"Institutsionaalne uurimistoetus" projekt IUT19-8
IUT19-8 "Struktuurne ja meditsiiniline metalloproteoomika (1.01.2014−31.12.2019)", Peep Palumaa, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut.
IUT19-8
Struktuurne ja meditsiiniline metalloproteoomika
Structural and medical metalloproteomics
1.01.2014
31.12.2019
Teadus- ja arendusprojekt
Institutsionaalne uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP310 Proteiinid, ensümoloogia1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB190 Kliiniline keemia 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)25,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T360 Biokeemiatehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).25,0
PerioodSumma
01.01.2014−31.12.2014208 000,00 EUR
01.01.2015−31.12.2015208 000,00 EUR
01.01.2016−31.12.2016208 000,00 EUR
01.01.2017−31.12.2017208 000,00 EUR
01.01.2018−31.12.2018208 000,00 EUR
01.01.2019−31.12.2019208 000,00 EUR
1 248 000,00 EUR

Teema raames jätkatakse struktuurse ja meditsiinilise metalloproteoomika aktuaalsete probleemide uurimist, mis on seotud tsingi ja vase valkude toimemehhanismide ning metallide rolliga amüloidsete peptiidide agregatsioonis ning Alzheimeri tõve patoloogias. Töös fokuseerutakse järgnevatele projektidele: a) süsteemibioloogiline lähenemine tsink finger valkude metallide sidumise afiinsuste määramisele, mille eesmärgiks on erinevate tsink finger valkude funktsionaalne iseloomustamine ühtses süteemis; b) tsink finger valkude redoksomaduste iseloomustamine; c) süsteemibioloogiline lähenemine ekstratsellulaarsetele Cu(II) valkudele ja nende Cu(II) sidumise afiinsuste määramine; d) valkude struktuuriuuringud: vase saperoonide Cox19, Cox23 ja Aß fibrillide struktuuur; e) osüdatiivse stressi mõju ekstratsellulaarsete Cu(II) siduvate valkude vase sidumise omadustele; f) keskkonnafaktorite ning endo- ja eksogeensete ligandide mõju amüloidsete peptiidide fibrillisatsioonile.
Project is focused to essential problems of structural and medical metalloproteomics, connected with mecahnism of action of zinc and copper proteins as well as with the role of metal ions in aggregation of amyloidogenic peptides and pathology of Alzheimers disease. Research will be performed on following subprojects: a) systems biology approach to the metal-binding affinities of zinc finger proteins with the aim to determine metal-binding properties of different zinc finger domains in unified system; b) redox properties of ZF domains; c) a systems biology study of extracellular Cu(II)-binding proteins and determination of their metal-binding affinities; d) elucidation of protein structures: structures of copper chaperones Cox19, Cox23 and Aß fibrils; e) role of oxidative stress on metal-binding properties of Cu(II)-binding proteins; f) effects of environmental factors and endogenous and exogenous ligands on the kinetics of the fibrillation of the amyloidogenic peptides.