See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Institutsionaalne uurimistoetus (IUT)" projekt IUT19-8
IUT19-8 "Struktuurne ja meditsiiniline metalloproteoomika (1.01.2014−31.12.2019)", Peep Palumaa, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut.
IUT19-8
Struktuurne ja meditsiiniline metalloproteoomika
Structural and medical metalloproteomics
1.01.2014
31.12.2019
Teadus- ja arendusprojekt
Institutsionaalne uurimistoetus (IUT)
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP310 Proteiinid, ensümoloogia1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB190 Kliiniline keemia 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)25,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T360 Biokeemiatehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).25,0
PerioodSumma
01.01.2014−31.12.2014208 000,00 EUR
01.01.2015−31.12.2015208 000,00 EUR
01.01.2016−31.12.2016208 000,00 EUR
01.01.2017−31.12.2017208 000,00 EUR
01.01.2018−31.12.2018208 000,00 EUR
01.01.2019−31.12.2019208 000,00 EUR
1 248 000,00 EUR

Teema raames jätkatakse struktuurse ja meditsiinilise metalloproteoomika aktuaalsete probleemide uurimist, mis on seotud tsingi ja vase valkude toimemehhanismide ning metallide rolliga amüloidsete peptiidide agregatsioonis ning Alzheimeri tõve patoloogias. Töös fokuseerutakse järgnevatele projektidele: a) süsteemibioloogiline lähenemine tsink finger valkude metallide sidumise afiinsuste määramisele, mille eesmärgiks on erinevate tsink finger valkude funktsionaalne iseloomustamine ühtses süteemis; b) tsink finger valkude redoksomaduste iseloomustamine; c) süsteemibioloogiline lähenemine ekstratsellulaarsetele Cu(II) valkudele ja nende Cu(II) sidumise afiinsuste määramine; d) valkude struktuuriuuringud: vase saperoonide Cox19, Cox23 ja Aß fibrillide struktuuur; e) osüdatiivse stressi mõju ekstratsellulaarsete Cu(II) siduvate valkude vase sidumise omadustele; f) keskkonnafaktorite ning endo- ja eksogeensete ligandide mõju amüloidsete peptiidide fibrillisatsioonile.
Project is focused to essential problems of structural and medical metalloproteomics, connected with mecahnism of action of zinc and copper proteins as well as with the role of metal ions in aggregation of amyloidogenic peptides and pathology of Alzheimers disease. Research will be performed on following subprojects: a) systems biology approach to the metal-binding affinities of zinc finger proteins with the aim to determine metal-binding properties of different zinc finger domains in unified system; b) redox properties of ZF domains; c) a systems biology study of extracellular Cu(II)-binding proteins and determination of their metal-binding affinities; d) elucidation of protein structures: structures of copper chaperones Cox19, Cox23 and Aß fibrils; e) role of oxidative stress on metal-binding properties of Cu(II)-binding proteins; f) effects of environmental factors and endogenous and exogenous ligands on the kinetics of the fibrillation of the amyloidogenic peptides.
Projekti raames keskenduti struktuurse ja meditsiinilise metalloproteoomika aktuaalsete probleemide lahendamisele, mis olid seotud tsingi ja vase valkude toimemehhanismide ning metallide rolliga amüloidsete peptiidide agregatsioonis ning Alzheimeri ning Wilsoni tõve patoloogias. Töö tulemusena a) iseloomustati ESI MS metoodikat kasutades erinevate tsink-sõrm valkude redoksomadusi, mis on oluline mõistmaks nende valkude käitumist oksüdatiivse stressi tingimustes; b) realiseeriti süsteemibioloogiline lähenemine ekstratsellulaarsete vasevalkude Cu(II) ioonide sidumisafiinsuste määramiseks kasutades innovatiivset LC ICP MS metoodikat, mis võimaldas kvantitatiivselt iseloomistada Cu(II) seostumistasakaalusid inimese veres; c) määrati Cu(I) ioonide sidumisafiinsused Wilsoni tõve ravis kasutatavatele ravimitele ja mõningatele endogeensetele ligandidele, mida saab kasutada organismi vase metabolismi regulatsiooniks Wilsoni ja Alzheimeri tõve korral; d) töötati välja neuronilaadne rakuline süsteem amüloidsete peptiidide toksilisuse uurimiseks ja selgitati peptiidide toksilisuse mehhanismi; e) määrati keskkonnafaktorite (pH, temperatuur, solvent, oksüdandid) ning endo- ja eksogeensete ligandide mõju amüloidsete peptiidide (Alzheimeri amüloidne peptiid, insuliin) fibrillisatsioonile; f) selgitati metallotioneiini supresseerivat rolli tsütokroom c oksüdaasi metalleerimisele ja ekspresseerimisele, mis võib omada olulist rolli bioenergeetiliste protsesside regulatsioonile. Kokkuvõtvalt mainime, et projekti raames teostatud teadustöö koguti kriitiline mass informatsiooni, mis on oluline organismi vase metabolismi põhialuste mõistmiseks ja molekulaarsete vahendite loomiseks vase metabolismi häiretega seotud haiguste nagu Wilsoni ja Alzheimeri tõve raviks.