See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
31.05.1993
+372 53365187
6204449
kaisa.roots@taltech.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
10.07.2017–20.02.2019   
AS Ida-Tallinna Keskhaigla, Bioanalüütik (1,00)
05.07.2017–31.08.2018   
Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut, insener (0,50)
28.05.2015–30.03.2016   
AS Nova Vita Kliinik, Tsütogeneetik (1,00)
 
 
Haridustee
29.01.2019–...   
Tallinna Tehnikaülikool, Keemia ja biotehnoloogia instituut, doktorant
2015–2017   
Tallinna Tehnikaülikool, geenitehnoloogia eriala, magistriõpe, diplom cum laude
2012–2015   
Tallinna Tehnikaülikool, geenitehnoloogia eriala, bakalaureuseõpe
2000–2012   
Kärdla Ühisgümnaasium, kuldmedal
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2020−...   
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, liige
2019−...   
Eesti Inimesegeneetika Ühing, liige
 
 
Lisainfo
Osalemine konverentsidel:

September 2020, Virtuaalne konverents 33rd Workshop of the European Helicobacter and Microbiota Study Group; video-ettekanne "Helicobacter pylori and the possible probiotic Lactobacillus salivarius co-exist in Estonian gastric biopsy sample"
September 2019, Konverents XXXIInd International Workshop on Helicocbacter & Microbiota in Inflammation & Cancer; Innsbruck, Austria; poster-ettekanne „Helicobacter pylori induces alterations in liver cell signaling“
Eesti Inimesegeneetika Ühingu aastakonverentsil osalemine aastatel 2017-2019

Õpetamiskogemus:

Oktoober 2019, Mikrobioloogia (KTO0290), DNA-põhiste identifikatsioonimeetodite praktikumi läbiviimise assisteerimine; Tallinna Tehnikaülikool, keemia ja biotehnoloogia instituut.

Juhendatud bakalaureusetöö:

Johanna Kristina Tamm; juh. Kaisa Roots, Pirjo Spuul; "Helicobacter pylori virulentsusfaktori CagA ja rakupinna adhesioonimolekuli CD44 interaktsiooni uurimine Huh7 maksavähi rakkudes"; Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut.

Lisategevused:

Tallinna Tehnikaülikooli Keemia ja Biotehnoloogia Instituudi mikroskoopiaruumi toavanem alates 2020. aasta augustist.

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2021, Kaisa Roots, Eesti Teaduste Akadeemia konkursi "Teadus 3 minutiga" finalist
2019, Kaisa Roots, Tamkivi reaalteaduste fondi stipendium, Sihtasutus Eesti Rahvuskultuuri Fond
2017, Kaisa Roots, Tallinna Tehnikaülikooli aasta teadusartikli kaasautor loodus-, täppis- ja terviseteaduste valdkonnas
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS KLASSIFIKAATOR: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia
 
 
Lisainfo
Oktoober 2020 - Euroopa Bioinformaatika Instituut (EMBL-EBI), Bioinformaatika suvekool (virtuaalne kursus), põhirõhk valkude automaatsel annoteerimisel
Mai - juuni 2020 - Tallinna Tehnikaülikool, Bioinformaatika erikursus, põhirõhk RNA-sekveneerimise andmeanalüüsil, Olli-Pekka Smolander
Veebruar 2020 - Kursus "Mikrobioom, mikroelu meis ja meie ümber"; Tallinn, Eesti
Veebruar 2020 - Biomeditsiini ja biotehnoloogia doktorikooli talvekool 2020, "Writing Process Reengineering", koolitaja Thomas Basbøll; Rakvere, Eesti
Jaanuar 2020 - Kursusus "13th Finnish Gut Day"; Helsingi, Soome
November 2019 - Science Day for Ph.D. students and supervisors teaduspäev, keskne teema välismaal õppimine ja koostöö; suuline ettekanne; Tõrve küla, Eesti
August 2019 - Baltic Summer School on Behavioural Characterization of Rodent Models of Major Brain Disorders kursus; Pühajärve, Eesti
Märts 2019 - Tallinna Tehnikaülikool, Reprodutseeritav andmeanalüüs kasutades R keelt, Taavi Päll
Aprill – mai 2015 - Tallinna Tehnikaülikool, katseloomadega töötamise kursus

Juhendamisel väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2021
6.3.
2021
5.1.
2020
5.1.
2020
5.1.
2019
1.1.
2017
8.11.2021
31.05.1993
+372 53365187
6204449
kaisa.roots@taltech.ee

Career

Institutions and positions
10.07.2017–20.02.2019   
East Tallinn Central Hospital, Laboratory technologist (1,00)
05.07.2017–31.08.2018   
Tallinn University of Technology , School of Science, Department of Chemistry and Biotechnology, Engineer (0,50)
28.05.2015–30.03.2016   
AS Nova Vita Clinic, Cytogeneticist (1,00)
 
 
Education
29.01.2019–...   
Tallinn University of Technology, Department of Chemistry and Biotechnology, PhD student
2015–2017   
Tallinn University of Technology, Gene technology, master's degree, graduated with honors
2012–2015   
Tallinn University of Technology, Gene technology, bachelor's degree
2000–2012   
Kärdla co-educational grammar school, graduated with honors
 
 
R&D related managerial and administrative work
2020−...   
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, member
2019−...   
Estonian Society of Human Genetics, member
 
 
Additional information
Participation in conferences:

September 2020, 33rd Workshop of the European Helicobacter and Microbiota Study Group virtual conference; virtual poster-presentation "Helicobacter pylori and the possible probiotic Lactobacillus salivarius co-exist in Estonian gastric biopsy sample"
September 2019, XXXIInd International Workshop on Helicocbacter & Microbiota in Inflammation & Cancer; Innsbruck, Austria; poster-presentation „Helicobacter pylori induces alterations in liver cell signaling“
Participation in Estonian Society of Human Genetics yearly conferences in 2017-2019

Teaching activities:

October 2019, Microbiology (KTO0290), teaching assistant for DNA-based methods of identification laboratory works; Tallinn University of Technology, Department of Chemistry and Biotechnology.

Supervised Bachelor's thesis:

Johanna Kristina Tamm; sup. Kaisa Roots, Pirjo Spuul; 'Investigation of the interaction of Helicobacter pylori virulence factor CagA with cell surface adhesion molecule CD44 in Huh7 liver cancer cells'; Tallinn University of Technology, School of Science, Department of chemistry and biotechnology.

Additional activities:

Manager of the local microscopy facility in TalTech Department of Chemistry and Biotechnology since August 2020.

Qualifications

 
 
Honours & awards
2021, Kaisa Roots, Finalist of the competition "Science with 3 minutes" organized by Estonian Academy of Sciences
2019, Kaisa Roots, The Stipend of Tamkivi exact sciences fund; issued by the Estonian National Culture Foundation
2017, Kaisa Roots, Tallinn University of Technology scientific paper of the year co-author of in the field of natural, exact, and health sciences
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS CLASSIFICATION: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology
 
 
Additional information
October 2020 - European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Summer school in bioinformatics (virtual), working on the project "Functional annotation of proteins"
May - june 2020 - Tallinn University of Technology, Special Course in Bioinformatics, focusing on RNA-sequencing data analysis, Olli-Pekka Smolander
February 2020 - Course "Microbiome, microlife inside and out"; Tallinn, Estonia
February 2020 - Doctoral School of Biomedicine and Biotechnology Winter school 2020, "Writing Process Reengineering" by Thomas Basbøll; Rakvere, Estonia
January 2020 - 13th Finnish Gut Day; Helsinki, Finland
November 2019 - Science Day for Ph.D. students and supervisors, focusing on working abroad and collaboration; oral presentation; Tõrve village, Estonia
August 2019 - Baltic Summer School on Behavioural Characterization of Rodent Models of Major Brain Disorders; Pühajärve, Estonia
March 2019, Tallinn University of Technology, Reproducible data analysis using R language, Taavi Päll
April – May 2015 - Tallinn University of Technology, course in laboratory animal techniques

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2021
6.3.
2021
5.1.
2020
5.1.
2020
5.1.
2019
1.1.
2017
8.11.2021