737 6437
www.twitter.com/hedipeterson
hedi.peterson@ut.ee

Teenistuskäik

Haridustee
2006–2015   
Tartu Ülikool, bioinformaatika PhD
2005–2006   
Uppsala Ülikool, bioinformaatika M.Sc, vahetusüliõpilane
2004–2006   
Tartu Ülikool, bioinformaatika M.Sc
2000–2004   
Tartu Ülikool, bioinformaatika B.Sc
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2018−...   
Tryggve Reference Group liige
2016−...   
Euroopa Komisjon, Horizon 2020 teaduse- ja innovatsiooni programmi granditaotluste ekspert "LIF" paneelis
2006−...   
ISCBSC
2005−...   
SOCBIN
2004−...   
ISCB
 
 
Teenistuskäigu lisainfo
Available in English;

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2017, Hedi Peterson, Researcher of the year 2017, Institute of Computer Science, University of Tartu
2010, Hedi Peterson, Haridus- ja Teadusminsiteeriumi tänukiri: Kaur Alasoo konkursitöö „Tugivektormasinate kombineerimine angiogeneesiga seotud geenide ennustamiseks” juhendamise eest loodusteaduste ja tehnika valdkonnas (I preemia)
2006, Hedi Peterson, Gertrud Thelins stipendium Tartu Ülikooli tudengitele õpinguteks Uppsala Ülikoolis, 2006/2007 õppeaasta kevadsemester
2005, Hedi Peterson, Human Research Potential & the Socio-economic Knowledge Base: Access to Research Infrastructures (ARI), 09.03-10.04.2005 Uppsala
2005, Hedi Peterson, Kristjan-Jaagu tasemeõppe stipendium, 2005/06 õppeaasta Uppsala Ülikoolis
2004, Hedi Peterson, Eesti olümpiakomitee kõrghariduse stipendium tippsportlastele, 2004/2005-2005/2006
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; PÕHISUUND: süsteemibioloogia geeniregulatsiooni bioinformaatika, süsteemibioloogia; geeniregulatsiooni bioinformaatika
VALDKOND: 3. Terviseuuringud; 3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatika; CERCS ERIALA: B110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.6. Arvutiteadused; CERCS ERIALA: P170 Arvutiteadus, arvutusmeetodid, süsteemid, juhtimine (automaatjuhtimisteooria)

Lõppenud projektid

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.5.
2013
3.5.
2012
1.1.
2011
3.5.
2011
3.5.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
5.1.
2010
5.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
3.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2007
3.5.
2007
13.09.2019
737 6437
www.twitter.com/hedipeterson
hedi.peterson@ut.ee

Career

Education
2006–2015   
University of Tartu, PhD bioinformatics
2005–2006   
University of Uppsala, M.Sc bioinformatics
2004–2006   
University of Tartu, M.Sc bioinformatics
2000–2004   
University of Tartu, B.Sc bioinformatics
 
 
R&D related managerial and administrative work
2018−...   
Member of Tryggve Reference Group
2016−...   
European Commission, Horizon 2020 research and innovation program; expert-evaluator in “LIF” expert panel
2006−...   
ISCBSC
2005−...   
SOCBIN
2004−...   
ISCB
 
 
Additional career information
Teaching activities:

1. ELIXIR-Estonia course “Web-based tools to analyse and interpret high-throughput biological data”,
Institute Pasteur, France 18.10.2016
2. ELIXIR-Estonia course “Web-based tools to analyse and interpret high-throughput biological data”,
University of Oxford, UK, 12.01.2016
3. ELIXIR Linux Command Line course, Tartu, 15.05.2015
4. ELIXIR g:Profiler course, Tartu, 05.12.2014
5. Lectures of Bioinformatics course, Tartu, autumnt 2010
6. BIIT service workshop City of Hope, USA, 23.11.2010
7. EMBO Practical course for microarray analysis, Hinxton, UK 20.10.2010
8. EMBO Practical course for microarray analysis, Hinxton, UK 15.10.2009
9. 9th BioSapiens European Bioinformatics School, Brussels, Belgium 30.01.2009
10. EBI Roadshow 2009, Tartu 07.-10.09.2009 (main local organiser)
11. ENFIN-EMBRACE workshop, Helsinki, Finland 06.10.2009

Undergraduate supervising activities:

1. Andreas Ellervee, bachelor thesis “Automatic detection of intermediate genes responsible for signal mediation from high-throughput data” 2015)
2. Henry Mägi, bachelor thesis “RNA-seq pipeline” (2014)
3. Kaur Alasoo, bachelor thesis „Combining Support Vector Machines to Predict Novel Angiogenesis Genes“ (2010) (The thesis got the First prizes from the Estonian Ministry of Education and Science from the Estonian Academy of Sciences in 2010)
4. Priidik Vaikla, bachelor thesis „Project management system by the example of BIIT scientific group“ (2008)
5. Sten Ilmjärv, bachelor thesis„Describing transcription start sites in Saccharomyces cerevisiae“ (2007)
6. Marten Teino, bachelor thesis „Scientific literature database for a research group“ (2007)
;

Qualifications

 
 
Honours & awards
2017, Hedi Peterson, Researcher of the year 2017, Institute of Computer Science, University of Tartu
2010, Hedi Peterson, Minister of Science and Education: letter of thanks for successful supervision of Kaur Alasoo's bachelor thesis " Combining Support Vector Machines to Predict Novel Angiogenesis Genes" in Natural Sciences and Engineering (1st prize)
2006, Hedi Peterson, Gertrud Thelin's scholarship for University of Tartu students for studing at University of Uppsala, spring semester 2006/2007
2005, Hedi Peterson, Human Research Potential & the Socio-economic Knowledge Base: Access to Research Infrastructures (ARI), 09.03-10.04.2005 Uppsala
2005, Hedi Peterson, Kristjan-Jaak fellowship for studying at the University of Uppsala, 2005/06 academic year
2004, Hedi Peterson, Estonian Olympic Committee scholarship for Higher Education studies for National Level athletes, 2004/2005-2005/2006
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; SPECIALITY: systems biology, bioinformatics of gene regulation
FIELD OF RESEARCH: 3. Health; 3.11. Biochemistry, Genetics, Microbiology, Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics relating to Health Studies; CERCS SPECIALITY: B110 Bioinformatics, medical informatics, biomathematics, biometrics
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.6. Computer Sciences; CERCS SPECIALITY: P170 Computer science, numerical analysis, systems, control
 
 

Completed projects

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2019
1.1.
2019
1.1.
2018
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2017
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
3.5.
2013
3.5.
2012
1.1.
2011
3.5.
2011
3.5.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
5.1.
2010
5.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
3.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2007
3.5.
2007
13.09.2019