See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
merike.somera@taltech.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2019–...   
Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut, Vanemteadur (1,00)
01.02.2018–23.03.2018   
Liege Ülikool, AgroBioTech Gembloux (Belgia), Külalisteadur (1,00)
01.02.2017–31.12.2018   
Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut, Vanemteadur (0,75)
08.08.2016–10.02.2017   
Rootsi Põllumajandusteaduste Ülikool, Külalisteadur (1,00)
01.08.2016–31.01.2017   
Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut, Vanemteadur (0,25)
01.09.2012–31.07.2016   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool, Vanemteadur (1,00)
01.01.2011–31.08.2012   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool, Teadur (1,00)
2007–2010   
Tallinna Tehnikaülikool, Lapsepuhkus
01.04.2004–15.10.2006   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool, Teadur (0,50)
01.01.2001–31.03.2004   
Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut, Teadur (1,00)
01.09.1997–31.12.2000   
Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut, Assistent (1,00)
 
 
Haridustee
1999–2006   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-Loodusteaduskond, doktorantuur geenitehnoloogia erialal
1997–1999   
Tallinna Tehnikaülikool, Keemiateaduskond, magistrantuur geenitehnoloogia erialal
1993–1997   
Tartu Ülikool, Bioloogia-Geograafia teaduskond, biotehnoloogia ja biomeditsiini eriala
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2020−...   
Rahvusvaheline Viiruste Taksonoomia Komitee (ICTV), Solemoviridae uurimisrühma juht
2020−...   
COST CA19125 „Epigenetic mechanisms of crop adaption to climate change“ Eesti esindaja
2020−...   
Euroopa Taimeteaduste Organisatsioon (EPSO), tugiteadlane
2017−...   
Rahvusvaheline Viiruste Taksonoomia Komitee (ICTV), Solemoviridae uurimisrühma liige
2017−...   
anonüümne retsensent ajakirjas Plant Disease
2012−...   
anonüümne retsensent ajakirjas Archives of Virology
2016−2019   
COST FA1407 "Application of next generation sequencing for the study and diagnosis of plant viral diseases in agriculture" Eesti esindaja
 
 
Loometöö
2020–2021 Viroloogia loengud üliõpilastele, TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituut (Tartu, Tartu Ülikool).
2013 Taimeviroloogia lühikursus doktorantidele (TTÜ, TÜ, EMÜ), ENVIRON tippkeskuse suvekool (Järvselja).
2012–2013 Viroloogia loengud üliõpilastele, TTÜ Geenitehnoloogia Instituut (Tallinn).
2004–2006 Geenitehnoloogia praktikumid üliõpilastele, TTÜ Geenitehnoloogia Instituut (Tallinn).
 
 
Lisainfo
2007-2010 emapuhkus

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2018, Merike Sõmera, Lühiajalise teadusmissiooni stipendium bioinformaatika-alaseks teadustööks Belgias
2016, Merike Sõmera, Rootsi Instituudi Visby Programmi teadusstipendium
2009, Merike Sõmera, Aasta preemia, Põllumajandusteadused - Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Erkki Truve; Riigi teaduspreemia uurimuste tsükli „Taimeviiruste ja taimede kaitsemehhanismide uurimine” eest
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS KLASSIFIKAATOR: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.6. Põllumajandusteadus; CERCS KLASSIFIKAATOR: B390 Taimekasvatus, aiandus, taimekaitsevahendid, taimehaigused
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogia; CERCS KLASSIFIKAATOR: B250 Entomoloogia, taimede parasitoloogia
 
 
Lisainfo
02/2020-...: bioinformaatilised ringtestid (taimeviroloogiliste HTS-andmete analüüside valideerimine), rahvusvaheline koostöögrupp (COST FA1407 endised liikmed)
02/2018-03/2018: bioinformaatiline teadustöö Liege Ülikoolis Belgias
08/2016-02/2017: teadustöö Rootsi Põllumajandusteaduste Ülikoolis (töö taimeviiruste putukvektoritega - lehetäide ja tirtidega)
04/2015: "COST FA1407 First Training School on COST-Divas", Thessaloniki Ülikool, Kreeka
05/2012: "COST FA0806 Training School on Next Generation Sequencing", Uppsala Ülikool, Rootsi
05/2012: praktiline kursus "Assembling and analysis of sequenced siRNA", International Potato Center (CIP), Lima, Peruu
1999-2005: teadustöö Helsinki Ülikoolis ja Turu Ülikoolis, Soome, ca 6 kuud

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
2.4.
2022
1.1.
2021
6.1.
2021
1.1.
2020
1.1.
2020
3.5.
2020
6.3.
2020
6.7.
2020
1.1.
2019
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
1.1.
2013
1.1.
2012
2.3.
2010
3.4.
2009
5.2.
2009
3.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
5.2.
2006
1.1.
2004
5.2.
2004
5.2.
2004
5.2.
2003
5.2.
2001
5.2.
2000
13.05.2021
merike.somera@taltech.ee

Career

Institutions and positions
01.01.2019–...   
Tallinn University of Technology , School of Science, Department of Chemistry and Biotechnology, Senior Researcher (1,00)
01.02.2018–23.03.2018   
University of Liege, AgroBio Tech Gembloux (Belgium), Guest Researcher (1,00)
01.02.2017–31.12.2018   
Tallinn University of Technology , School of Science, Department of Chemistry and Biotechnology, Senior Researcher (0,75)
08.08.2016–10.02.2017   
Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Guest Researcher (1,00)
01.08.2016–31.01.2017   
Tallinn University of Technology , School of Science, Department of Chemistry and Biotechnology, Senior Researcher (0,25)
01.09.2012–31.07.2016   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Gene Technology, Senior Researcher (1,00)
01.01.2011–31.08.2012   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Gene Technology, Researcher (1,00)
2007–2010   
Tallinn University of Technology , Maternity leave
01.04.2004–15.10.2006   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Gene Technology, Researcher (0,50)
01.01.2001–31.03.2004   
National Institute of Chemical Physics and Biophysics, National Institute of Chemical Physics and Biophysics; Researcher (1,00)
01.09.1997–31.12.2000   
National Institute of Chemical Physics and Biophysics, National Institute of Chemical Physics and Biophysics; research assistant (1,00)
 
 
Education
1999–2006   
Tallinn Technical University, Faculty of Mathematics and Science, Ph.D studies
1997–1999   
Tallinn Technical University, Faculty of Chemistry, M.Sc studies (gene technology)
1993–1997   
Tartu University, Faculty of Biology and Geography, B.Sc studies (biotechnology and biomedicine)
 
 
R&D related managerial and administrative work
2020−...   
International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), chair of the Solemoviridae Study Group
2020−...   
COST CA19125 „Epigenetic mechanisms of crop adaption to climate change“ Estonian representative
2020−...   
European Plant Science Organisation (EPSO), supportive scientist
2017−...   
International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), member of the Solemoviridae Study Group
2017−...   
anonymous reviewer for the journal Plant Disease
2012−...   
anonymous reviewer for the journal Archives of Virology
2016−2019   
COST FA 1407 "Application of next generation sequencing for the study and diagnosis of plant viral diseases in agriculture"; Estonian representative
 
 
Creative work
2020-2021 Virology lectures for B.Sc students (Univ. of Tartu, Institute of Molecular and Cell Biology) (Tartu, Tartu Ülikool).
2013 Short plant virology course for PhD students (Tallinn Univ. of Technology, Univ. of Tartu, Estonian Univ. of Life Sciences), ENVIRON Summer School (Järvselja).
2012-2013 Virology lectures for B.Sc students at Tallinn Univ. of Technology, Institute of Gene Technology (Tallinn).
2004-2006 Practical courses in gene technology for B.Sc students at Tallinn Univ. of Technology, Institute of Gene Technology (Tallinn).
 
 
Additional information
2007-2010 maternity leave

Qualifications

 
 
Honours & awards
2018, Merike Sõmera, Short-term scientific mission grant for bioinformatic studies in Belgium
2016, Merike Sõmera, Swedish Institute Visby Programme, senior researcher scholarship
2009, Merike Sõmera, Yearly Award, Agricultural Sciences - Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Erkki Truve; National Science Award
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS CLASSIFICATION: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.6. Agricultural Sciences; CERCS CLASSIFICATION: B390 Phytotechny, horticulture, crop protection, phytopathology
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.4. Ecology, Biosystematics and -physiology; CERCS CLASSIFICATION: B250 Entomology, plant parasitology
 
 
Additional information
02/2020-...: bioinformatic proficiency tests (validation of plant virus HTS-data analysis), international working group, former members of COST FA1407
02/2018-03/2018: scientific mission at Liege University in Belgium (bioinformatics)
08/2016-02/2017: scientific mission at Swedish University of Agricultural Sciences (plant virus studies with aphid and planthopper vectors)
04/2015: "COST FA1407 First Training School on COST-Divas", Thessaloniki University, Greece
05/2012: "COST FA0806 Training School on Next Generation Sequencing", Uppsala University, Sweden
05/2012: training course "Assembling and analysis of sequenced siRNA", International Potato Center (CIP), Lima, Peru
1999-2005: research training at Helsinki University and Turku University, Finland, approx. 6 months

Projects in progress

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
2.4.
2022
1.1.
2021
6.1.
2021
1.1.
2020
1.1.
2020
3.5.
2020
6.3.
2020
6.7.
2020
1.1.
2019
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
5.2.
2015
5.2.
2015
1.1.
2013
1.1.
2012
2.3.
2010
3.4.
2009
5.2.
2009
3.1.
2008
5.2.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
5.2.
2006
1.1.
2004
5.2.
2004
5.2.
2004
5.2.
2003
5.2.
2001
5.2.
2000
13.05.2021

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
  • Leitud 14 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
MUUAR14006Eesti osalus ülemaailmses viirusuuringute võrgustikus (GVN)01.09.201331.08.2015Maria Cecilia Sarmiento GuerinTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool21 000,00 EUR
TKTAR11058Keskkonnamuutustele kohanemise tippkeskus01.01.201131.12.2015Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool2 729 927,00 EUR
TKF11100PKTF (TK107)Keskkonnamuutustele kohanemise tippkeskus01.01.201131.12.2015Ülo NiinemetsEesti Maaülikool; Eesti Maaülikool, Põllumajandus- ja keskkonnainstituut; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut3 054 552,95 EUR
ETFETF5909Keskkonnaohutute taimsete viirusvektorite konstrueerimine01.01.200431.12.2007Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond36 698,52 EUR
MUU439LMolekulaarsete ja koekultuurimeetodite rakendamine sordiaretuses ja taimse materjali analüüsis01.01.200431.12.2007Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool166 170,29 EUR
ETFETF5939Post-transkriptsiooniline geenivaigistamine ja selle suppressorid01.01.200431.12.2007Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond25 981,36 EUR
MUUAR11121Põllukultuuride resistentsusaretus01.06.201131.08.2015Kadri JärveTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Geenitehnoloogia õppetool675 097,88 EUR
EMPETAG21022Raiheina kohanemisvõime ja vastupidavuse parandamine ohutute ja säästvate toidusüsteemide jaoks CRISPR-Cas9 tehnoloogia abil01.05.202130.04.2024Maria Cecilia Sarmiento GuerinTallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut225 500,00 EUR
HLKHLK06-3Raku- ja koeproovide ning sortide, liinide ja tüvede kollektsiooni säilitamine ning täiendamine Tallinna Tehnikaülikoolis01.01.200631.12.2008Andres VeskeTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond32 980,66 EUR
ETFETF7363Sobemoviirused: paljunemine ning interaktsioonid peremehega01.01.200831.12.2011Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond86 296,05 EUR
ETFETF9415Sobemoviiruste fülogenees ja seire Eestis01.01.201231.12.2015Merike SõmeraTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond46 440,00 EUR
SFSF0140106s08Taim-patogeen molekulaarsed interaktsioonid01.01.200831.12.2013Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond874 591,68 EUR
IUTIUT19-3Taim-patogeen molekulaarsed interaktsioonid  01.01.201431.12.2019Maria Cecilia Sarmiento GuerinTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut; Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut954 000,00 EUR
SFSF0222604s03Taimede ja taimeviiruste geenide ekspressiooni ja funktsiooni uurimine01.01.200331.12.2007Erkki TruveTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond218 130,45 EUR