See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Personaalse uurimistoetuse stardigrant" projekt PSG433
PSG433 "Geeniekspressiooni regulatsioon munasarjade granuloosrakkudes ja selle olulisus viljakusele (1.01.2020−31.12.2020)", Agne Velthut-Meikas, Tallinna Tehnikaülikool, Loodusteaduskond, Keemia ja biotehnoloogia instituut.
PSG433
Geeniekspressiooni regulatsioon munasarjade granuloosrakkudes ja selle olulisus viljakusele
Regulation of gene expression in ovarian granulosa cells and its role in fertility
1.01.2020
31.12.2020
Teadus- ja arendusprojekt
Personaalse uurimistoetuse stardigrant
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB450 Arengubioloogia, teratoloogia, ontogenees, (inim)embrüoloogia 3.4 Meditsiiniline biotehnoloogia60,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB110 Bioinformaatika, meditsiiniinformaatika, biomatemaatika, biomeetrika 3.4 Meditsiiniline biotehnoloogia40,0
PerioodSumma
01.01.2020−31.12.202094 965,00 EUR
94 965,00 EUR

Erinevate rakutüüpide vaheline suhtlus munasarjas on munaraku küpsemise, ovulatsiooni ja kollaskeha funktsioonide aluseks. Häired rakkudevahelises kommunikatsioonis võivad olla polütsüstiliste munasarjade sündroomi (PCOS) või viljatuse ravis kasutatava hormoonstimulatsioonile ebapiisava vastuse põhjustajaks. Käesolev projekt adresseerib rakkudevahelise suhtluse tähtsust inimese munasarjas interdistsiplinaarselt, ühendades teise ja kolmanda põlvkonna RNA sekveneerimise meetodid (RNA-seq) ja süsteemibioloogilise analüüsi. Koostatakse munasarja granuloosrakkude populatsioone kirjeldav mRNA isovormide kaart. Lisaks kirjeldatakse rakutüüpide ja follikulaarvedelike mikroRNA profiilid. Kahe andmestiku ühendamine võimaldab modelleerida somaatiliste rakkude vahelist kommunikatsiooni folliikulis, et selgitada, millised molekulaarsed signaalirajad on häiritud RNA tasemel PCOS ja ebapiisava hormoonstimulatsiooni vastusega patsientide munasarjades.
Communication between cell populations in ovarian follicle is a prerequisite for oocyte maturation and ovarian functions. Disturbances in the communication may lead to infertility. Polycystic ovarian syndrome (PCOS) and poor response to hormonal stimulation in infertility treatment are types of subfertility of ovarian aetiology. The current project addresses the importance of intercellular communication in human ovarian follicle by an interdisciplinary approach combining 2nd and 3rd generation RNA sequencing methods (RNA-seq) with systems biology analysis. The full-length single-molecule RNA-seq will be exploited to characterize the mRNA isoform map of ovarian granulosa cell populations. MicroRNA profile of cells and follicular fluids will also be analysed. The two datasets will be integrated to model communication between follicular cells to reveal signalling pathways disturbed by transcriptional and post-transcriptional events in PCOS and poorly responding IVF patients.