"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF7514
ETF7514 "Vähikatku uuringud Eesti jõevähi Astacus astacus looduslikes ja vähikasvanduste populatsioonides (1.01.2008−31.12.2010)", Tiit Paaver, Eesti Maaülikool, Veterinaarmeditsiini ja loomakasvatuse instituut.
ETF7514
Vähikatku uuringud Eesti jõevähi Astacus astacus looduslikes ja vähikasvanduste populatsioonides
Crayfish plague (aphanomycosis) in Estonian wild and farmed populations of noble crayfish Astacus astacus
1.01.2008
31.12.2010
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.6. PõllumajandusteadusB402 Akvakultuuride kasvatamine, kalakasvatus 4.1. Põllumajandus, metsandus, kalandus ja nendega seonduvad teadused (agronoomia, loomakasvatus, kalakasvatus, metsakasvatus, aiandus jne.)34,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogiaB260 Hüdrobioloogia, mere-bioloogia, veeökoloogia, limnoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt33,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt33,0
PerioodSumma
01.01.2008−31.12.2008267 600,00 EEK (17 102,76 EUR)
01.01.2009−31.12.2009256 896,00 EEK (16 418,65 EUR)
01.01.2010−31.12.2010256 896,00 EEK (16 418,65 EUR)
49 940,06 EUR

Projekti eesmärgiks on ohtliku haiguse, vähikatku määramise uute meetodite rakendamine Eestis ja vähikatku leviku teede ja viiside väljaselgitamine. Jõevähi järele on Põhja-Euroopas suur nõudmine. Seepärast on Eestis rajatud arvukalt vähikasvandusi. Vähikasvatuse jaoks kõige suurem ohutegur on vähikatk Aphanomyces astaci Schikora. Kogu Euroopa ulatuses on Eesti saar Saaremaa (Rootsi saare Gotlandi kõrval) unikaalne reservaat, kus kuni 2007 aastani ei olnud kordagi esinenud vähikatku ja pole sisse toodud võõrvähiliike. 2007 aastal hävitas vähikatk Saaremaal kolme vähikasvanduse vähivarud ja samuti Põduste jõe vähipopulatsiooni. Kuni viimaste aastateni oli vähikatku diagnostika väga keeruline. Selleks, et katku põhjustavat seent Aphanomyces astaci avastada oli vaja tabada haigestunud kuid veel elav vähk, võtta temast proovid ja kultiveerida seent söötmel. Mitmed vähkide massilised suremised jäid adekvaatse diagnoosimise meetodi puudumise tõttu kinnitamata. Praeguseks on võimalik reaalaja PCR meetodil määrata vähikatku seene esinemist ka juba surnud või elavatest, nakatatud, kuid veel haigustunnusteta vähkidest. Projekti käigus uuritakse vähikatku levikut Eestis, hinnatakse Saaremaal vähikatku leviku piiramiseks ette võetud meetmete tulemuslikkust ja selgitatakse katku säilimise võimalusi üksikutes mõne katkutüve suhtes vähem tundlikes isendites. Selleks kontrollitakse kõiki teada olevaid või oletatavaid katku koldeid. Kasutades EMÜ kalakasvatuse osakonna laboris välja töötatud jõevähi mikrosatelliitide markereid tehakse kindlaks võimalikud allikad, kust haigust kandvad vähid võisid pärineda. Projekt viiakse läbi koostöös Kuopio Ülikooliga ja Norra Veterinaarinstituudiga, kelle abil rakendatakse vähikatku diagnoosimise meetodid.
The aim of current project is to apply methods of molecular diagnostics of crayfish plague in Estonia for revealing the ways of spreading and supposed survival of the disease in plague resistant animals. Crayfish plague is a disease, which is lethal for all European crayfish species. It is caused by oomycete fungus Aphanomyces astaci Schikora. The disease has been brought to Europe from America by means of introduction of relatively little susceptible to this disease American crayfish. The crayfish plague has had devastating effect on crayfish populations of Europe. Estonian island Saaremaa was (besides Swedish island Gotland) a unique reserve in Europe where plague did not occur until 2007 and where alien crayfish species have never been introduced. In 2007 crayfish plague was discovered there in some crayfish farms and in a river. Thus, we have besides practical problem a good model object for studies of plague spreading and need to initiate DNA tests of crayfish plague in Estonia. It has been taken as rule in Northern Europe that absolutely all noble crayfish die fast during an outbreak. After this the site is considered disease free and can be restocked (if there are no alien crayfish populations carrying Aphanomyces astaci). Estonia has never had any alien crayfish populations. Still, the outbreaks of crayfish plague repeat periodically and sometimes in the same water body. The main method for detecting crayfish plague in our project is real-time PCR. This method for detecting A.astaci was first described by T.Vralstad (unpublished data) from Norwegian Veterinary Institute. It is species specific and requires low amount of template DNA. Variable 59 bp long motif from ITS1 region is used for PCR amplification. The sites of suspected or proved outbreaks of crayfish plague will be sampled for alive crayfish and presence of plague determined. Microsatellite markers for population genetic studies of noble crayfish have been developed in the dept. of aquaculture of EMU. Now it is possible to measure genetic differences between crayfish populations and we hope to use these markers as genetic tags in experiments. The project will be carried out in cooperation with University of Kuopio and Norwegian Veterinary Institute.