"Personaalse uurimistoetuse stardigrant" projekt PSG295
PSG295 (PSG295) "Pseudouridiinide bioloogiline funktsioon eukarüootide mRNAs (1.01.2019−31.12.2022)", Margus Leppik, Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
PSG295
Pseudouridiinide bioloogiline funktsioon eukarüootide mRNAs
The biological function of pseudouridines in eukaryotic mRNA
1.01.2019
31.12.2022
Teadus- ja arendusprojekt
Personaalse uurimistoetuse stardigrant
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudT360 Biokeemiatehnoloogia 1.6 Bioteadused100,0
PerioodSumma
01.01.2019−31.12.201950 625,00 EUR
50 625,00 EUR

Pseudouridiin (Ψ) on kõige levinum RNA modifikatsioon looduses. Ψ on leitud erinevate RNAde funktsionaalselt olulistest piirkondadest, kuid Ψ funktsioon on siiani teadmata. Ψ esinevad ka eukarüootsete organismide mRNAdes. Valdav enamus mRNA Ψ asub kodeerivas järjestuses ja nende esinemine on tugevas sõltuvuses stressist, mis on otsene viide bioloogiliselt olulisele rollile. On näidatud, et Ψ mRNA stop koodonis põhjustab valgusüteesi stop signaali kadumise. Seega on Ψ võimeline muutma stop koodoni bioloogilist identiteeti. Antud projekti eesmärk on selgitada kuidas Ψ mõjutavas mRNA kodeerivas järjestuses koodoni identiteeti ja valgusünteesi kiirust ning kuidas Ψ 5’-mittetransleeritavas piirkonnas (5’UTR) mõjutavad ribosoomi preinitsiatsiooni kompleksi skaneerimist, AUG koodoni valikut valgusünteesi alustamist. Seega selgitatakseveel kirjeldamata geeni avaldumise mehanismi. Projektil on potensiaalne mõju meditsiinis, kuna paljude inimeste vähi liikide puhul on leitud seos Ψ sünteesiga.
Pseudouridine (Ψ) is the most abundant posttranscriptional RNA modification. Ψ has been found from functionally important regions of RNAs but the effect of pseudouridylation is largely enigmatic. Recently, pseudouridines were detected from eukaryotic mRNA. Moreover, Ψ are mostly concentrated into coding region of mRNA and are highly correlated with cell stress, an indication of an important biological role. It has been shown that Ψ in mRNA stop codon suppresses the stop signal, hence, Ψ in mRNA can change the stop codon identity. This project elucidates the effect of Ψ on codon identity and translation efficiency when synthesized into mRNA coding region. Also the effect on preinitiation complex scanning, initiator AUG selection and translation initiation when Ψs are present in 5’-UTR. This project clarifies new posttranscriptional gene expression mechanism. Many human cancer types have been related to Ψ synthesis, hence the project has strong impact in medicine and disease diagnostics.