"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF6597
ETF6597 "Antisense transkriptide osa geenide avaldamise kontrollis (1.01.2006−31.12.2009)", Tarmo Annilo, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
ETF6597
Antisense transkriptide osa geenide avaldamise kontrollis
THE ROLE OF ANTISENSE TRANSCRIPTS IN REGULATION OF GENE EXPRESSION
1.01.2006
31.12.2009
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud 1.3. Keemiateadused (keemia ja muud seotud teadused)100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2006−31.12.2007
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2009
PerioodSumma
01.01.2006−31.12.2006102 000,00 EEK (6 518,99 EUR)
01.01.2007−31.12.2007104 520,00 EEK (6 680,05 EUR)
01.01.2008−31.12.200892 520,00 EEK (5 913,11 EUR)
01.01.2009−31.12.200988 819,00 EEK (5 676,57 EUR)
24 788,72 EUR

Paljude valkekodeerivate geenide avaldumist kontrollivad lisaks regulatoorsetele järjestustele seonduvatele valgulistele faktoritele ka erinevad RNA molekulid nagu mikroRNAd ja vastasahelalt transkribeeritavad antisense RNAd. Käesolevas taotluses esitatud projekti eesmärgiks on selgitada, millist rolli mängivad antisense RNA molekulid kõrgvererõhutõve kujunemises oluliste geenide avaldumises. Selleks on planeeritud järgnevad spetsiifilised eesmärgid: 1. Kuna enamus antisense transkripte on seni kirjeldatud ainult in silico analüüsi abil, siis tuleb esmalt iseloomustada detailselt kõrgvererõhutõvega seotud geenide antisense transkriptide struktuuri, ekspressioonimustrit ja splaissingu isovorme. 2. Selgitada eksperimentaalselt, kas ja millist rolli omavad antisense transkriptid vastavate sense geenide ekspressiooni regulatsioonis. 3. Uurida sense-antisense geenipaaride evolutsioonilist konserveerumist selgroogsetel. Kas ja millisel määral on sense-antisense geenipaarid, nende asukoht genoomis ja kattumismuster konserveerunud? 4. Kirjeldada antisense transkriptide geneetilist variatsiooni ning uurida selle võimalikku seost ekspressioonimustri ning vererõhu regulatsiooni häiretega.
In addition to protein factors that are binding to promoter regions, the expression of a number of protein-coding genes is controlled by different RNA molecules like microRNAs and natural antisense RNAs. The goal of the current project is to elucidate the role of antisense transcripts in expression of blood pressure regulating genes in human. The following specific aims are proposed: 1. Since majority of the antisense transcripts have been described only in silico, we should determine the detailed structure, expression pattern and splicing isoforms of antisense transcripts that are related to blood pressure regulating genes. 2. Test experimentally the functional relationship of overlapping sense-antisense gene pairs. 3. Perform the evolutionary analysis of overlapping gene pairs. How strongly is conserved the location and pattern of overlap? 4. Assess the relationship between the variation of primary sequence and expression of antisense transcripts. Is there a relationship between the specific gene variants, expression level and deviation in blood pressure?