"Sihtfinantseerimine" projekt SF0182129s02
SF0182129s02 "Postgenoomiks: sekveneeritud genoomi biokeemiline ja geneetiline funktsionaalanalüüs (1.01.2002−31.12.2006)", Juhan Sedman, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
SF0182129s02
Postgenoomiks: sekveneeritud genoomi biokeemiline ja geneetiline funktsionaalanalüüs
Postgenomics: biochemical and genetical analysis of the sequenced genome
1.01.2002
31.12.2006
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudB120 Molekulaarne biofüüsika1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2002−31.12.2006
PerioodSumma
01.01.2002−31.12.2002600 000,00 EEK (38 346,99 EUR)
01.01.2003−31.12.2003595 000,00 EEK (38 027,43 EUR)
01.01.2004−31.12.2004595 000,00 EEK (38 027,43 EUR)
01.01.2005−31.12.2005595 000,00 EEK (38 027,43 EUR)
01.01.2006−31.12.2006644 000,00 EEK (41 159,10 EUR)
193 588,38 EUR

Plaanitav teaduslik töö on pühendatud genoomi sekveneerimise projektist tulenevate järjestuste andmete analüüsile biokeemiliste ja geneetiliste vahenditega. Meie kitsamateks uurimisobjektideks on mudelorganismi S. cerevisiae mitokondriaalse DNA metabolismis osalevad ensüümid ja mitokondri spetsiifilised transportsüsteemid.
.

Vastutav täitja (1)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Juhan SedmandoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006

Põhitäitjad (8)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Priit JõersdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Priit JõersdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Silja KuuskdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Silja KuuskdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Tiina SedmandoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Tiina SedmandoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Priit VäljamäedoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Priit VäljamäedoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006

Täitjad (4)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Anu AundoktorikraadEST / ENG01.01.2006−01.01.2010
Joachim Matthias GerholddoktorikraadEST / ENG01.01.2005−01.01.2009
Katrin Krõlovmagistrikraad (teaduskraad)EST / ENG01.01.2006−01.01.2010
Dmitri Lubenetsmagistrikraad (teaduskraad)EST / ENG01.01.2005−01.01.2009
Publikatsioonid
Publikatsioonid
Sedman, T.; Joers, P.; Kuusk, S.; Sedman, J. (2005). Helicase Hmi1 stimulates the synthesis of concatemeric mitochondrial DNA molecules in yeast Saccharomyces cerevisiae. Current Genetics, 47 (4), 213−222.
Kuusk, S.; Sedman, T.; Joers, P.; Sedman, J. (2005). Hmi1p from Saccharomyces cerevisiae mitochondria is a structure-specific DNA helicase. Journal of Biological Chemistry, 280 (26), 24322−24329.
Kuusk, S.; Sedman, T.; Sedman, J. (2002). Recombinant yeast mtDNA helicases. Purification and functional assays. In: Copeland, W.C. (Ed.). Mitochondrial DNA: Methods and Protocols (303−316).. Humana Press. (Methods in Molecular Biology; 197).
Jõers, P.; Gerhold, J. M.; Sedman, T.; Kuusk, S.; Sedman, J. (2007). The helicase CaHmi1p is required for wild-type mitochondrial DNA organization in Candida albicans. FEMS Yeast Research, 7 (1), 118−130.10.1111/j.1567-1364.2006.00132.x.
Kipper, K.; Valjamae, P.; Johansson, G. (2005). Processive action of cellobiohydrolase Cel7A from Trichoderma reesei is revealed as 'burst' kinetics on fluorescent polymeric model substrates. Biochemical Journal, 385, 527−535.
Hilden, L.; Valjamae, P.; Johansson, G. (2005). Surface character of pulp fibres studied using endoglucanases. Journal of Biotechnology, 118 (4), 386−397.
Gruno, M.; Valjamae, P.; Pettersson, G.; Johansson, G. (2004). Inhibition of the Trichoderma reesei cellulases by cellobiose is strongly dependent on the nature of the substrate. Biotechnology and Bioengineering, 86 (5), 503−511.
Valjamae, P.; Kipper, K.; Pettersson, G.; Johansson, G. (2003). Synergistic cellulose hydrolysis can be described in terms of fractal-like kinetics. Biotechnology and Bioengineering, 84 (2), 254−257.
Juhendamised
Juhendamised
Anu Aun, magistrikraad (teaduskraad), 2006, (juh) Juhan Sedman, Interaktsioonid pärmi Saccharomyces cerevisiae helikaasi Hmi1 ja tugivalgu Ste5 vahel, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Silja Kuusk, doktorikraad, 2006, (juh) Juhan Sedman, Biochemical properties of Hmi1p, a DNA helicase from Saccharomyces cerevisiae mitochondria, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Dmitri Lubenets, magistrikraad (teaduskraad), 2005, (juh) Juhan Sedman, Saccharomyces cerevisiae helikaasi Hmi1 mitokondriaalse transpordi uurimine in vivo, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Tiina Sedman, doktorikraad, 2005, (juh) Juhan Sedman, Characterization of the yeast Saccharomyces cerevisiae mitochondrial DNA helicase Hmi1, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
Katrin Viikov, magistrikraad (teaduskraad), 2006, (juh) Priit Väljamäe; Juhan Sedman, Saccharomyces cerevisiae mitokondriaalse DNA polümeraasi Mip1 puhastamine ja biokeemiline analüüs, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Marju Puurand, magistrikraad (teaduskraad), 2003, (juh) Priit Väljamäe, Trichoderma reesei tsellulaaside produktinhibitsioon tselluloosi hüdrolüüsil, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Kalle Kipper, magistrikraad (teaduskraad), 2005, (juh) Priit Väljamäe, Trichoderma reesei tsellobiohüdrolaas Cel7A protsessiivsus tselluloosi hüdrolüüsil, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Priit Jõers, doktorikraad, 2007, (juh) Juhan Sedman, Studies of the Mitochondrial Helicase Hmi1p in Candida albicans and Saccharomyces cerevisiae, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.