Mitmete geenide produktid kaitsevad bakteri translatsiooni aparaati stressitingimustes tekkivate kahjustuste eest. Mitmed sellised stressikaitse geenid on ka varasemates töödes inaktiveeritud. Paraku on geenide inaktiveerimiseks kasutatud erinevaid E.coli tüvesid, mis muudab erinevate geenide rollide võrdlemise raskeks, kuna erinaval geneetilisel tagapõhjal võivad ilmneda erinevad efektid. Mis on veelgi olulisem, tüvede iseloomustamiseks puuduvad ühtsed standardid.
Käesoleva töö eesmärgid on:
1. Töötada välja testid erinevate geenide katkestustega E. coli tüvede võrdlemiseks.
2. Selgitada translatsiooni kahjustuste eest kaitsvate geenide (relA, spoT, rmf, relB, relE, yfiA, yhbH, sra, ssrA) rolli erinevate stressitingimuste korral.
Products of several genes protect the bacterial translational apparatus in stress conditions. Some of the stress response genes have been inactivated in previous studies. Unfortunately, different E.coli strains have been used for the inactivations, making comparisons of the roles of the genes difficult, as different effects could occur in different genetic backgrounds. Moreover, no standard sets of conditions have been developed for comparison of the strains.
The aims of the current project are:
1. To develop standard experimental conditions for the comparisons of different E. coli knock-out strains.
2. To determine the roles of genes protecting the translational machinery (relA, spoT, rmf, relB, relE, yfiA, yhbH, sra, ssrA) in different stress conditions.