"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF6768
ETF6768 "Translatsioon stressis kahjustuste eest kaitsvate geenide funktsioonid (1.01.2006−31.12.2009)", Tanel Tenson, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
ETF6768
Translatsioon stressis kahjustuste eest kaitsvate geenide funktsioonid
CHARACTERIZATION OF THE GENES PROTECTING THE TRANSLATIONAL APPARATUS IN STRESS CONDITIONS
1.01.2006
31.12.2009
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. Geneetika601 1.3. Keemiateadused (keemia ja muud seotud teadused)100,0
PerioodSumma
01.01.2006−31.12.2006180 000,00 EEK (11 504,10 EUR)
01.01.2007−31.12.2007184 440,00 EEK (11 787,86 EUR)
01.01.2008−31.12.2008184 440,00 EEK (11 787,86 EUR)
01.01.2009−31.12.2009177 062,00 EEK (11 316,32 EUR)
46 396,14 EUR

Mitmete geenide produktid kaitsevad bakteri translatsiooni aparaati stressitingimustes tekkivate kahjustuste eest. Mitmed sellised stressikaitse geenid on ka varasemates töödes inaktiveeritud. Paraku on geenide inaktiveerimiseks kasutatud erinevaid E.coli tüvesid, mis muudab erinevate geenide rollide võrdlemise raskeks, kuna erinaval geneetilisel tagapõhjal võivad ilmneda erinevad efektid. Mis on veelgi olulisem, tüvede iseloomustamiseks puuduvad ühtsed standardid. Käesoleva töö eesmärgid on: 1. Töötada välja testid erinevate geenide katkestustega E. coli tüvede võrdlemiseks. 2. Selgitada translatsiooni kahjustuste eest kaitsvate geenide (relA, spoT, rmf, relB, relE, yfiA, yhbH, sra, ssrA) rolli erinevate stressitingimuste korral.
Products of several genes protect the bacterial translational apparatus in stress conditions. Some of the stress response genes have been inactivated in previous studies. Unfortunately, different E.coli strains have been used for the inactivations, making comparisons of the roles of the genes difficult, as different effects could occur in different genetic backgrounds. Moreover, no standard sets of conditions have been developed for comparison of the strains. The aims of the current project are: 1. To develop standard experimental conditions for the comparisons of different E. coli knock-out strains. 2. To determine the roles of genes protecting the translational machinery (relA, spoT, rmf, relB, relE, yfiA, yhbH, sra, ssrA) in different stress conditions.