"Muu" projekt MLOTI10201
MLOTI10201 "FEBS praktiline kursus „Viirus-Põhised Ekspressioonivektorid Põhi-ja Rakendusuuringutes" (1.11.2010−31.12.2011)", Eva Žusinaite, Tartu Ülikool, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut.
MLOTI10201
FEBS praktiline kursus „Viirus-Põhised Ekspressioonivektorid Põhi-ja Rakendusuuringutes"
FEBS practical course „Viral Expression Vectors for Basic and Applied Studies"
1.11.2010
31.12.2011
Teadus- ja arendusprojekt
Muu
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T490 Biotehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).50,0
AsutusRiikTüüp
Federation of European Biochemical Societies
PerioodSumma
01.11.2010−31.12.2011652 463,00 EEK (41 699,99 EUR)
41 699,99 EUR
Koolitusprogramm

Viirused on võimsad geeneetilisematerjali rakkutoimetamise vahendajad. Rekombinantsetel viirusgenoomidel põhinevate ekspressioonisüsteemide arv kasvab kiiresti ning igal aastal luuakse juurde üha uusi ja edasiarenenud süsteeme. Kursuse teaduslikuks eesmärgiks on anda osalejatele ajakohast informatsiooni sellest valdkonnast ning õpetada tehnikaid sagedamini kasutatavate viirus-ekspressioonisüsteemide loomisest ning tuua näiteid ka nende kasutamisvõimalustest. Kursus koosneb teoreetilisest ja praktilisest osast. Loengute läbiviimiseks kutsutakse antud ala tipp-spetsialistid, kes annavad ülevaadet geeniteraapia- ja ekspressioonivektoritena kasutatavate viiruste molekulaarbioloogiast ja praktilistest rakendamisest (herpes-, lenti-, flavi-, gripi-, ja negatiivse polaarsusega RNA genoomiga viirused). Praktilises osas keskendutakse neljal viirus-põhisel ekspressioonisüsteemil (rekombinantsete viiruste konstrueerimine, aga ka valmis tehtud viirusvarude kasutamine): 1. Adenoviirusel põhinev ekspressioonisüsteem. Rekombinantsed adenoviirused konstrueeritakse kasutades AdEasy tehnoloogiat. Adenoviirus-vahendatud ekspressiooni võrreldakse alfaviirus-vahendatud ekspressiooniga erinevates rakuliinides. 2. Bacüloviirusel põhinev ekspressioonisüsteem annab võimaluse saada väga kõrge rekombinantse valgu saagis putukarakkudes. Tudengitele pakutakse võimalus sooritada kõik baculoviiruse konstrueerimise etapid ning kasutada valmis tehtud viirusvaru rekombinantse valgu ekspresseerimiseks. Baculoviiruse toime peremeesraku ainevahetusele võrreldakske teiste viirusvektoritega. 3. Lentiviirusel põhinev ekspressioonisüsteem. Lentiviiruspartiklite konstrueerimine ja puhastamine. Antud töö eesmärgiks on näidata rekombinantsete viirusosakeste kontsentreerimise ja puhastamise meetodit ning anda ülevaade nende praktilisest kasutamisest potentsiaalsete vaktsineerimisvahenditena. 4. Alfaviirusel põhinev ekspressioonisüsteem. Tudengid õpivad rekombinantsete alfaviiruse genoomide ülesehitust ja valmistamist, kasutades Semliki Forest viiruse ja Chikungunya viiruse replikonvektoreid. Konstrueeritakse Chikungunya viiruse mittetsütotoksilist replikoni sisaldav stabiilne rakuliin, et näidata viirusvektorite kasutamisvõimalust potentsiaalsete inhibiitorite välja sõelumiseks.
Viruses are powerful gene delivery agents. The number of expression systems based on recombinant virus creation is rapidly growing and new advanced systems and applications are developed every year. The scientific aim of the course is to give up-to-date information on the subject and teach the techniques for using few of the most common viral expression vector systems and their use in several spheres. The course will consist of theoretical and practical parts. The lectures will be given by the most outstanding experts of the field to give an overview on the molecular biology and practical applications of the major groups of viruses used as expression and/or gene therapy vectors (herpes-, lenti-, flavi-, influenza-, and negative-strand RNA viruses). The practical part will focus on four different types of virus-based expression systems and their comparison with each other (construction of recombinant viruses, as well as experiments with ready-made recombinant viruses using different cell types): 1. Adenovirus-based expression system. The recombinant adenoviruses will be constructed using the AdEasy technology. Adenovirus-mediated expression will be compared to alphavirus based expression in different cell lines. 2. Baculovirus-based expression system offers a high yield of recombinant protein expression and a correct folding of protein. Students will have a possibility to perform all steps of a recombinant baculovirus creation, and to use the pre-made baculovirus vector for expression of recombinant protein. Effects on host cell metabolism will be compared to other viral vectors. 3. Lentivirus-based expression system. Construction and purification of lentivirus-based particles. The aim of the study is to demonstrate the procedure of concentration and purification of recombinant viral particles and to evaluate the use of the heterologous epitopes bearing lentiviral particles as potential vaccine delivery systems. 4. Alphavirus-based expression system. Students will learn the technique and design of recombinant alphavirus genomes using Semliki Forest virus and Chikungunya virus replicon vectors. Non-cytotoxic Chikungunya replicon containing stable cell line will be used to demonstrate the possibility to use viral vectors for screening of potential inhibiting compounds.
KirjeldusProtsent
Katse- ja arendustöö100,0