"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF7509
ETF7509 "Ribosomaalse RNA modifitseeritud nukleosiidide ja modifikatsiooniensüümide funktsioon (1.01.2008−31.12.2011)", Jaanus Remme, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
ETF7509
Ribosomaalse RNA modifitseeritud nukleosiidide ja modifikatsiooniensüümide funktsioon
Functional Impostance of Modified Nucleosides and Modification Enzymes in Ribosomal RNA
1.01.2008
31.12.2011
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP320 Nukleiinhappesüntees, proteiinisüntees 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2011
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituutkoordinaator01.01.2008−31.12.2011
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2011
PerioodSumma
01.01.2008−31.12.2008322 800,00 EEK (20 630,68 EUR)
01.01.2009−31.12.2009309 888,00 EEK (19 805,45 EUR)
01.01.2010−31.12.2010309 888,00 EEK (19 805,45 EUR)
01.01.2011−31.12.201119 806,00 EUR
80 047,58 EUR

Lisaks tavalistele nukleotiididele esinevad stabiilsetes RNAdes ka modifitseeritud nukleosiidid. Nende füsioloogiline tähtsus on enamikul juhtudel ebaselge. Meie uurimus käsitleb ribosoomi RNA modifitseeritud nukleosiide ja neid sünteesivaid ensüüme. Tahame selgitada millal ribosoomide kokkupanemise suhtes modifikatsioonid RNAsse lisatakse. Uurime ka modifitseerivate ensüümi RluD sekundaarseid funktsioone, mille kohta on kirjanduses viiteid. Selgitame välja senitundmata ensüümi RlmH ja iseloomustame pseudouridiini süntaasi RluD substraadi spetsiifikat. Kontrollime selle ensüümi võimalikku osalemist ribosoomide kvaliteedi kontrollis.
Post-transcriptional modifications are frequent in ribosomal RNA. Their physiological role is unclear. This project is dedicated to modified nucleosides in E. coli rRNA and the corresponding enzymes. We are interested to know when are specific modifications made during ribosome assembly. Pseudouridine synthase RluD has been reported to have a second function which is a subject of this study. The substrate specificity of the RluD is analyzed both in vivo and in vitro. Possible involvment in quality control of ribosome biogenesis is tested. A plan for identification of pseudouridine specific methyl transferase RlmH is proposed.