"Sihtfinantseerimine" projekt SF_0182562As03
SF_0182562As03 "Mikroorganismide geeniregulatsioon ning geneetilise mitmekesisuse kujunemise molekulaarsed mehhanismid muutuvates keskkonnatingimustes (1.01.2003−31.12.2007)", Ain Heinaru, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
SF_0182562As03
Mikroorganismide geeniregulatsioon ning geneetilise mitmekesisuse kujunemise molekulaarsed mehhanismid muutuvates keskkonnatingimustes
Molecular mechanisms of gene regulation and genetic diversity in changing environmental conditions
1.01.2003
31.12.2007
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudB434 Agrokeemia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt40,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB225 Taimegeneetika1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt30,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T490 Biotehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).30,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2003−31.12.2007

1-s alateemas (A. Heianru) viidi läbi molekulaarsed uurimused, et leida efektiivseid bioaugmentatsiooniks kasutatavaid mikroobitüvesid. Kohtla-Järve tuhamägede läbiviidud katsed näitasid kõige efektiivsemat biodegradatsiooni mikroobide töötluse ja taimede koosmõjul. Sekveneeriti täielikult herbitsiid 2,4-D lagundav kohalik plasmiidi pEST 4011. 2-s alateemas (A. Mäe) selgitati fütopatogeense bakteri (Erwinia carotovora)  virulentsusfaktorite toimet erinevatel uutel mutantidel. Koostati mikrokiip. 3-s alateemas (M. Kivisaar, T. Alamäe) uuriti pseudomonaadidel ja pärmseentel metaboolsete protsesside regulatsiooni ja geneetilisi ümberkorraldusi. Pärmidega läbiviidud uurimustes näidati, et Hansenula polymorpha maltaasi ja maltoosi permeaasi geenid paiknevad genoomis kõrvuti ja divergentselt. 4-s alateemas (EBK, juh. M. Kivisaar) näidati transpositsiooni tulemusel saavutatud mutatsioonilisi efekte. 5-s alateemas (A. Nurk) uuriti laktaati produtseerivaid mikroobitüvesid Bacillus coagulans. *Avaldati 30 rahvusvahelist publikatsiooni, k.a. 20 artikli 1.1. alt, 2 patenditaotlust ja saadi 1 patent. *Kaitsti 5 PhD tööd ja 8 MSci tööd. *Esineti 30 konverentsil.
"Project contains 5 subprojects that are divided between three different institutions (IMCB of TU, Institute of Technology of TU, Estonian Biocentre). Staff consists of 18 full time researchers, the PIs are 1 professor, 3 associated professors and 1 senior researcher. It is expected to study: 1) Biodegradative potential of microbial populations; 2) Regulation of expression of virulence factors in phytopathogen Erwinia carotovora: 3) Regulation of metabolic processes and genetic rearrangements in bacteria and regulation of gene expression in methylotrophic yeasts; 4) Mechanisms of adaptation to industrial wastes from the aspect of horizontal gene transfer and environmental technology, and new microbial technologies based on renewable raw materials. All these investigations are connected with the study of processes of biodegradation by using modern methods of molecular genetics and biotechnology. Several post-graduate and PhD students are involved. This study is mostly basic research. However, these investigations are connected with real pollution problems in nature. Mostly microbes that are investigated originate from pollutedenvironment. It gives the dimension of technological development to the studies. We expect that our research results will give important new information on gene regulation and genetic rearrangements in natural conditions. One part of current investigation is directly connected with applied research and is directed to the optimisation of the microbiological production of lactic acid and study of possibilities to produce biodegradative plastics. "