Urmas Kõljalg

24.02.1961
737 6235
urmas.koljalg@ut.ee

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.01.2005–...    Tartu Ülikooli Loodusmuuseumi direktor
01.09.2006–31.07.2007    Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Botaanika ja ökoloogia instituut, mükoloogia professor (1,00)
01.01.2003–31.12.2004    Carl ja Tecla Lambergi nimeline külalisprofessuur Göteborgi Ülikoolis.
01.09.2001–31.08.2006    Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Botaanika ja ökoloogia instituut, mükoloogia professor (1,00)
01.01.1999–31.12.2001    Tartu Ülikooli dotsent ning mükoloogia õppetooli hoidja.
01.01.1998–31.12.2004    EPMÜ Zooloogia ja Botaanika Instituudi vanemteadur ja mükoloogia osakonna juhataja (peale tööleasumist Tartu Ülikooli töötamine kohakaasluse alusel 0,5 koormusega).
01.01.1997–31.12.1999    Göteborgi Ülikooli järeldoktor sealses Evolutsioonilise botaanika instituudis (osalise koormusega).
01.01.1996–31.12.1997    Zooloogia ja Botaanika Instituudi teadur.
01.01.1992–31.12.1996    Tartu ja Helsingi Ülikooli doktorant.
01.01.1988–31.12.1993    Zooloogia ja Botaanika Instituudi vanemlaborant.
 
 
Haridustee
1994–1996    Helsingi Ülikool, Ph.D. botaanikas
1983–1988    Tartu Ülikool, diplom botaanikas
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
2011−...    Eesti Teaduste Akadeemia liige
1995−...    Briti Mükoloogia Ühingu liige.
1997−2006    Eesti Looduseuurijate Seltsi presiidiumi liige.
1996−2006    Ajakirja Folia Cryptogamica Estonica peatoimetaja.
1994−1999    Eesti Mükoloogia Ühingu (ELUS-i alluvuses) esimees.

Kvalifikatsioon

 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2003, Urmas Kõljalg, Carl ja Tecla Lambergi nimeline külalisprofessuur Göteborgi Ülikoolis (2003/2004 akadeemiline aasta).
1997, Urmas Kõljalg, Eesti Vabariigi teaduspreemia 1996. aasta parima teadustöö eest geo- ja bioteaduste valdkonnas
 
 
Teadustöö põhisuunad
VALDKOND: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.2. Mikrobioloogia; CERCS ERIALA: B230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia ; PÕHISUUND: Seente ja taimejuurte vahelise kooselu uurimine ning interaktsioonid, seente süstemaatika ja evolutsioon.
VALDKOND: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.6. Arvutiteadused; CERCS ERIALA: P175 Informaatika, süsteemiteooria; PÕHISUUND: Eluslooduse andmehalduse ja -analüüsi tehnoloogiate arendustöö.
 
 
Lisainfo
Ph.D.
Helsingi Ülikool, 1996

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
6.8.
2015
6.8.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.2.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
3.2.
2011
6.3.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
2.2.
2008
3.2.
2008
3.3.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.2.
2006
3.1.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2003
1.1.
2003
3.5.
2003
1.2.
2002
1.3.
2002
1.2.
2001
3.2.
2001
1.1.
2000
1.2.
2000
3.2.
2000
6.2.
2000
6.2.
2000
1.1.
1999
3.2.
1999
5.2.
1999
3.2.
1998
4.2.
1998
1.1.
1997
1.1.
1997
1.2.
1996
2.2.
1996
1.1.
1992
1.2.
1992
3.2.
1989

Urmas Kõljalg

24.02.1961
737 6235
urmas.koljalg@ut.ee

Career

Institution and occupation
01.01.2005–...    Director of the Natural History Museum, University of Tartu (since 2005)
Professor of the Institute of Botany and Ecology, University of Tartu (since 2001)
01.09.2006–31.07.2007    University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Botany and Ecology, Professor (1,00)
01.01.2003–31.12.2004    Carl and Tecla Lambergs guest professorship in the University of Gothenburg (2003-2004).
01.09.2001–31.08.2006    University of Tartu, Faculty of Biology and Geography, Institute of Botany and Ecology, Professor (1,00)
01.01.1999–31.12.2001    Docent of the Institute of Botany and Ecology, University of Tartu (1999-2001)
01.01.1998–31.12.2004    Senior Researcher and the Head of the Mycological Department of the Inst. of Zoology and Boatny (since 1998, from 2000 part time)
01.01.1997–31.12.1999    Part time postdoc in the University of Göteborg (1997-1998).
01.01.1996–31.12.1997    Research Associate of the Inst. of Zoology and Botany, Estonian Agricultural University (1996-1997)
01.01.1992–31.12.1996    Ph.D. student of the University of Tartu and University of Helsinki (1992-1996).
01.01.1988–31.12.1993    Senior Laboratory Assistant of the Inst. of Zoology and Botany (1988-1993).
 
 
Education
1994–1996    1996 Ph.D. of the University of Helsinki in botany
1983–1988    1988 Diploma of the University of Tartu in botany
 
 
R&D related managerial and administrative work
2011−...    Member of the Estonian Academy of Sciences
1995−...    Member of the British Mycological Society (since 1995).
1997−2006    Member of the Board of the Estonian Naturalist’s Society (since 1997).
1996−2006    Editor in Chief of the journal Folia Cryptogamica Estonica (since 1996).
1994−1999    Chairman of the Estonian Mycological Society (1994-1999).

Qualifications

 
 
Honours & awards
2003, Urmas Kõljalg, Carl and Tecla Lambergs guest professorship in the University of Gothenburg (2003-2004).
1997, Urmas Kõljalg, Estonian National Science Prize
 
 
Field of research
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.2. Microbiology; CERCS SPECIALTY: B230 Microbiology, bacteriology, virology, mycology ; SPECIALITY: Interactions between fungi and plant roots, taxonomy and evolution of fungi.
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.4. Ecology, Biosystematics and -physiology
FIELD OF RESEARCH: 1. Biosciences and Environment; 1.4. Ecology, Biosystematics and -physiology
FIELD OF RESEARCH: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.6. Computer Sciences; CERCS SPECIALTY: P175 Informatics, systems theory ; SPECIALITY: Technologies for the storage, management and analyses of biodiversity data.
 
 
Additional information
Ph.D.
University of Helsinki, 1996

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
6.8.
2016
1.1.
2015
1.1.
2015
1.1.
2015
6.8.
2015
6.8.
2015
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2014
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2013
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.1.
2012
1.2.
2012
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2011
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2010
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2009
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2008
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2007
1.1.
2006
1.1.
2006
1.2.
2006
5.2.
2006
1.1.
2005
1.1.
2004
1.1.
2003
1.1.
2003
1.2.
2002
1.2.
2001
3.2.
2001
1.1.
2000
1.2.
2000
1.1.
1999
3.2.
1999
3.2.
1998
1.1.
1997
1.1.
1997
1.2.
1996
2.2.
1996
1.1.
1992
1.2.
1992
3.2.
1989
  • Leitud 28 kirjet
ProgrammNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusRahastamine kokku
EMPEMP265Arktika seenestiku määramine elurikkuse informaatika vahenditega03.09.201331.08.2016Leho TedersooTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond270 000,00 EUR
MUUSP2RT14010Eesti DataCite platvormi loomine01.01.201401.03.2015Liisi LembinenTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli Raamatukogu247 117,00 EUR
MUUSBGOM07196Eesti loodusteaduslike kollektsioonide kuraatorite täiendõppe korraldamiseks Rootsi Loodusmuuseumis 6.-9. novembril 200701.11.200725.11.2007Urmas KõljalgTartu Ülikool5 560,31 EUR
MUUVBGBO04012Ektomükoriisa seente identifitseerimine Põhjamaades01.01.200431.12.2006Urmas KõljalgTartu Ülikool23 827,48 EUR
ETFETF8235Ektomükoriisat moodustavate seente ja peremeestaimede valitud taksonite koevolutsioon01.01.201031.12.2013Urmas KõljalgTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut67 492,28 EUR
MUUMP1LM12220REU-BON - Euroopa elurikkuse vaatluste võrgustiku loomine01.12.201231.05.2017Urmas KõljalgTartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed, Tartu Ülikooli Muuseumid, Loodusmuuseum221 080,00 EUR
TKTK131Globaalmuutuste ökoloogia looduslikes ja põllumajanduskooslustes01.01.201601.03.2023Martin ZobelTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut3 198 027,47 EUR
HLKHLK04-16Herbaarium (TAA(M)*) seente DNA taksonoomia ja ökoloogia varamuna01.01.200431.12.2008Bellis KullmanEesti Maaülikool, põllumajandus- ja keskkonnainstituut76 203,51 EUR
MUULP1LM15106Kaitsealuste seente seiremetoodika analüüs ja metoodika täpsustamine27.07.201515.11.2015Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed3 240,00 EUR
SFSF0182536As03Kand- ja kottseente (s.h. lihheniseerunud seente) valitud taksonite molekulaarne fülogenees, süstemaatika ja ökoloogia01.01.200331.12.2007Urmas KõljalgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond283 256,43 EUR
SFSF_0182536As03Kand- ja kottseente (s.h. samblike) molekulaarne fülogenees, nende taksonoomia ning põllumajanduslikult oluliste seenerühmade autökoloogia.01.01.200331.12.2007Urmas KõljalgTartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond0,00 EUR
ETFETF8583Kandseente viljakehades elunevate organismide mitmekesisus01.01.201131.12.2014Kadri PõldmaaTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut40 800,00 EUR
ETFETF6606Lehternahkiselaadsete (Thelephorales, Fungi) biogeograafia ja ökoloogia.01.01.200631.12.2009Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond62 294,25 EUR
MUUVP1UM10179Ligipääs andmebaasi platvormile PlutoF01.09.201031.12.2011Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut23 520,00 EUR
MUUSP1LM11186TLooduslikud arhiivid ja andmevõrgustik (NATARC)01.01.201131.12.2015Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed2 243 298,65 EUR
HLKHLK06-4Loodusteaduslike kogude veebipõhine andmebaas01.01.200631.12.2008Urmas KõljalgTartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed, Tartu Ülikooli Muuseumid47 509,23 EUR
1.1.5.3.4.1.2.SP1LM16336TLoodusteaduslikud arhiivid ja andmevõrgustik01.01.201631.12.2021Urmas KõljalgTartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed896 976,91 EUR
IUTIUT20-53Loodusteaduslikud arhiivid ja andmevõrgustik01.01.201431.12.2019Urmas KõljalgTartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed196 717,84 EUR
MUU8-2/T12115MIMKMetsakultiveerimisega seotud metsakaitseprobleemid Eesti metsanduses ning nende vältimine keskkonnasäästlike tõrjevõtetega01.09.201231.08.2015Ivar SibulEesti Maaülikool; Eesti Maaülikool, metsandus- ja maaehitusinstituut, metsakasvatuse osakond139 740,00 EUR
SFSF0180153s08Mükoriisat ja samblikke moodustavate seente ökoloogia, taksonoomia ning biogeograafia spetsiifilised ja integreeritud küsimused.01.01.200831.12.2013Urmas KõljalgTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut681 835,04 EUR
MUULP1LM13088Nagoya protokolli ratifitseerimise ja EL-i rakendusmääruse mõju analüüs ning ettepanekute tegemine selle riiklikuks rakendamiseks13.05.201301.09.2013Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed, Tartu Ülikooli Muuseumid, Loodusmuuseum2 500,00 EUR
MUUSP1LM14009TProgrammi „Keskkonnahariduse arendamine Eesti Loodusmuuseumi kogude baasil" tegevuste elluviimine01.01.201415.10.2015Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed100 300,00 EUR
MUUMP1LM11133IRahvusvahelise juurdepääsu loomine loodusvaatluste andmetele (BALTICDIVERSITY)01.05.201131.12.2013Urmas KõljalgTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaed, Tartu Ülikooli Muuseumid, Loodusmuuseum300 000,00 EUR
MUUSBGOM07135Riikliku programmi "Humanitaar- ja loodusteaduslikud kogud (2004-2008)" raameskorraldatud konverentse artiklikogumiku "Eesti humanitaar- ja loodusteaduslikud kogud 2006: seisund, kasutamine, andmebaasid" väljaandmine14.12.200701.05.2008Urmas KõljalgTartu Ülikool9 158,67 EUR
IUTIUT20-30Suured andmemahud - uurimus seeneliikidest ja nende interaktsioonidest 01.01.201431.12.2019Urmas KõljalgTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut675 600,00 EUR
  • Leitud 90 kirjet
PublikatsioonKlassifikaatorFail
Abarenkov, K.; Adams, R.I.; Irinyi, L.; Agan, A.; Ambrosio, E.; Antonelli, A.; Bahram, M.; Bengtsson-Palme, J.; Bok, G.; Cangren, P.; Coimbra, V.; Coleine, C.; Gustafsson, C.; He, J.; Hofmann, T.; Kristiansson, E.; Larsson, E.; Larsson, T.; Liu, Y.; Martinsson, S. ... Nilsson, R.H. (2016). Annotating public fungal ITS sequences from the built environment according to the MIxS-Built Environment standard – a report from a May 23-24, 2016 workshop (Gothenburg, Sweden). MycoKeys, 16, 1−15.10.3897/mycokeys.16.10000.1.1.
Põlme, Sergei; Öpik, Maarja; Moora, Mari; Zobel, Martin; Kohout, Petr; Oja, Jane; Kõljalg, Urmas; Tedersoo, Leho (2016). Arbuscular mycorrhizal fungi associating with roots of Alnus and Rubus in Europe and the Middle East. Fungal Ecology, 24A, 27−34.1.1.
Oja, Jane; Vahtra, Johanna; Bahram, Mohammad; Kohout, Petr; Kull, Tiiu; Rannap, Riinu; Kõljalg, Urmas; Tedersoo, Leho (2016). Local-scale spatial structure and community composition of orchid mycorrhizal fungi in semi-natural grasslands. Mycorrhiza, x (x), 1−13.10.1007/s00572-016-0755-7.1.1.
Hibbett D, Abarenkov K, Kõljalg U, Öpik M, Chai B, Cole JR, Wang Q, Crous PW, Robert VARG, Helgason T, Herr J, Kirk P, Lueschow S, O’Donnell K, Nilsson H, Oono R, Schoch CL, Smyth C, Walker D, Porras-Alfaro A, Taylor JW, Geiser DM. (2016). Sequence-based classification and identification of Fungi. Mycologia, 108 (6), 1049−1068.16-130.1.1.
Kõljalg, U.; Tedersoo, L.; Nilsson, R.H.; Abarenkov, K. (2016). Digital identifiers for fungal species. Science, 352, 1182−1183.10.1126/science.aaf7115.6.8.
Nilsson, R.H.; Tedersoo, L.; Ryberg, M.; Kristiansson, E.; Hartmann, M.; Unterseher, M.; Porter, T.M.; Bengtsson-Palme, J.; Walker, D.M.; De Sousa, F.; Gamper, H.A.; Larsson, E.; Larsson, K.-H.; Kõljalg, U.; Edgar, R.C.; Abarenkov, K. (2015). A comprehensive, automatically updated fungal ITS sequence dataset for reference-based chimera control in environmental sequencing efforts. Microbes and Environments, 30 (2), 145−150.10.1264%2Fjsme2.ME14121.1.1.
Tedersoo, Leho; Anslan, Sten; Bahram, Mohammad; Põlme, Sergei; Riit, Taavi; Liiv, Ingrid; Kõljalg, Urmas; Kisand, Veljo; Nilsson, R. Henrik; Hildebrand, Falk; Bork, Peer; Abarenkov, Kessy (2015). Shotgun metagenomes and multiple primer pair-barcode combinations of amplicons reveal biases in metabarcoding analyses of fungi. MycoKeys, 10, 1−43.10.3897/mycokeys.10.4852.1.1.
Oja, J.; Kohout, P.; Tedersoo, L.; Kull, T.; Kõljalg, U. (2015). Temporal patterns of orchid mycorrhizal fungi in meadows and forests as revealed by 454 pyrosequencing. New Phytologist, 205 (4), 1608−1618.10.1111/nph.13223/abstract.1.1.
Tedersoo, L.; Bahram, M.; Põlme, S.; Anslan, S.; Riit, T.; Kõljalg, U.; Nilsson, R.H.; Hildebrand, F.; Abvarenkov, K. (2015). Response to comment on “Global diversity and geography of soil fungi”: Analytical biases in microbial diversity studies. Science, 349 (6251), 936−936.10.1126/science.aaa5594.6.8.
Tedersoo, Leho; Ramirez, Kelly S.; Nilsson, R Henrik; Kaljuvee, Aivi; Kõljalg, Urmas; Abarenkov, Kessy (2015). Standardizing metadata and taxonomic identification in metabarcoding studies. GigaScience, 4 (34), 1−4.10.1186/s13742-015-0074-5.6.8.
Schoch, C.L.; Robbertse, B.; Robert, V.; Vu, D.; Cardinali, G.; Irinyi, L.; Kõljalg, U.; Tedersoo, L.; Federnse, S. (2014). Finding needles in haystacks: linking scientific names, reference specimens and molecular data for Fungi. Database, bau061.10.1093/database/bau061.1.1.
Põlme, Sergei; Bahram, Mohammad; Kõljalg, Urmas; Tedersoo, Leho (2014). Global biogeography of Alnus associated Frankia actonibacteria. New Phytologist, 204 (4), 979−988.DOI:10.1111/nph.12962.1.1.
Tedersoo, L.; Bahram, M.; Ryberg, M.; Otsing, E.; Kõljalg, U.; Abarenkov, K. (2014). Global biogeography of the ectomycorrhizal /sebacina lineage (Fungi, Sebacinales) as revealed from comparative phylogenetics analyses. Molecular Ecology, 23 (16), 4168−4183.10.1111/mec.12849.1.1.
Tedersoo, L.; Bahram, M.; Põlme, S.; Kõljalg, U.; Yorou, N.S.; Wijesundera, R.; Villarreal-Ruiz, L.; Vasco-Palacios, A.; Quang Thu, P.; Suija, A.; Smith, M.E.; Sharp, C.; Saluveer, E.; Saitta, A.; Ratkowsky, D.; Pritsch, K.; Riit, T.; Põldmaa, K.; Piepenbring, M.; Phosri, C. ... Abarenkov, K. (2014). Global diversity and geography of soil fungi. Science, 346 (6213), 1078.10.1126/science.1256688.1.1.
Nilsson, R. Henrik; Hyde, Kevin D.; Pawłowska, Julia; Ryberg, Martin; Tedersoo, Leho; Aas, Anders Bjørnsgard; Alias, Siti A.; Alves, Artur; Anderson, Cajsa Lisa; Antonelli, Alexandre; Arnold, A. Elizabeth; Bahnmann, Barbara; Bahram, Mohammad; Bengtsson-Palme, Johan; Berlin, Anna; Branco, Sara; Chomnunti, Putarak; Dissanayake, Asha; Drenkhan, Rein; Friberg, Hanna ... Abarenkov, Kessy (2014). Improving ITS sequence data for identification of plant pathogenic fungi. Fungal Diversity, 67 (1), 11−19.10.1007/s13225-014-0291-8.1.1.
Tedersoo, L.; Harend, H.; Buegger, F.; Pritsch, K.; Saar, I.; Kõljalg, U. (2014). Stable isotope analysis, field observations and synthesis experiments suggest that Odontia is a non-mycorrhizal sister genus of Tomentella and Thelephora. Fungal Ecology, 11, 80−90.10.1016/j.funeco.2014.04.006.1.1.
Zhou, Li-Wei; Kõljalg, Urmas (2013). A new species of Lenzitopsis (Thelephorales, Basidiomycota) and its phylogenetic placement. Mycoscience, 54 (1), 87−92.10.1016/j.myc.2012.06.002.1.1.
Põlme, S.; Bahram, M.; Yamanaka, T.; Nara, K.; Dai, Y. C.; Grebenc, T.; Kraigher, H.; Toivonen, M.; Wang, P.; Matsuda, Y.; Naadel, T.; Kennedy, P.; Kõljalg, U.; Tedersoo, L. (2013). Biogeography of ectomycorrhizal fungi associated with alders (Alnus spp.) in relation to biotic and abiotic variables at the global scale. New Phytologist, 198 (4), 1239−1249.10.1111/nph.12170.1.1.
Veldre, V.; Abarenkov, K.; Bahram, M.; Martos, F.; Selosse, M.-A.; Tamm, H.; Kõljalg, U.; Tedersoo, L. (2013). Evolution of nutritional modes of Ceratobasidiaceae (Cantharellales, Basidiomycota) as revealed from publicly available ITS sequences. Fungal Ecology, 6 (4), 256−268.10.1016/j.funeco.2013.03.004.1.1.
Lindahl, Björn D.; Nilsson, R. Henrik; Tedersoo, Leho; Abarenkov, Kessy; Carlsen, Tor; Kjøller, Rasmus; Kõljalg, Urmas; Pennanen, Taina; Rosendahl, Søren; Stenlid, Jan; Kauserud, Håvard (2013). Fungal community analysis by high-throughput sequencing of amplified markers – a user's guide. New Phytologist, 199 (1), 288−299.10.1111/nph.12243.1.1.
Bahram, M.; Kõljalg, U.; Courty, P.; Diédhiou, AG.; Kjøller, R.; Põlme, S.; Ryberg, M.; Veldre, V.; Tedersoo, L. (2013). The distance decay of similarity in communities of ectomycorrhizal fungi in different ecosystems and scales. Journal of Ecology, 101 (5), 1335−1344.10.1111/1365-2745.12120.1.1.
Kõljalg, Urmas; Nilsson, Henrik; Abarenkov, Kessy; Tedersoo, Leho; Taylor, Andy; Bahram, Mohammad; Bates, Scott; Bruns, Thomas; Bengtsson-Palme, Johan; O'Callaghan, Tony; Douglas, Brian; Drenkhan, Tiia; Eberhardt, Ursula; Dueñas, Margarita; Grebenc, Tine; Griffith, Gareth; Hartmann, Martin; Kirk, Paul; Kohout, Petr; Larsson, Ellen ... Larsson, Karl-Henrik (2013). Towards a unified paradigm for sequence-based identification of Fungi. Molecular Ecology, 22 (21), 5271−5277.10.1111/mec.12481.1.1.
Phosri, C.; Põlme, S.; Taylor, A.F.S.; Kõljalg, U.; Suwannasai, N.; Tedersoo, L. (2012). Diversity and community composition of ectomycorrhizal fungi in a dry deciduous dipterocarp forest in Thailand. Biodiversity and Conservation, 21 (9), 2287−2298.1.1.
Bahram M, Kõljalg U, Kohout P, Mirshahvaladi S, Tedersoo L. (2012). Ectomycorrhizal fungi of exotic pine plantations in relation to native host trees in Iran: evidence of host range expansion by local symbionts to distantly related host taxa. Mycorrhiza, DOI: 10.1007/s00572-012-0445-z.1.1.
Tedersoo, L.; Naadel, T.; Bahram, M.; Pritsch, K.; Buegger, F.; Leal, M.; Kõljalg, U.; Põldmaa, K. (2012). Enzymatic activities and stable isotope patterns of ectomycorrhizal fungi in relation to phylogeny and exploration types in an afrotropical rain forest. New Phytologist, 195 (4), 832−843.10.1111/j.1469-8137.2012.04217.x.1.1.
  • Leitud 14 kirjet
PealkiriJuhendatavKraadJuhendajaKaitsmise staatusKaitsmise aastaAsutus
Biogeography and ecology of Alnus-associated ectomycorrhizal fungi - from regional to global scalePõlme, SergeidoktorikraadLeho Tedersoo; Urmas KõljalgKaitstud2013Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut
Biogeography of the genera Tomentella and Thelephora (Thelephorales, Basidiomycota)Abarenkov, KessymagistrikraadUrmas KõljalgKaitstud2006Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Ectomycorrhizal fungal diversity of birch (Betula pubescens) in Tagamõisa wooded meadow and the adjacent forestNaadel, TriinmagistrikraadUrmas KõljalgKaitstud2005Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Ectomycorrhizal fungi: diversity and community structure in Estonia, Seychelles and AustraliaTedersoo, LehodoktorikraadUrmas KõljalgKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Botaanika ja ökoloogia instituut
Elurikkuse informaatika veebi- ja mobiilsed rakendused - andmekaevandus ja -haldus ning analüüsPeterson, MarkodoktorikraadUrmas Kõljalg; Kessy AbarenkovJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond
Fine scale distribution of ectomycorrhizal fungi and roots across substrate layers including coarse woody derbis in a mixed forestTedersoo, LehomagistrikraadUrmas KõljalgKaitstud2003Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Influence of cultivation techniques on productivity and fruit quality of some Vaccinium and Rubus taxaStarast, MargedoktorikraadUrmas Kõljalg; Kadri KarpKaitstud2008Tartu Ülikool
Majavammi (Serpula lacrymans, Basidiomycota) DNA põhine määramine ehituspuidustOja, JanemagistrikraadUrmas KõljalgKaitstud2009Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Mycorrhizal fungi of native and introduced trees in the Seychelles Islands Naadel, TriindoktorikraadUrmas Kõljalg; Leho TedersooKaitstud2010Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Online information system for the biological characters and straitsAdojaan, KristjandoktorikraadUrmas Kõljalg; Kessy AbarenkovJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, Ökoloogia ja maateaduste instituut
Orhideeliste koevolutsioon ektomükoriisat moodustavate seenetaksonitega lehternahkiselaadsete seltsist (Thelephorales)Oja, JanedoktorikraadUrmas Kõljalg; Tiiu KullJuhendamiselTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool
Perekonna pilvik (Russula) sektsiooni Xerampelinae ektomükoriisa sümbiondid EestisJairus, TeelemagistrikraadLeho Tedersoo; Urmas KõljalgKaitstud2007Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Botaanika ja ökoloogia instituut
PlutoF - cloud database and computing services supporting biological researchAbarenkov, KessydoktorikraadUrmas KõljalgKaitstud2011Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
The taxonomy and phylogeny of the genera Cystoderma and Cystodermella (Agaricales, Fungi)Saar, IrjadoktorikraadUrmas KõljalgKaitstud2012Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Botaanika osakond
  • Leitud 1 kirjet
NimetusAsutusVastutav isik
Mükoloogilised kogud (TU(M))Tartu Ülikool, Tartu Ülikooli loodusmuuseum ja botaanikaaedAve Suija