Kairi Koort
https://www.etis.ee/CV/Kairi_Koort/est
kairita@tlu.ee
Teenistuskäik
Töökohad ja ametid
01.09.2015–...
Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut, Lektor (1,00)
2014–31.08.2015
Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS (endine Reproduktiivmeditsiini TAK AS) , Teadur (1,00)
01.01.2014–2015
Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut, Lektor (1,00)
2009–2014
Reproduktiivmeditsiini ja -bioloogia Tehnoloogia Arenduskeskuse AS, Teadur (0,50)
2008–2013
Tallinna Tehnikaülikool, Lektor (0,25)
2008–2013
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskuse erakorraline teadur (0,25)
01.01.2008–31.12.2013
Wellcome Trust Tüviraku-uuringute Keskus, Cambridge Ülikool, UK, Teadur (1,00)
01.01.2008–31.12.2010
EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituut, Cambridge, UK, Teadur (1,00)
2003–2006
Tervise Arengu Instituut, Vanemteadur (1,00)
Haridustee
2006–2008
Marie Curie Biostar stipendiaat, EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituut, Cambridge, UK
01.02.2005–01.12.2005
Doktoriõppe projekt, Bergeni Arvutiteaduste Keskus, Bergeni Ülikool
2003–2008
Doktoriõpe funktsionaalses genoomikas ja bioinformaatikas, CMB, Karolinska Instituut, Stockholm, Rootsi Kuningriik
2002–2003
Rootsi Instituudi Visby programmi stipendiaat, CGB, Karolinska Instituut, Stockholm, Rootsi Kuningriik
2001–2003
Magistrikraad geenitehnoloogias. Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut, Tallinna Tehnikaülikool
1995–2001
Bakalaureusekraad molekulaarbioloogias ja geneetikas. Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Tartu Ülikool
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2021−...
Raadio 2 teadussaate "Puust ja punaseks" ekspert
2020−...
Eesti Biokeemia Seltsi liige
2020−...
Tallinna Ülikooli senati liige
2020−...
Üliõpilaste teadustööde riikliku konkursi retsensent
2020−...
Eesti EMBL-i, EMBO, ja EMBC-ga ühinemist ettevalmistava töögrupi liige
2019−...
Eesti Mikrobioloogide Ühenduse liige
2019−...
Molekulaarne biokeemia ja ökoloogia M.Sc õppekava juht, Loodus- ja terviseteaduste instituut, Tallinna Ülikool
2019−...
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi nõukogu liige
2018−...
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi valimiskomisjoni liige
2018−...
TLÜ Loodus- ja terviseteaduste instituudi atesteerimiskomisjoni liige
2018−...
Õpilaste teadustööde riikliku konkursi retsensent
2016−...
TLÜ Looduse Akadeemia liige
2015−...
Intergreeritud loodusteaduste B.Sc bioloogia õppekava juht, Loodus- ja tervisteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2015−...
Bioloogia B.Sc õppekava juht, Loodus- ja Terviseteaduste Instituut, Tallinna Ülikool
2010−...
European Molecular Biology Laboratories Alumni Association liige
2003−...
The Swedish Institute Visby Programme Alumni Association liige
2017−2020
TLÜ karjäärimudeli töörühma liige
2015−2019
Molekulaarne biokeemia ja ökoloogia M.Sc molekulaarse ökoloogia õppekava juht, Loodus- ja terviseteaduste instituut, TLÜ
2015−2016
Haridusinnovatsiooni keskuse töörühma liige, Tallinna Ülikool
Lisainfo
Kvalifikatsioon
Teaduskraadid
Teaduspreemiad ja tunnustused
2021, Kairi Koort, Tallinna Ülikooli Loodus- ja terviseteaduste instituudi tudengite tänukiri suurepärase õppekuraatori töö eest. TLÜ LTI Üliõpilasnõukogu.
2021, Kairi Koort, Tallinna Linnavolikogu ja Tallinna Linnavalitsuse aukiri Raestipendiumi väärilise uurimustöö juhendamise eest
2021, Kairi Koort, Tallinna Ülikooli aukiri "Parim õppekava juht"
2021, Kairi Koort, Maarja Tali konkursitöö „Kontseptsioon „Ühtne tervis‟ integreeritud tervisekäsitustes COVID-19 näitel” juhendamine.
Tallinna Ülikooli üleülikoolilise üliõpilaste teadustööde konkurss, Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkond, kolmas koht.
2021, Kairi Koort, Kärt Viljalo konkursitöö „Nanoplasti põlvkondadeülesed mõjud Daphnia magna näitel” juhendamine.
Tallinna Ülikooli üleülikoolilise üliõpilaste teadustööde konkurss, Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkond, jagatud esimene koht.
2021, Kairi Koort, Kadi Karmen Kaldma konkursitöö „Tallinna kogukonnaaedade mulla mikrobioloogilise koostise määramine” juhendamine.
Tallinna Ülikooli üleülikoolilise üliõpilaste teadustööde konkurss, Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkond, jagatud esimene koht.
2020, Kairi Koort, Jelizaveta Titova bakalaureusetöö TLÜ Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkonna teadustööde auhind bakalaureusetööde kategoorias, II koht. "Nanoplasti hilistunud toksilisus suurele kiivrikule Daphnia magna." Juhendajad: Margit Heinlaan, Kairi Koort
2020, Kairi Koort, Mari-Helena Toompere bakalaureusetöö TLÜ Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkonna teadustööde auhind bakalaureusetööde kategoorias, III koht. "Tallinna loomaaia ilvese (Lynx lynx lynx) populatsiooni geneetiline analüüs". Juhendaja Kairi Koort
2019, Kairi Koort, Merlin Matvere konkursitöö „Ekstratsellulaarsete vesiikulite fraktsioneerimine suuruseraldus-kromatograafia abil” juhendamine.
Tallinna Ülikooli üleülikoolilise üliõpilaste teadustööde konkurss, Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkond, esimene koht.
2019, Kairi Koort, Kristiina Sõsa konkursitöö „Viljatute paaride suguteede mikrobioomi bioinformaatiline analüüs” juhendamine.
Tallinna Ülikooli üleülikoolilise üliõpilaste teadustööde konkurss, Terve ja jätkusuutliku eluviisi valdkond, esimene koht.
2018, Kairi Koort, Margaret Hooki uurimistöö "Naftaga reostunud pinnase mikrobioloogiline analüüs Eesti rannikualade näitel" juhendamine.
Eesti Teadusagentuuri ja Tartu Keskkonnahariduse Keskuse keskkonna-alaste uurimistööde konkurss, II koht.
2017, Kairi Koort, Triin Palmiste konkursitöö „Probiootilise potentsiaaliga vaginaalsete Lactobacillus crispatus tüvede proteoomi analüüs” juhendamine.
Eesti Teadusagentuuri teadustööde riikliku konkursi tänukiri terviseuuringute valdkonnas.
2015, Kairi Koort, Negavatt konkurssi Eesti Kunstiakadeemia tudengite finaalitöö "RING" juhendamine.
2009, Kairi Koort, Cancer Research UK grant Wellcome Trust Tüviraku-uuringute Keskuses, Cambridge Ülikoolis, UK
2006, Kairi Koort, Marie Curie Biostar grant EMBL Euroopa Bioinformaatika Instituudis, Cambridges, UK
2002, Kairi Koort, Rootsi Instituudi Visby programmi stipendium magistritöö läbiviimiseks Karolinska Instituudis, Rootsi Kuningriigis.
Teadustöö põhisuunad
ETIS VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika
Klass
Aasta
Publikatsioon
1.1.
2022
5.1.
2022
1.1.
2021
5.2.
2021
5.2.
2021
5.2.
2021
1.1.
2020
1.2.
2020
2.5.
2020
3.2.
2020
3.2.
2020
1.1.
2019
2.5.
2019
3.4.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2018
6.7.
2018
1.1.
2017
2.4.
2017
2.4.
2017
2.4.
2017
5.2.
2017
6.7.
2017
5.2.
2016
2.4.
2015
2.4.
2015
2.4.
2015
2.4.
2014
1.1.
2010
3.2.
2009
3.2.
2009
5.2.
2009
3.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2007
5.2.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
9.06.2022
Kairi Koort
https://www.etis.ee/CV/Kairi_Koort/eng
kairita@tlu.ee
Career
Institutions and positions
01.09.2015–...
Tallinn University, School of Natural Sciences and Health, Lecturer (1,00)
2014–31.08.2015
Competence Centre on Health Technologies, Researcher (1,00)
01.01.2014–2015
Tallinn University, Institute of Mathematics and Natural Sciences, Lecturer (1,00)
2009–2014
CCRMB, Researcher (0,50)
2008–2013
Tallinn University of Technology , Lecturer (0,25)
2008–2013
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Extraordinary Researcher (0,25)
01.01.2008–31.12.2013
The Wellcome Trust Centre for Stem Cell Research, University of Cambridge, UK, Researcher (1,00)
01.01.2008–31.12.2010
EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK, Researcher (1,00)
2003–2006
National Institute for Health Development, Senior Researcher (1,00)
Education
2006–2008
Marie Curie Biostar Fellow. EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK
01.02.2005–01.12.2005
Doctoral Project, Bergen Center for Computational Science, Bergen University
2003–2008
Doctoral Studies in Functional Genomics and Bioinformatics, Department of Cell and Molecular Biology, CGB, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden
2002–2003
The Swedish Institute Visby Programme Scholar, Center for Genomics and Bioinformatics, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden
2001–2003
MSc in Gene Technology. National Institute of Chemical Physics and Biophysics, Tallinn Technical University, Estonia
1995–2001
BSc in Molecular Biology and Genetics, Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu, Estonia
R&D related managerial and administrative work
2021−...
Radio 2 science programme "Puust ja punaseks" co-author
2020−...
Member of the Estonian Biochemical Society
2020−...
Member of the Tallinn University Senate
2020−...
Expert at the National University Student Research Competition
2020−...
Member of the Committee for Estonian Membership in EMBL, EMBO & EMBC
2019−...
Member of the Estonian Society of Microbiology
2019−...
Head of Molecular Biochemistry and Ecology M.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2019−...
Member of Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...
Member of the Electoral Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...
Member of the Evaluation Committee, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2018−...
Expert at the National Student Research Competition
2016−...
Member of Tallinn University Nature Academy
2015−...
Head of Biology in Integrated Natural Sciences B.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn University
2015−...
Head of Biology B.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn Univesity
2010−...
Member of European Molecular Biology Laboratories Alumni Association
2003−...
The Swedish Institute Visby Programme Alumni Association Member
2017−2020
Member of the Career Model Workgroup, Tallinn University
2015−2019
Head of Molecular Ecology module in Molecular Biochemistry and Ecology M.Sc study programme, School of Natural Sciences and Health, Tallinn Univesity
2015−2016
Member of the Centre for Innovation in Education Team, Tallinn University
Additional information
Qualifications
Academic degrees
Honours & awards
2021, Kairi Koort, For the role as an excellent Study Programme Curator. Tallinn University School of Natural Sciences and Health Student Union.
2021, Kairi Koort, Letter of Recognition by the Tallinn City Council and Tallinn City Government for the supervision of Raestipendium winning Master Thesis
2021, Kairi Koort, "The Best Head of Curricula", Tallinn University
2021, Kairi Koort, Supervision of Maarja Tali's Bachelor Thesis "“One Health” Concept in Integrated Health Approaches with Respect to COVID-19."
Third place in the Tallinn University Best Thesis Competition, Healthy and Sustainable Lifestyle.
2021, Kairi Koort, Supervision of Kärt Viljalo's Master Thesis "Intergenerational Effects of Nanoplastics on the Example of Daphnia magna".
Shared first place in the Tallinn University Best Thesis Competition, Healthy and Sustainable Lifestyle.
2021, Kairi Koort, Supervision of Kadi Karmen Kaldma's Master Thesis "The determination of soil microbiological composition in Tallinn community gardens".
Shared first place in the Tallinn University Best Thesis Competition, Healthy and Sustainable Lifestyle.
2020, Kairi Koort, Late Toxicity of Nanoplastic to the Planktonic Crustacean Daphnia magna. For the supervision of Jelizaveta Titova's bachelor thesis.
2020, Kairi Koort, "The genetic analysis of the Tallinn Zoo Lynx lynx lynx population." Mari-Helena Toompere Bachelor thesis supervision Kairi Koort
2019, Kairi Koort, Supervision of Merlin Matvere's Master Thesis "Fractionation of extracellular vesicles by size-exclusion chromatography".
First place in the Tallinn University Best Thesis Competition, Healthy and Sustainable Lifestyle.
2019, Kairi Koort, Supervision of Kristiina Sõsa's Master Thesis "The Bioinformatic Analysis of Infertile Couple's Genital microbiome".
First place in the Tallinn University Best Thesis Competition, Healthy and Sustainable Lifestyle.
2018, Kairi Koort, For the supervision of Margaret Hook's research paper "Microbiological analysis of oil-contaminated coastal soils in Estonia".
Estonian Research Council and Tartu Environmental Education Centre competition of research papers in Environmental Sciences, II place.
2017, Kairi Koort, Supervision of Triin Palmiste's Master Thesis "Proteome Analysis of Lactobacillus crispatus Strains with Probiotic Potential".
Honourable mention in the Estonian Research Fund National Competition Health Research Category.
2015, Kairi Koort, Negavatt competition finals. Supervision of Estonian Art Academy project "RING".
2009, Kairi Koort, Cancer Research UK Collaborator Grant at the Wellcome Trust Center for Stem Cell Research, University of Cambridge, UK
2006, Kairi Koort, Marie Curie Biostar Fellowship at the EMBL European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK
2002, Kairi Koort, The Swedish Institute Visby Programme Scholarship. Scholarsip for overseas research at the Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
Fields of research
ETIS RESEARCH FIELD: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies
Category
Year
Publication
1.1.
2022
5.1.
2022
1.1.
2021
5.2.
2021
5.2.
2021
5.2.
2021
1.1.
2020
1.2.
2020
2.5.
2020
3.2.
2020
3.2.
2020
1.1.
2019
2.5.
2019
3.4.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2019
5.2.
2018
6.7.
2018
1.1.
2017
2.4.
2017
2.4.
2017
2.4.
2017
5.2.
2017
6.7.
2017
5.2.
2016
2.4.
2015
2.4.
2015
2.4.
2015
2.4.
2014
1.1.
2010
3.2.
2009
3.2.
2009
5.2.
2009
3.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2008
5.2.
2007
5.2.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
9.06.2022
Otsi projekti
Asutus on projekti finantseerija
Asutus on projekti teostaja
Kõik
Tavaprojektid
Ülemprojektid
Alamprojektid
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
- Leitud 20 kirjet
Programm | Liik | Number | Nimi | Projekti algus | Projekti lõpp | Vastutav täitja | Asutus | Finantseerijapoolne rahastamine | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
- | Kairi Koort | Tallinna Ülikool | 0,00 EUR | ||||||
1.2.2.1. | TKA19021 | Elixir Metabolomics Use Case | 02.10.2017 | 31.10.2023 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 10 000,00 EUR (kogurahastus 110 000,00 EUR) | ||
TT | TKA19021 | Elixir Metabolomics Use Case | 02.10.2017 | 31.10.2023 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 5 000,00 EUR | ||
1.1.9. | TF7320 | Fluorestseeruva märgistamise strateegia rakuväliste vesiikulite fenotüpiseerimiseks keerulistes bioloogilistes maatriksites | 01.02.2021 | 01.08.2021 | Danilo Mladenović | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 3 000,00 EUR | ||
1.1.8.1. | TF1816 (TLÜ uuringufondi nõukogu otsus 15.04.2016 ) | Genoomika labori loomine Loodus- ja terviseteaduste instituudis, rõhuga geenitehnoloogia rakendamisele keskkonna- ja terviseteadustes | 01.04.2016 | 31.12.2018 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 37 400,00 EUR | ||
MUU | TF1713 | MLI bioinformaatika arvutusbaasi loomine | 01.05.2013 | 28.02.2021 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool | 2 000,00 EUR | ||
1.1.8.1. | TF/6120 | Nanoplasti põlvkondadeülesed mõjud vesikirp Daphnia magna näitel | 01.01.2021 | 31.12.2023 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool | 3 000,00 EUR | ||
2.1.1. | TRU17053A | Paber- ja tekstiilrätikute analüüsid | 17.04.2017 | 31.07.2017 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 660,00 EUR | ||
1.1.8.1. | TF3720 (Otsustatud rahastada TLÜ uuringufondi nõukogu koosoleku otsusega nr 7.1-17/4 29.04.2020) | Parkinsoni tõve preventsiooni ja jälgimise teadusgrupi moodustamine ja uurimissuundade rakendamine | 01.06.2020 | 01.06.2023 | Toomas Toomsoo | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 40 000,00 EUR (kogurahastus 60 000,00 EUR) | ||
MUU | F/2213 (TLÜ senati teadukomisjoni istungi protokoll 18.11.2013) | Pilootprojekt kombineeritud teaduskompetentsi väljakujunemiseks neurodegeneratiivsete haiguste uurimiseks TLÜ's | 01.11.2013 | 31.12.2020 | Madis Metsis; Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut | 8 000,00 EUR | ||
MUU | TRU19207A | Probiootikumide elulemuse uuring | 01.12.2019 | 15.06.2020 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 0,00 EUR | ||
ETF | ETF7823 | Raku energiaühikute moodustumise dünaamika tüvirakkude differentseerumise protsessis lihasrakkudeks ja nende degradatsioon vananemise käigus | 01.01.2009 | 31.12.2012 | Valdur Saks | Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut | 88 352,54 EUR | ||
1.1.7. | TF5419 | Tallinna linna kogukonna- ja õppeaedade mullastiku kompleksanalüüs ja aiasaaduste kasvatamise ohutuse hindamine | 01.01.2020 | 31.12.2023 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 9 600,00 EUR | ||
1.1.8.1. | TF5916 (TLÜ uuringufondi nõukogu 25. novembri 2016. aasta koosoleku otsus nr 9/16) | Tallinna Ülikooli loodus- ja terviseteaduste instituudi molekulaarteaduste labori proovimaterjali eeltöötluse metoodika kaasajastamine ja arendamine | 21.11.2016 | 30.01.2017 | Margit Kaldmäe | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 8 000,00 EUR | ||
MUU | TF1515 (TLÜ senati teaduskomisjoni istungi protokoll 20.04.2015 nr 9) | TLÜ käitumis- ja neuroteaduste tippkeskus | 01.05.2015 | 31.12.2023 | Ruth Shimmo | Tallinna Ülikool, Matemaatika ja Loodusteaduste Instituut | 138 000,00 EUR | ||
MUU | VEU445 | Uue metagenoomse keskkonnamonitooringu meetodi arendus | 01.01.2010 | 30.06.2012 | Madis Metsis | Tallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Integreeritud süsteemide bioloogia keskus | 1 597 791,21 EUR | ||
2.1.1. | TKA19113 | Uuringute „Laktobatsillide proteoom“ ja „Uudsete probiootikumide kliiniline efektiivsus vaginiitide korral” teostamine | 13.06.2016 | 31.12.2017 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool | 0,00 EUR | ||
1.1.7. | TA/4119 | Varase algusega Parkinsoni tõve etiopatogeneesi molekulaarse komponendi uuring Eesti populatsioonis: eksoomianalüüs ja biomarkerite tuvastamine | 01.01.2020 | 31.12.2023 | Kairi Koort | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 10 000,00 EUR | ||
1.1.8.1. | TF3117 (TLÜ uuringufondi nõukogu 27.11.2017 otsus nr 7.1-17/7) | Vetikapolüsahhariide lagundavad bakterid Läänemerest: iseloomustamine ja ensüümide eraldamine | 07.12.2017 | 07.09.2018 | Rando Tuvikene | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 6 850,00 EUR | ||
COVSG | COVSG7 | Viirusevastase toimega sahhariidid: rakendused desovahendites, kosmeetikatoodetes ja farmatseutilistes formulatsioonides | 01.10.2020 | 31.12.2021 | Rando Tuvikene | Tallinna Ülikool, Loodus- ja terviseteaduste instituut | 200 000,00 EUR |