"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF7019
ETF7019 "Pseudomonas aeruginosa statsionaarse faasi populatsioonis toimuvate mutatsiooniprotsesside iseloomustamiseks kasutatavate testsüsteemide konstrueerimine (1.01.2007−31.12.2010)", Riho Teras, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
ETF7019
Pseudomonas aeruginosa statsionaarse faasi populatsioonis toimuvate mutatsiooniprotsesside iseloomustamiseks kasutatavate testsüsteemide konstrueerimine
Construction of test systems for investigation of mutational processes in Pseudomonas aeruginosa stationary-phase population
1.01.2007
31.12.2010
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2007−31.12.2007
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituutkoordinaator01.01.2008−31.12.2010
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2010
PerioodSumma
01.01.2007−31.12.2007232 800,00 EEK (14 878,63 EUR)
01.01.2008−31.12.2008234 840,00 EEK (15 009,01 EUR)
01.01.2009−31.12.2009225 446,00 EEK (14 408,63 EUR)
01.01.2010−31.12.2010225 446,00 EEK (14 408,63 EUR)
58 704,90 EUR

Pseudomonas aeruginosa on inimese- ja loomapatogeen. Paljud molekulaarsed mehhanismid, mis mõjutavad selle bakteri patogeensust nagu näiteks antibiootikumide resistentsuse teke ja biofilmi moodustumine on seotud mutatsiooniliste protsessidega. Mutatsioonide teke bakterirakkudes on soodustatud statsionaarse faasi bakteripopulatsioonis mitmete stressifaktorite poolt nagu näiteks süsinikunälg, happe ja osmootne stress ning eksponeeritus erinevatele antibiootikumidele. Selleks, et uurida mutatsiooniprotsesse statsionaarse faasi bakteripopulatsioonis on kasutatud mitmeid erinevaid testsüsteeme. Seni ei ole konstrueeritud ühtki testsüsteemi, mis võimaldaks uurida mutatsiooniprotsesse P. aeruginosa statsionaarse faasi rakkudes. Taotletava projekti eesmärgiks on konstrueerida erinevad testsüsteemid, mis võimaldaksid uurida mutatsiooniprotsesse P. aeruginosa statsionaarse faasi rakkudes. Testsüsteemid, mida selle projekti raames on plaanis konstrueerida põhinevad nii erinevate süsinikuallikate kasutuselevõtul, aminohapete biosünteesil, ja samuti transkriptsiooni repressorvalgu inaktivatsioonil. Taotletavas projektis määratletud aja jooksul kavatseme teostada järgnevad uuringud: 1. Konstrueerime uued testsüsteemid mutatsiooniprotsesside uurimiseks. 2. Võimalusel kohandame uusi testsüsteeme ka teistele perekond Pseudomonas liikidele. 3. Kasutades uusi testsüsteeme uurime mutatsioonide tekkeprotsesse P. aeruginosa statsionaarse faasi populatsioonis. Kavatseme selgitada välja erinevate DNA polümeraaside ja DNA reparatsioonisüsteemide osalust mutatsioonide tekkeprotsessides.
Pseudomonas aeruginosa is human and animal pathogen. Several molecular mechanisms which influence the pathogenesis of this bacterium, for example generation of antibiotic resistance and formation of biofilm are connected with mutational processes. Generation of mutations in stationary-phase bacteria is predisposed by several stress-factors such as carbon starvation, acidic or osmolar stress and exposure to different antibiotics. For investigation of mutational processes in stationary phase bacteria, several test systems has been used. However, no test systems for investigation of mutational processes in stationary phase P. aeruginosa cells are available. The aim of the proposed project is to construct different test systems for investigation of mutational processes in P. aeruginosa stationary phase cells. Test systems for the proposed project will be based either on consumption of different carbon sources, biosynthesis of amino acids or inactivation of transcriptional repressor protein. During the period assigned in the proposed project we will perform following investigations: 1. We are planning to construct new test systems for investigation of mutational processes. 2. If it is possible, we will adapt these test systems also for other Pseudomonas species. 3. We are planning to investigate mutational processes in P. aeruginosa stationary-phase populations. We will investigate the involvement of different DNA polymerases and DNA repair systems on mutational processes in P. aeruginosa cells.