See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Muu" projekt SLOTI12030T
SLOTI12030T "Piimhappebakterite süsteemibioloogiline disain (1.09.2011−31.08.2014)", Liisa Arike, Tartu Ülikool, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
SLOTI12030T
Piimhappebakterite süsteemibioloogiline disain
Systems biology applied on design of lactic acid bacteria
Piimhappebakterite süsteemibioloogiline disain
1.09.2011
31.08.2014
Teadus- ja arendusprojekt
Muu
Biotehnoloogia teadus- ja arendustegevuse toetamine
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikoolpartner01.09.2011−31.08.2014
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondpartner01.09.2011−31.08.2014
AsutusRiikTüüp
SA Archimedes
PerioodSumma
01.09.2011−31.08.201428 500,00 EUR
28 500,00 EUR

Projekt on suunatud toiduainetööstuses kasutatavate piimhappebakterite (LAB - lactic acid bacteria) juuretiste arendamisele. Kuigi LAB-e on aastakümneid tööstustes toodetud ja kasutatud, ei ole siiski selged kriteeriumid mille järgi saaks LAB-e tõhusamalt selekteerida toidu- ja biotehnoloogias kasutatavate protsesside jaoks. Projekti idee tugineb raku kui terviku analüüsile (mitte hetkel valdavale üksikute metabolismiradade geenide modifitseerimisele), kus tsentraalse tähtsusega on aminohapete metabolism (kuna LAB-id on auksotroofid aminohapete suhtes). Projekti eesmärgiks luua platvorm, mille abil saab LAB-e disainida ja välja selgitada nende täpsed metabolismi molekulaarsed regulatsioonid, mis seotud saagiste suurendamise, stressi taluvuse ning tervisele kasulike fenotüüpidega. Platvormi arendamisel kasutatakse süsteemibioloogilist lähenemist ja kasvuruumi kontseptsiooni võttes arvesse raku kui terviku, mis põhineb kolmel suurel osal: 1) muutusstaatsetel rakkude kultiveerimisel, kus rakkude metabolism on üksüheses vastavuses rakendatud keskkonnatingimustega, 2) rakusiseste komponentide, kogu tarbitud ja toodetud ühendite analüüsil, kasutades suure jõudlusega nn. oomikameetodeid, mis võimaldavad ühe analüüsiga määrata kvalitatiivselt ja kvantitatiivselt tuhandeid erinevaid molekule ning 3) rakkude ainevahetuse modelleerimisel, kus lihtsamate mudelitega saab arvutada elementide (süsiniku ja lämmastiku) bilansse ning hinnata rakkude ligikaudset kasvuruumi ning kogu genoomiinfot sisaldavad mudelid, kus on võimalik analüüsida ja ennustada rakkude vastest antud keskkonnatingimustel. ehk läbi mitmete oomikameetodite (proteoomika, transkriptoomika, metaboloomika jt) samaaegse rakendamise võetakse arvesse kõik rakuprotsessid ning leitakse nende omavahelised seosed erinevatel keskkonnatingimustel. Selle tehnoloogia juurutamisel ehk nende kolme osa ühendamise tulemusena on võimalik disainida optimaalsed söötmed rakkude kultiveerimiseks ning panna rakud toiduainete valmistamisel tootma tarbijatele kasulikke ühendeid (nt vitamiine, asendamatuid aminohappeid jm) ning disainima rakke ab initio kemikaale, ravimeid jm sünteesivale biotehnoloogililisteks protsessideks. Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituudi Proteoomika Tuumiklabor panustab antud projekti uute kvantitiivsete proteoomka meetodite juurutamise ja laiaulatusliku kasutamisega uurimaks piimhappebakterite käitumist kasvukeskkonna muutudes.
KirjeldusProtsent
Alusuuring70,0
Rakendusuuring30,0