See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem

Olen nõus

Mart Loog

https://www.etis.ee/CV/Mart_Loog/est

Sünniaeg

22.05.1969

Telefon

517 5698 (4848)

E-post

Palun lisage siia ainult üks aadress. Sellele meiliaadressile saadetakse ETISe teated (nt rahastusotsused, andmete kinnitamisega seotud info).

mart.loog@ut.ee

Kodulehekülg

http://www.looglab.com

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid

01.02.2019–...

Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, molekulaarse süsteemibioloogia professor (1,00)

2002-2005 Post-doctoral training, California Ylikool, San Francisco

01.01.2016–31.01.2019

Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut, molekulaarse süsteemibioloogia professor (1,00)

01.02.2014–31.12.2015

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarse süsteemibioloogia professor (1,00)

01.01.2014–31.01.2014

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia vanemteadur (1,00)

01.05.2013–31.12.2013

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia vanemteadur (1,00)

01.01.2011–30.04.2013

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia vanemteadur (1,00)

01.01.2008–31.12.2010

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia vanemteadur (1,00)

01.01.2006–31.12.2007

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, molekulaarbioloogia vanemteadur (1,00)

01.11.2005–31.12.2005

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, erakorraline vanemteadur (1,00)

01.01.2005–31.10.2005

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, erakorraline vanemteadur (0,20)

2005–2005

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, erakorraline vanemteadur (1,00)

2004–2004

Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond, Keemilise füüsika instituut, Analüütilise keemia õppetool, erakorraline vanemteadur (1,00)

Haridustee

1993 Bakalaureus, Bio-orgaaniline keemia, Tartu Ylikool, Keemia osakond

1995 Magister, Bio-orgaaniline keemia, Tartu Ylikool, Keemia osakond

1996–2002

2002 Ph.D, Meditsiiniline biokeemia, Uppsala Ylikool

Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus

2007−...

Eesti Proteoomika Selts, president

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid

Mart Loog, doktorikraad, 2002, (juh) Pia Ek; Jaak Järv, Studies on the Differential Specificity of Protein Kinases and its Applications, Uppsala Ülikool.

Mart Loog, magistrikraad (teaduskraad), 1995, (juh) Jaak Järv, Proteiini kinaas A spetsiifilisusest reaktsioonis peptiidsubstraatide ja valkudega, Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond.

Teaduspreemiad ja tunnustused

2012, Mart Loog, Riiklik teaduspreemia keemia ja molekulaarbioloogia alal

2012, Mart Loog, Uurimuste tsükli “Rakkude pooldumist reguleerivad fosforüleerimislülitid” eest

Teadustöö põhisuunad

ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.1. Biokeemia; CERCS KLASSIFIKAATOR: P310 Proteiinid, ensümoloogia; TÄPSUSTUS: Proteiini kinaasid rakutsükli regulaatoritena.

Lisainfo

Ph.D
Uppsala Ylikool, 2002

Jooksvad projektid

Lõppenud projektid

Juhendamisel väitekirjad

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass

Aasta

Publikatsioon

1.1.

2020

Valk, Ervin; Maljavin, Artemi; Loog, Mart (2020). Detection of Multisite Phosphorylation of Intrinsically Disordered Proteins using Quantitative Mass-Spectrometry. Methods in molecular biology [ilmumas].

1.1.

2020

Örd, Mihkel; Loog, Mart (2020). Detection of Multisite Phosphorylation of Intrinsically Disordered Proteins using Phos-tag SDS-PAGE. Methods in molecular biology [ilmumas].

1.1.

2020

Venta, Rainis; Valk, Ervin; Örd, Mihkel; Košik, Oleg; Pääbo, Kaur; Maljavin, Artemi; Kivi, Rait; Faustova, Ilona; Shtaida, Nastassia; Lepiku, Martin; Möll, Kaidi; Doncic, Andreas; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart (2020). A processive phosphorylation circuit with multiple kinase inputs and mutually diversional routes controls G1/S decision. Nature Communications, 11 (1), 1836−1836.10.1038/s41467-020-15685-z.

1.1.

2020

Örd, Mihkel; Puss, Kait Kaarel; Kivi, Rait; Möll, Kaidi; Ojala, Tuuliki; Borovko, Irina; Faustova, Ilona; Venta, Rainis; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart (2020). Proline-Rich Motifs Control G2-CDK Target Phosphorylation and Priming an Anchoring Protein for Polo Kinase Localization. Cell Reports, 31 (11), 107757−107757.10.1016/j.celrep.2020.107757.

1.1.

2019

Örd, Mihkel; Loog, Mart (2019). How the cell cycle clock ticks. Molecular Biology of the Cell, 30 (2), 169−172.10.1091/mbc.E18-05-0272.

1.1.

2019

Alina Goldstein Darya Goldman, Ervin Valk, Mart Loog, Liam J. Holt, and Larisa Gheber (2019). Synthetic-evolution reveals narrow paths to regulation of the Saccharomyces cerevisiae mitotic kinesin-5 Cin8. International Journal of Biological Sciences, 15 (6), 1125−1138.10.7150/ijbs.30543.

1.1.

2019

Örd, Mihkel; Venta, Rainis; Möll, Kaidi; Valk, Ervin; Loog, Mart (2019). Cyclin-Specific Docking Mechanisms Reveal the Complexity of M-CDK Function in the Cell Cycle. Molecular Cell, 75, 76−89.10.1016/j.molcel.2019.04.026.

1.1.

2019

Örd, M.; Möll, K.; Agerova, A.; Kivi, R.; Faustova, I.; Venta, R.; Valk, E.; Loog, M. (2019). Multisite phosphorylation code of CDK. Nature Structural & Molecular Biology, 26, 649−658.10.1038/s41594-019-0256-4.

1.1.

2017

Goldstein, Alina; Siegler, Nurit; Goldman, Darya; Judah, Haim; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart; Gheber, Larisa (2017). Three Cdk1 sites in the kinesin-5 Cin8 catalytic domain coordinate motor localization and activity during anaphase. Cellular and Molecular Life Sciences, 74 (18), 3395−3412.10.1007/s00018-017-2523-z.

1.1.

2017

Linke C, Chasapi A, González-Novo, A Sawad I, Tognetti S, Klipp E, Loog M, Krobitsch S, Posas F, Xenarios I, Barberis M. (2017). A Clb/Cdk1-mediated regulation of Fkh2 synchronizes CLB expression in the budding yeast cell cycle. NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS, 3.10.1038/s41540-017-0008-1.

1.1.

2016

Hõrak, Hanna; Sierla, Maija; Tõldsepp, Kadri; Wang, Cun; Wang, Yuh-Shuh; Nuhkat, Maris; Valk, Ervin; Pechter, Priit; Merilo, Ebe; Salojärvi, Jarkko; Overmyer, Kirk; Loog, Mart; Brosché, Mikael; Schroeder, Julian I.; Kangasjärvi, Jaakko; Kollist, Hannes (2016). A Dominant Mutation in the HT1 Kinase Uncovers Roles of MAP Kinases and GHR1 in CO2-induced Stomatal Closure. Plant Cell, 28 (10), 2493−2509.

1.1.

2016

Jakobson, Liina1; Vaahtera, Lauri; Tõldsepp, Kadri; Nuhkat, Maris; Wang, Cun; Wang, Yuh-Shuh; Hõrak, Hanna; Valk, Ervin; Pechter, Priit; Sindarovska, Yana; Tang, Jing; Xiao, Chuanlei; Xu, Yang; Gerst Talas, Ulvi; Garcia-Sosa, Alfonso T.; Kangasjärvi, Saijaliisa; Maran, Uko; Remm, Maido; Roelfsema, M. Rob G.; Hu, Honghong ... Brosche, Mikael (2016). Natural Variation in Arabidopsis Cvi-0 Accession Reveals an Important Role of MPK12 in Guard Cell CO2 Signaling. Plos Biology, 1/25−25/25.10.1371/journal.pbio.2000322.

1.1.

2015

Doncic, A.; Atay, O.; Valk, E.; Grande, A.; Bush, A.; Vasen, G.; Colman-Lerner, A.; Loog, M.; Skotheim, JM. (2015). Compartmentalization of a bistable switch enables memory to cross a feedback-driven transition. Cell, 160 (6), 1182−1195.10.1016/j.cell.2015.02.032.

1.1.

2015

Bhaduri, S.; Valk, E.; Winters, MJ.; Gruessner, B.; Loog, M.; Pryciak, PM. (2015). A Docking Interface in the Cyclin Cln2 Promotes Multi-site Phosphorylation of Substrates and Timely Cell-Cycle Entry. Current Biology, 25 (3), 316−325.10.1016/j.cub.2014.11.069.

6.3.

2015

Venta, R.; Valk, E.; Loog, M (2015). Sünteetiline bioloogia juhib inimkonna järgmisesse arenguetappi. Horisont, 4, 18−25.

1.1.

2014

Valk, Ervin; Venta, Rainis; Ord, Mihkel; Faustova, Ilona, Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart. (2014). Multistep phosphorylation systems: tunable components of biological signaling circuits. Molecular Biology of the Cell, 25 (22), 3456−3460.10.1091/mbc.E14-02-0774.

1.1.

2014

Piirsoo, Alla; Kasak, Lagle; Kauts, Mari-Liis; Uusen, Piia; Tints, Kairit; Loog, Mart; Neuman, Toomas; Piirsoo, Marko (2014). Protein kinase inhibitor SU6668 attenuates positive regulation of Gli proteins in cancer and multipotent progenitor cells. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research, 1843 (4), 703−714.10.1016/j.bbamcr.2014.01.003.

1.1.

2013

Kivi, R.; Loog, M.; Jemth, P.; Järv, J. (2013). Kinetics of Acrylodan-Labelled cAMP-Dependent Protein Kinase Catalytic Subunit Denaturation. The Protein Journal, 32 (7), 519−525.10.1007/s10930-013-9511-4.

1.1.

2013

Kõivomägi, Mardo; Örd, Mihkel; Iofik, Anna; Valk, Ervin; Venta, Rainis; Faustova, Ilona; Kivi, Rait; Balog, Eva Rose M; Rubin, Seth M; Loog, Mart (2013). Multisite phosphorylation networks as signal processors for Cdk1. Nature Structural & Molecular Biology, 1415−1424.10.1038/nsmb.2706.

1.1.

2013

McGrath, Denise; Balog, Eva Rose M.; Kõivomägi, Mardo; Lucena, Rafael ; Mai, Michelle V.; Hirschi, Alexander; Kellogg, Douglas R.; Loog, Mart; Rubin, Seth M. (2013). Cks Confers Specificity to Phosphorylation-Dependent Cdk Signaling Pathways. Nature Structural & Molecular Biology, 20 (12), 1407−1414.10.1038/nsmb.2707.

1.1.

2013

Valk, Ervin; Loog, Mart (2013). Multiple Pho85-dependent mechanisms control G1 cyclin abundance in response to nutrient stress. Molecular and Cellular Biology, 33 (7), 1270−1272.10.1128/MCB.00086-13.

1.1.

2012

Faustova, Ilona; Loog, Mart; Järv, Jaak (2012). Probing L-pyruvate kinase regulatory phosphorylation site by mutagenesis. The Protein Journal, 31 (7), 592−597.10.1007/s10930-012-9438-1.

1.1.

2012

Venta, Rainis; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardi; Loog, Mart (2012). Double-negative feedback between S-phase cyclin-CDK and CKI generates abruptness in the G1/S switch. Frontiers in Systems Biology, 3 (459), 1−15.10.3389/fphys.2012.00459.Epub2012Dec6.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Valk, E.; Venta, R.; Iofik, A.; Lepiku, M.; Balog, E.R.M.; Rubin, S.M.; Morgan, D.O.; Loog, M. (2011). Cascades of multisite phosphorylation control Sic1 destruction at the onset of S phase. Nature, 480 (7375), 128−131.10.1038/nature10560.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Loog, M. (2011). Cdk1: a kinase with changing substrate specificity. Cell Cycle, 10 (21), 3625−3626.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Valk, E.; Venta, R.; Iofik, A.; Lepiku, M.; Morgan, D.; Loog, M. (2011). Dynamics of Cdk1 Substrate Specificity during the Cell Cycle. Molecular Cell, 610−623.

1.1.

2011

Avunie-Masala, R.; Movshovich, N.; Nissenkorn, Y.; Gerson-Gurwitz, A.; Fridman, V.; Kõivomägi, M.; Loog, M.; Hoyt, A.; Zaritsky, A.; Gheber, L. (2011). Phospho-regulation of Kinesin-5 function during anaphase spindle elongation. Journal of Cell Science, 124 (6), 873−878.

5.1.

2011

Faustova, I.; Kuznetsov, A.; Loog, M.; Järv, J. (2011). Probing L-type pyruvate kinase phophorylation site by mutagenesis. FEBS Journal, 278: 36th FEBS Congress, Biochemistry for Tomorrow's Medicine, Torino, Italy, 25 - 30 June, 2011. Wiley-Blackwell, 383−383.

1.1.

2010

Vahisalu, T.; Puzõrjova, I.; Brosché, M.; Valk, E.;Lepiku, M.; Moldau, H.; Pechter, P.; Wang, Y-S.; Lindgren, O.; Salojärvi, J.; Loog, M.; Kangasjärvi, J.; Kollist, H. (2010). Ozone-triggered rapid stomatal response involves production of reactive oxygen species and is controlled by SLAC1 and OST1. The Plant Journal, 62 (3), 442−453.10.1111/j.1365-313X.2010.04159.x.

1.1.

2010

Faustova, Ilona; Kuznetsov, Aleksei; Juronen, Erkki; Loog, Mart; Järv, Jaak (2010). Phosphorylation is switch of L-type pyruvate kinase allostery. Central European Journal of Biology, 5, 135−142.10.2478/s11535-010-0004-6.

5.1.

2010

Faustova, I.; Kuznetsov, A.; Loog, M; Järv, J. (2010). Phosphorylation is switch of L-PK cooperativity. FEBS Journal, 277: 35th FEBS Congress; Gothenburg, Sweden; 26 June - 1 July 2010. Blackwell Publishing Ltd, 186. (Supplement 1).

5.1.

2008

Iofik, A.; Koivomagi, M.; Valk, E.; Loog, M. (2008). Cks1-mediated multisite phosphorylation by Cdk1. FEBS Journal, 275 . 220.

1.1.

2005

Loog, M.; Morgan, D.O. (2005). Cyclin specificity in the phosphorylation of cyclin-dependent kinase substrates. Nature, 434 (7029), 104−108.

1.1.

2005

Loog, M.; Oskolkov, N.; O'Farrell, F.; Ek, P.; Jarv, J. (2005). Comparison of cAMP-dependent protein kinase substrate specificity in reaction with proteins and synthetic peptides. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1747 (2), 261−266.

1.1.

2005

Loog, M.; Ek, B.; Oskolkov, N.; Narvanen, A.; Jarv, J.; Ek, P. (2005). Screening for the optimal specificity profile of protein kinase C using electrospray mass-spectrometry. Journal of Biomolecular Screening, 10 (4), 320−328.

1.1.

2000

Loog, M.; Toomik, R.; Sak, K.; Muszynska, G.; Ek, P.; Järv, J. (2000). Peptide phosphorylation by Ca++-dependent protein kinase from maize seedlings. European Journal of Biochemistry, 267 (2), 337−343.

1.1.

2000

Loog, M.; Uri, A.; Jarv, J.; Ek, P. (2000). Bi-substrate analogue ligands for affinity chromatography of protein kinases. FEBS Letters, 480, 244−248.

1.1.

2000

Szczegielniak, J.; Liwosz, A.; Jurkowski, I.; Loog, M.; Dobrowolska, GY.; Ek, P.; Harmon, AC.; Muszynska, G. (2000). Calcium-dependent protein kinase from maize seedlings activated by phospholipids. European Journal of Biochemistry, 267 (12), 3818−3827.

1.1.

1999

OFarrell, F.; Loog, M.; Janson, I.; Ek, P. (1999). Kinetic study of the inhibition of CK2 by heparin fragments of different length. Biochimica et Biophysica Acta, 1433, 68−75.

1.1.

1999

Loog, M.; Sak, K.; Ek, P.; Jarv, J. (1999). Differential specificity of protein kinases A and C in reaction with synthetic peptides. Bioorganic Chemistry, 27 (3), 189−196.

1.1.

1999

Loog, M.; Uri, A.; Raidaru, G.; Jarv, J.; Ek, P. (1999). Adenosine-5 '-carboxylic acid peptidyl derivatives as inhibitors of protein kinases. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 9 (10), 1447−1452.

5.1.

1998

Loog, M.; Uri, A.; Ek, P.; Järv, J. (1998). Adenosine-peptide Conjugates as a Novel Class of Protein Kinase Inhibitors. Cellular and Molecular Biology Letters, 3, 317.

1.1.

1997

Vincent, B.; Jiracek, J.; Noble, F.; Loog, M.; Roques, B.; Dive, V.; Vincent, J.-P.; Checler, F. (1997). Effect of a novel selective and potent phosphinic peptide inhibitor of endopeptidase 3.4.24.16 on neurotensin-induced analgesia and neuronal inactivation. British Journal of Pharmacology, 121 (4), 705−710.

1.1.

1997

Vincent, B.; Jiracek, J.; Noble, F.; Loog, M.; Roques, B.; Dive, V.; Vincent, J.-P.; Checler, F. (1997). Contribution of endopeptidase 3.4.24.15 to central neurotensin inactivation. European Journal of Pharmacology, 334 (1), 49−53.

1.2.

1997

Loog, M.; Järv, J.; Ek, P.; Engström, L. (1997). Influence of enzyme inactivation on the kinetics of peptide phosphorylation by protein kinase C. Proceedings of the Estonian Academy of Sciences. Chemistry, 46 (3), 102−111.

1.1.

1994

Loog, M.; Eller, M.; Ekman, P.; Engstrom, L.; Eriksson, S.; Jarv, J.; Ragnarsson, U.; Toomik, R. (1994). Comparison of substrate specificities of protein kinase-a and kinase-c based on peptide-substrates. Bioorganic Chemistry, 22 (3), 328−336.

Tööstusomand

Patentne leiutis: Afiinsuskromatograafia meetod proteiinkinaaside puhastamiseks; Omanikud: Tartu Ülikool; Autorid: Asko Uri, Mart Loog, Jaak Järv, Pia Ek; Prioriteedi number: SE19990001807; Prioriteedi kuupäev: 17.05.1999.

Viimati uuendatud

27.07.2020

Mart Loog

https://www.etis.ee/CV/Mart_Loog/eng

Date of birth

22.05.1969

Phone

517 5698 (4848)

E-mail

Palun lisage siia ainult üks aadress. Sellele meiliaadressile saadetakse ETISe teated (nt rahastusotsused, andmete kinnitamisega seotud info).

mart.loog@ut.ee

Homepage

http://www.looglab.com

Career

Institutions and positions

01.02.2019–...

University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Professor of Molecular Systems Biology (1,00)

2002-2005 Post-doctoral training, University of California, San Francisco

01.01.2016–31.01.2019

University of Tartu, Faculty of Science and Technology, Institute of Technology, Professor of Molecular Systems Biology (1,00)

01.02.2014–31.12.2015

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Professor of Molecular Systems Biology (1,00)

01.01.2014–31.01.2014

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow in Molecular Biology (1,00)

01.05.2013–31.12.2013

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow in Molecular Biology (1,00)

01.01.2011–30.04.2013

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow in Molecular Biology (1,00)

01.01.2008–31.12.2010

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow (1,00)

01.01.2006–31.12.2007

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow (1,00)

01.11.2005–31.12.2005

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow extraordinarius (1,00)

01.01.2005–31.10.2005

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, Senior Research Fellow extraordinarius (0,20)

2005–2005

University of Tartu, Faculty of Science and Technology (old), Institute of Technology, University of Tartu, erakorraline vanemteadur (1,00)

2004–2004

University of Tartu, Faculty of Physics and Chemistry, Institute of Chemical Physics, Chair of Analytical Chemistry, erakorraline vanemteadur (1,00)

Education

1993 Bachelors degree, Bio-organic chemistry, University of Tartu

1995 Master of Sciences, Bio-organic chemistry, University of Tartu

1996–2002

2002 Ph.D, Medical biochemistry, Uppsala University, Sweden

R&D related managerial and administrative work

2007−...

Estonian Society for Proteomics, the president

Qualifications

Academic degrees

Mart Loog, Doctor's Degree, 2002, (sup) Pia Ek; Jaak Järv, Studies on the Differential Specificity of Protein Kinases and its Applications, Uppsala University, Sweden.

Mart Loog, Research Master's Degree, 1995, (sup) Jaak Järv, Proteiini kinaas A spetsiifilisusest reaktsioonis peptiidsubstraatide ja valkudega (Specificity of Protein Kinase A in Reaction with Peptides and Proteins), University of Tartu, Faculty of Physics and Chemistry.

Honours & awards

2012, Mart Loog, Estonian Science Prize in Chemistry and Molecular Biology

2012, Mart Loog, National Science Award

Fields of research

ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.1. Biochemistry; CERCS CLASSIFICATION: P310 Proteins, enzymology ; SPECIFICATION: Protein kinase signaling networks in eukaryotic cell cycle.

Additional information

Ph.D
Uppsla University, Sweden, 2002

Projects in progress

Completed projects

Dissertations under supervision

Supervised dissertations

Publications

Category

Year

Publication

1.1.

2020

Valk, Ervin; Maljavin, Artemi; Loog, Mart (2020). Detection of Multisite Phosphorylation of Intrinsically Disordered Proteins using Quantitative Mass-Spectrometry. Methods in molecular biology [forthcoming].

1.1.

2020

Örd, Mihkel; Loog, Mart (2020). Detection of Multisite Phosphorylation of Intrinsically Disordered Proteins using Phos-tag SDS-PAGE. Methods in molecular biology [forthcoming].

1.1.

2020

Venta, Rainis; Valk, Ervin; Örd, Mihkel; Košik, Oleg; Pääbo, Kaur; Maljavin, Artemi; Kivi, Rait; Faustova, Ilona; Shtaida, Nastassia; Lepiku, Martin; Möll, Kaidi; Doncic, Andreas; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart (2020). A processive phosphorylation circuit with multiple kinase inputs and mutually diversional routes controls G1/S decision. Nature Communications, 11 (1), 1836−1836.10.1038/s41467-020-15685-z.

1.1.

2020

Örd, Mihkel; Puss, Kait Kaarel; Kivi, Rait; Möll, Kaidi; Ojala, Tuuliki; Borovko, Irina; Faustova, Ilona; Venta, Rainis; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart (2020). Proline-Rich Motifs Control G2-CDK Target Phosphorylation and Priming an Anchoring Protein for Polo Kinase Localization. Cell Reports, 31 (11), 107757−107757.10.1016/j.celrep.2020.107757.

1.1.

2019

Örd, Mihkel; Loog, Mart (2019). How the cell cycle clock ticks. Molecular Biology of the Cell, 30 (2), 169−172.10.1091/mbc.E18-05-0272.

1.1.

2019

Alina Goldstein Darya Goldman, Ervin Valk, Mart Loog, Liam J. Holt, and Larisa Gheber (2019). Synthetic-evolution reveals narrow paths to regulation of the Saccharomyces cerevisiae mitotic kinesin-5 Cin8. International Journal of Biological Sciences, 15 (6), 1125−1138.10.7150/ijbs.30543.

1.1.

2019

Örd, Mihkel; Venta, Rainis; Möll, Kaidi; Valk, Ervin; Loog, Mart (2019). Cyclin-Specific Docking Mechanisms Reveal the Complexity of M-CDK Function in the Cell Cycle. Molecular Cell, 75, 76−89.10.1016/j.molcel.2019.04.026.

1.1.

2019

Örd, M.; Möll, K.; Agerova, A.; Kivi, R.; Faustova, I.; Venta, R.; Valk, E.; Loog, M. (2019). Multisite phosphorylation code of CDK. Nature Structural & Molecular Biology, 26, 649−658.10.1038/s41594-019-0256-4.

1.1.

2017

Goldstein, Alina; Siegler, Nurit; Goldman, Darya; Judah, Haim; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart; Gheber, Larisa (2017). Three Cdk1 sites in the kinesin-5 Cin8 catalytic domain coordinate motor localization and activity during anaphase. Cellular and Molecular Life Sciences, 74 (18), 3395−3412.10.1007/s00018-017-2523-z.

1.1.

2017

Linke C, Chasapi A, González-Novo, A Sawad I, Tognetti S, Klipp E, Loog M, Krobitsch S, Posas F, Xenarios I, Barberis M. (2017). A Clb/Cdk1-mediated regulation of Fkh2 synchronizes CLB expression in the budding yeast cell cycle. NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS, 3.10.1038/s41540-017-0008-1.

1.1.

2016

Hõrak, Hanna; Sierla, Maija; Tõldsepp, Kadri; Wang, Cun; Wang, Yuh-Shuh; Nuhkat, Maris; Valk, Ervin; Pechter, Priit; Merilo, Ebe; Salojärvi, Jarkko; Overmyer, Kirk; Loog, Mart; Brosché, Mikael; Schroeder, Julian I.; Kangasjärvi, Jaakko; Kollist, Hannes (2016). A Dominant Mutation in the HT1 Kinase Uncovers Roles of MAP Kinases and GHR1 in CO2-induced Stomatal Closure. Plant Cell, 28 (10), 2493−2509.

1.1.

2016

Jakobson, Liina1; Vaahtera, Lauri; Tõldsepp, Kadri; Nuhkat, Maris; Wang, Cun; Wang, Yuh-Shuh; Hõrak, Hanna; Valk, Ervin; Pechter, Priit; Sindarovska, Yana; Tang, Jing; Xiao, Chuanlei; Xu, Yang; Gerst Talas, Ulvi; Garcia-Sosa, Alfonso T.; Kangasjärvi, Saijaliisa; Maran, Uko; Remm, Maido; Roelfsema, M. Rob G.; Hu, Honghong ... Brosche, Mikael (2016). Natural Variation in Arabidopsis Cvi-0 Accession Reveals an Important Role of MPK12 in Guard Cell CO2 Signaling. Plos Biology, 1/25−25/25.10.1371/journal.pbio.2000322.

1.1.

2015

Doncic, A.; Atay, O.; Valk, E.; Grande, A.; Bush, A.; Vasen, G.; Colman-Lerner, A.; Loog, M.; Skotheim, JM. (2015). Compartmentalization of a bistable switch enables memory to cross a feedback-driven transition. Cell, 160 (6), 1182−1195.10.1016/j.cell.2015.02.032.

1.1.

2015

Bhaduri, S.; Valk, E.; Winters, MJ.; Gruessner, B.; Loog, M.; Pryciak, PM. (2015). A Docking Interface in the Cyclin Cln2 Promotes Multi-site Phosphorylation of Substrates and Timely Cell-Cycle Entry. Current Biology, 25 (3), 316−325.10.1016/j.cub.2014.11.069.

6.3.

2015

Venta, R.; Valk, E.; Loog, M (2015). Sünteetiline bioloogia juhib inimkonna järgmisesse arenguetappi. Horisont, 4, 18−25.

1.1.

2014

Valk, Ervin; Venta, Rainis; Ord, Mihkel; Faustova, Ilona, Kõivomägi, Mardo; Loog, Mart. (2014). Multistep phosphorylation systems: tunable components of biological signaling circuits. Molecular Biology of the Cell, 25 (22), 3456−3460.10.1091/mbc.E14-02-0774.

1.1.

2014

Piirsoo, Alla; Kasak, Lagle; Kauts, Mari-Liis; Uusen, Piia; Tints, Kairit; Loog, Mart; Neuman, Toomas; Piirsoo, Marko (2014). Protein kinase inhibitor SU6668 attenuates positive regulation of Gli proteins in cancer and multipotent progenitor cells. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research, 1843 (4), 703−714.10.1016/j.bbamcr.2014.01.003.

1.1.

2013

Kivi, R.; Loog, M.; Jemth, P.; Järv, J. (2013). Kinetics of Acrylodan-Labelled cAMP-Dependent Protein Kinase Catalytic Subunit Denaturation. The Protein Journal, 32 (7), 519−525.10.1007/s10930-013-9511-4.

1.1.

2013

Kõivomägi, Mardo; Örd, Mihkel; Iofik, Anna; Valk, Ervin; Venta, Rainis; Faustova, Ilona; Kivi, Rait; Balog, Eva Rose M; Rubin, Seth M; Loog, Mart (2013). Multisite phosphorylation networks as signal processors for Cdk1. Nature Structural & Molecular Biology, 1415−1424.10.1038/nsmb.2706.

1.1.

2013

McGrath, Denise; Balog, Eva Rose M.; Kõivomägi, Mardo; Lucena, Rafael ; Mai, Michelle V.; Hirschi, Alexander; Kellogg, Douglas R.; Loog, Mart; Rubin, Seth M. (2013). Cks Confers Specificity to Phosphorylation-Dependent Cdk Signaling Pathways. Nature Structural & Molecular Biology, 20 (12), 1407−1414.10.1038/nsmb.2707.

1.1.

2013

Valk, Ervin; Loog, Mart (2013). Multiple Pho85-dependent mechanisms control G1 cyclin abundance in response to nutrient stress. Molecular and Cellular Biology, 33 (7), 1270−1272.10.1128/MCB.00086-13.

1.1.

2012

Faustova, Ilona; Loog, Mart; Järv, Jaak (2012). Probing L-pyruvate kinase regulatory phosphorylation site by mutagenesis. The Protein Journal, 31 (7), 592−597.10.1007/s10930-012-9438-1.

1.1.

2012

Venta, Rainis; Valk, Ervin; Kõivomägi, Mardi; Loog, Mart (2012). Double-negative feedback between S-phase cyclin-CDK and CKI generates abruptness in the G1/S switch. Frontiers in Systems Biology, 3 (459), 1−15.10.3389/fphys.2012.00459.Epub2012Dec6.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Valk, E.; Venta, R.; Iofik, A.; Lepiku, M.; Balog, E.R.M.; Rubin, S.M.; Morgan, D.O.; Loog, M. (2011). Cascades of multisite phosphorylation control Sic1 destruction at the onset of S phase. Nature, 480 (7375), 128−131.10.1038/nature10560.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Loog, M. (2011). Cdk1: a kinase with changing substrate specificity. Cell Cycle, 10 (21), 3625−3626.

1.1.

2011

Kõivomägi, M.; Valk, E.; Venta, R.; Iofik, A.; Lepiku, M.; Morgan, D.; Loog, M. (2011). Dynamics of Cdk1 Substrate Specificity during the Cell Cycle. Molecular Cell, 610−623.

1.1.

2011

Avunie-Masala, R.; Movshovich, N.; Nissenkorn, Y.; Gerson-Gurwitz, A.; Fridman, V.; Kõivomägi, M.; Loog, M.; Hoyt, A.; Zaritsky, A.; Gheber, L. (2011). Phospho-regulation of Kinesin-5 function during anaphase spindle elongation. Journal of Cell Science, 124 (6), 873−878.

5.1.

2011

Faustova, I.; Kuznetsov, A.; Loog, M.; Järv, J. (2011). Probing L-type pyruvate kinase phophorylation site by mutagenesis. FEBS Journal, 278: 36th FEBS Congress, Biochemistry for Tomorrow's Medicine, Torino, Italy, 25 - 30 June, 2011. Wiley-Blackwell, 383−383.

1.1.

2010

Vahisalu, T.; Puzõrjova, I.; Brosché, M.; Valk, E.;Lepiku, M.; Moldau, H.; Pechter, P.; Wang, Y-S.; Lindgren, O.; Salojärvi, J.; Loog, M.; Kangasjärvi, J.; Kollist, H. (2010). Ozone-triggered rapid stomatal response involves production of reactive oxygen species and is controlled by SLAC1 and OST1. The Plant Journal, 62 (3), 442−453.10.1111/j.1365-313X.2010.04159.x.

1.1.

2010

Faustova, Ilona; Kuznetsov, Aleksei; Juronen, Erkki; Loog, Mart; Järv, Jaak (2010). Phosphorylation is switch of L-type pyruvate kinase allostery. Central European Journal of Biology, 5, 135−142.10.2478/s11535-010-0004-6.

5.1.

2010

Faustova, I.; Kuznetsov, A.; Loog, M; Järv, J. (2010). Phosphorylation is switch of L-PK cooperativity. FEBS Journal, 277: 35th FEBS Congress; Gothenburg, Sweden; 26 June - 1 July 2010. Blackwell Publishing Ltd, 186. (Supplement 1).

5.1.

2008

Iofik, A.; Koivomagi, M.; Valk, E.; Loog, M. (2008). Cks1-mediated multisite phosphorylation by Cdk1. FEBS Journal, 275 . 220.

1.1.

2005

Loog, M.; Morgan, D.O. (2005). Cyclin specificity in the phosphorylation of cyclin-dependent kinase substrates. Nature, 434 (7029), 104−108.

1.1.

2005

Loog, M.; Oskolkov, N.; O'Farrell, F.; Ek, P.; Jarv, J. (2005). Comparison of cAMP-dependent protein kinase substrate specificity in reaction with proteins and synthetic peptides. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1747 (2), 261−266.

1.1.

2005

Loog, M.; Ek, B.; Oskolkov, N.; Narvanen, A.; Jarv, J.; Ek, P. (2005). Screening for the optimal specificity profile of protein kinase C using electrospray mass-spectrometry. Journal of Biomolecular Screening, 10 (4), 320−328.

1.1.

2000

Loog, M.; Toomik, R.; Sak, K.; Muszynska, G.; Ek, P.; Järv, J. (2000). Peptide phosphorylation by Ca++-dependent protein kinase from maize seedlings. European Journal of Biochemistry, 267 (2), 337−343.

1.1.

2000

Loog, M.; Uri, A.; Jarv, J.; Ek, P. (2000). Bi-substrate analogue ligands for affinity chromatography of protein kinases. FEBS Letters, 480, 244−248.

1.1.

2000

Szczegielniak, J.; Liwosz, A.; Jurkowski, I.; Loog, M.; Dobrowolska, GY.; Ek, P.; Harmon, AC.; Muszynska, G. (2000). Calcium-dependent protein kinase from maize seedlings activated by phospholipids. European Journal of Biochemistry, 267 (12), 3818−3827.

1.1.

1999

OFarrell, F.; Loog, M.; Janson, I.; Ek, P. (1999). Kinetic study of the inhibition of CK2 by heparin fragments of different length. Biochimica et Biophysica Acta, 1433, 68−75.

1.1.

1999

Loog, M.; Sak, K.; Ek, P.; Jarv, J. (1999). Differential specificity of protein kinases A and C in reaction with synthetic peptides. Bioorganic Chemistry, 27 (3), 189−196.

1.1.

1999

Loog, M.; Uri, A.; Raidaru, G.; Jarv, J.; Ek, P. (1999). Adenosine-5 '-carboxylic acid peptidyl derivatives as inhibitors of protein kinases. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 9 (10), 1447−1452.

5.1.

1998

Loog, M.; Uri, A.; Ek, P.; Järv, J. (1998). Adenosine-peptide Conjugates as a Novel Class of Protein Kinase Inhibitors. Cellular and Molecular Biology Letters, 3, 317.

1.1.

1997

Vincent, B.; Jiracek, J.; Noble, F.; Loog, M.; Roques, B.; Dive, V.; Vincent, J.-P.; Checler, F. (1997). Effect of a novel selective and potent phosphinic peptide inhibitor of endopeptidase 3.4.24.16 on neurotensin-induced analgesia and neuronal inactivation. British Journal of Pharmacology, 121 (4), 705−710.

1.1.

1997

Vincent, B.; Jiracek, J.; Noble, F.; Loog, M.; Roques, B.; Dive, V.; Vincent, J.-P.; Checler, F. (1997). Contribution of endopeptidase 3.4.24.15 to central neurotensin inactivation. European Journal of Pharmacology, 334 (1), 49−53.

1.2.

1997

Loog, M.; Järv, J.; Ek, P.; Engström, L. (1997). Influence of enzyme inactivation on the kinetics of peptide phosphorylation by protein kinase C. Proceedings of the Estonian Academy of Sciences. Chemistry, 46 (3), 102−111.

1.1.

1994

Loog, M.; Eller, M.; Ekman, P.; Engstrom, L.; Eriksson, S.; Jarv, J.; Ragnarsson, U.; Toomik, R. (1994). Comparison of substrate specificities of protein kinase-a and kinase-c based on peptide-substrates. Bioorganic Chemistry, 22 (3), 328−336.

Industrial property

Invention: Method for the purification of protein kinase by affinity chromatography; Owners: Tartu Ülikool; Authors: Asko Uri, Mart Loog, Jaak Järv, Pia Ek; Priority number: SE19990001807; Priority date: 17.05.1999.

Viimati uuendatud

27.07.2020

Leitud 23 kirjet

	Programm	Liik	Number	Nimi	Projekti algus	Projekti lõpp	Vastutav täitja	Asutus	Finantseerijapoolne rahastamine

	SF		SF0182564s03	Antibiootikumide toimemehhanismid	01.01.2003	31.12.2007	Tanel Tenson	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut	317 960,45 EUR
	MUU		ILOTI08170K	EAS eeluuring: "Uudne mass-speltromeetrial baseeruv meetod valkude kvantitatiivseks määramiseks"	01.08.2008	30.11.2008	Mart Loog	Tartu Ülikool	10 855,46 EUR
	1.1.5.3.4.1.5.		SLTTI19095T (MOBEC005)	Gaasfermentatsiooni ERA õppetooli loomine (Mobilitas+ toetus)	01.03.2019	31.10.2022	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	200 000,00 EUR
	1.2.3.4.		MLTTI18304R (810755)	Gas Fermentation Technologies ERA Chair	01.09.2018	31.08.2023	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	2 496 875,00 EUR
	1.2.3.4.		MLTTI17385R	Industrial Cell Factories and Sustainable Bioprocessing for Future Bioeconomy	01.09.2017	31.08.2018	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	237 250,00 EUR
	RITA1	Alamprojekt	LLTKT19190 (RITA1/02-20-03)	Kliimamuutuste leevendamine läbi CCS ja CCU tehnoloogiate	01.04.2019	31.03.2021	Gunnar Nurk	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, keemia instituut	105 388,68 EUR
	2.1.1.		LLTTI19432	Ligniini keemilise ja bioloogilise töötlemisega seotud uurimis- ja arendustöö	01.07.2019	01.10.2023	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	122 272,00 EUR
	RITA1	Alamprojekt	LLTTI18211 (RITA1/01-18-16)	Lisandväärtuse tõstmine ja toorme tõhusam kasutamine Eesti biomajanduses ja selle sektorites	01.03.2018	28.02.2021	Petri-Jaan Lahtvee	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	62 791,00 EUR
	1.2.3.4.		MLTTI19486R	Lühikesed lineaarsed interaktsioonimotiivid spetsiifilisuse determinantidena ubikvitinüleerimise süsteemides – avastamine, mehhanismid ja terapeutilised rakendused	01.12.2019	30.11.2023	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	232 069,68 EUR
	EMP		EMP24	Mass-spektromeetrial baseeruv fosfoproteoomika - vahend rakusiseste signaalisüsteemide kaardistamiseks	01.04.2008	31.12.2010	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond	28 818,33 EUR
	TK		SLTTI16143T (TK143)	Molekulaarse Rakutehnoloogia Tippkeskus (TK143)	01.01.2016	01.03.2023	Tanel Tenson	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	3 917 568,00 EUR
	IUT		IUT2-21	Molekulaarsed lülitid eukarüootsetes süsteemides	01.01.2013	31.12.2018	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	1 344 000,00 EUR
	2.1.1.		LLTTI20021	Pelleti keemiliste ja füüsikaliste omaduste analüüs	02.01.2020	16.02.2020	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	4 950,00 EUR
	1.2.3.4.		MLOTI15038R	Phosphoprocessors - Bioloogiliste signaalide protsessimine multifosforüülitavate süsteemide abil	01.05.2015	31.10.2020	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	1 999 289,00 EUR
	ETF		ETF6766	Proteiin kinaaside signaalisüsteemid eukarüootses rakutsüklis	01.01.2006	31.12.2009	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond	36 444,99 EUR
	SF		SF0180071s07	Proteiini kinaasid ja fosfataasid kui molekulaarsed lülitid	01.01.2007	31.12.2012	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut	773 832,31 EUR
	MUU		MP1TI06106	Protein kinase signaling networks in eukaryotic cell cycle	01.07.2006	30.06.2011	Mart Loog	Tartu Ülikool	932 976,11 EUR
	1.2.3.4.		MLOTI15037R (668997)	SynBioTEC - Establishing ERA Chair position in Synthetic Biology at University of Tartu Institute of Technology	01.06.2015	30.09.2020	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	2 393 438,00 EUR
	1.1.5.3.4.1.5.		SLTTI16110T (MOBEC002)	Sünteetilise bioloogia alase ERA õppetooli loomine Tartu Ülikooli tehnoloogiainstituudis (Mobilitas+ toetus)	01.01.2016	30.06.2020	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	200 000,00 EUR
	PRG		PRG550	Sünteetiliste multifosforüülitavate signaalivõrgustike kasutamine rakuvabrikutes	01.01.2019	31.12.2023	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	457 125,00 EUR
	PUTJD		PUTJD626	Valkude ekspressiooni ja lokalisatsiooni reguleerivate multifosforüülimisel baseeruvate moodulite disain	01.02.2016	31.01.2018	Nastassia Shtaida	Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut	66 000,00 EUR
	AP		IUT2-21AP14	Väikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema IUT2-21 raames	01.01.2014	31.10.2015	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond	63 839,05 EUR
	AP		SF0180071s07AP	Väikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema SF0180071s07 raames	01.01.2010	31.12.2011	Mart Loog	Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut	63 884,17 EUR