"Sihtfinantseerimine" projekt SF0222604s03
SF0222604s03 (SF0222604s03) "Taimede ja taimeviiruste geenide ekspressiooni ja funktsiooni uurimine (1.01.2003−31.12.2007)", Erkki Truve, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond.
SF0222604s03
Taimede ja taimeviiruste geenide ekspressiooni ja funktsiooni uurimine
Expression and function of plant and plant virus genes
1.01.2003
31.12.2007
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudT490 Biotehnoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T490 Biotehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).25,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.6. PõllumajandusteadusB225 Taimegeneetika4.1. Põllumajandus, metsandus, kalandus ja nendega seonduvad teadused (agronoomia, loomakasvatus, kalakasvatus, metsakasvatus, aiandus jne.)25,0
PerioodSumma
01.01.2004−31.12.2004636 000,00 EEK (40 647,81 EUR)
01.01.2005−31.12.2005482 000,00 EEK (30 805,41 EUR)
01.01.2006−31.12.20061 075 000,00 EEK (68 705,02 EUR)
01.01.2007−31.12.20071 220 000,00 EEK (77 972,21 EUR)
218 130,45 EUR

Kavandatava uuringu olulisimaks põhieesmärgiks on geenide vaigistamise mehhanismide kirjeldamine õistaimedes ja viiruste rolli selgitamine selle protsessi mõjutamisel. Eelkõige soovime me teada saada, millised on need taimsed geenid, milliste produktidega interakteeruvad viraalsed geenivaigistamise supressorid. Kuna geenide vaigistamise uurimine antud töö kontekstis toimub viraalsete valkude abil, siis on töö teiseks põhieesmärgiks keraheina laiguviiruse (CfMV) geenide bioloogiliste funktsioonide selgitamine ning nende teede leidmine, kuidas CfMV suudab pärssida viirusvastase PTGS-i funktsioneerimist peremeestaimes. CfMV infektsioonilise cDNA baasil soovime välja töötada ka sobilikku viirus-indutseeritud geenivaigistamise vektorit kõrreliste jaoks. Sobemoviiruste ja post-transkriptsioonilise geenivaigistamise vahekordade uurimisega paralleelselt on kavas uurida kartuliviiruse A P1 ja HC-Pro valkude rolli selles uudses geeniekspressiooni regulatsiooni mehhanismis. Nähes ette geenide vaigistamise bioloogiliste mehhanismide täiendavat selgitamist, kavandame me samas ka uuringu raames geenivaigistamise kasutamist ebaselge või tundmatu funktsiooniga taimegeenide (ribonukleaas L-i inhibiitor) või geeniperekondade (müosiinid ja müosiini-sarnased valgud) funktsioonide selgitamisel.
The main task of the project is to describe the mechanisms of gene silencing in higher plants and clarify the role of viruses in the process. First of all, we plan to identify plant genes which products interact with viral gene silencing suppressors. As gene silencing is studied using viral proteins, the second task of the project is to identify the biological functions of cocksfoot mottle sobemovirus (CfMV) genes and to describe the mechanisms how this particular virus affects antiviral gene silencing mechanisms in host plant. We also plan to elaborate a novel virus-induced gene silencing vector for cereals, based on the infectious cDNA clone of CfMV. In parallel with studies on sobemoviruses and gene silencing we shall study also the role of potato A potyvirus proteins P1 and HC-Pro in this novel mechanism of gene expression regulation. Besides focusing on the studies on gene silencing mechanisms, we foresee also the application of gene silencing for the functional analysis plant genes (RNase L inhibitor) as well as gene families (myosin and myosin-like genes).