See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Institutsionaalne uurimistoetus (IUT)" projekt IUT20-30
IUT20-30 "Suured andmemahud - uurimus seeneliikidest ja nende interaktsioonidest " (1.01.2014−31.12.2019); Vastutav täitja: Urmas Kõljalg; Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, ökoloogia ja maateaduste instituut; Finantseerija: Sihtasutus Eesti Teadusagentuur; Eraldatud summa: 1 013 400 EUR.
IUT20-30
Suured andmemahud - uurimus seeneliikidest ja nende interaktsioonidest
Big data – integrated study of fungal species and their interactions
1.01.2014
31.12.2019
Teadus- ja arendusprojekt
Institutsionaalne uurimistoetus (IUT)
ETIS valdkondETIS alamvaldkondCERCS valdkondFrascati Manuali valdkondProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.6 Bioteadused90,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.6. ArvutiteadusedP175 Informaatika, süsteemiteooria1.2 Arvutiteadus ja informaatika10,0
PerioodFinantseerija poolt eraldatud summa
01.01.2014−31.12.2014168 900,00 EUR
01.01.2015−31.12.2015168 900,00 EUR
01.01.2016−31.12.2016168 900,00 EUR
01.01.2017−31.12.2017168 900,00 EUR
01.01.2018−31.12.2018168 900,00 EUR
01.01.2019−31.12.2019168 900,00 EUR
1 013 400,00 EUR

Projekti eesmärgiks on arendada geenijärjestustel põhinevat taksonoomiat ja seente määramist ning suure läbilaskevõimega sekveneerimistehnoloogiatel põhinevat seenekoosluste uurimist. Uurimistöö käigus kasutatakse teaduslike hüpoteeside esitamiseks ja testimiseks kombineeritult seenetaksonite taksonoomia, suure läbilaskevõimega sekveneerimistehnoloogia ning bioinformaatika alast teadmust.
The main aims of the project are to produce fundamental progress in sequence-based taxonomy and identification of fungi and high-throughput DNA sequencing based analyses of fungal communities. For this we combine our expertise in: 1) taxonomy of selected fungal taxa; 2) fungal community studies with high-throughput sequencing and 3) bioinformatics.
Meie projekti poolt loodud eluslooduse liikide kommunikatsiooni süsteem on oluline nii teadusele kui ka mitmele teisele valdkonnale. Teaduslikes artiklites ja andmeportaalides saab digitaalsete püsiidentifikaatoritega viidata nüüd kõigile rDNA ITS geenijärjestuste põhjal arvutatud seeneliikidele. See võimaldab näiteks võrrelda eri uurimusi, mis kasutavad sama kommunikatsiooni süsteemi. Meditsiinis, taimekasvatuses jm. kasutatakse UNITE liigihüpoteese seenhaiguste määramiseks ja kommunikatsiooniks. Meie uurijad lõid esmakordselt DNA triipkoodi järjestuse enam kui 1400 seeneliigile. Valdavalt on need liikidele, mis esinevad (lähis)troopika metsades aga nende seas on ka mitmeid Eestile uusi liike. Tänu sellele on need liigid nüüd määratavad näiteks mulla-, vee- ja muudest keskkonnaproovidest. Lisaks kirjeldati arvukates taksonoomiaalastes artiklites projekti täitjate poolt teadusele uutena üks selts, üks sugukond, viis perekonda ja 36 liiki. Projekti käigus avaldatud artiklid mikroorganismidest ja putukatest on maailmas ühed esimestest, mis käsitlevad seente viljakehade interaktsioone teiste organismirühmade esindajatega. Need tööd lisavad uut teavet seentoiduliste ja -kaaslejate organismide koosluste mustritest ja neid mõjutavatest teguritest metsaökosüsteemis. Uuringute käigus eraldati puhaskultuuri rohkelt viljakehades elunevaid baktereid ja mikroseeni nii Eestist kui mujalt maailmast. Taolised sümbiontsed ja antagonistlikud mikroobitüved on heaks algmaterjaliks uute metaboliitide leidmiseks ja biotehnoloogiaalasteks rakendusteks tulevikus. Meie töörühma liikmed arendavad Eesti elurikkuse andmeportaali (https://elurikkus.ee ). Selle kaudu saab otsida ligi 30 000 Eestist leitud liigi esinemise andmeid. Andmekirjeid on üle 4 miljoni. Seetõttu kasutavad selle portaali teenuseid nii harrastusteadlased, riigiametnikud, looduskaitsjad, erafirmad kui ka teadlased.