"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF7154
ETF7154 "Struktuursete rakkude talitlus hingamisteede remodelleerumisel astma ja kroonilise obstruktiivse kopsuhaiguse (KOK) korral: proteoomi analüüs (1.01.2007−31.12.2010)", Siiri Altraja, Tartu Ülikool, Arstiteaduskond.
ETF7154
Struktuursete rakkude talitlus hingamisteede remodelleerumisel astma ja kroonilise obstruktiivse kopsuhaiguse (KOK) korral: proteoomi analüüs
Functioning of the structural cells in airway remodeling in asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD): a proteomic approach to stimulated and diseased airway cells
1.01.2007
31.12.2010
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB540 Hingamissüsteemi haigused 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Arstiteaduskondkoordinaator01.01.2007−31.12.2010
PerioodSumma
01.01.2007−31.12.2007240 000,00 EEK (15 338,80 EUR)
01.01.2008−31.12.2008240 000,00 EEK (15 338,80 EUR)
01.01.2009−31.12.2009230 400,00 EEK (14 725,24 EUR)
01.01.2010−31.12.2010230 400,00 EEK (14 725,24 EUR)
60 128,08 EUR

Hingamisteede põletik ja remodelleerumine on suure levimuse ja sotsiaalse tähtsusega haiguste, astma ja kroonilise obstruktiivse kopsuhaiguse (KOK) keskseteks patogeneesimehhanismideks. Viimastes on aga jätkuvalt palju ebaselget. Käesoleva projektiga selgitame hingamisteede kudede remodelleerumise ja fibroosi tagamaid proteoomikal põhinevate meetoditega, mis võimaldavad avastada muutusi rakkude kogu valgukoosseisu ulatuses. Uuring hõlmab in vitro kultiveeritud inimese hingamisteede struktuurseid rakke (epiteelrakud ja fibroblastid ) nii natiivis kui uurib nende reaktsiooni mõjustusele relevantsete põletikumediaatoritega (TGF-b1, IL-4, IL-13 ja tsüsteinüülleukotrieenid) ja oksüdatiivsele stressile, mis in vivo osalevad astma ja KOK puhuses hingamisteede remodelleerumises. Proteoomi aspektist võrreldakse omavahel 1) ülaltoodud agensitega mõjustatud ja mõjustamata kommertsiaalseid hingamisteede rakkude liine, 2) rakke, mis on isoleeritud astma ja KOK-ga patsientidelt ning tervetelt kontrollisikutelt, 3) patsientidelt ja tervetelt kontrollisikutelt isoleeritud rakkude reaktsioone toodud mõjustustele ja 4) kommertsiaalsete rakkude liine ja rakke, mis pärinevad antud uuringus osalenud indiviididelt. Eri uuringurühmade vaheliste erinevuste ja mõjustustele saadud vastuste esiletoomiseks selgitatakse statistilise andmetöötlusega 2D-PAGE geelidel oluliselt üles- või allaekspresseerunud konkreetsed valgud. Seejärel viimased identifitseeritakse ja käsitletakse olulisuse seisukohast astma ja KOK patogeneesis.
The mechanisms of airway inflammation and remodeling, a central concept in asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), diseases of high prevalence and social significance, are still poorly understood. We expect a success in unraveling major pathologic processes behind the tissue remodeling and fibrosis with use of proteomics that covers changes in expression of multiple proteins from one set of experiments on airway structural cells. The modifications in protein display will be characterized in in vitro cultured human airway epithelial cells and fibroblasts in response to stimulation with relevant mediators (TGF-b1, IL-4, IL-13, and cysteinyl leukotrienes), which drive or exogenous agents (oxidative stress), which in vivo induce remodeling characteristic of these diseases. Proteomic comparisons between 1) stimulated and unstimulated commercial airway cell lines, 2) cells isolated from patients with asthma and COPD and those from healthy controls, 3) the response of cells from patients to the listed stimuli and that of the respective cells from controls, and 4) behavior of commercial airway cell lines and that of cells primarily isolated from human beings will be performed. To show significant over- or underexpression of proteins either in response to stimulation or in patients compared to controls, statistical analysis of the data from 2D-PAGE will be performed. The proteins of interest will be identified and analyzed in the light of their relevance in the pathogenesis of asthma and COPD.