformatics Institute Annual Scientific Report 2008 (123−124). Hinxton, UK: EMBL-EBI.
5.2.
2008
Tammoja, K; Dvinge, H; Salmon-Divon, M; Bertone, P. (2008). Whole Genome Investigation of Androgen Receptor Binding. Conference Proceedings of Signalling to Chromatin 2008: Signalling to Chromatin 2008, Wellcome Trust Conference Centre. Hinxton, UK: Wellcome Trust Conference Centre,.
5.2.
2008
Tammoja, Kairi; Lenhard, Boris. (2008). Transcriptional regulation of hormone-dependant systems. Conference Proceedings of Post-translational Modifications & Chromatin Conference: Post-translational Modifications & Chromatin Conference, The Babbage Lecture Theatre University New Museums Site. _EditorsAbbr Minh Tran-Dang. Cambridge, UK: St. John's Innovation Centre, Cambridge, UK,.
5.2.
2007
Tammoja, K; Lenhard, B; Bertone PN. (2007). Genome wide identification of Estrogen Receptor Binging Regions in MCF7 Breast Cancer Cell-line. Conference Proceedings of Functional Genomics & Systems Biology: Joint Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust Conference: Functional Genomics & Systems Biology. Cold Spring Harbor, USA: Cold Spring Harbor Lab Press, Publications Dept,.
5.2.
2006
Tammoja, K; Metsis, M; Lenhard, B, Bertone, PN. (2006). Whole Genome Analysis of Transcription Factor Binding Regions in LNCaP Prostate Cancer Cell-line. Conference Proceedings of the 3rd EMBL Biennial Symposium: From Functional Genomics to Systems Biology: The 3rd EMBL Biennial Symposium: From Functional Genomics to Systems Biology, EMBL Heidelberg, October 14-17, 2006. Heidelberg, Germany: European Molecular Biology Organization,.
5.2.
2006
Tammoja, Kairi (2006). Transcriptional landscape of Androgen Receptor Binding. 3rd Conference of the Consortium for Post-Genome Science Proceedings, 3: 3rd Conference of the Consortium for Post-Genome Science ‘Genomes to Systems’. Manchester International Convention Centre,.
1.1.
2005
Carninci P, Kasukawa T, […] Tammoja K, […] Hayashizaki Y. (2005). The transcriptional landscape of the mammalian genome. Science, 309 (5740), 1559−1563.
6.7.
2003
Tammoja, Kairi (2003). Genome-wide identification of TGFβ target genes in human neuroblastoma cells. In: . Tallinna Tehnikaülikool.
6.7.
2001
Tammoja, Kairi (2001). Inimese neutrofiilide tuumaantigeeni IGR-2 2F1 iseloomustamine. Tartu Ülikool.

Industrial property

13.05.2019
Detailne otsing
  • Leitud 9 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
MUUTF1816 (TLÜ uuringufondi nõukogu otsus 15.04.2016 )Genoomika labori loomine Loodus- ja terviseteaduste instituudis, rõhuga geenitehnoloogia rakendamisele keskkonna- ja terviseteadustes01.04.201631.12.2018Kairi KoortTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut37 400,00 EUR
MUUTF1713 MLI bioinformaatika arvutusbaasi loomine 01.05.201331.12.2018Kairi KoortTallinna Ülikool2 000,00 EUR
2.1.1.TRU17053A Paber- ja tekstiilrätikute analüüsid 17.04.201731.07.2017Kairi KoortTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut660,00 EUR
MUUF/2213 (TLÜ senati teadukomisjoni istungi protokoll 18.11.2013)Pilootprojekt kombineeritud teaduskompetentsi väljakujunemiseks neurodegeneratiivsete haiguste uurimiseks TLÜ's 01.11.201331.12.2018Madis MetsisTallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut8 000,00 EUR
ETFETF7823Raku energiaühikute moodustumise dünaamika tüvirakkude differentseerumise protsessis lihasrakkudeks ja nende degradatsioon vananemise käigus01.01.200931.12.2012Valdur SaksKeemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut88 352,54 EUR
MUUTF5916 (TLÜ uuringufondi nõukogu 25. novembri 2016. aasta koosoleku otsus nr 9/16)Tallinna Ülikooli loodus- ja terviseteaduste instituudi molekulaarteaduste labori proovimaterjali eeltöötluse metoodika kaasajastamine ja arendamine21.11.201630.01.2017Margit KaldmäeTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut8 000,00 EUR
MUUTF1515 (TLÜ senati teaduskomisjoni istungi protokoll 20.04.2015 nr 9)TLÜ käitumis- ja neuroteaduste tippkeskus 01.05.201531.12.2020Ruth ShimmoTallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut108 000,00 EUR
MUUVEU445Uue metagenoomse keskkonnamonitooringu meetodi arendus01.01.201030.06.2012Madis MetsisTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus1 597 791,21 EUR
MUUTF3117 (TLÜ uuringufondi nõukogu 27.11.2017 otsus nr 7.1-17/7)Vetikapolüsahhariide lagundavad bakterid Läänemerest: iseloomustamine ja ensüümide eraldamine 07.12.201707.09.2018Rando TuvikeneTallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut6 850,00 EUR