"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF8235
ETF8235 "Ektomükoriisat moodustavate seente ja peremeestaimede valitud taksonite koevolutsioon (1.01.2010−31.12.2013)", Urmas Kõljalg, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut.
ETF8235
Ektomükoriisat moodustavate seente ja peremeestaimede valitud taksonite koevolutsioon
Coevolution of selected taxa of ectomycorrhizal fungi and their plant hosts
1.01.2010
31.12.2013
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogiaB290 Süstemaatiline botaanika, taksonoomia, morfoloogia, fütogeograafia, kemotaksonoomia, mittesoontaimede füsioloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
PerioodSumma
01.01.2010−31.12.2010264 000,00 EEK (16 872,68 EUR)
01.01.2011−31.12.201116 873,20 EUR
01.01.2012−31.12.201216 873,20 EUR
01.01.2013−31.12.201316 873,20 EUR
67 492,28 EUR

Projekti käigus uuritakse ektomükoriisat moodustavate seene perekondade Thelephora ja Tomentella (Thelephoraceae) koevolutsiooni peremeestaimedega. Need kaks seente sõsarperekonda on levinud globaalselt ja on üks liigirikkamaid ning suurema ohtrusega puujuurtel ektomükoriisat moodustavaid taksoneid nii lõuna- kui ka põhjapoolkeral. Peremeestaimede nn. mudelrühmadeks valitakse perekonnad Alnus, Pisonia, Coccoloba ja Nothofagus. Grandi taotleja käimasolevatest uuringutest on olemas osaline andmestik ja see lubab oletada, et perekondade Thelephora ja Tomentella liigid on neil peremeestaimedel väga sage ning liigirikas rühm. Lisaks selgitatakse projekti käigus mittefotosünteesivate orhideede (perekond Corallorhiza) koevolutsiooni Thelephora ja Tomentella liikidega. Seente ja taimede koevolutsiooni uuringud sisaldavad tänapäeval väga suuri andmemahte. Tavaliselt on samas analüüsis sadade kuni tuhandete eksemplaride geenijärjestused, leiu- ja kasvukohad, mullastiku andmed, peremehe ja sümbiondi vahelised ühendused jm. Reeglina sisaldavad analüüsid samaaegselt ka keskkonnaproovidest, näiteks taimejuurtest pärit seene DNA määramist liigi, populatsiooni vm. tasemel. See seab andmete talletamise viisile ning analüüsidele suuri nõudmisi. Seetõttu luuakse projekti käigus veebipõhine platvorm, mis võimaldab andmestiku haldamist ja analüüsimist.
During this project the coevolution between plant hosts and their root mycobionts from the fungal genera Thelephora and Tomentella (Thelephoraceae, Basidiomycota) will be studied. Species of these two sister genera form ectomycorrhiza as well as orchid mycorrhiza with wide range of plant hosts in all continents. They are also one of the most frequent and abundant ectomycorrhizal taxa worldwide. In the planned coevolutionary studies we will focus on the tree genera Alnus, Pisonia, Coccoloba and Nothofagus where we have sufficient expertise and preliminary data from our previous project. These data demonstrate that the species of Thelephora and Tomentella are probably very specious and frequent on all four genera of hosts. In addition we will study the presence of coevolution between mycoheterotrophic orchids and ectomycorrhizal fungi of the same two genera. The amount of data, available through the public genebanks (NCBI, EMBL, DDBJ) and generated during this project is overlarge to be handled by common software. Therefore we aim to develop a web- based platform for the data handling and the execution of phylogenetic, coevolutionary, etc. analyses. We acquired expertise necessary for this part of the project by developing UNITE (http://unite.ut.ee) and its web based platform PlutoF. The PlutoF platform is presently in an operational mode but needs to be expanded and equipped with tools for analysis, primarily for phylogenetic analysis, molecular clustering, DNA sequence manipulation, and data export facilities. Design and implementation of a software pipeline for processing sequences from the massively parallel DNA sequencing system Roche GS FLX will be developed too.