See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Ly Porosk

https://www.etis.ee/CV/Ly_Pärnaste/est
15.12.1988
737 4866
ly.parnaste@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.10.2017–...   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, peptiidikeemia teadur (1,00)
01.09.2016–31.12.2016   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, spetsialist (1,00)
01.09.2016–30.10.2017   
Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, spetsialist (1,00)
01.04.2015–31.08.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, spetsialist (0,80)
01.09.2013–31.03.2015   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, spetsialist (1,00)
01.01.2013–31.12.2015   
Tartu Ülikool, spetsialist, molekulaarse biotehnoloogia labor
01.01.2013–31.12.2014   
TBD-Biodiscovery, mikrobioloogia laborant (0.25)
01.01.2013–31.12.2013   
Henkel Balti OÜ, laborant (1.00)
01.01.2012–31.12.2012   
AEGEE-Tartu MTÜ, juhatuse liige (1.00)
01.09.2011–05.11.2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, spetsialist (0,50)
 
 
Haridustee
01.09.2018–...   
Tartu Ülikoo, loodus- ja täppisteaduste valdkond, Füüsika, keemia ja materjaliteadus
2013–17.06.2016   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, PhD Tehnika ja tehnoloogia, Biomeditsiini tehnoloogia
2011–2013   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, MSc Geenitehnoloogia
2008–2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, BSc Geenitehnoloogia
2005–2008   
Miina Härma Gümnaasium

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Ly Porosk, doktorikraad, 2016, (juh) Ülo Langel; Piret Arukuusk, How, why, what and where: Mechanisms behind CPP/cargo nanocomplexes (Rakku tungivate peptiidide sisenemismehhanismid, komplekse mõjutavad tegurid ja liikumine rakus), Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut.
Ly Porosk, magistrikraad, 2013, (juh) Ülo Langel; Piret Arukuusk, Rakku sisenevad peptiidid NickFect1 ja NickFect 51 plasmiidse DNA transporteritena, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2013, Ly Porosk, Üliõpilaste teadustööde riiklik konkurss, Diplom konkursitöö „Rakku sisenevad peptiidid NickFect1 ja NickFect51 plasmiidse DNA transporteritena” eest
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS KLASSIFIKAATOR: T490 Biotehnoloogia ; TÄPSUSTUS: Rakku sisenevad peptiidid

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
3.1.
2022
Porosk, Ly; Nebogatova, Jekaterina; Gaidutšik, Ilja; Langel, Ülo (2022). Endpoint and Kinetic Approaches for Assessing Transfection Efficacy in Mammalian Cell Culture. In: Cell Penetrating Peptides (529−545). Humana, New York, NY. (Methods in Molecular Biology; 2383). DOI: 10.1007/978-1-0716-1752-6_33.
1.1.
2021
Darnell, Astrid; Leito, Ivo; Sikk, Lauri; Porosk, Ly (2021). Uncertainty of small enthalpy effects measured by isothermal calorimetric titration. Journal of Chemical Metrology, 1, 25−37. DOI: 10.25135/jcm.57.21.03.1994.
1.1.
2021
Porosk, Ly; Põhako, Kaisa, Arukuusk, Piret; Langel, Ülo (2021). Cell-penetrating peptides predicted from CASC3, AKIP1 and AHRR proteins. Frontiers in Pharmacology. DOI: 10.3389/fphar.2021.716226 [ilmumas].
1.1.
2021
de Mello, Lucas R.; Porosk, Ly; Lourenço, Thiago C.; Garcia, Bianca B. M.; Costa, Carlos A. R.; Han, Sang W.; de Souza, Juliana S.; Langel, Ülo; da Silva, Emerson R. (2021). Amyloid-like Self-Assembly of a Hydrophobic Cell-Penetrating Peptide and Its Use as a Carrier for Nucleic Acids. ACS Applied Bio Materials. DOI: 10.1021/acsabm.1c00601 [ilmumas].
1.1.
2021
Kiisholts, Kristina; Kurrikoff, Kaido; Arukuusk, Piret; Porosk, Ly; Peters, Maire; Salumets, Andres; Langel, Ülo (2021). Cell-Penetrating Peptide and siRNA-Mediated Therapeutic Effects on Endometriosis and Cancer In Vitro Models. Pharmaceutics. DOI: 10.3390/pharmaceutics13101618 [ilmumas].
1.1.
2020
Porosk, Ly; Gaidutšik, Ilja; Langel, Ülo (2020). Approaches for the discovery of new cell-penetrating peptides. Expert Opinion on Drug Discovery, 1−13. DOI: 10.1080/17460441.2021.1851187.
1.1.
2019
Porosk, Ly; Arukuusk, Piret; Põhako, Kaisa; Kurrikoff, Kaido; Kiisholts, Kristina; Padari, Kärt; Pooga, Margus; Langel, Ülo (2019). Enhancement of siRNA transfection by the optimization of fatty acid length and histidine content in the CPP. Biomaterials Science. DOI: 10.1039/C9BM00688E.
1.2.
2019
Künnapuu, Kadri; Veiman, Kadi-Liis; Porosk, Ly; Rammul, Evelin; Kiisholts, Kristina; Langel, Ülo; Kurrikoff, Kaido (2019). Tumor gene therapy by systemic delivery of plasmid DNA with cell‐penetrating peptides. FASEB BioAdvances, 1 (2), 105−114. DOI: 10.1096/fba.1026.
3.1.
2019
Padari, K., Porosk, L., Arukuusk, P., Pooga, M. (2019). Characterization of Peptide/oligonucleotide Complexes Using Electron Microscopy, Dynamic Light Scattering and Protease Resistance Assay. In: Olof Gissberg, Rula Zain, and Karin E. Lundin (Ed.). Methods Mol Biol (127−139). Humana Press.
1.1.
2018
Freimann, Krista; Arukuusk, Piret; Kurrikoff, Kaido; Pärnaste, Ly; Raid, Raivo; Piirsoo, Andres; Pooga, Margus; Lange, Ülo (2018). Formulation of stable and homogenous cell penetrating peptide NF55 nanoparticles for efficient gene delivery in vivo. Molecular Therapy — Nucleic Acids, 10, 28−35. DOI: 10.1016/j.omtn.2017.10.011.
1.1.
2017
Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Langel, Kent; Tenson, Tanel; Langel, Ülo (2017). The formation of nanoparticles between small interfering RNA and amphipathic cell-penetrating peptides. Molecular Therapy — Nucleic Acids, 7, 1−10. DOI: 10.1016/j.omtn.2017.02.003.
1.1.
2017
Kurrikoff, Kaido; Veiman, Kadi-Liis; Künnapuu, Kadri; Peets, Elin Madli; Lehto, Tõnis; Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Langel, Ülo (2017). Effective in vivo gene delivery with reduced toxicity, achieved by charge and fatty acid -modified cell penetrating peptide. Scientific Reports, 7 (1), 17056−17056. DOI: 10.1038/s41598-017-17316-y.
1.1.
2016
Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Zagato, Elisa; Braeckmans, Kevin; Langel, Ülo (2016). Methods to follow intracellular trafficking of cell-penetrating peptides. Journal of Drug Targeting, 24 (6), 508−519.10.3109/1061186X.2015.1095194.
1.1.
2015
Arukuusk, P.; Pärnaste, L.; Hällbrink, M.; Langel, Ü. (2015). Pepfects and nickfects for the intracellular delivery of nucleic acids (Methods in Molecular Biology). Methods in Molecular Biology, 1324, 303−315. DOI: 10.1007/978-1-4939-2806-4_19.
1.1.
2014
Vasconcelos, Luis; Madani, Fatemeh; Arukuusk, Piret; Pärnaste, Ly; Gräslund, Astrid, Langel, Ülo (2014). Effects of cargo molecules on membrane perturbation caused by transportan10 based cell-penetrating peptides. Biochimica et Biophysica Acta, 1838 (12), 3118−3129. DOI: 10.1016/j.bbamem.2014.08.011.
1.1.
2013
Arukuusk, P; Pärnaste, L.; Margus, H.; Eriksson, J.; Vasconcelos, L.;.Padari, K.; Pooga, M.; Langel, Ü. (2013). Differential endosomal pathways for radically modified peptide vectors. Bioconjugate Chemistry, 24 (10), 1721−1732. DOI: 10.1021/bc4002757.
1.1.
2013
Arukuusk, P.; Pärnaste, L.; Oskolkov, N.; Copolovici, D. M.; Margus, H.; Padari, K.; Möll, K.; Maslovskaja, J.; Tegova, R.; Kivi, G.; Tover, A.; Pooga, M.; Ustav, M.; Langel, Ü. (2013). New generation of efficient peptide-based vectors, NickFects, for the delivery of nucleic acids. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1828 (5), 1365−1373. DOI: 10.1016/j.bbamem.2013.01.011.

Tööstusomand

15.11.2021

Ly Porosk

https://www.etis.ee/CV/Ly_Pärnaste/eng
15.12.1988
737 4866
ly.parnaste@ut.ee

Career

Institutions and positions
01.10.2017–...   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Research Fellow in Peptide Chemistry (1,00)
01.09.2016–31.12.2016   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Specialist (1,00)
01.09.2016–30.10.2017   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, specialist (1,00)
01.04.2015–31.08.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Specialist (0,80)
01.09.2013–31.03.2015   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Specialist (1,00)
01.01.2013–31.12.2015   
Other staff
01.01.2013–31.12.2014   
Other staff
01.01.2013–31.12.2013   
Other staff
01.01.2012–31.12.2012   
Other staff
01.09.2011–05.11.2011   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Specialist (0,50)
 
 
Education
01.09.2018–...   
Tartu Ülikoo, loodus- ja täppisteaduste valdkond, Füüsika, keemia ja materjaliteadus
2013–17.06.2016   
University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, PhD Engineering and Technology
2011–2013   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, MSc Geenitehnoloogia
2008–2011   
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, BSc Geenitehnoloogia
2005–2008   
Miina Härma Gümnaasium

Qualifications

Academic degrees
Ly Porosk, Doctor's Degree, 2016, (sup) Ülo Langel; Piret Arukuusk, How, why, what and where: Mechanisms behind CPP/cargo nanocomplexes, University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu.
Ly Porosk, Master's Degree, 2013, (sup) Ülo Langel; Piret Arukuusk, Rakku sisenevad peptiidid NickFect1 ja NickFect 51 plasmiidse DNA transporteritena (Cell-penetrating peptides, NickFect1 and NickFect51 as plasmid DNA transporters), University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu.
 
 
Honours & awards
2013, Ly Porosk, The national student research competition, diplom
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS CLASSIFICATION: T490 Biotechnology ; SPECIFICATION: Cell-penetrating peptides
 
 

Projects in progress

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
3.1.
2022
Porosk, Ly; Nebogatova, Jekaterina; Gaidutšik, Ilja; Langel, Ülo (2022). Endpoint and Kinetic Approaches for Assessing Transfection Efficacy in Mammalian Cell Culture. In: Cell Penetrating Peptides (529−545). Humana, New York, NY. (Methods in Molecular Biology; 2383). DOI: 10.1007/978-1-0716-1752-6_33.
1.1.
2021
Darnell, Astrid; Leito, Ivo; Sikk, Lauri; Porosk, Ly (2021). Uncertainty of small enthalpy effects measured by isothermal calorimetric titration. Journal of Chemical Metrology, 1, 25−37. DOI: 10.25135/jcm.57.21.03.1994.
1.1.
2021
Porosk, Ly; Põhako, Kaisa, Arukuusk, Piret; Langel, Ülo (2021). Cell-penetrating peptides predicted from CASC3, AKIP1 and AHRR proteins. Frontiers in Pharmacology. DOI: 10.3389/fphar.2021.716226 [forthcoming].
1.1.
2021
de Mello, Lucas R.; Porosk, Ly; Lourenço, Thiago C.; Garcia, Bianca B. M.; Costa, Carlos A. R.; Han, Sang W.; de Souza, Juliana S.; Langel, Ülo; da Silva, Emerson R. (2021). Amyloid-like Self-Assembly of a Hydrophobic Cell-Penetrating Peptide and Its Use as a Carrier for Nucleic Acids. ACS Applied Bio Materials. DOI: 10.1021/acsabm.1c00601 [forthcoming].
1.1.
2021
Kiisholts, Kristina; Kurrikoff, Kaido; Arukuusk, Piret; Porosk, Ly; Peters, Maire; Salumets, Andres; Langel, Ülo (2021). Cell-Penetrating Peptide and siRNA-Mediated Therapeutic Effects on Endometriosis and Cancer In Vitro Models. Pharmaceutics. DOI: 10.3390/pharmaceutics13101618 [forthcoming].
1.1.
2020
Porosk, Ly; Gaidutšik, Ilja; Langel, Ülo (2020). Approaches for the discovery of new cell-penetrating peptides. Expert Opinion on Drug Discovery, 1−13. DOI: 10.1080/17460441.2021.1851187.
1.1.
2019
Porosk, Ly; Arukuusk, Piret; Põhako, Kaisa; Kurrikoff, Kaido; Kiisholts, Kristina; Padari, Kärt; Pooga, Margus; Langel, Ülo (2019). Enhancement of siRNA transfection by the optimization of fatty acid length and histidine content in the CPP. Biomaterials Science. DOI: 10.1039/C9BM00688E.
1.2.
2019
Künnapuu, Kadri; Veiman, Kadi-Liis; Porosk, Ly; Rammul, Evelin; Kiisholts, Kristina; Langel, Ülo; Kurrikoff, Kaido (2019). Tumor gene therapy by systemic delivery of plasmid DNA with cell‐penetrating peptides. FASEB BioAdvances, 1 (2), 105−114. DOI: 10.1096/fba.1026.
3.1.
2019
Padari, K., Porosk, L., Arukuusk, P., Pooga, M. (2019). Characterization of Peptide/oligonucleotide Complexes Using Electron Microscopy, Dynamic Light Scattering and Protease Resistance Assay. In: Olof Gissberg, Rula Zain, and Karin E. Lundin (Ed.). Methods Mol Biol (127−139). Humana Press.
1.1.
2018
Freimann, Krista; Arukuusk, Piret; Kurrikoff, Kaido; Pärnaste, Ly; Raid, Raivo; Piirsoo, Andres; Pooga, Margus; Lange, Ülo (2018). Formulation of stable and homogenous cell penetrating peptide NF55 nanoparticles for efficient gene delivery in vivo. Molecular Therapy — Nucleic Acids, 10, 28−35. DOI: 10.1016/j.omtn.2017.10.011.
1.1.
2017
Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Langel, Kent; Tenson, Tanel; Langel, Ülo (2017). The formation of nanoparticles between small interfering RNA and amphipathic cell-penetrating peptides. Molecular Therapy — Nucleic Acids, 7, 1−10. DOI: 10.1016/j.omtn.2017.02.003.
1.1.
2017
Kurrikoff, Kaido; Veiman, Kadi-Liis; Künnapuu, Kadri; Peets, Elin Madli; Lehto, Tõnis; Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Langel, Ülo (2017). Effective in vivo gene delivery with reduced toxicity, achieved by charge and fatty acid -modified cell penetrating peptide. Scientific Reports, 7 (1), 17056−17056. DOI: 10.1038/s41598-017-17316-y.
1.1.
2016
Pärnaste, Ly; Arukuusk, Piret; Zagato, Elisa; Braeckmans, Kevin; Langel, Ülo (2016). Methods to follow intracellular trafficking of cell-penetrating peptides. Journal of Drug Targeting, 24 (6), 508−519.10.3109/1061186X.2015.1095194.
1.1.
2015
Arukuusk, P.; Pärnaste, L.; Hällbrink, M.; Langel, Ü. (2015). Pepfects and nickfects for the intracellular delivery of nucleic acids (Methods in Molecular Biology). Methods in Molecular Biology, 1324, 303−315. DOI: 10.1007/978-1-4939-2806-4_19.
1.1.
2014
Vasconcelos, Luis; Madani, Fatemeh; Arukuusk, Piret; Pärnaste, Ly; Gräslund, Astrid, Langel, Ülo (2014). Effects of cargo molecules on membrane perturbation caused by transportan10 based cell-penetrating peptides. Biochimica et Biophysica Acta, 1838 (12), 3118−3129. DOI: 10.1016/j.bbamem.2014.08.011.
1.1.
2013
Arukuusk, P; Pärnaste, L.; Margus, H.; Eriksson, J.; Vasconcelos, L.;.Padari, K.; Pooga, M.; Langel, Ü. (2013). Differential endosomal pathways for radically modified peptide vectors. Bioconjugate Chemistry, 24 (10), 1721−1732. DOI: 10.1021/bc4002757.
1.1.
2013
Arukuusk, P.; Pärnaste, L.; Oskolkov, N.; Copolovici, D. M.; Margus, H.; Padari, K.; Möll, K.; Maslovskaja, J.; Tegova, R.; Kivi, G.; Tover, A.; Pooga, M.; Ustav, M.; Langel, Ü. (2013). New generation of efficient peptide-based vectors, NickFects, for the delivery of nucleic acids. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1828 (5), 1365−1373. DOI: 10.1016/j.bbamem.2013.01.011.

Industrial property

15.11.2021

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
Uus otsing (Beetaversioon) Lihtotsing Tühjenda
  • Leitud 4 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
TKSLTTI16143T (TK143)Molekulaarse Rakutehnoloogia Tippkeskus (TK143)01.01.201601.03.2023Tanel TensonTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut3 917 568,00 EUR
2.1.1.LLTTI19567 Rakku penetreeruvate peptiidide kasutamine transfektsioonireagendina01.10.201930.09.2020Kaido KurrikoffTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut160 033,90 EUR
IUTIUT20-26Trans-barrier targeting01.01.201431.12.2019Ülo LangelTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut889 200,00 EUR
2.1.1.LLTTI21506Uudsed meetodid ekstratsellulaarsete vesiikulite spetsiifiliseks modifitseerimiseks01.09.202131.05.2022Kaido KurrikoffTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut53 000,00 EUR