See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF8856
ETF8856 "CCR5 ja tema signaalirajaga seotud geenide regulatoorsete regioonide metülatsiooni mustri mõju HIV seropositiivsusele europiidsesse rassi kuuluvate süstivate narkomaanide populatsioonis (1.01.2011−31.12.2013)", Silver Türk, Tartu Ülikool, Arstiteaduskond.
ETF8856
CCR5 ja tema signaalirajaga seotud geenide regulatoorsete regioonide metülatsiooni mustri mõju HIV seropositiivsusele europiidsesse rassi kuuluvate süstivate narkomaanide populatsioonis
The impact of regulatory region methylation of CCR5 and its signaling pathway associated genes on the HIV seropositivity in the caucasian intravenous drug users population
1.01.2011
31.12.2013
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB510 Nakkushaigused3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)100,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Arstiteaduskondkoordinaator01.01.2011−31.12.2013
PerioodSumma
01.01.2011−31.12.20118 400,00 EUR
01.01.2012−31.12.20128 400,00 EUR
01.01.2013−31.12.20138 400,00 EUR
25 200,00 EUR

Hüpoteesid 1. HIV ja/või HCV negatiivseks jäämine kõrgelt eksponeeritute süstivate narkomaanide (IDU) populatsioonis on seotud CCR5 ja tema signaalrajaga seotud geenide regulatoorsete piirkondade metülatsioonimustriga. Üheks võimalikuks seletuseks võib olla näiteks ala-metüleeritud CCR5 promootorist tingitud kõrgem CCR5 ekspressiooni tase, mis võimaldab efektiivsemat HIV replikatsiooni. Teine võimalik kuid veidi keerukam hüpotees võiks siduda erinevuse metülatsioonimustris T-rakkude aktivatsiooni ja paljunemisvõimega läbi CCR5, IL-2 ekspresiooni taseme ning NFAT transaktivatsiooni. 2. GpC metülatsiooni staatus erineb erinevates vererakkude populatsioonides, mis võib viidata HIV ja/või HCV kaitsega seotud rakkude grupile. Eesmärgid 1. Määrata CCR5 signaalirajaga seotud geenide regulatoorsete piirkondade metülatsiooni mustrid CD4+ ja CD8+ (naiivsete, tsentraalsete mälu ning effektor mälu alapopulatsioonides), loomulike tapjarakkude ja makrofaagide populatsioonis. 2. Määrata nakatumist ja haiguse kulgu kõige enam mõjutavad peremehepoolsed geneetilised faktorid (CCR5 haplotüüpid, CCL3L1 genotüübid, HLA haplotüübid). 3. Määrata interaktsioonid eelmainitud faktorite vahel neljas uuringupopulatsioonis (HIV negatiivsed IDUd, HIV negatiivsed veredoonorid, HIV positiivsed IDUd ja HIV positiivsed isikud, kes pole kunagi süstitavaid narkootikume tarbinud). Kaasatud neli populatsiooni võimaldavad eristada põhjus- tagajärg seoseid metülatsiooni mustri, HIV negatiivseks jäämise, süstitavate narkootikumide tarvitamise ning HIV positiivseks olemise vahel.
Annotation Hypothesis 1. Remaining HIV, HCV or co-infection negative in highly exposed intravenous drug users (IVDU) population is associated with specific GpC methylation pattern of one or more regulatory regions of CCR5 and its associated signaling pathway genes. One of the possible explanations can be that alterations in methylation pattern (for example hypomethylated CCR5 gene promoter) can be associated with higher CCR5 expression and therefore gives better possibility to HIV replication. Another more complicated theory may link alterations in gene methylation pattern of aforementioned signling pathway with T-cell activation and proliferation through CCR5, IL-2 expression and NFAT transactivation. 2. GpC methylation status differs between different blood cell populations which may mediate protection against HIV, HCV or co-infection among intravenous drug users. Aims 1. To determine the methylation status of the gene regulatory regions of the CCR5 signal pathway genes from CD4+ and CD8+ (naive, central memory and effectors memory), NK and macrophage cells. 2. To determine the polymorphisms of host genetic factors (CCR5 haplotypes, CCL3L1 genotypes, HLA haplotypes) influencing the course and infectivity of HIV and HCV infections the most. 3. To determine the causality between methylation status, intravenous drug use, remaining HIV negative and being HIV positive within current cross-sectional cohort four study population will be recruited: HIV negative IVDUs, HIV negative blood donors, HIV positive IVDUs and HIV positives never being IVDUs.